{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[198.9253669891676, 475.5081435640568, 1, 0, 0.2949517837955488, 0.005027010959615092, 0, -0.04174386398319785, 1, 0.2949517837955489, 0.001186496284617831],
[198.5695306618971, 475.8639798913272, 0, 1, 0.2944241760748432, 0, 0.002101440836577648, 0.01745018285330167, 0.7055758239251568, 1, 0.00117995451068077],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001179938839810851],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001282690953517236],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 7.615425163034718e-05],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001272396917791961],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.00117995451068077],
[199.0908406827446, 475.3426698704798, 1, 0, 0.2951971359184605, 0.005022832776086976, 0, -0.04170916870875033, 1, 0.2951971359184604, 0.00117995451068077],
[198.9877888762842, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2951252021258937, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7048747978741063, 1, 0.001179938839810851],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001347885937804365],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001179923168940964],
[199.0908406827446, 475.3426698704798, 1, 0, 0.2951971359184605, 0.005022832776086976, 0, -0.04170916870875033, 1, 0.2951971359184604, 0.00117987615633146],
[198.9877888762842, 475.3639798913272, 0, 1, 0.2950801022438742, 0, 0.002103651185831559, 0.01746853740222783, 0.7049198977561258, 1, 0.001348553215128743],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 7.555884649766376e-05],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001272992424700543],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921526999, 0, -0.0417523917860435, 1, 0.2948915407638664, 0.00117995451068077],
[198.9253669891676, 475.5081435640568, 1, 0, 0.2949517837955488, 0.005027010959615093, 0, -0.04174386398319786, 1, 0.2949517837955488, 0.001186496284617831],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001078449019932987],
[198.598146688754, 475.7738390085539, 1, 0, 0.2944934708155195, 0.005035293715843254, 0, -0.04181264327414669, 1, 0.2944934708155195, 0.001348595050465968],
[198.9877888762842, 475.5072465328568, 0, 1, 0.2950174255257201, 0, 0.002103017372062072, 0.01746327426753473, 0.7049825744742799, 1, 0.001186826781868438],
[199.0788267902576, 475.1698901708933, 0, 1, 0.2952602233898328, 0, 0.002104510451283757, 0.01747567266818411, 0.7047397766101672, 1, 0.001186826781868438],
[199.0493137322007, 475.3841968210237, 0, 1, 0.2951355628354298, 0, 0.002103561722680672, 0.01746779450796479, 0.7048644371645703, 1, 0.001186826781868438],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001186826781868438],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001186826781868438],
[198.5695306618972, 475.8639798913272, 1, 0, 0.2944241760748432, 0.005036019356376948, 0, -0.04181866893034329, 1, 0.2944241760748432, 0.001186826781868438],
[198.598146688754, 475.7738390085539, 1, 0, 0.2944934708155194, 0.005035293715843255, 0, -0.04181264327414669, 1, 0.2944934708155194, 0.001348273206601389],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001348006578770827],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001186449010816086],
[198.8029952842107, 475.6305152690138, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001173185256075649],
[198.9060470906712, 475.5274634625532, 0, 1, 0.2949231376826346, 0, 0.002102927962811022, 0.01746253182085128, 0.7050768623173654, 1, 0.001348006582226375],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001173154092026488],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.0008625072255096881],
[198.9046356716114, 475.528874881613, 1, 0, 0.2949210449351099, 0.005027534912011729, 0, -0.04174821483855794, 1, 0.2949210449351098, 0.0008625072255096881],
[198.9877888762842, 475.5072465328568, 0, 1, 0.2950174255257201, 0, 0.002103017372062072, 0.01746327426753473, 0.7049825744742799, 1, 0.001144728658940121],
[198.8847370698237, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2949366063627748, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2949366063627747, 0.001023175589004712],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.001348600300711311],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.0007174436819261226],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006303735200769185],
[198.7743792573538, 475.7206561517871, 0, 1, 0.2947010264305053, 0, 0.002102073952578028, 0.01745544019378048, 0.7052989735694947, 1, 0.001348719680111219],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001130431434393883],
[199.1725824683576, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2953183365769894, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7046816634230106, 1, 0.001351358956769963],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 1, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0.002214001735179117, -0.0253462294901828, 0.912397850905533, 0.5043510554562538, 0.002698617458219138],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 1, 0.2959766022753602, 0, 0.002214001735179117, 0.01838487881453864, 0.7040233977246397, 1, 0.001348450701164202],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348594555368102],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.001216800891203394],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001350891071365153],
[189.0492144459451, 452.5073458191123, 0, 0, 0.2946727165689645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004755904615255011],
[198.5695306618971, 475.8639798913272, 1, 0, 0.2944241760748432, 0.005036019356376949, 0, -0.0418186689303433, 1, 0.2944241760748432, 0.000872675584161623],
[189.8025776700464, 451.7539825950111, 1, 0, 0.2958469906248483, 0.005268632345649196, 0, -0.04375026706349103, 1, 0.2958469906248482, 0.000585598874999848],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005718074195892629],
[189.7624621385621, 451.7940981264953, 0, 1, 0.2957844621839145, 0, 0.002213397660896437, 0.0183798626339704, 0.7042155378160855, 1, 0.0005810515760526851],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005698589227974229],
[198.9877888762842, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2951252021258937, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7048747978741063, 1, 0.001187854966678724],
[198.7757480223397, 475.5002162006822, 1, 2, 0.2947988043017252, 0.005030794802430393, 0.004206096930891638, -0.006848219757886199, 0.7905207622457617, 0.6492972915014659, 0.004042414429564494],
[190.09183448764, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2962027010717208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002266507990047976],
[199.0908406827446, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2951520374022111, 0.005022832776086976, 0, -0.04170916870875033, 1, 0.2951520374022111, 0.001121803947491],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348321913156733],
[189.6796272617981, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2957503581613241, 0, 0, 0, 1, 1, 8.992386176219485e-05],
[198.8847370698237, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2949366063627749, 0.005028037921526999, 0, -0.0417523917860435, 1, 0.2949366063627749, 0.001258626495201675],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 7.27801171654996e-05],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.00127577145702357],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004875169421881455],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.0008611217977558018],
[199.3645201401272, 475.0689904130972, 0, 1, 0.295602927524453, 0, 0.002104957427615825, 0.01747938432096535, 0.7043970724755471, 1, 0.001348553240637664],
[198.9877888762842, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2951252021258937, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7048747978741063, 1, 0.001348450674263956],
[198.6605685758706, 475.5881483852804, 1, 0, 0.2946398911535743, 0.005033711557198576, 0, -0.04179950516567749, 1, 0.2946398911535743, 0.001348506453950492],
[198.7119573702373, 475.7215531829871, 0, 1, 0.2946353558369865, 0, 0.002102069988860371, 0.01745540727941207, 0.7053646441630135, 1, 0.001171016571076963],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003380071671389971],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.00101049641973991],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003854053629489637],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.0009630968003702272],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.00134830844675187],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001348298496160114],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004722265219434833],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.0008752696845787648],
[198.9877888762842, 475.405606145456, 1, 0, 0.2950618887212996, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950618887212997, 0.001349052408080908],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348553230434021],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.0008847853194973544],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348891055992111],
[199.1110576124411, 475.3224529407833, 0, 1, 0.295227112082723, 0, 0.002103834973107366, 0.01747006355586162, 0.704772887917277, 1, 0.001118033505044012],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006173596506144935],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002522523333480244],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001347939885055647],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001349226176403216],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004485151341831404],
[189.7826790682586, 451.7738811967988, 1, 0, 0.2958159744946734, 0.005269184758638235, 0, -0.04375485425314753, 1, 0.2958159744946733, 0.0006220268063749139],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000276888963663553],
[190.3039890891061, 451.2525711759513, 0, 1, 0.2966285451285581, 0, 0.00221605385514819, 0.0184019194411763, 0.7033714548714418, 1, 0.001351532429925727],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.00134819197131337],
[198.8029952842107, 475.5689904130972, 0, 1, 0.2947972328338139, 0, 0.002102744333963748, 0.01746100698279431, 0.705202767166186, 1, 0.001348631314089759],
[190.132268347033, 451.4242919180244, 0, 0, 0.2963608824582518, 0, 0, 0, 1, 1, 7.068572646614468e-05],
[199.1110576124411, 475.3224529407833, 0, 1, 0.295227112082723, 0, 0.002103834973107366, 0.01747006355586162, 0.704772887917277, 1, 0.001277634324921026],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001348631318921549],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000403627972434347],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.0009446543946883122],
[189.0492144459451, 452.5073458191123, 0, 0, 0.2946727165689645, 0, 0, 0, 1, 1, 3.395088455092742e-05],
[198.5695306618971, 475.8639798913272, 1, 0, 0.2944241760748432, 0.005036019356376949, 0, -0.0418186689303433, 1, 0.2944241760748432, 0.001314916349075492],
[188.8857308747191, 452.6708293903383, 0, 0, 0.2944178932511912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004721721682605562],
[198.4877888762842, 475.9457216769403, 0, 1, 0.2943029754163143, 0, 0.00210107992246808, 0.01744718585376845, 0.7056970245836858, 1, 0.0008755418219710123],
[198.9046356716114, 475.528874881613, 1, 0, 0.2949210449351099, 0.005027534912011729, 0, -0.04174821483855794, 1, 0.2949210449351098, 0.001348184083775041],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001348250515137569],
[199.1725824683576, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2953183365769894, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7046816634230106, 1, 0.0008737156452319057],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001348306789969517],
[190.0705244667926, 451.4860357982648, 0, 1, 0.2962646417149338, 0, 0.002214907927843033, 0.01839240376000006, 0.7037353582850663, 1, 0.001347256287751857],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001351538571398865],
[199.1926374717408, 475.3893409164417, 0, 1, 0.2952830698911987, 0, 0.002103538960449196, 0.0174676054923644, 0.7047169301088012, 1, 0.001351538618109265],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348234255104954],
[199.0788267902576, 475.1698901708933, 0, 1, 0.2952602233898328, 0, 0.002104510451283757, 0.01747567266818411, 0.7047397766101672, 1, 0.001008943062237931],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001349664016816805],
[198.7743792573538, 475.7206561517871, 0, 1, 0.2947010264305053, 0, 0.002102073952578028, 0.01745544019378048, 0.7052989735694948, 1, 0.0008725077736151744],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.001347704082861459],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.00134758203796434],
[198.9046356716114, 475.528874881613, 1, 0, 0.2949210449351099, 0.005027534912011729, 0, -0.04174821483855794, 1, 0.2949210449351098, 0.0008440201807461315]
],
"NAMES": [
["Node53"],
["Node50"],
["Node47"],
["Node39"],
["Node43"],
["Node42"],
["Node648"],
["Node645"],
["Node642"],
["Node17"],
["Node74"],
["Node71"],
["Node63"],
["Node67"],
["Node66"],
["Node652"],
["Node655"],
["Node659"],
["Node665"],
["Node673"],
["Node678"],
["Node688"],
["Node698"],
["Node703"],
["Node708"],
["Node725"],
["Node755"],
["Node639"],
["Node85"],
["Node805"],
["Node636"],
["Node632"],
["Node627"],
["Node616"],
["Node613"],
["Node603"],
["Node598"],
["Node597"],
["Node609"],
["Node133"],
["Node113"],
["Node120"],
["Node119"],
["Node117"],
["Node130"],
["Node126"],
["Node138"],
["Node137"],
["Node391"],
["Node390"],
["Node204"],
["Node203"],
["Node194"],
["Node178"],
["Node184"],
["Node183"],
["Node227"],
["Node239"],
["Node238"],
["Node246"],
["Node245"],
["Node252"],
["Node251"],
["Node256"],
["Node267"],
["Node278"],
["Node380"],
["Node334"],
["Node333"],
["Node322"],
["Node321"],
["Node316"],
["Node313"],
["Node304"],
["Node303"],
["Node310"],
["Node329"],
["Node347"],
["Node352"],
["Node366"],
["Node371"],
["Node370"],
["Node404"],
["Node407"],
["Node422"],
["Node421"],
["Node420"],
["Node432"],
["Node429"],
["Node443"],
["Node457"],
["Node456"],
["Node452"],
["Node485"],
["Node484"],
["Node480"],
["Node479"],
["Node468"],
["Node467"],
["Node476"],
["Node516"],
["Node494"],
["Node497"],
["Node506"],
["Node505"],
["Node520"],
["Node527"],
["Node543"],
["Node539"],
["Node550"],
["Node557"],
["Node556"],
["Node563"]
],
"RESOLVED": [
[198.9253669891676, 475.5081435640568, 1, 0, 0.2949517837955488, 0.005027010959615092, 0, -0.04174386398319785, 1, 0.2949517837955489, 0.001186496284617831],
[198.5695306618971, 475.8639798913272, 0, 1, 0.2944241760748432, 0, 0.002101440836577648, 0.01745018285330167, 0.7055758239251568, 1, 0.00117995451068077],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001179938839810851],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001282690953517236],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 7.615425163034718e-05],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001272396917791961],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.00117995451068077],
[199.0908406827446, 475.3426698704798, 1, 0, 0.2951971359184605, 0.005022832776086976, 0, -0.04170916870875033, 1, 0.2951971359184604, 0.00117995451068077],
[198.9877888762842, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2951252021258937, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7048747978741063, 1, 0.001179938839810851],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001347885937804365],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001179923168940964],
[199.0908406827446, 475.3426698704798, 1, 0, 0.2951971359184605, 0.005022832776086976, 0, -0.04170916870875033, 1, 0.2951971359184604, 0.00117987615633146],
[198.9877888762842, 475.3639798913272, 0, 1, 0.2950801022438742, 0, 0.002103651185831559, 0.01746853740222783, 0.7049198977561258, 1, 0.001348553215128743],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 7.555884649766376e-05],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001272992424700543],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921526999, 0, -0.0417523917860435, 1, 0.2948915407638664, 0.00117995451068077],
[198.9253669891676, 475.5081435640568, 1, 0, 0.2949517837955488, 0.005027010959615093, 0, -0.04174386398319786, 1, 0.2949517837955488, 0.001186496284617831],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001078449019932987],
[198.598146688754, 475.7738390085539, 1, 0, 0.2944934708155195, 0.005035293715843254, 0, -0.04181264327414669, 1, 0.2944934708155195, 0.001348595050465968],
[198.9877888762842, 475.5072465328568, 0, 1, 0.2950174255257201, 0, 0.002103017372062072, 0.01746327426753473, 0.7049825744742799, 1, 0.001186826781868438],
[199.0788267902576, 475.1698901708933, 0, 1, 0.2952602233898328, 0, 0.002104510451283757, 0.01747567266818411, 0.7047397766101672, 1, 0.001186826781868438],
[199.0493137322007, 475.3841968210237, 0, 1, 0.2951355628354298, 0, 0.002103561722680672, 0.01746779450796479, 0.7048644371645703, 1, 0.001186826781868438],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001186826781868438],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001186826781868438],
[198.5695306618972, 475.8639798913272, 1, 0, 0.2944241760748432, 0.005036019356376948, 0, -0.04181866893034329, 1, 0.2944241760748432, 0.001186826781868438],
[198.598146688754, 475.7738390085539, 1, 0, 0.2944934708155194, 0.005035293715843255, 0, -0.04181264327414669, 1, 0.2944934708155194, 0.001348273206601389],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001348006578770827],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001186449010816086],
[198.8029952842107, 475.6305152690138, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001173185256075649],
[198.9060470906712, 475.5274634625532, 0, 1, 0.2949231376826346, 0, 0.002102927962811022, 0.01746253182085128, 0.7050768623173654, 1, 0.001348006582226375],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001173154092026488],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.0008625072255096881],
[198.9046356716114, 475.528874881613, 1, 0, 0.2949210449351099, 0.005027534912011729, 0, -0.04174821483855794, 1, 0.2949210449351098, 0.0008625072255096881],
[198.9877888762842, 475.5072465328568, 0, 1, 0.2950174255257201, 0, 0.002103017372062072, 0.01746327426753473, 0.7049825744742799, 1, 0.001144728658940121],
[198.8847370698237, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2949366063627748, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2949366063627747, 0.001023175589004712],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.001348600300711311],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.0007174436819261226],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006303735200769185],
[198.7743792573538, 475.7206561517871, 0, 1, 0.2947010264305053, 0, 0.002102073952578028, 0.01745544019378048, 0.7052989735694947, 1, 0.001348719680111219],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001130431434393883],
[199.1725824683576, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2953183365769894, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7046816634230106, 1, 0.001351358956769963],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 1, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0.002214001735179117, -0.0253462294901828, 0.912397850905533, 0.5043510554562538, 0.002698617458219138],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 1, 0.2959766022753602, 0, 0.002214001735179117, 0.01838487881453864, 0.7040233977246397, 1, 0.001348450701164202],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348594555368102],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.001216800891203394],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001350891071365153],
[189.0492144459451, 452.5073458191123, 0, 0, 0.2946727165689645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004755904615255011],
[198.5695306618971, 475.8639798913272, 1, 0, 0.2944241760748432, 0.005036019356376949, 0, -0.0418186689303433, 1, 0.2944241760748432, 0.000872675584161623],
[189.8025776700464, 451.7539825950111, 1, 0, 0.2958469906248483, 0.005268632345649196, 0, -0.04375026706349103, 1, 0.2958469906248482, 0.000585598874999848],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005718074195892629],
[189.7624621385621, 451.7940981264953, 0, 1, 0.2957844621839145, 0, 0.002213397660896437, 0.0183798626339704, 0.7042155378160855, 1, 0.0005810515760526851],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005698589227974229],
[198.9877888762842, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2951252021258937, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7048747978741063, 1, 0.001187854966678724],
[198.7757480223397, 475.5002162006822, 1, 2, 0.2947988043017252, 0.005030794802430393, 0.004206096930891638, -0.006848219757886199, 0.7905207622457617, 0.6492972915014659, 0.004042414429564494],
[190.09183448764, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2962027010717208, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002266507990047976],
[199.0908406827446, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2951520374022111, 0.005022832776086976, 0, -0.04170916870875033, 1, 0.2951520374022111, 0.001121803947491],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348321913156733],
[189.6796272617981, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2957503581613241, 0, 0, 0, 1, 1, 8.992386176219485e-05],
[198.8847370698237, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2949366063627749, 0.005028037921526999, 0, -0.0417523917860435, 1, 0.2949366063627749, 0.001258626495201675],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 7.27801171654996e-05],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.00127577145702357],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004875169421881455],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.0008611217977558018],
[199.3645201401272, 475.0689904130972, 0, 1, 0.295602927524453, 0, 0.002104957427615825, 0.01747938432096535, 0.7043970724755471, 1, 0.001348553240637664],
[198.9877888762842, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2951252021258937, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7048747978741063, 1, 0.001348450674263956],
[198.6605685758706, 475.5881483852804, 1, 0, 0.2946398911535743, 0.005033711557198576, 0, -0.04179950516567749, 1, 0.2946398911535743, 0.001348506453950492],
[198.7119573702373, 475.7215531829871, 0, 1, 0.2946353558369865, 0, 0.002102069988860371, 0.01745540727941207, 0.7053646441630135, 1, 0.001171016571076963],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003380071671389971],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.00101049641973991],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003854053629489637],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.0009630968003702272],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.00134830844675187],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001348298496160114],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004722265219434833],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.0008752696845787648],
[198.9877888762842, 475.405606145456, 1, 0, 0.2950618887212996, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950618887212997, 0.001349052408080908],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348553230434021],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.0008847853194973544],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348891055992111],
[199.1110576124411, 475.3224529407833, 0, 1, 0.295227112082723, 0, 0.002103834973107366, 0.01747006355586162, 0.704772887917277, 1, 0.001118033505044012],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 0, 0, 0.2959766022753602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006173596506144935],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002522523333480244],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001347939885055647],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001349226176403216],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004485151341831404],
[189.7826790682586, 451.7738811967988, 1, 0, 0.2958159744946734, 0.005269184758638235, 0, -0.04375485425314753, 1, 0.2958159744946733, 0.0006220268063749139],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 0, 0.2950443383411634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000276888963663553],
[190.3039890891061, 451.2525711759513, 0, 1, 0.2966285451285581, 0, 0.00221605385514819, 0.0184019194411763, 0.7033714548714418, 1, 0.001351532429925727],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.00134819197131337],
[198.8029952842107, 475.5689904130972, 0, 1, 0.2947972328338139, 0, 0.002102744333963748, 0.01746100698279431, 0.705202767166186, 1, 0.001348631314089759],
[190.132268347033, 451.4242919180244, 0, 0, 0.2963608824582518, 0, 0, 0, 1, 1, 7.068572646614468e-05],
[199.1110576124411, 475.3224529407833, 0, 1, 0.295227112082723, 0, 0.002103834973107366, 0.01747006355586162, 0.704772887917277, 1, 0.001277634324921026],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001348631318921549],
[189.6796272617981, 451.8769330032593, 0, 0, 0.2956553467139865, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000403627972434347],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.0009446543946883122],
[189.0492144459451, 452.5073458191123, 0, 0, 0.2946727165689645, 0, 0, 0, 1, 1, 3.395088455092742e-05],
[198.5695306618971, 475.8639798913272, 1, 0, 0.2944241760748432, 0.005036019356376949, 0, -0.0418186689303433, 1, 0.2944241760748432, 0.001314916349075492],
[188.8857308747191, 452.6708293903383, 0, 0, 0.2944178932511912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004721721682605562],
[198.4877888762842, 475.9457216769403, 0, 1, 0.2943029754163143, 0, 0.00210107992246808, 0.01744718585376845, 0.7056970245836858, 1, 0.0008755418219710123],
[198.9046356716114, 475.528874881613, 1, 0, 0.2949210449351099, 0.005027534912011729, 0, -0.04174821483855794, 1, 0.2949210449351098, 0.001348184083775041],
[198.8847370698237, 475.5487734834007, 1, 0, 0.2948915407638664, 0.005028037921527, 0, -0.04175239178604351, 1, 0.2948915407638664, 0.001348250515137569],
[199.1725824683576, 475.2609280848667, 0, 1, 0.2953183365769894, 0, 0.002104107324853415, 0.01747232514119215, 0.7046816634230106, 1, 0.0008737156452319057],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 0, 1, 0.2950443383411634, 0, 0.002103289512150639, 0.01746553409527984, 0.7049556616588366, 1, 0.001348306789969517],
[190.0705244667926, 451.4860357982648, 0, 1, 0.2962646417149338, 0, 0.002214907927843033, 0.01839240376000006, 0.7037353582850663, 1, 0.001347256287751857],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001351538571398865],
[199.1926374717408, 475.3893409164417, 0, 1, 0.2952830698911987, 0, 0.002103538960449196, 0.0174676054923644, 0.7047169301088012, 1, 0.001351538618109265],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.001348234255104954],
[199.0788267902576, 475.1698901708933, 0, 1, 0.2952602233898328, 0, 0.002104510451283757, 0.01747567266818411, 0.7047397766101672, 1, 0.001008943062237931],
[198.8029952842107, 475.6305152690137, 0, 1, 0.2947703401053375, 0, 0.002102472334926631, 0.01745874832632823, 0.7052296598946625, 1, 0.001349664016816805],
[198.7743792573538, 475.7206561517871, 0, 1, 0.2947010264305053, 0, 0.002102073952578028, 0.01745544019378048, 0.7052989735694948, 1, 0.0008725077736151744],
[189.8857308747191, 451.6708293903383, 1, 0, 0.2959766022753602, 0.005266325149306611, 0, -0.04373110830472144, 1, 0.2959766022753603, 0.001347704082861459],
[198.9877888762842, 475.4457216769403, 1, 0, 0.2950443383411634, 0.005025434000986492, 0, -0.04173076905521216, 1, 0.2950443383411634, 0.00134758203796434],
[198.9046356716114, 475.528874881613, 1, 0, 0.2949210449351099, 0.005027534912011729, 0, -0.04174821483855794, 1, 0.2949210449351098, 0.0008440201807461315]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.6338209194872499, 2.364356305191415, 0, 3, 0.211402085997495, 0, 1.268844291113358, 10.53637319067008, 0.4904185306835983, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9994052281009226, 2.000594771899081, 0, 1, 0.3331350760336405, 0, 0.499851351231285, 4.150722364690063, 0.6668649239663595, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 2.112887276296528, 0, 0, 0.1680584884440156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 2.15140131799006, 0, 0, 0.204088007064437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 2.276245092223157, 0, 0, 0.1579019903856459, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9990850045216769, 2.000914995478326, 0, 1, 0.3330283348405587, 0, 0.499771355734653, 4.150058089008648, 0.6669716651594413, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.611820559132197, 0, 0, 0.2549883065583755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.836516428774028, 1.163483571225975, 0, 0, 0.6121721429246755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.004694115428229, 1.995305884571773, 0, 1, 0.3348980384760761, 0, 0.5011762896768166, 4.161724538884768, 0.665101961523924, 1, 0.1204251470740345],
[0.4483369879062229, 2.551663012093778, 0, 0, 0.1494456626354076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.836516428774028, 1.163483571225975, 0, 0, 0.6121721429246755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355067158369049, 2.164493284163096, 1, 0, 0.2785022386123015, 1.196878470328424, 0, -9.938775242621142, 1, 0.2785022386123015, 0.1204251470740345],
[0.9986764740399846, 2.001323525960018, 0, 1, 0.3328921580133278, 0, 0.499669337330309, 4.149210937007403, 0.6671078419866722, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.247122310842359, 0, 1, 0.2190808411006378, 0, 0.4450136048113636, 3.695354463945806, 0.7809191588993621, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.832852254822884, 1.165078448542533, 1, 0, 0.6113724552623451, 0.5455977138193466, 0, -4.53059620084106, 1, 0.6113724552623451, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.611820559132197, 0, 0, 0.2549883065583755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2396630719154307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 8.30391346240352, 0.4444444444444445, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355067024268199, 2.164493297573181, 1, 0, 0.2785022341422732, 1.196878489538614, 0, -9.938775402140894, 1, 0.2785022341422732, 0.1204251470740345],
[0.5782205558507385, 2.421779444149263, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5782205558507385, 2.421779444149263, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.054841940353122, 1.822797404759223, 0, 1, 0.3665650256501968, 0, 0.5486073204784335, 4.555587714093991, 0.6334349743498032, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2396630719154307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4483369879062229, 2.551663012093778, 0, 0, 0.1494456626354076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 2.276245092223157, 0, 0, 0.1579019903856459, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7549150403305616, 2.245084959669441, 0, 1, 0.2516383467768536, 0, 0.4454174420852371, 3.698707893720945, 0.7483616532231463, 1, 0.1204251470740345],
[0.8352165210764055, 2.164783478923596, 1, 0, 0.2784055070254684, 1.197294324005021, 0, -9.942228455564624, 1, 0.2784055070254684, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.832394365711354, 1.167605634288649, 1, 0, 0.610798121903784, 0.5457340508749, 0, -4.531728331952094, 1, 0.610798121903784, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000897206580971, 1.997281595857565, 1, 1, 0.3338350620606423, 0.9991035976770923, 0.5006805260079682, -4.138862054805759, 0.8885541513389672, 0.5562242754602517, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2191253767734476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.9981997354962376, 2.001800264503765, 0, 1, 0.3327332451654122, 0, 0.4995503386287614, 4.148222782087613, 0.6672667548345879, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -4.15195673120176, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8352854785083361, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2946036597865923, 1.19719548074248, 0, -9.941407669666145, 1, 0.2946036597865923, 0.1204251470740345],
[0.7030643300838357, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2600990003304988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4483369879062229, 2.551663012093778, 0, 0, 0.1494456626354076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9191733783663423, 2.080826621633659, 1, 0, 0.3063911261221139, 1.087934032399102, 0, -9.034110057845858, 1, 0.3063911261221139, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[0.9979305117662834, 2.001380476434275, 0, 1, 0.3327199199056692, 0, 0.4996551189415182, 4.149092868737309, 0.6672800800943308, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.9193645827559984, 2.080635417244003, 1, 0, 0.306454860918666, 1.087707769862397, 0, -9.032231193321277, 1, 0.3064548609186659, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.247143818650408, 0, 1, 0.2190792036181219, 0, 0.4450093455080151, 3.69531909505939, 0.7809207963818781, 1, 0.1204251470740345],
[0.9979310224787238, 2.002068977521279, 0, 1, 0.3326436741595742, 0, 0.4994832901502123, 4.147666017323956, 0.6673563258404258, 1, 0.1204251470740345],
[1.000762731654774, 1.997689035129836, 0, 1, 0.3337598232330222, 0, 0.5005784095596274, 4.156759794130737, 0.6662401767669779, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.05568585214368, 1.8217101976965, 0, 1, 0.3668893102853589, 0, 0.5489347324642915, 4.558306514891109, 0.633110689714641, 1, 0.1204251470740345],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.000000000000002, 0, 0, 0.294909777460932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9979289270736249, 2.002071072926378, 0, 1, 0.3326429756912079, 0, 0.4994827673816417, 4.147661676298985, 0.6673570243087921, 1, 0.1204251470740345],
[0.8353626363604012, 2.1646373636396, 1, 0, 0.2784542121201336, 1.19708490238073, 0, -9.940489436519357, 1, 0.2784542121201337, 0.1204251470740345],
[0.7030643300838357, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2600990003304988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.83018184679892, 1.169818153201083, 1, 0, 0.6100606155996394, 0.5463937923704414, 0, -4.537206768238627, 1, 0.6100606155996394, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.004218738187570905, 2.995781261812431, 0, 1, 0.001406246062523634, 0, 0.3338027421251061, 2.771869084119882, 0.9985937539374764, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.836516428774028, 0, 0, 0.352545111269534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8353626859344117, 2.164637314065589, 1, 0, 0.2784542286448038, 1.197084831340569, 0, -9.940488846608009, 1, 0.2784542286448037, 0.1204251470740345],
[0.6314224751498455, 2.368577524850157, 1, 0, 0.2104741583832817, 1.583725697699762, 0, -13.15112114188348, 1, 0.2104741583832817, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8350326663941681, 2.164967333605833, 1, 0, 0.2783442221313892, 1.197557940239862, 0, -9.944417501966035, 1, 0.2783442221313892, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8353001479395625, 2.164699852060439, 1, 0, 0.2784333826465207, 1.197174455753064, 0, -9.94123307997349, 1, 0.2784333826465207, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.36751797310684, 0, 1, 0.2102826450078849, 0, 0.4223832770687366, 3.507434180745201, 0.789717354992115, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.832152975306681, 1.167158031420855, 1, 0, 0.6108579507750653, 0.545805952602081, 0, -4.532325397672403, 1, 0.6108579507750653, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.7030643300838357, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2600990003304988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.836516428774028, 1.163483571225975, 0, 0, 0.6121721429246755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5510479965514087, 1.988658517605799, 1, 0, 0.2169731004270279, 1.81472395555059, 0, -15.06931068504272, 1, 0.2169731004270279, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9197689370315971, 2.080231062968405, 0, 0, 0.3065896456771989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[0.9197689370315971, 2.080231062968405, 0, 0, 0.3065896456771989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9979295989441167, 2.002070401055887, 0, 1, 0.3326431996480386, 0, 0.4994829350019873, 4.147663068203829, 0.6673568003519614, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7546069612242541, 2.245393038775748, 0, 1, 0.2515356537414179, 0, 0.4453563285941371, 3.698200412579465, 0.748464346258582, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.367776556201418, 0, 1, 0.2102645088829326, 0, 0.4223371489091362, 3.5070511364997, 0.7897354911170674, 1, 0.1204251470740345],
[1.832418234346315, 1.167581765653687, 0, 1, 0.610806078115438, 0, 0.8564710664525805, 7.112061618874691, 0.389193921884562, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2191253767734476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355067292469898, 2.164493270753011, 1, 0, 0.2785022430823298, 1.196878451118235, 0, -9.938775083101397, 1, 0.2785022430823298, 0.1204251470740345],
[0.9188380199451038, 2.081161980054898, 1, 0, 0.3062793399817011, 1.088331107652408, 0, -9.037407336387373, 1, 0.3062793399817011, 0.1204251470740345],
[0.4291182658822523, 2.27561232758069, 0, 1, 0.1586547166358776, 0, 0.4394421615140162, 3.649089680943945, 0.8413452833641224, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.827351240394721, 1.171959930761907, 2, 0, 0.60925697138988, 1.094480336231356, 0, -9.088469998367502, 1, 0.371194057187169, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5510479965514087, 2.152016333532429, 1, 0, 0.2038604817571314, 1.81472395555059, 0, -15.06931068504272, 1, 0.2038604817571313, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.919186143615581, 2.080813856384421, 1, 0, 0.3063953812051935, 1.087918923654072, 0, -9.033984596134603, 1, 0.3063953812051935, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.836516428774028, 0, 0, 0.352545111269534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.083252508257571, 1.080231062968404, 0, 0, 0.5006982824666089, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9924439114142286, 2.007556088585774, 1, 1, 0.3308146371380759, 1.007613617755994, 0.4981180878011988, -4.230806790226042, 0.8905616758552033, 0.5521909501313549, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6317606860925741, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2400524825190549, 1.582877855513577, 0, -13.14408073373962, 1, 0.2400524825190549, 0.1204251470740345],
[0.8330572002030001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2940488459404588, 1.2003977635105, 0, -9.967999148653927, 1, 0.2940488459404588, 0.1204251470740345],
[3.608137258466203, 13.5622176315295, 0, 0, 0.2101376052843545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.312406332227886, 12.85794855776782, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[5.72345162999857, 11.44690325999714, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.787761317787281, 12.38259357220843, 0, 0, 0.278838809591342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.787761317787281, 12.38259357220843, 0, 0, 0.278838809591342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[5.72345162999857, 11.44690325999714, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[5.72345162999857, 11.44690325999714, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[3.608137258466203, 12.85794855776782, 0, 0, 0.2191253767734476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.787761317787281, 12.38259357220843, 0, 0, 0.278838809591342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[3.309417382882587, 13.86093750711312, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[4.649499420088095, 9.349170387078226, 0, 2, 0.3321386591823091, 0, 0.2139227243910605, 9.744301457661082, 0.446038770558804, 1, 0.02195362338907034],
[0.5516630120937778, 2.15140131799006, 0, 0, 0.204088007064437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.057232053713743, 1.819718234453215, 0, 0, 0.3674836016674296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.916298100932743, 1, 0, 0.3429004736107611, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.342900473610761, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 1.736664333365294, 0, 0, 0.1972833274711746, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355125217714008, 2.164487478228601, 1, 0, 0.2785041739238001, 1.196870153280125, 0, -9.938706178571802, 1, 0.2785041739238001, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.836516428774028, 0, 0, 0.352545111269534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8356408633681698, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2946920656149651, 1.196686332414809, 0, -9.937179746013641, 1, 0.2946920656149652, 0.1204251470740345],
[0.6324864896817423, 2.36751351031826, 0, 1, 0.2108288298939139, 0, 0.4223840732657834, 3.507440792296577, 0.7891711701060861, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.000000000000002, 0, 0, 0.294909777460932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5782205558507385, 2.421779444149263, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8352977703476681, 2.164702229652333, 1, 0, 0.2784325901158892, 1.197177863390895, 0, -9.941261376703149, 1, 0.2784325901158893, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2396630719154307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 2.15140131799006, 0, 0, 0.204088007064437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9973178088442994, 2.002682191155703, 0, 1, 0.3324392696147662, 0, 0.4993303502753586, 4.14639601783822, 0.6675607303852338, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.162568204705966, 0, 1, 0.2789239154626235, 0, 0.4624131612699657, 3.839838875062243, 0.7210760845373765, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6314225422002701, 2.368577457799732, 1, 0, 0.2104741807334232, 1.583725529524771, 0, -13.15111974537291, 1, 0.2104741807334232, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6310191621895763, 2.368980837810426, 0, 1, 0.2103397207298586, 0, 0.4221224520010337, 3.505268311954171, 0.7896602792701414, 1, 0.1204251470740345],
[0.8350172607876492, 2.164982739212352, 1, 0, 0.2783390869292163, 1.197580034521355, 0, -9.94460097096756, 1, 0.2783390869292164, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.057232053713743, 1.819718234453215, 0, 0, 0.3674836016674296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 1.736664333365294, 0, 0, 0.1972833274711746, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345]
],
"RESOLVED": [
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.6338209194872499, 2.364356305191415, 0, 3, 0.211402085997495, 0, 1.268844291113358, 10.53637319067008, 0.4904185306835983, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9994052281009226, 2.000594771899081, 0, 1, 0.3331350760336405, 0, 0.499851351231285, 4.150722364690063, 0.6668649239663595, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 2.112887276296528, 0, 0, 0.1680584884440156, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 2.15140131799006, 0, 0, 0.204088007064437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 2.276245092223157, 0, 0, 0.1579019903856459, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9990850045216769, 2.000914995478326, 0, 1, 0.3330283348405587, 0, 0.499771355734653, 4.150058089008648, 0.6669716651594413, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.611820559132197, 0, 0, 0.2549883065583755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.836516428774028, 1.163483571225975, 0, 0, 0.6121721429246755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.004694115428229, 1.995305884571773, 0, 1, 0.3348980384760761, 0, 0.5011762896768166, 4.161724538884768, 0.665101961523924, 1, 0.1204251470740345],
[0.4483369879062229, 2.551663012093778, 0, 0, 0.1494456626354076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.836516428774028, 1.163483571225975, 0, 0, 0.6121721429246755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355067158369049, 2.164493284163096, 1, 0, 0.2785022386123015, 1.196878470328424, 0, -9.938775242621142, 1, 0.2785022386123015, 0.1204251470740345],
[0.9986764740399846, 2.001323525960018, 0, 1, 0.3328921580133278, 0, 0.499669337330309, 4.149210937007403, 0.6671078419866722, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.247122310842359, 0, 1, 0.2190808411006378, 0, 0.4450136048113636, 3.695354463945806, 0.7809191588993621, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.832852254822884, 1.165078448542533, 1, 0, 0.6113724552623451, 0.5455977138193466, 0, -4.53059620084106, 1, 0.6113724552623451, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.611820559132197, 0, 0, 0.2549883065583755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2396630719154307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999989, 8.30391346240352, 0.4444444444444445, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355067024268199, 2.164493297573181, 1, 0, 0.2785022341422732, 1.196878489538614, 0, -9.938775402140894, 1, 0.2785022341422732, 0.1204251470740345],
[0.5782205558507385, 2.421779444149263, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5782205558507385, 2.421779444149263, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.054841940353122, 1.822797404759223, 0, 1, 0.3665650256501968, 0, 0.5486073204784335, 4.555587714093991, 0.6334349743498032, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2396630719154307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4483369879062229, 2.551663012093778, 0, 0, 0.1494456626354076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 2.276245092223157, 0, 0, 0.1579019903856459, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7549150403305616, 2.245084959669441, 0, 1, 0.2516383467768536, 0, 0.4454174420852371, 3.698707893720945, 0.7483616532231463, 1, 0.1204251470740345],
[0.8352165210764055, 2.164783478923596, 1, 0, 0.2784055070254684, 1.197294324005021, 0, -9.942228455564624, 1, 0.2784055070254684, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.832394365711354, 1.167605634288649, 1, 0, 0.610798121903784, 0.5457340508749, 0, -4.531728331952094, 1, 0.610798121903784, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000897206580971, 1.997281595857565, 1, 1, 0.3338350620606423, 0.9991035976770923, 0.5006805260079682, -4.138862054805759, 0.8885541513389672, 0.5562242754602517, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2191253767734476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.9981997354962376, 2.001800264503765, 0, 1, 0.3327332451654122, 0, 0.4995503386287614, 4.148222782087613, 0.6672667548345879, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -4.15195673120176, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8352854785083361, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2946036597865923, 1.19719548074248, 0, -9.941407669666145, 1, 0.2946036597865923, 0.1204251470740345],
[0.7030643300838357, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2600990003304988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4483369879062229, 2.551663012093778, 0, 0, 0.1494456626354076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9191733783663423, 2.080826621633659, 1, 0, 0.3063911261221139, 1.087934032399102, 0, -9.034110057845858, 1, 0.3063911261221139, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[0.9979305117662834, 2.001380476434275, 0, 1, 0.3327199199056692, 0, 0.4996551189415182, 4.149092868737309, 0.6672800800943308, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.9193645827559984, 2.080635417244003, 1, 0, 0.306454860918666, 1.087707769862397, 0, -9.032231193321277, 1, 0.3064548609186659, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.247143818650408, 0, 1, 0.2190792036181219, 0, 0.4450093455080151, 3.69531909505939, 0.7809207963818781, 1, 0.1204251470740345],
[0.9979310224787238, 2.002068977521279, 0, 1, 0.3326436741595742, 0, 0.4994832901502123, 4.147666017323956, 0.6673563258404258, 1, 0.1204251470740345],
[1.000762731654774, 1.997689035129836, 0, 1, 0.3337598232330222, 0, 0.5005784095596274, 4.156759794130737, 0.6662401767669779, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.05568585214368, 1.8217101976965, 0, 1, 0.3668893102853589, 0, 0.5489347324642915, 4.558306514891109, 0.633110689714641, 1, 0.1204251470740345],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.000000000000002, 0, 0, 0.294909777460932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9979289270736249, 2.002071072926378, 0, 1, 0.3326429756912079, 0, 0.4994827673816417, 4.147661676298985, 0.6673570243087921, 1, 0.1204251470740345],
[0.8353626363604012, 2.1646373636396, 1, 0, 0.2784542121201336, 1.19708490238073, 0, -9.940489436519357, 1, 0.2784542121201337, 0.1204251470740345],
[0.7030643300838357, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2600990003304988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.83018184679892, 1.169818153201083, 1, 0, 0.6100606155996394, 0.5463937923704414, 0, -4.537206768238627, 1, 0.6100606155996394, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.004218738187570905, 2.995781261812431, 0, 1, 0.001406246062523634, 0, 0.3338027421251061, 2.771869084119882, 0.9985937539374764, 1, 0.1204251470740345],
[0, 2.146361524278639, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.836516428774028, 0, 0, 0.352545111269534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8353626859344117, 2.164637314065589, 1, 0, 0.2784542286448038, 1.197084831340569, 0, -9.940488846608009, 1, 0.2784542286448037, 0.1204251470740345],
[0.6314224751498455, 2.368577524850157, 1, 0, 0.2104741583832817, 1.583725697699762, 0, -13.15112114188348, 1, 0.2104741583832817, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8350326663941681, 2.164967333605833, 1, 0, 0.2783442221313892, 1.197557940239862, 0, -9.944417501966035, 1, 0.2783442221313892, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8353001479395625, 2.164699852060439, 1, 0, 0.2784333826465207, 1.197174455753064, 0, -9.94123307997349, 1, 0.2784333826465207, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.36751797310684, 0, 1, 0.2102826450078849, 0, 0.4223832770687366, 3.507434180745201, 0.789717354992115, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.832152975306681, 1.167158031420855, 1, 0, 0.6108579507750653, 0.545805952602081, 0, -4.532325397672403, 1, 0.6108579507750653, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[0.7030643300838357, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2600990003304988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.836516428774028, 1.163483571225975, 0, 0, 0.6121721429246755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5510479965514087, 1.988658517605799, 1, 0, 0.2169731004270279, 1.81472395555059, 0, -15.06931068504272, 1, 0.2169731004270279, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9197689370315971, 2.080231062968405, 0, 0, 0.3065896456771989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[0.9197689370315971, 2.080231062968405, 0, 0, 0.3065896456771989, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9979295989441167, 2.002070401055887, 0, 1, 0.3326431996480386, 0, 0.4994829350019873, 4.147663068203829, 0.6673568003519614, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7546069612242541, 2.245393038775748, 0, 1, 0.2515356537414179, 0, 0.4453563285941371, 3.698200412579465, 0.748464346258582, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.367776556201418, 0, 1, 0.2102645088829326, 0, 0.4223371489091362, 3.5070511364997, 0.7897354911170674, 1, 0.1204251470740345],
[1.832418234346315, 1.167581765653687, 0, 1, 0.610806078115438, 0, 0.8564710664525805, 7.112061618874691, 0.389193921884562, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2191253767734476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355067292469898, 2.164493270753011, 1, 0, 0.2785022430823298, 1.196878451118235, 0, -9.938775083101397, 1, 0.2785022430823298, 0.1204251470740345],
[0.9188380199451038, 2.081161980054898, 1, 0, 0.3062793399817011, 1.088331107652408, 0, -9.037407336387373, 1, 0.3062793399817011, 0.1204251470740345],
[0.4291182658822523, 2.27561232758069, 0, 1, 0.1586547166358776, 0, 0.4394421615140162, 3.649089680943945, 0.8413452833641224, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.827351240394721, 1.171959930761907, 2, 0, 0.60925697138988, 1.094480336231356, 0, -9.088469998367502, 1, 0.371194057187169, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5510479965514087, 2.152016333532429, 1, 0, 0.2038604817571314, 1.81472395555059, 0, -15.06931068504272, 1, 0.2038604817571313, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 1.98804350206343, 0, 0, 0.2172152605108568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.919186143615581, 2.080813856384421, 1, 0, 0.3063953812051935, 1.087918923654072, 0, -9.033984596134603, 1, 0.3063953812051935, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -16.60782692480704, 1, 0.1111111111111109, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.836516428774028, 0, 0, 0.352545111269534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.083252508257571, 1.080231062968404, 0, 0, 0.5006982824666089, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9924439114142286, 2.007556088585774, 1, 1, 0.3308146371380759, 1.007613617755994, 0.4981180878011988, -4.230806790226042, 0.8905616758552033, 0.5521909501313549, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6317606860925741, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2400524825190549, 1.582877855513577, 0, -13.14408073373962, 1, 0.2400524825190549, 0.1204251470740345],
[0.8330572002030001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2940488459404588, 1.2003977635105, 0, -9.967999148653927, 1, 0.2940488459404588, 0.1204251470740345],
[3.608137258466203, 13.5622176315295, 0, 0, 0.2101376052843545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.312406332227886, 12.85794855776782, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[5.72345162999857, 11.44690325999714, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.787761317787281, 12.38259357220843, 0, 0, 0.278838809591342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.787761317787281, 12.38259357220843, 0, 0, 0.278838809591342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[5.72345162999857, 11.44690325999714, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[5.72345162999857, 11.44690325999714, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[3.608137258466203, 12.85794855776782, 0, 0, 0.2191253767734476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[4.787761317787281, 12.38259357220843, 0, 0, 0.278838809591342, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[3.309417382882587, 13.86093750711312, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01791120895950584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0.1204251470740345],
[4.649499420088095, 9.349170387078226, 0, 2, 0.3321386591823091, 0, 0.2139227243910605, 9.744301457661082, 0.446038770558804, 1, 0.02195362338907034],
[0.5516630120937778, 2.15140131799006, 0, 0, 0.204088007064437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.057232053713743, 1.819718234453215, 0, 0, 0.3674836016674296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.539706514157206, 0, 0, 0.3937462830550118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.916298100932743, 1, 0, 0.3429004736107611, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.342900473610761, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 1.736664333365294, 0, 0, 0.1972833274711746, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8355125217714008, 2.164487478228601, 1, 0, 0.2785041739238001, 1.196870153280125, 0, -9.938706178571802, 1, 0.2785041739238001, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 1.836516428774028, 0, 0, 0.352545111269534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.15195673120176, 0.6666666666666667, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8356408633681698, 2.000000000000002, 1, 0, 0.2946920656149651, 1.196686332414809, 0, -9.937179746013641, 1, 0.2946920656149652, 0.1204251470740345],
[0.6324864896817423, 2.36751351031826, 0, 1, 0.2108288298939139, 0, 0.4223840732657834, 3.507440792296577, 0.7891711701060861, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.000000000000002, 0, 0, 0.294909777460932, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5782205558507385, 2.421779444149263, 0, 0, 0.1927401852835794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.30391346240352, 1, 0.3333333333333333, 0.1204251470740345],
[0.8352977703476681, 2.164702229652333, 1, 0, 0.2784325901158892, 1.197177863390895, 0, -9.941261376703149, 1, 0.2784325901158893, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2396630719154307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.5516630120937778, 2.15140131799006, 0, 0, 0.204088007064437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.182075827946841, 1.448336987906223, 0, 0, 0.4493879518920623, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.9973178088442994, 2.002682191155703, 0, 1, 0.3324392696147662, 0, 0.4993303502753586, 4.14639601783822, 0.6675607303852338, 1, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.162568204705966, 0, 1, 0.2789239154626235, 0, 0.4624131612699657, 3.839838875062243, 0.7210760845373765, 1, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6314225422002701, 2.368577457799732, 1, 0, 0.2104741807334232, 1.583725529524771, 0, -13.15111974537291, 1, 0.2104741807334232, 0.1204251470740345],
[0.8365164287740263, 2.163483571225975, 0, 0, 0.2788388095913419, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.6310191621895763, 2.368980837810426, 0, 1, 0.2103397207298586, 0, 0.4221224520010337, 3.505268311954171, 0.7896602792701414, 1, 0.1204251470740345],
[0.8350172607876492, 2.164982739212352, 1, 0, 0.2783390869292163, 1.197580034521355, 0, -9.94460097096756, 1, 0.2783390869292164, 0.1204251470740345],
[0.6304128158530637, 2.369587184146939, 0, 0, 0.2101376052843544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.7534625276861064, 2.246537472313896, 0, 0, 0.2511541758953686, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.057232053713743, 1.819718234453215, 0, 0, 0.3674836016674296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345],
[0.4268192378606803, 1.736664333365294, 0, 0, 0.1972833274711746, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1204251470740345]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node113":{
"Global MG94xREV":0.001351358956769963,
"Nucleotide GTR":0.001506290505380955,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "T", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.001348594555368102,
"Nucleotide GTR":0.001503209168950078,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node119":{
"Global MG94xREV":0.001348450701164202,
"Nucleotide GTR":0.001503048822048609,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.002698617458219138,
"Nucleotide GTR":0.003008010443566201,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node126":{
"Global MG94xREV":0.001350891071365153,
"Nucleotide GTR":0.001505768977522394,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.001216800891203394,
"Nucleotide GTR":0.001356305532424689,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node133":{
"Global MG94xREV":0.001130431434393883,
"Nucleotide GTR":0.001260033929609373,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node137":{
"Global MG94xREV":0.000872675584161623,
"Nucleotide GTR":0.0009727267060429104,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node138":{
"Global MG94xREV":0.0004755904615255011,
"Nucleotide GTR":0.0005301162900180895,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node17":{
"Global MG94xREV":0.001347885937804365,
"Nucleotide GTR":0.001502419309303346,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node178":{
"Global MG94xREV":0.004042414429564494,
"Nucleotide GTR":0.004505871991718688,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node183":{
"Global MG94xREV":0.001121803947491,
"Nucleotide GTR":0.001250417312542526,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node184":{
"Global MG94xREV":0.0002266507990047976,
"Nucleotide GTR":0.0002526360186296892,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node194":{
"Global MG94xREV":0.001187854966678724,
"Nucleotide GTR":0.001324040995261891,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node203":{
"Global MG94xREV":0.0005698589227974229,
"Nucleotide GTR":0.0006351925078944769,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.0005810515760526851,
"Nucleotide GTR":0.0006476683843031555,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node227":{
"Global MG94xREV":0.001348321913156733,
"Nucleotide GTR":0.001502905268663414,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node238":{
"Global MG94xREV":0.001258626495201675,
"Nucleotide GTR":0.001402926387578543,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node239":{
"Global MG94xREV":8.992386176219485e-05,
"Nucleotide GTR":0.000100233515677686,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.00127577145702357,
"Nucleotide GTR":0.001422036996997348,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node246":{
"Global MG94xREV":7.27801171654996e-05,
"Nucleotide GTR":8.112426303736488e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node251":{
"Global MG94xREV":0.0008611217977558018,
"Nucleotide GTR":0.0009598482930371726,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node252":{
"Global MG94xREV":0.0004875169421881455,
"Nucleotide GTR":0.0005434101261929654,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node256":{
"Global MG94xREV":0.001348553240637664,
"Nucleotide GTR":0.001503163117539476,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node267":{
"Global MG94xREV":0.001348450674263956,
"Nucleotide GTR":0.001503048792064283,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node278":{
"Global MG94xREV":0.001348506453950492,
"Nucleotide GTR":0.001503110966819409,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node303":{
"Global MG94xREV":0.0008752696845787648,
"Nucleotide GTR":0.000975618216702436,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node304":{
"Global MG94xREV":0.0004722265219434833,
"Nucleotide GTR":0.0005263666791336655,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node310":{
"Global MG94xREV":0.001349052408080908,
"Nucleotide GTR":0.001503719513881535,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node313":{
"Global MG94xREV":0.001348298496160114,
"Nucleotide GTR":0.001502879166938557,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node316":{
"Global MG94xREV":0.00134830844675187,
"Nucleotide GTR":0.00150289025835273,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.0009630968003702272,
"Nucleotide GTR":0.001073514597208089,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node322":{
"Global MG94xREV":0.0003854053629489637,
"Nucleotide GTR":0.0004295915870647144,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node329":{
"Global MG94xREV":0.001348553230434021,
"Nucleotide GTR":0.001503163106165999,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node333":{
"Global MG94xREV":0.00101049641973991,
"Nucleotide GTR":0.001126348521353514,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.0003380071671389971,
"Nucleotide GTR":0.0003767592496882778,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node347":{
"Global MG94xREV":0.0008847853194973544,
"Nucleotide GTR":0.0009862248068010458,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "T", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "ACT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node352":{
"Global MG94xREV":0.001348891055992111,
"Nucleotide GTR":0.001503539662985396,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node366":{
"Global MG94xREV":0.001118033505044012,
"Nucleotide GTR":0.001246214593767821,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node370":{
"Global MG94xREV":0.0002522523333480244,
"Nucleotide GTR":0.0002811727356220134,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node371":{
"Global MG94xREV":0.0006173596506144935,
"Nucleotide GTR":0.0006881391324394145,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node380":{
"Global MG94xREV":0.001171016571076963,
"Nucleotide GTR":0.001305272099482042,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node39":{
"Global MG94xREV":0.001282690953517236,
"Nucleotide GTR":0.001429749804773708,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.0005718074195892629,
"Nucleotide GTR":0.0006373643973118747,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node391":{
"Global MG94xREV":0.000585598874999848,
"Nucleotide GTR":0.0006527370251664325,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node404":{
"Global MG94xREV":0.001347939885055647,
"Nucleotide GTR":0.001502479441536898,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node407":{
"Global MG94xREV":0.001349226176403216,
"Nucleotide GTR":0.001503913204516221,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node42":{
"Global MG94xREV":0.001272396917791961,
"Nucleotide GTR":0.001418275571227282,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node420":{
"Global MG94xREV":0.000276888963663553,
"Nucleotide GTR":0.0003086339235935364,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node421":{
"Global MG94xREV":0.0006220268063749139,
"Nucleotide GTR":0.0006933413715438628,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node422":{
"Global MG94xREV":0.0004485151341831404,
"Nucleotide GTR":0.0004999368115741384,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node429":{
"Global MG94xREV":0.00134819197131337,
"Nucleotide GTR":0.001502760429156538,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node43":{
"Global MG94xREV":7.615425163034718e-05,
"Nucleotide GTR":8.488523763468924e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node432":{
"Global MG94xREV":0.001351532429925727,
"Nucleotide GTR":0.001506483867008638,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node443":{
"Global MG94xREV":0.001348631314089759,
"Nucleotide GTR":0.001503250142011415,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node452":{
"Global MG94xREV":0.001348631318921549,
"Nucleotide GTR":0.001503250147397163,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node456":{
"Global MG94xREV":0.001277634324921026,
"Nucleotide GTR":0.001424113440278878,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node457":{
"Global MG94xREV":7.068572646614468e-05,
"Nucleotide GTR":7.878975316551179e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node467":{
"Global MG94xREV":0.0008755418219710123,
"Nucleotide GTR":0.0009759215542931236,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node468":{
"Global MG94xREV":0.0004721721682605562,
"Nucleotide GTR":0.000526306093871611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node47":{
"Global MG94xREV":0.001179938839810851,
"Nucleotide GTR":0.001315217294733818,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node476":{
"Global MG94xREV":0.001348184083775041,
"Nucleotide GTR":0.001502751637322189,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node479":{
"Global MG94xREV":0.001314916349075492,
"Nucleotide GTR":0.001465669800063165,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node480":{
"Global MG94xREV":3.395088455092742e-05,
"Nucleotide GTR":3.784330935326184e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node484":{
"Global MG94xREV":0.0009446543946883122,
"Nucleotide GTR":0.001052957793676441,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node485":{
"Global MG94xREV":0.000403627972434347,
"Nucleotide GTR":0.0004499033950514725,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node494":{
"Global MG94xREV":0.0008737156452319057,
"Nucleotide GTR":0.0009738860087635802,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node497":{
"Global MG94xREV":0.001348306789969517,
"Nucleotide GTR":0.001502888411622432,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.00117995451068077,
"Nucleotide GTR":0.001315234762248611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "P", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CCA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":0.001351538571398865,
"Nucleotide GTR":0.001506490712593691,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node506":{
"Global MG94xREV":0.001347256287751857,
"Nucleotide GTR":0.001501717470690407,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node516":{
"Global MG94xREV":0.001348250515137569,
"Nucleotide GTR":0.001502825684954118,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node520":{
"Global MG94xREV":0.001351538618109265,
"Nucleotide GTR":0.001506490764659378,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node527":{
"Global MG94xREV":0.001348234255104954,
"Nucleotide GTR":0.001502807560729889,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node53":{
"Global MG94xREV":0.001186496284617831,
"Nucleotide GTR":0.001322526542068014,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node537":{
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "N", "I", "G", "S", "F", "A", "A", "C", "S", "R", "-", "L", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAT", "ATT", "GGG", "AGC", "TTC", "GCA", "GCG", "TGT", "AGC", "AGG", "---", "CTC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.001349664016816805,
"Nucleotide GTR":0.001504401242764355,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node543":{
"Global MG94xREV":0.001008943062237931,
"Nucleotide GTR":0.001124617073432167,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "L", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "TTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node550":{
"Global MG94xREV":0.0008725077736151744,
"Nucleotide GTR":0.0009725396562353452,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node556":{
"Global MG94xREV":0.00134758203796434,
"Nucleotide GTR":0.001502080567741511,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node557":{
"Global MG94xREV":0.001347704082861459,
"Nucleotide GTR":0.001502216604927517,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node563":{
"Global MG94xREV":0.0008440201807461315,
"Nucleotide GTR":0.0009407859978569944,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node597":{
"Global MG94xREV":0.0006303735200769185,
"Nucleotide GTR":0.0007026450251271525,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node598":{
"Global MG94xREV":0.0007174436819261226,
"Nucleotide GTR":0.0007996976679045544,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node603":{
"Global MG94xREV":0.001348600300711311,
"Nucleotide GTR":0.001503215572989424,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node609":{
"Global MG94xREV":0.001348719680111219,
"Nucleotide GTR":0.001503348639082424,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node613":{
"Global MG94xREV":0.001023175589004712,
"Nucleotide GTR":0.001140481340900838,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node616":{
"Global MG94xREV":0.001144728658940121,
"Nucleotide GTR":0.001275970312373858,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node627":{
"Global MG94xREV":0.0008625072255096881,
"Nucleotide GTR":0.0009613925582829941,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node63":{
"Global MG94xREV":0.001348553215128743,
"Nucleotide GTR":0.00150316308910599,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"Global MG94xREV":0.0008625072255096881,
"Nucleotide GTR":0.0009613925582829941,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node636":{
"Global MG94xREV":0.001173154092026488,
"Nucleotide GTR":0.001307654684431208,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node639":{
"Global MG94xREV":0.001186449010816086,
"Nucleotide GTR":0.001322473848386319,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node642":{
"Global MG94xREV":0.001179938839810851,
"Nucleotide GTR":0.001315217294733818,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node645":{
"Global MG94xREV":0.00117995451068077,
"Nucleotide GTR":0.001315234762248611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node648":{
"Global MG94xREV":0.00117995451068077,
"Nucleotide GTR":0.001315234762248611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node652":{
"Global MG94xREV":0.00117995451068077,
"Nucleotide GTR":0.001315234762248611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node655":{
"Global MG94xREV":0.001186496284617831,
"Nucleotide GTR":0.001322526542068014,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node659":{
"Global MG94xREV":0.001078449019932987,
"Nucleotide GTR":0.001202091798869825,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "A", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "GCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node66":{
"Global MG94xREV":0.001272992424700543,
"Nucleotide GTR":0.001418939352229204,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node665":{
"Global MG94xREV":0.001348595050465968,
"Nucleotide GTR":0.001503209720810272,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node67":{
"Global MG94xREV":7.555884649766376e-05,
"Nucleotide GTR":8.422157007713675e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node673":{
"Global MG94xREV":0.001186826781868438,
"Nucleotide GTR":0.001322894930398998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node678":{
"Global MG94xREV":0.001186826781868438,
"Nucleotide GTR":0.001322894930398998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node688":{
"Global MG94xREV":0.001186826781868438,
"Nucleotide GTR":0.001322894930398998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node698":{
"Global MG94xREV":0.001186826781868438,
"Nucleotide GTR":0.001322894930398998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node703":{
"Global MG94xREV":0.001186826781868438,
"Nucleotide GTR":0.001322894930398998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node708":{
"Global MG94xREV":0.001186826781868438,
"Nucleotide GTR":0.001322894930398998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node71":{
"Global MG94xREV":0.00117987615633146,
"Nucleotide GTR":0.001315147424674955,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node725":{
"Global MG94xREV":0.001348273206601389,
"Nucleotide GTR":0.001502850977964783,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node74":{
"Global MG94xREV":0.001179923168940964,
"Nucleotide GTR":0.001315199827219058,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node755":{
"Global MG94xREV":0.001348006578770827,
"Nucleotide GTR":0.001502553781599868,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node805":{
"Global MG94xREV":0.001348006582226375,
"Nucleotide GTR":0.00150255378545159,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.001173185256075649,
"Nucleotide GTR":0.001307689421398116,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003176996918243326,
"Nucleotide GTR":0.003016460507160099,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "A", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GCT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582181606965482,
"Nucleotide GTR":0.001502232597444698,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582334152098958,
"Nucleotide GTR":0.001502377434340209,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001502948028127964,
"Nucleotide GTR":0.001427002760099914,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "P", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "CCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001586712169862014,
"Nucleotide GTR":0.001506534227066723,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001893214369259541,
"Nucleotide GTR":0.0001797548604364754,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583099482058014,
"Nucleotide GTR":0.001503104091512329,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007987549625249717,
"Nucleotide GTR":0.007583931811576863,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "RGW", "P", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "YC", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "V", "H", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "KAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "NGG", "CCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TRT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GTG", "CAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.006386585712845969,
"Nucleotide GTR":0.006063865994885837,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "PL", "T", "RS", "P", "M", "LV", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CYG", "ACT", "AGW", "CCC", "ATG", "STA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KRM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ADG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "TA", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "RCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418676_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418676_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "LF", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "YTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418703_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582510817853964,
"Nucleotide GTR":0.001502545173021317,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "RC", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "YGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAR", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "ED", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAK", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCR", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582493678398024,
"Nucleotide GTR":0.001502528899636956,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420198_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420428_Boutersem_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583975299735191,
"Nucleotide GTR":0.001503935653362299,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "W", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "TGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420428_Boutersem_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "GC", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "KGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAW", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420679_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582769120373146,
"Nucleotide GTR":0.001502790423290064,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420679_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582303287991608,
"Nucleotide GTR":0.001502348129822989,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "I", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ATC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420760_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAR", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420760_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCK", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "TPAS", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "TI", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "NCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AYA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582922767679919,
"Nucleotide GTR":0.001502936306665101,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "V", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GTG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421787_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "NK", "PL", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAS", "CYC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "SL", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TYA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "HP", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TS", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CMC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "WCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001583046641747552,
"Nucleotide GTR":0.001503053921268606,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTC", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001584330665226612,
"Nucleotide GTR":0.001504273061927074,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "H", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "CAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423067_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "AS", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "KCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423216_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423362_England_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423362_England_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582871883793209,
"Nucleotide GTR":0.001502887993985342,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "V", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423427_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005585187277047889,
"Nucleotide GTR":0.0005302962917453379,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423528_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTR", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "AV", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GYT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423653_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00158222754869812,
"Nucleotide GTR":0.00150227621770172,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGT", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423718_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "DEAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNS", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423815_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "RC", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "YGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423856_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582923019990684,
"Nucleotide GTR":0.001502936546226385,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "TTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424040_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "NS", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ARC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424156_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582622258495287,
"Nucleotide GTR":0.001502650982470332,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "A", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "GCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582862899192906,
"Nucleotide GTR":0.001502879463384686,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "R", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AGG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582025921045755,
"Nucleotide GTR":0.001502084778469591,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425380_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585347751592698,
"Nucleotide GTR":0.001505238754036513,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "M", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "ATG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005437964303971478,
"Nucleotide GTR":0.0005163179248957637,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "T", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "ACT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585462940550022,
"Nucleotide GTR":0.001505348122395871,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTA", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582569453659238,
"Nucleotide GTR":0.001502600845908469,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001583108892159691,
"Nucleotide GTR":0.001503113026113403,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582492380184689,
"Nucleotide GTR":0.001502527667023469,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "S", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TCA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583870716761348,
"Nucleotide GTR":0.001503836355056872,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGG", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585035018670643,
"Nucleotide GTR":0.001504941823780384,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGA", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583523182629194,
"Nucleotide GTR":0.001503506382125986,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "N", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001584533381061773,
"Nucleotide GTR":0.001504465534355179,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGT", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582413056286438,
"Nucleotide GTR":0.001502452351430628,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTG", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "LF", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTW", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "NT", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "AMC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158383422799684,
"Nucleotide GTR":0.001503801710101298,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACR", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":7.767983239755083e-05,
"Nucleotide GTR":7.375460306067606e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585844199546667,
"Nucleotide GTR":0.001505710116044582,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "D", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GAT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583306360430516,
"Nucleotide GTR":0.001503300516141152,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "Y", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582871953062262,
"Nucleotide GTR":0.001502888059754168,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "Y", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "TAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001583151940907574,
"Nucleotide GTR":0.001503153899570699,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "L", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "TTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAY", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582810762414796,
"Nucleotide GTR":0.001502829961123217,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "S", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AGT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "NTSIYCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429065_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "TISF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "IL", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "MTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158356067677993,
"Nucleotide GTR":0.00150354198166475,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCA", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583127829574063,
"Nucleotide GTR":0.001503131006603794,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000205537986802485,
"Nucleotide GTR":0.0001951519739760111,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001587383624524348,
"Nucleotide GTR":0.001507171752542321,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "A", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "GCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001583488523317371,
"Nucleotide GTR":0.001503473474179266,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429814_NS_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429814_NS_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158274533377323,
"Nucleotide GTR":0.001502767838647683,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158301343286683,
"Nucleotide GTR":0.001503022390461445,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCT", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001582138896416689,
"Nucleotide GTR":0.001502192045096998,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "RGW", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "NGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TP", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "MCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00158287073167685,
"Nucleotide GTR":0.001502886900086421,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTY", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTR", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "DA", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GMT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAY", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "AS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "MI", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "IM", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "KCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATK", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATN", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "YS", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "PL", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "KAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACY", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TMC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CYA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTK", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "NTSI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "QHPRL", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "TS", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ANT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTS", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CNN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AST", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "NHDY", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAR", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAN", "NAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "DY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "KAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "ND", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "TPAS", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "RAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "NCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTR", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATM", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582810765177068,
"Nucleotide GTR":0.001502829963745908,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGG", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAY", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":{
"Global MG94xREV":0.001583184510702644,
"Nucleotide GTR":0.001503184823585764,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432711_England_20200312_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001581972217924124,
"Nucleotide GTR":0.001502033789013297,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACT", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001590559860872872,
"Nucleotide GTR":0.001510187490912011,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "HPRL", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "RG", "H", "H", "L", "RG", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTT", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CNC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "NGA", "CAC", "CAT", "CTA", "NGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583080238346912,
"Nucleotide GTR":0.001503085820202647,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCT", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001583232803601849,
"Nucleotide GTR":0.001503230676202865,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "T", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ACT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001586551957821778,
"Nucleotide GTR":0.001506382110679901,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "Q", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "CAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001584254848601937,
"Nucleotide GTR":0.001504201076382232,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGC", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433666_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003984599027472457,
"Nucleotide GTR":0.0003783253781021961,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "L", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "TTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433845_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001583540898699127,
"Nucleotide GTR":0.001503523202987532,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "H", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CAC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433949_England_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433959_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583046887674367,
"Nucleotide GTR":0.001503054154768527,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTC", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433959_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582922768909473,
"Nucleotide GTR":0.001502936307832524,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434007_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003188517630908381,
"Nucleotide GTR":0.003027399068217214,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "QHPRL", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "M", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTC", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CNN", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ATG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582877888731422,
"Nucleotide GTR":0.001502893695488816,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "L", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CTT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583975299183185,
"Nucleotide GTR":0.001503935652838185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCT", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002309854009790075,
"Nucleotide GTR":0.0002193135082324784,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582492381805663,
"Nucleotide GTR":0.001502527668562536,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "L", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "CTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KN", "I", "G", "S", "F", "A", "A", "C", "S", "R", "-", "L", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AA-", "ATT", "GGG", "AGC", "TTC", "GCA", "GCG", "TGT", "AGC", "AGG", "---", "CTC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582877886419488,
"Nucleotide GTR":0.001502893693293707,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "S", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "TCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001583078986312767,
"Nucleotide GTR":0.001503084631434873,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582678049308074,
"Nucleotide GTR":0.00150270395412494,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001582706038407686,
"Nucleotide GTR":0.001502730528911058,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582734040955644,
"Nucleotide GTR":0.00150275711646597,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "KTRMQPLEAGVSW", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "CW", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "--G", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TG-", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 22.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003177390606376645,
"Nucleotide GTR":0.003016834301890424,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "I", "A", "Y", "A", "N", "R", "K", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "ATT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAA", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585035019759782,
"Nucleotide GTR":0.001504941824814485,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "K", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAA", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435612_California_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583079544917632,
"Nucleotide GTR":0.001503085161812951,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435612_California_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582372965722599,
"Nucleotide GTR":0.00150241428667777,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "L", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "CTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001583437690796667,
"Nucleotide GTR":0.00150342521026994,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158249367683721,
"Nucleotide GTR":0.001502528898155014,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACC", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00158308023706533,
"Nucleotide GTR":0.001503085818985825,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585205548896663,
"Nucleotide GTR":0.001505103736966106,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "D", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GAC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "QH", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAN", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KQE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "NAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582869050920929,
"Nucleotide GTR":0.001502885304260554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00158490899086931,
"Nucleotide GTR":0.001504822164273208,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "M", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "ATG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583523388495769,
"Nucleotide GTR":0.001503506577589943,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "RM", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "RM", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TA", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "RCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "IL", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "MTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001584154863860783,
"Nucleotide GTR":0.001504106143956806,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "V", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "GTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "NIYF", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "WWC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001583963229661708,
"Nucleotide GTR":0.0015039241932001,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTG", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582468377733462,
"Nucleotide GTR":0.001502504877436931,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "TTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002055848375062456,
"Nucleotide GTR":0.0001951964572730567,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003167504228100363,
"Nucleotide GTR":0.003007447490887233,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATC", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583057045270495,
"Nucleotide GTR":0.001503063799092508,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583523370115807,
"Nucleotide GTR":0.001503506560138736,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "D", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GAC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0015836390755974,
"Nucleotide GTR":0.001503616418921943,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001584533622117895,
"Nucleotide GTR":0.001504465763230528,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "L", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CTT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001538097716306815,
"Nucleotide GTR":0.0001460376304034329,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583802713616527,
"Nucleotide GTR":0.001503771788169968,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACY", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158540526098978,
"Nucleotide GTR":0.001505293357433858,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "D", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GAT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583133965886277,
"Nucleotide GTR":0.001503136832842828,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001896407836975496,
"Nucleotide GTR":0.0001800580703385924,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582810765177068,
"Nucleotide GTR":0.001502829963745908,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAG", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "LF", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTK", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001583554645463371,
"Nucleotide GTR":0.001503536255115851,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002233648434389781,
"Nucleotide GTR":0.000212078024077602,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438422_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGY", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438422_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "LF", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "YTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438435_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACY", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438511_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438531_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001583080239976126,
"Nucleotide GTR":0.001503085821749535,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAT", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438531_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438615_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582433111803063,
"Nucleotide GTR":0.001502471393524596,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTG", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438615_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582810762413481,
"Nucleotide GTR":0.001502829961121967,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "G", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GGG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAY", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "LF", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "YTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585035022681614,
"Nucleotide GTR":0.001504941827588676,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "Q", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAA", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582648684726374,
"Nucleotide GTR":0.001502676073361033,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WC", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGK", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583939979659368,
"Nucleotide GTR":0.001503902118040553,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTG", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439409_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005609816317351223,
"Nucleotide GTR":0.00053263474309786,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "QPRL", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "GC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CNA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "KGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439458_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440007_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001976788176278751,
"Nucleotide GTR":0.000187689935439503,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440007_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583046470254053,
"Nucleotide GTR":0.001503053758440823,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "H", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "CAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440052_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001896996564005192,
"Nucleotide GTR":0.0001801139681527949,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440088_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "PR", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CSC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCK", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440230_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTS", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440384_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAY", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440436_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440521_England_20200304_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440521_England_20200304_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGR", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440816_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440988_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000189322195117336,
"Nucleotide GTR":0.0001797555803157888,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440988_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441046_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "IV", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "RTC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441103_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACK", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441198_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001893214377948941,
"Nucleotide GTR":0.0001797548612615072,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441250_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441307_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "T", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441307_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441318_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "IV", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "RTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441318_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583975295928223,
"Nucleotide GTR":0.001503935649747699,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "L", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CTT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441573_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441625_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003186313862075204,
"Nucleotide GTR":0.003025306657735472,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "-", "KN", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "---", "AA-", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7.833333333333334, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441625_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.166666666666667, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441875_England_20200429_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001583047117574583,
"Nucleotide GTR":0.001503054373051686,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACC", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441875_England_20200429_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582810763189167,
"Nucleotide GTR":0.001502829961858457,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442012_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442065_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "PL", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CYA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442072_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442078_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005704443354701292,
"Nucleotide GTR":0.0005416192882019787,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442078_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442107_England_20200405_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442107_England_20200405_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442149_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583181683545699,
"Nucleotide GTR":0.001503182139287512,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "T", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "ACA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442149_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442216_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442216_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442224_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001583975295982084,
"Nucleotide GTR":0.001503935649798839,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "F", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TTT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442224_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442344_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442344_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTY", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442621_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442625_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442625_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001584065624642932,
"Nucleotide GTR":0.001504021414074071,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442782_England_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585844081972892,
"Nucleotide GTR":0.001505710004411911,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "N", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "AAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442846_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442982_England_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0001979090551998656,
"Nucleotide GTR":0.0001879085389071942,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442982_England_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "SF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TYT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTK", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAY", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443318_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443337_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443412_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443412_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443478_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001582649886533915,
"Nucleotide GTR":0.001502677214440196,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAC", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443478_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001583623460882051,
"Nucleotide GTR":0.001503601593231711,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "A", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "GCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443629_England_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443648_England_20200416_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443648_England_20200416_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443657_England_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443657_England_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001581705730808031,
"Nucleotide GTR":0.001501780767722421,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443673_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443680_England_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001582850576904189,
"Nucleotide GTR":0.001502867763751912,
"amino-acid": [
["M", "V", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443680_England_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAR", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443713_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583975295900687,
"Nucleotide GTR":0.001503935649721553,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "H", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAT", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443744_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443766_England_20200328_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443766_England_20200328_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "KN", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAW", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443875_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAY", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443875_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444077_California_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001582870626071309,
"Nucleotide GTR":0.001502886799817222,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444077_California_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444080_England_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00158287073171823,
"Nucleotide GTR":0.00150288690012571,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444080_England_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158189118816553,
"Nucleotide GTR":0.001501956853758715,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444084_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444368_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAN", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444368_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444418_England_20200419_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0001878850605501516,
"Nucleotide GTR":0.0001783910654053424,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444418_England_20200419_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582648684681882,
"Nucleotide GTR":0.001502676073318788,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTC", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158236519825842,
"Nucleotide GTR":0.001502406911710296,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585906095006947,
"Nucleotide GTR":0.001505768883873545,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "N", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "AAT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002701031477888292,
"Nucleotide GTR":0.0002564546013520018,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444835_Unknown_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444835_Unknown_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60":{
"Global MG94xREV":0.001583523382632649,
"Nucleotide GTR":0.001503506572023093,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582870900672981,
"Nucleotide GTR":0.001502887060543031,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCT", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007959093483485891,
"Nucleotide GTR":0.007556913583348864,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "F", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "TTT", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.75, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.25, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583182796739659,
"Nucleotide GTR":0.001503183196230816,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "N", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AAT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445096_California_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582412407649334,
"Nucleotide GTR":0.001502451735569722,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "G", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GGA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445174_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "TI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "AYT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445178_California_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582752779667215,
"Nucleotide GTR":0.001502774908294185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "L", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "CTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0001896407833515331,
"Nucleotide GTR":0.0001800580700100607,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001975812658038376,
"Nucleotide GTR":0.0001875973129937831,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005914324925556375,
"Nucleotide GTR":0.000561546895497712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAY", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGY", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001586934235261387,
"Nucleotide GTR":0.001506745071308771,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCY", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000398356588337245,
"Nucleotide GTR":0.0003782272842589832,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "A", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "GCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582648684726374,
"Nucleotide GTR":0.001502676073361033,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTC", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583559771134441,
"Nucleotide GTR":0.001503541121782313,
"amino-acid": [
["M", "T", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "ACA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "VL", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "KTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AS", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "KCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582993661233894,
"Nucleotide GTR":0.001503003617906276,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCC", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582908207527881,
"Nucleotide GTR":0.001502922482250179,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583618428487663,
"Nucleotide GTR":0.001503596815128577,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "T", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "HY", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "YAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001893214374285122,
"Nucleotide GTR":0.0001797548609136389,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "MI", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATK", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAY", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTY", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001583623250047234,
"Nucleotide GTR":0.00150360139305056,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCG", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582809688017637,
"Nucleotide GTR":0.001502828941016278,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001582300386785726,
"Nucleotide GTR":0.001502345375217555,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTY", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "HR", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CRT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATY", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582797130894591,
"Nucleotide GTR":0.001502817018415557,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582877888978354,
"Nucleotide GTR":0.001502893695723272,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "V", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GTA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582648684714206,
"Nucleotide GTR":0.00150267607334948,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "T", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ACA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "ML", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "MTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTK", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTY", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003818166135164969,
"Nucleotide GTR":0.0003625230887183096,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0001893221950738565,
"Nucleotide GTR":0.0001797555802745063,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583078986285672,
"Nucleotide GTR":0.001503084631409149,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "V", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447679_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582411804539321,
"Nucleotide GTR":0.001502451162935382,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "GV", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GKT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGY", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447936_England_20200428_null_26":{
"Global MG94xREV":0.0001978895455342153,
"Nucleotide GTR":0.0001878900150818785,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447936_England_20200428_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448097_England_20200506_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001582871954142268,
"Nucleotide GTR":0.001502888060779601,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "F", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "TTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448097_England_20200506_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448100_England_20200508_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448100_England_20200508_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001582854540002235,
"Nucleotide GTR":0.001502871526591172,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001582649313398376,
"Nucleotide GTR":0.001502676670265692,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATC", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448334_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTY", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448334_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448426_England_20200429_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0001893214381348113,
"Nucleotide GTR":0.000179754861584248,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448426_England_20200429_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001582420601085192,
"Nucleotide GTR":0.001502459514984155,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAT", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448433_England_20200429_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585868941093478,
"Nucleotide GTR":0.001505733607379565,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "K", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AAA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448539_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "ED", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAW", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448615_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001584329604728969,
"Nucleotide GTR":0.001504272055017295,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "CGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448657_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583253300870518,
"Nucleotide GTR":0.001503250137726764,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "S", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "TCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448684_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448748_England_20200101_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448748_England_20200101_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448819_England_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448819_England_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448896_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448906_England_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001583080237419142,
"Nucleotide GTR":0.001503085819321757,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448906_England_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001979285643636021,
"Nucleotide GTR":0.0001879270622559581,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001583732086070071,
"Nucleotide GTR":0.001503704729494722,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTA", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGW", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448978_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAY", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449004_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449030_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582974317626242,
"Nucleotide GTR":0.001502985251747906,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTC", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001978895449109097,
"Nucleotide GTR":0.0001878900144900692,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0001979090546905449,
"Nucleotide GTR":0.0001879085384236102,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001582304047174745,
"Nucleotide GTR":0.00150234885064394,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "C", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGT", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002083909251839034,
"Nucleotide GTR":0.0001978607509054101,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449579_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449579_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449605_England_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000238665601578879,
"Nucleotide GTR":0.0002266056216316279,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449605_England_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449610_England_20200427_null_21":{
"Global MG94xREV":0.001583253421574992,
"Nucleotide GTR":0.001503250252331936,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449610_England_20200427_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449658_England_20200411_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449658_England_20200411_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001584509366579579,
"Nucleotide GTR":0.001504442733345608,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCA", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449684_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449700_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449700_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCM", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001582810765177068,
"Nucleotide GTR":0.001502829963745908,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001582877887163659,
"Nucleotide GTR":0.001502893694000272,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "L", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TTG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001583079072165611,
"Nucleotide GTR":0.001503084712949502,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001583159675390347,
"Nucleotide GTR":0.00150316124322335,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00168541036301345,
"Nucleotide GTR":0.001600245114873936,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CT-", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003173135074155557,
"Nucleotide GTR":0.003012793805405159,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCA", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450234_California_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450234_California_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48":{
"Global MG94xREV":0.0005704456747808554,
"Nucleotide GTR":0.0005416205598361715,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582810762413481,
"Nucleotide GTR":0.001502829961121967,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "S", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AGC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00158304775213303,
"Nucleotide GTR":0.001503054975545344,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGC", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450454_California_20200325_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001582301333262594,
"Nucleotide GTR":0.001502346273868128,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450454_California_20200325_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450472_California_20200404_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450472_California_20200404_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585906095007131,
"Nucleotide GTR":0.001505768883873721,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "I", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "ATT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001582869050878683,
"Nucleotide GTR":0.001502885304220444,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "F", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TTT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "VL", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "KTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585477872082229,
"Nucleotide GTR":0.0015053622994248,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "I", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "ATC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582870731697413,
"Nucleotide GTR":0.001502886900105944,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "F", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "TTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001582649313410545,
"Nucleotide GTR":0.001502676670277245,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "T", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ACT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_256":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_256",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003176524659802392,
"Nucleotide GTR":0.00301601211234798,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "K", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "AAA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582885996659236,
"Nucleotide GTR":0.001502901393716001,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_239":{
"Global MG94xREV":0.0005564747561683677,
"Nucleotide GTR":0.0005283556038642853,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_239",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002558397161789622,
"Nucleotide GTR":0.0002429119133183184,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_228":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_228",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582143399200698,
"Nucleotide GTR":0.001502196320351423,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "V", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "GTG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "LVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "BTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "TR", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "TM", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "HY", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ASA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "AYG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTY", "GCT", "GCA", "YAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "LF", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "YTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AV", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "LF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GYA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "YTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_500":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_500",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCY", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "GC", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "KGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATY", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "GV", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GKT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTK", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "CF", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TKT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "PA", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTY", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "SCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001975812655543098,
"Nucleotide GTR":0.0001875973127568644,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "P", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CCA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTK", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTK", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "VL", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "KTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001583047754807731,
"Nucleotide GTR":0.001503054978084888,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCC", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001582790219656332,
"Nucleotide GTR":0.001502810456408163,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "ED", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "NK", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAW", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATY", "AAS", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "SC", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TST", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAY", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "TI", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "AYT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "HY", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "YAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCR", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "GV", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GKG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "TI", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AYC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCY", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "SI", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AKT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003167841129608354,
"Nucleotide GTR":0.003007767368469689,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "C", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "P", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "TGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "CCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001585205552886968,
"Nucleotide GTR":0.001505103740754777,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "I", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "ATC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "PS", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "YCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAY", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTY", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451890_Bern_20200407_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451890_Bern_20200407_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "LF", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "YTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451908_Bern_20200407_null_27976":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451908_Bern_20200407_null_27976",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "Y", "R", "I", "G", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":7571.28165149222,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01845992768020402],
[0.01579213030865073],
[0.01183572010260792],
[0.02548091715675227],
[0.01550047254884196],
[0.01326037060261498],
[0.009938243406174789],
[0.02139587238638573],
[0.01621656936466718],
[0.01387297832378438],
[0.01039737421238943],
[0.02238432716022669],
[0.02769399856536128],
[0.02369170896486082],
[0.01775621341643408],
[0.03822704484048056],
[0.01348104992640229],
[0.01153279150510835],
[0.008643475553226936],
[0.01860838906368358],
[0.01131979756008758],
[0.009683879657240027],
[0.007257772503792388],
[0.0156251329288312],
[0.01184275393854783],
[0.01013125926876692],
[0.007593069880280297],
[0.01634698885302479],
[0.02022457421226597],
[0.01730175312331189],
[0.01296713636790134],
[0.02791672367091538],
[0.01594281095050914],
[0.0136387830103266],
[0.01022185196648253],
[0.0220064483519795],
[0.0133868944543456],
[0.01145224322183494],
[0.008583107071145233],
[0.01847842280244495],
[0.01400534737327041],
[0.01198131837611626],
[0.008979632765711445],
[0.01933209611392677],
[0.02391776345173345],
[0.02046120893129546],
[0.01533505215183888],
[0.03301456861837944],
[0.01341088992785241],
[0.02163873831909427],
[0.01316321022682709],
[0.01126088545867586],
[0.00843969026290301],
[0.01816966323580898],
[0.01178112019312806],
[0.008829590332386212],
[0.01900907235361367],
[0.02351811688247746],
[0.02011931860493931],
[0.01507881577780617],
[0.03246292175932306]
],
"Log Likelihood":-3229.535658609826,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.585693076969511, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.4317152132345619, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":553
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":8252.184914912246,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2537383116890782],
[0.2189363327182989],
[0.208431756554957],
[0.3188935990376658]
],
"Log Likelihood":-3270.638021045683,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2612773958773325,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3518087131580087,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3065273392068419,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.088907602455758,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.8580865339635868
},
"display order":0,
"estimated parameters":853
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-25/sequences.M.compressed.fas",
"number of sequences":424,
"number of sites":234,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"((epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1,epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2)Node53,(epi_isl_442072_England_20200405_null_1,epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1)Node50,(epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2,epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4)Node47,(epi_isl_423216_England_20200325_null_1,epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2)Node39,((epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3,epi_isl_442216_England_20200407_null_6)Node43,epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1)Node42,(epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1,epi_isl_447936_England_20200428_null_26)Node648,(epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1,epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1)Node645,(epi_isl_442982_England_20200407_null_5,epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2)Node642,(epi_isl_433051_England_20200404_null_3,epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3)Node17,epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1,(epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2,epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4)Node74,(epi_isl_440007_England_20200321_null_3,epi_isl_440436_England_20200316_null_2)Node71,(epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6,epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5)Node63,((epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1,epi_isl_450472_California_20200404_null_4)Node67,epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1)Node66,(epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1,epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3)Node652,(epi_isl_420760_England_20200327_null_1,epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6)Node655,(epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1)Node659,epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_444077_California_20200430_null_3,(epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6,epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6,epi_isl_440521_England_20200304_null_5)Node665,epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1,(epi_isl_440988_England_20200331_null_2,epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2)Node673,epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1,(epi_isl_441250_England_20200401_null_2,epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2)Node678,epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1,epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1,epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2,(epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10,epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1)Node688,epi_isl_424040_England_20200321_null_1,epi_isl_434007_England_20200101_null_1,epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1,epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2,(epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1,epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3)Node698,epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1,epi_isl_420428_Boutersem_20200325_null_1,epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2,(epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1,epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1)Node703,epi_isl_420198_England_20200328_null_1,(epi_isl_448426_England_20200429_null_12,epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1)Node708,epi_isl_421787_England_20200326_null_1,epi_isl_444080_England_20200404_null_7,epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1,epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_442224_England_20200406_null_2,epi_isl_443478_England_20200414_null_5,(epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_444835_Unknown_20200309_null_1)Node725,epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1,epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1,epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1,epi_isl_441875_England_20200429_null_6,epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18,epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3,epi_isl_448097_England_20200506_null_4,epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1,epi_isl_449684_England_20200415_null_1,epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3,epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_441573_England_20200404_null_1,epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3,(epi_isl_429814_NS_20200315_null_1,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1)Node755,epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1,epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1,epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_433959_England_20200411_null_1,epi_isl_450495_GP_20200325_null_1,epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5,(epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_440088_England_20200321_null_1)Node639,epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2,epi_isl_445174_California_20200331_null_1,epi_isl_448657_England_20200101_null_1,epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_445096_California_20200313_null_1,epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1,epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1,epi_isl_447679_France_20200301_null_1,epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1,(epi_isl_418703_England_20200317_null_1,epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1)Node85,epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1,epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2,epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1,epi_isl_448906_England_20200330_null_4,epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1,epi_isl_451908_Bern_20200407_null_27976,epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1,epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1,(epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3,epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1)Node805,epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1,epi_isl_440816_England_20200403_null_1,epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18,epi_isl_442012_England_20200324_null_2,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_438531_England_20200401_null_2,epi_isl_423427_England_20200331_null_1,epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4,epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1,epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1,epi_isl_435612_California_20200307_null_1,epi_isl_440052_England_20200322_null_1,epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1,epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1,epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1,epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6,epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_442149_England_20200407_null_1,epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1,epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2,epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1,(epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4,epi_isl_443875_England_20200330_null_2)Node636,(epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1,epi_isl_442078_England_20200405_null_4)Node632,epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,epi_isl_443744_England_20200325_null_1,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1,(epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2,epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48)Node627,epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1,(epi_isl_449605_England_20200427_null_3,epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2)Node616,(epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2,epi_isl_449030_England_20200419_null_3)Node613,((epi_isl_439409_England_20200331_null_1,epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2,(epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2,epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1)Node603,epi_isl_448748_England_20200101_null_9)Node598,epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1)Node597,(epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1,epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16)Node609,epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4,epi_isl_442625_England_20200405_null_2,epi_isl_450454_California_20200325_null_18,epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14,epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1,epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1,epi_isl_448615_England_20200101_null_1,epi_isl_449004_England_20200419_null_1,epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2,epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1,epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1,epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1,epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1,epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1,epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_443713_England_20200330_null_1,epi_isl_443381_England_20200412_null_1,epi_isl_443318_England_20200415_null_1,epi_isl_442621_England_20200412_null_1,(epi_isl_438511_England_20200401_null_2,epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2)Node133,(epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_441307_England_20200401_null_1)Node113,epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9,epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1,epi_isl_449579_England_20200401_null_2,(epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4,((epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1)Node120,epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4)Node119,epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1)Node117,((epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1)Node130,epi_isl_423067_England_20200324_null_1,epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16)Node126,((epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5,epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1)Node138,epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1)Node137,epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,epi_isl_441318_England_20200403_null_1,epi_isl_441103_England_20200401_null_1,epi_isl_438435_England_20200329_null_1,epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1,epi_isl_423653_England_20200323_null_1,epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1,epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1,((epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2,epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1)Node391,epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2)Node390,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1,((epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1)Node204,epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1)Node203,epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1,(epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_444418_England_20200419_null_17)Node194,epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1,epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1,epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1,(epi_isl_444368_England_20200428_null_1,epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1,epi_isl_448100_England_20200508_null_16)Node178,((epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2,epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1)Node184,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1)Node183,epi_isl_423445_England_20200327_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1,epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1,epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1,epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1,epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1,epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1,(epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51)Node227,epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1,epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,((epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2,epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_256)Node239,epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2)Node238,((epi_isl_432711_England_20200312_null_17,epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5)Node246,epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2)Node245,((epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1,epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3)Node252,epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1)Node251,(epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3,epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1,epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13)Node256,epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5,(epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4,epi_isl_450234_California_20200314_null_8)Node267,epi_isl_441625_England_20200404_null_1,epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1,epi_isl_439458_England_20200330_null_1,epi_isl_442846_England_20200411_null_1,(epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1,epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21)Node278,epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_423378_England_20200328_null_1,epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,(epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1,epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6)Node380,((epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_443680_England_20200413_null_5,epi_isl_448539_England_20200406_null_1,epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13)Node334,epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1)Node333,((epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1,epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26,epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1)Node322,epi_isl_442107_England_20200405_null_6)Node321,(epi_isl_448334_England_20200423_null_2,epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1)Node316,(epi_isl_442344_England_20200325_null_3,epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10)Node313,((epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_228,epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1)Node304,epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1)Node303,(epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1)Node310,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1)Node329,epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1,epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,(epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1)Node347,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5,epi_isl_448684_England_20200101_null_1,(epi_isl_441198_England_20200403_null_1,epi_isl_423740_England_20200323_null_2,epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1)Node352,epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2,(epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2)Node366,epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_448978_England_20200421_null_1,((epi_isl_418676_England_20200310_null_1,epi_isl_439434_England_20200401_null_9)Node371,epi_isl_429065_California_20200328_null_1)Node370,epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2,epi_isl_443629_England_20200417_null_4,epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1,epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1,epi_isl_433949_England_20200412_null_2,epi_isl_440230_England_20200323_null_1,epi_isl_423856_England_20200317_null_1,epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1,epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1,epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1,epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1,(epi_isl_423362_England_20200328_null_4,epi_isl_449658_England_20200411_null_11)Node404,(epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14)Node407,epi_isl_440384_England_20200316_null_1,epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1,epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3,(((epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3,epi_isl_433666_England_20200403_null_2,epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66)Node422,epi_isl_443766_England_20200328_null_7)Node421,epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1)Node420,(epi_isl_438422_England_20200329_null_2,epi_isl_442782_England_20200407_null_4,(epi_isl_438615_England_20200421_null_1,epi_isl_443412_England_20200416_null_4)Node432,epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15)Node429,epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2,(epi_isl_448896_England_20200413_null_3,epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1)Node443,epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1,epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1,((epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2,epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19)Node457,epi_isl_445178_California_20200405_null_1)Node456,(epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4,epi_isl_444084_England_20200404_null_1)Node452,epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1,epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1,epi_isl_442065_England_20200404_null_1,((epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1,epi_isl_448819_England_20200324_null_5)Node485,epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1)Node484,((epi_isl_420679_England_20200328_null_2,epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1)Node480,epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1)Node479,((epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_500,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1)Node468,epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13)Node467,(epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4,epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20)Node476,(epi_isl_443648_England_20200416_null_9,epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1)Node516,epi_isl_451890_Bern_20200407_null_32,(epi_isl_423718_England_20200323_null_2,epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_239)Node494,(epi_isl_425380_England_20200318_null_1,epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7)Node497,((epi_isl_443337_England_20200415_null_1,epi_isl_443657_England_20200413_null_7)Node506,epi_isl_449700_England_20200416_null_3)Node505,epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2,epi_isl_449610_England_20200427_null_21,epi_isl_423815_England_20200323_null_1,epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60,(epi_isl_448433_England_20200429_null_9,epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1,epi_isl_443673_England_20200412_null_1,epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1)Node520,(epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7,epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5,epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4,epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12)Node527,(epi_isl_433845_England_20200408_null_1,epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2)Node543,(epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1,epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1)Node539,epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_1,epi_isl_424156_England_20200320_null_1,(epi_isl_423528_England_20200326_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1)Node550,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,((epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1)Node557,epi_isl_441046_England_20200404_null_1)Node556,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,(epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2,epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1)Node563,epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node113":"test",
"Node117":"test",
"Node119":"test",
"Node120":"test",
"Node126":"test",
"Node130":"test",
"Node133":"test",
"Node137":"test",
"Node138":"test",
"Node17":"test",
"Node178":"test",
"Node183":"test",
"Node184":"test",
"Node194":"test",
"Node203":"test",
"Node204":"test",
"Node227":"test",
"Node238":"test",
"Node239":"test",
"Node245":"test",
"Node246":"test",
"Node251":"test",
"Node252":"test",
"Node256":"test",
"Node267":"test",
"Node278":"test",
"Node303":"test",
"Node304":"test",
"Node310":"test",
"Node313":"test",
"Node316":"test",
"Node321":"test",
"Node322":"test",
"Node329":"test",
"Node333":"test",
"Node334":"test",
"Node347":"test",
"Node352":"test",
"Node366":"test",
"Node370":"test",
"Node371":"test",
"Node380":"test",
"Node39":"test",
"Node390":"test",
"Node391":"test",
"Node404":"test",
"Node407":"test",
"Node42":"test",
"Node420":"test",
"Node421":"test",
"Node422":"test",
"Node429":"test",
"Node43":"test",
"Node432":"test",
"Node443":"test",
"Node452":"test",
"Node456":"test",
"Node457":"test",
"Node467":"test",
"Node468":"test",
"Node47":"test",
"Node476":"test",
"Node479":"test",
"Node480":"test",
"Node484":"test",
"Node485":"test",
"Node494":"test",
"Node497":"test",
"Node50":"test",
"Node505":"test",
"Node506":"test",
"Node516":"test",
"Node520":"test",
"Node527":"test",
"Node53":"test",
"Node539":"test",
"Node543":"test",
"Node550":"test",
"Node556":"test",
"Node557":"test",
"Node563":"test",
"Node597":"test",
"Node598":"test",
"Node603":"test",
"Node609":"test",
"Node613":"test",
"Node616":"test",
"Node627":"test",
"Node63":"test",
"Node632":"test",
"Node636":"test",
"Node639":"test",
"Node642":"test",
"Node645":"test",
"Node648":"test",
"Node652":"test",
"Node655":"test",
"Node659":"test",
"Node66":"test",
"Node665":"test",
"Node67":"test",
"Node673":"test",
"Node678":"test",
"Node688":"test",
"Node698":"test",
"Node703":"test",
"Node708":"test",
"Node71":"test",
"Node725":"test",
"Node74":"test",
"Node755":"test",
"Node805":"test",
"Node85":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":"background",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"background",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":"background",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":"background",
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418676_England_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419308_Saitama_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420428_Boutersem_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420679_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420760_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421477_Portugal_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_423362_England_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_425817_Scotland_20200313_null_4":"background",
"epi_isl_425915_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_425921_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":"background",
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":"background",
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_428388_Connecticut_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":"background",
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_428841_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":"background",
"epi_isl_429814_NS_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_430121_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430425_New_York_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_430443_Malaysia_20200128_null_6":"background",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430675_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_432330_Wales_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":"background",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_433191_Scotland_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_433443_Scotland_20200412_null_4":"background",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":"background",
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_433959_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_434007_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_434368_Antwerp_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435612_California_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_436125_Victoria_20200412_null_51":"background",
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436130_Victoria_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_436381_Comunitat_Valenciana_20200318_null_6":"background",
"epi_isl_436412_Kinshasa_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":"background",
"epi_isl_436718_Abruzzo_20200319_null_13":"background",
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436827_Michigan_20200319_null_7":"background",
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_437037_Unknown_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_16":"background",
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_437951_Innsbruck_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_438143_Washington_20200404_null_14":"background",
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_438422_England_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_438531_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_438615_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_438958_Kanto_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_438967_Kanto_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_439067_Scotland_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":"background",
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_440007_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_440521_England_20200304_null_5":"background",
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440988_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_441307_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441318_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441625_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_441875_England_20200429_null_6":"background",
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442078_England_20200405_null_4":"background",
"epi_isl_442107_England_20200405_null_6":"background",
"epi_isl_442149_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442216_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_442224_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442344_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442625_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442982_England_20200407_null_5":"background",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443412_England_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_443478_England_20200414_null_5":"background",
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_443648_England_20200416_null_9":"background",
"epi_isl_443657_England_20200413_null_7":"background",
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443680_England_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443766_England_20200328_null_7":"background",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443875_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444077_California_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_444080_England_20200404_null_7":"background",
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_444368_England_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444418_England_20200419_null_17":"background",
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_444835_Unknown_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_444967_Unknown_20200330_null_60":"background",
"epi_isl_445044_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_445174_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_445376_Santiago_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445391_Wales_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":"background",
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_14":"background",
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_445658_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_446116_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_446720_Wales_20200413_null_13":"background",
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_447084_Michigan_20200328_null_9":"background",
"epi_isl_447161_Li_ge_20200419_null_5":"background",
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":"background",
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_16":"background",
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_447476_Comunitat_Valenciana_20200327_null_5":"background",
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447486_Comunitat_Valenciana_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_447492_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_447587_Tamil_Nadu_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_447604_Kinshasa_20200423_null_10":"background",
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_447936_England_20200428_null_26":"background",
"epi_isl_448097_England_20200506_null_4":"background",
"epi_isl_448100_England_20200508_null_16":"background",
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_10":"background",
"epi_isl_448174_Scotland_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_448334_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_448426_England_20200429_null_12":"background",
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":"background",
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448748_England_20200101_null_9":"background",
"epi_isl_448819_England_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":"background",
"epi_isl_448906_England_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_448943_Northern_Ireland_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_448957_Northern_Ireland_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_449242_Scotland_20200426_null_3":"background",
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":"background",
"epi_isl_449263_Scotland_20200503_null_26":"background",
"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_19":"background",
"epi_isl_449268_Scotland_20200503_null_18":"background",
"epi_isl_449290_Scotland_20200423_null_6":"background",
"epi_isl_449579_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_449605_England_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_449610_England_20200427_null_21":"background",
"epi_isl_449658_England_20200411_null_11":"background",
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_449700_England_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_450027_New_York_20200324_null_18":"background",
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":"background",
"epi_isl_450078_New_York_20200319_null_3":"background",
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_450234_California_20200314_null_8":"background",
"epi_isl_450287_Saint_Petersburg_20200422_null_48":"background",
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_450454_California_20200325_null_18":"background",
"epi_isl_450472_California_20200404_null_4":"background",
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_450523_Latvia_20200428_null_6":"background",
"epi_isl_450619_Michigan_20200325_null_21":"background",
"epi_isl_450623_Michigan_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_450746_Pomerania_20200508_null_5":"background",
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_450837_Norrbotten_20200402_null_20":"background",
"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_13":"background",
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":"background",
"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_256":"background",
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_451304_Lazio_20200323_null_239":"background",
"epi_isl_451390_Sichuan_20200123_null_2":"background",
"epi_isl_451510_New_South_Wales_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_451583_New_South_Wales_20200406_null_15":"background",
"epi_isl_451604_New_South_Wales_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_228":"background",
"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_12":"background",
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_66":"background",
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_500":"background",
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451817_Basel_Land_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":"background",
"epi_isl_451890_Bern_20200407_null_32":"background",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_451908_Bern_20200407_null_27976":"background",
"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_2":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":16
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":5
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":21
}
}
}