{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614336910887988],
[157.8961027076207, 361.3074018931359, 1, 0, 0.3041121666330729, 0.006333278547423804, 0, -0.09358117823947791, 1, 0.3041121666330729, 0.0008751532818251712],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614416510077076],
[157.630556606546, 361.5729479942106, 1, 0, 0.3036007176564738, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036007176564739, 0.00161441754377881],
[157.630556606546, 361.5729479942106, 1, 0, 0.3036007176564738, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036007176564739, 0.00161453454841599],
[157.5913916347319, 361.6121129660247, 0, 1, 0.3035252848609186, 0, 0.002765394089810136, 0.0408617488214203, 0.6964747151390813, 1, 0.001613747733779816],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004622083111256983],
[158.2931131791162, 360.9103914216404, 1, 1, 0.3048768195446528, 0.006317394230969811, 0.002770770872129672, -0.05240527322565358, 0.9070501249043372, 0.5168037639936429, 0.003254233323520249],
[158.2931131791162, 360.9103914216404, 1, 0, 0.3048768195446528, 0.006317394230969811, 0, -0.09334646993821458, 1, 0.3048768195446528, 0.001616083898222149],
[158.1274740359736, 355.0760305647829, 0, 0, 0.3081184610362081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001396031526710489],
[158.4308348312498, 360.6190580934448, 0.5, 1.5, 0.3052323813006458, 0.003155951305391829, 0.00415951394230339, 0.01482874522193612, 0.694767618699354, 0.5172979560068289, 0.001902866642871799],
[157.9618348928311, 361.2416697079255, 1, 0, 0.3042387686005633, 0.006330643099191955, 0, -0.09354223658408113, 1, 0.3042387686005633, 0.001615183193423625],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614479402832678],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614513996455772],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001614607385543591],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614356025491396],
[158.1529994661066, 361.05050513465, 0, 1, 0.3046069567417866, 0, 0.002769695612604282, 0.0409253085667064, 0.6953930432582134, 1, 0.001614880724488773],
[157.7570307778745, 361.4464738228822, 0, 1, 0.3038443103329633, 0, 0.002766661379825841, 0.04088047442964245, 0.6961556896670367, 1, 0.001614098164950321],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004596142842185713],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004596142575142353],
[157.630556606546, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3036976049282449, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036976049282449, 0.001614405889623755],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001622182026826205],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614593766094922],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004622083269718982],
[157.7570307778745, 361.4464738228822, 0, 1, 0.3038443103329633, 0, 0.002766661379825841, 0.04088047442964245, 0.6961556896670367, 1, 0.001614890068723936],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595932473905693],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004599754014511811],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001613778808752266],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614897520358161],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001614425965669688],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001686295167969406],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004621214873647703],
[157.7961957496886, 361.4246367625304, 0, 1, 0.3039096004414944, 0, 0.002766828539851415, 0.04088294440345311, 0.6960903995585056, 1, 0.001614604956991202],
[158.7961957496886, 360.4073088510681, 0, 0, 0.3058457701894663, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005390349059331221],
[158.7961957496886, 360.4073088510681, 1, 0, 0.3058457701894663, 0.006297380080668344, 0, -0.09305073878528193, 1, 0.3058457701894663, 0.001616048525645507],
[158.2961957496886, 360.9073088510681, 0, 1, 0.3048827566589924, 0, 0.002770794537753902, 0.04094154639827, 0.6951172433410076, 1, 0.001614397986798355],
[157.6962887917564, 361.5072158090002, 1, 0, 0.3037273196239643, 0.006341303322112646, 0, -0.09369975313948664, 1, 0.3037273196239643, 0.001614233244176727],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001613868329277022],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595966841281232],
[157.630556606546, 361.5729479942106, 1, 0, 0.3036007176564738, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036007176564739, 0.001614417543769338],
[157.7961957496886, 361.3468632856651, 0, 0, 0.3039551295222896, 0, 0, 0, 1, 1, 4.351194290428669e-06],
[157.7961957496886, 361.3468632856651, 0, 0, 0.3039551295222896, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003045010564753332],
[157.7961957496886, 361.3770860683666, 0, 1, 0.3039374352954249, 0, 0.002767192604488532, 0.04088832386015025, 0.6960625647045751, 1, 0.001312223986524435],
[157.7570307778745, 361.4464738228822, 0, 1, 0.3038443103329633, 0, 0.002766661379825841, 0.04088047442964245, 0.6961556896670367, 1, 0.00161466654852203],
[157.7961957496886, 361.368143879254, 0, 1, 0.3039426703738334, 0, 0.002767261079698646, 0.04088933565693049, 0.6960573296261666, 1, 0.001614190743320835],
[157.7596391925316, 361.5975611844983, 0, 1, 0.3037594146726092, 0, 0.002765505377647636, 0.04086339322200666, 0.6962405853273907, 1, 0.001615079167063564],
[157.4873603229641, 361.5113401628359, 1, 0, 0.3034446139760093, 0.006349715926086194, 0, -0.09382405864508088, 1, 0.3034446139760093, 0.001614036090212664],
[157.8578035810633, 361.1920052434201, 0, 1, 0.3041284302532956, 0, 0.00276861056026438, 0.04090927572121268, 0.6958715697467044, 1, 0.001616388398168375],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595907074123742],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595931741026324],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001275221668528928],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004620510351085245]
],
"NAMES": [
["Node389"],
["Node378"],
["Node397"],
["Node177"],
["Node185"],
["Node210"],
["Node284"],
["Node255"],
["Node254"],
["Node250"],
["Node249"],
["Node242"],
["Node260"],
["Node263"],
["Node277"],
["Node271"],
["Node274"],
["Node306"],
["Node301"],
["Node311"],
["Node339"],
["Node404"],
["Node407"],
["Node414"],
["Node432"],
["Node440"],
["Node462"],
["Node465"],
["Node472"],
["Node529"],
["Node42"],
["Node40"],
["Node47"],
["Node57"],
["Node53"],
["Node52"],
["Node61"],
["Node68"],
["Node25"],
["Node76"],
["Node87"],
["Node86"],
["Node85"],
["Node130"],
["Node127"],
["Node124"],
["Node121"],
["Node117"],
["Node142"],
["Node156"],
["Node164"],
["Node163"]
],
"RESOLVED": [
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614336910887988],
[157.8961027076207, 361.3074018931359, 1, 0, 0.3041121666330729, 0.006333278547423804, 0, -0.09358117823947791, 1, 0.3041121666330729, 0.0008751532818251712],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614416510077076],
[157.630556606546, 361.5729479942106, 1, 0, 0.3036007176564738, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036007176564739, 0.00161441754377881],
[157.630556606546, 361.5729479942106, 1, 0, 0.3036007176564738, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036007176564739, 0.00161453454841599],
[157.5913916347319, 361.6121129660247, 0, 1, 0.3035252848609186, 0, 0.002765394089810136, 0.0408617488214203, 0.6964747151390813, 1, 0.001613747733779816],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004622083111256983],
[158.2931131791162, 360.9103914216404, 1, 1, 0.3048768195446528, 0.006317394230969811, 0.002770770872129672, -0.05240527322565358, 0.9070501249043372, 0.5168037639936429, 0.003254233323520249],
[158.2931131791162, 360.9103914216404, 1, 0, 0.3048768195446528, 0.006317394230969811, 0, -0.09334646993821458, 1, 0.3048768195446528, 0.001616083898222149],
[158.1274740359736, 355.0760305647829, 0, 0, 0.3081184610362081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001396031526710489],
[158.4308348312498, 360.6190580934448, 0.5, 1.5, 0.3052323813006458, 0.003155951305391829, 0.00415951394230339, 0.01482874522193612, 0.694767618699354, 0.5172979560068289, 0.001902866642871799],
[157.9618348928311, 361.2416697079255, 1, 0, 0.3042387686005633, 0.006330643099191955, 0, -0.09354223658408113, 1, 0.3042387686005633, 0.001615183193423625],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614479402832678],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614513996455772],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001614607385543591],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614356025491396],
[158.1529994661066, 361.05050513465, 0, 1, 0.3046069567417866, 0, 0.002769695612604282, 0.0409253085667064, 0.6953930432582134, 1, 0.001614880724488773],
[157.7570307778745, 361.4464738228822, 0, 1, 0.3038443103329633, 0, 0.002766661379825841, 0.04088047442964245, 0.6961556896670367, 1, 0.001614098164950321],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004596142842185713],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004596142575142353],
[157.630556606546, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3036976049282449, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036976049282449, 0.001614405889623755],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001622182026826205],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614593766094922],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004622083269718982],
[157.7570307778745, 361.4464738228822, 0, 1, 0.3038443103329633, 0, 0.002766661379825841, 0.04088047442964245, 0.6961556896670367, 1, 0.001614890068723936],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595932473905693],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004599754014511811],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001613778808752266],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001614897520358161],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001614425965669688],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 1, 0, 0.3039197431285185, 0.006337288394368491, 0, -0.0936404281522733, 1, 0.3039197431285185, 0.001686295167969406],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004621214873647703],
[157.7961957496886, 361.4246367625304, 0, 1, 0.3039096004414944, 0, 0.002766828539851415, 0.04088294440345311, 0.6960903995585056, 1, 0.001614604956991202],
[158.7961957496886, 360.4073088510681, 0, 0, 0.3058457701894663, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005390349059331221],
[158.7961957496886, 360.4073088510681, 1, 0, 0.3058457701894663, 0.006297380080668344, 0, -0.09305073878528193, 1, 0.3058457701894663, 0.001616048525645507],
[158.2961957496886, 360.9073088510681, 0, 1, 0.3048827566589924, 0, 0.002770794537753902, 0.04094154639827, 0.6951172433410076, 1, 0.001614397986798355],
[157.6962887917564, 361.5072158090002, 1, 0, 0.3037273196239643, 0.006341303322112646, 0, -0.09369975313948664, 1, 0.3037273196239643, 0.001614233244176727],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001613868329277022],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595966841281232],
[157.630556606546, 361.5729479942106, 1, 0, 0.3036007176564738, 0.006343947655377831, 0, -0.09373882608105408, 1, 0.3036007176564739, 0.001614417543769338],
[157.7961957496886, 361.3468632856651, 0, 0, 0.3039551295222896, 0, 0, 0, 1, 1, 4.351194290428669e-06],
[157.7961957496886, 361.3468632856651, 0, 0, 0.3039551295222896, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003045010564753332],
[157.7961957496886, 361.3770860683666, 0, 1, 0.3039374352954249, 0, 0.002767192604488532, 0.04088832386015025, 0.6960625647045751, 1, 0.001312223986524435],
[157.7570307778745, 361.4464738228822, 0, 1, 0.3038443103329633, 0, 0.002766661379825841, 0.04088047442964245, 0.6961556896670367, 1, 0.00161466654852203],
[157.7961957496886, 361.368143879254, 0, 1, 0.3039426703738334, 0, 0.002767261079698646, 0.04088933565693049, 0.6960573296261666, 1, 0.001614190743320835],
[157.7596391925316, 361.5975611844983, 0, 1, 0.3037594146726092, 0, 0.002765505377647636, 0.04086339322200666, 0.6962405853273907, 1, 0.001615079167063564],
[157.4873603229641, 361.5113401628359, 1, 0, 0.3034446139760093, 0.006349715926086194, 0, -0.09382405864508088, 1, 0.3034446139760093, 0.001614036090212664],
[157.8578035810633, 361.1920052434201, 0, 1, 0.3041284302532956, 0, 0.00276861056026438, 0.04090927572121268, 0.6958715697467044, 1, 0.001616388398168375],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595907074123742],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004595931741026324],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 1, 0.3039197431285185, 0, 0.002766961197268119, 0.04088490456314992, 0.6960802568714815, 1, 0.001275221668528928],
[157.7961957496886, 361.4073088510681, 0, 0, 0.3039197431285185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004620510351085245]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9177187676661263, 2.082281232333874, 1, 0, 0.3059062558887087, 1.089658439200416, 0, -16.10090569290443, 1, 0.3059062558887087, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9177187676661493, 2.082281232333851, 1, 0, 0.3059062558887164, 1.089658439200388, 0, -16.10090569290402, 1, 0.3059062558887164, 0.06767684128978046],
[0.9177184812971488, 2.082281518702851, 1, 0, 0.3059061604323829, 1.089658779222306, 0, -16.10091071710302, 1, 0.3059061604323829, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.077395802291789, 0, 1, 0.3073190452651558, 0, 0.4813719171362517, 7.11280118815092, 0.6926809547348443, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.253896654487356, 1.57096485438845, 0, 0, 0.4438789832873478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 1.414825059227558, 0, 0, 0.3192490616972606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9990659122392437, 2.000934087760756, 0, 1, 0.3330219707464145, 0, 0.4997665870738897, 7.384602731885432, 0.6669780292535854, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.692608447453411, 0, 0, 0.3713870841286895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6626324776399192, 2.033643854448678, 0, 1, 0.2457583704436663, 0, 0.4917281842700529, 7.265826461441342, 0.7542416295563337, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.921670056371827, 0, 0, 0.3422699965107678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9990654539600393, 2.000934546039961, 0, 1, 0.3330218179866798, 0, 0.4997664726110581, 7.384601040570805, 0.6669781820133203, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.234469738789064, 0, 0, 0.2089984830164988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9990655833124475, 2.000934416687552, 0, 1, 0.3330218611041492, 0, 0.499766504918962, 7.384601517955732, 0.6669781388958509, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.253896654487356, 1.57096485438845, 0, 0, 0.4438789832873478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 1.414825059227558, 0, 0, 0.3192490616972606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2, 0, 0, 0.2279160152160966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9629611886002769, 2.037038811399724, 1, 0, 0.3209870628667589, 1.038463451941985, 0, -15.34444327115482, 1, 0.3209870628667588, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.95632587929654, 0, 0, 0.3382577025770754, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.5918632067255165, 2.404465935343159, 0, 1, 0.1975294364079415, 0, 0.4158927707400781, 6.145274554988427, 0.8024705635920585, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.043674120703461, 1.034655822924713, 0, 0, 0.5021696020418694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.008028783407836, 2.016057566815672, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06713780638384734],
[0.6555260079855939, 2.340154899563233, 2.5, 1.5, 0.2188237092721496, 3.813731216679569, 0.6409832102481594, -46.88085238562265, 0.9813366314612895, 0.1226952188703703, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.04622233866263302, 3.056439996842186, 0, 1, 0.01489763746885863, 0, 0.3271780244445064, 5.10516260074645, 0.9851023625311414, 1, 0.06408767947893926],
[1.007705709117963, 2.015411418235925, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9923532147845948, 0, -15.08732321730286, 1, 0.3333333333333333, 0.06577397464690866],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.921670056371827, 1.078329943628173, 0, 0, 0.6405566854572755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.388051665400384, 0.6666666666666667, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.7668221935831506, 2.23317780641685, 1, 0, 0.2556073978610502, 1.304083278194223, 0, -19.26926927056724, 1, 0.2556073978610502, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 1.414825059227558, 0, 0, 0.3192490616972606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2, 0, 0, 0.3154600069784644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.2949064905841712, 2.705093509415829, 0, 1, 0.09830216352805704, 0, 0.3696729878354379, 5.462326266862286, 0.901697836471943, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.388051665400384, 0.6666666666666667, 1, 0.06767684128978046],
[0.9177187961896835, 2.000413401855173, 1, 1, 0.314488424069531, 1.089658405332814, 0.4998966708944287, -8.714380328613856, 0.9010970311262629, 0.5300738792653248, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.089549128455773, 0, 0, 0.2410068532263215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9951164656907542, 2.004883534309246, 0, 1, 0.3317054885635847, 0, 0.4987820902746531, 7.370055705451071, 0.6682945114364154, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.089549128455773, 0, 0, 0.2410068532263215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.692608447453411, 0, 0, 0.3713870841286895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.610276616440213, 2.389723383559788, 1, 1, 0.2034255388134042, 1.638601206503817, 0.4184584738466158, -18.02895509606842, 0.958618050158476, 0.3654691277852847, 0.06767684128978046],
[0.9682271503085831, 2.101027680382781, 0, 0, 0.3154600069784644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06442260796626022],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.388051665400384, 0.6666666666666667, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 1, 0.1967972566955803, 0, 0.4150052226689139, 6.132160052977852, 0.8032027433044198, 1, 0.06767684128978046],
[1.914304589615849, 1.080811003448718, 1, 0, 0.6391421399723524, 0.5223829088769379, 0, -7.718783839809916, 1, 0.6391421399723524, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.088687270718143, 0, 1, 0.2410823252898868, 0, 0.4787696147811419, 7.07434929965383, 0.7589176747101132, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.921670056371827, 0, 0, 0.3422699965107678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2, 0, 0, 0.2279160152160966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0, 1.672990231198771, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.692608447453411, 0, 0, 0.3713870841286895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9177187676661263, 2.082281232333874, 1, 0, 0.3059062558887087, 1.089658439200416, 0, -16.10090569290443, 1, 0.3059062558887087, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9177187676661493, 2.082281232333851, 1, 0, 0.3059062558887164, 1.089658439200388, 0, -16.10090569290402, 1, 0.3059062558887164, 0.06767684128978046],
[0.9177184812971488, 2.082281518702851, 1, 0, 0.3059061604323829, 1.089658779222306, 0, -16.10091071710302, 1, 0.3059061604323829, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.077395802291789, 0, 1, 0.3073190452651558, 0, 0.4813719171362517, 7.11280118815092, 0.6926809547348443, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.253896654487356, 1.57096485438845, 0, 0, 0.4438789832873478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 1.414825059227558, 0, 0, 0.3192490616972606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9990659122392437, 2.000934087760756, 0, 1, 0.3330219707464145, 0, 0.4997665870738897, 7.384602731885432, 0.6669780292535854, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.692608447453411, 0, 0, 0.3713870841286895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6626324776399192, 2.033643854448678, 0, 1, 0.2457583704436663, 0, 0.4917281842700529, 7.265826461441342, 0.7542416295563337, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.921670056371827, 0, 0, 0.3422699965107678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9990654539600393, 2.000934546039961, 0, 1, 0.3330218179866798, 0, 0.4997664726110581, 7.384601040570805, 0.6669781820133203, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.234469738789064, 0, 0, 0.2089984830164988, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9990655833124475, 2.000934416687552, 0, 1, 0.3330218611041492, 0, 0.499766504918962, 7.384601517955732, 0.6669781388958509, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.253896654487356, 1.57096485438845, 0, 0, 0.4438789832873478, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 1.414825059227558, 0, 0, 0.3192490616972606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2, 0, 0, 0.2279160152160966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9629611886002769, 2.037038811399724, 1, 0, 0.3209870628667589, 1.038463451941985, 0, -15.34444327115482, 1, 0.3209870628667588, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.95632587929654, 0, 0, 0.3382577025770754, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.5918632067255165, 2.404465935343159, 0, 1, 0.1975294364079415, 0, 0.4158927707400781, 6.145274554988427, 0.8024705635920585, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.043674120703461, 1.034655822924713, 0, 0, 0.5021696020418694, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.008028783407836, 2.016057566815672, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06713780638384734],
[0.6555260079855939, 2.340154899563233, 2.5, 1.5, 0.2188237092721496, 3.813731216679569, 0.6409832102481594, -46.88085238562265, 0.9813366314612895, 0.1226952188703703, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.04622233866263302, 3.056439996842186, 0, 1, 0.01489763746885863, 0, 0.3271780244445064, 5.10516260074645, 0.9851023625311414, 1, 0.06408767947893926],
[1.007705709117963, 2.015411418235925, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9923532147845948, 0, -15.08732321730286, 1, 0.3333333333333333, 0.06577397464690866],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.921670056371827, 1.078329943628173, 0, 0, 0.6405566854572755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.388051665400384, 0.6666666666666667, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[0.7668221935831506, 2.23317780641685, 1, 0, 0.2556073978610502, 1.304083278194223, 0, -19.26926927056724, 1, 0.2556073978610502, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 1.414825059227558, 0, 0, 0.3192490616972606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2, 0, 0, 0.3154600069784644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -14.77610333080077, 1, 0.3333333333333333, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.2949064905841712, 2.705093509415829, 0, 1, 0.09830216352805704, 0, 0.3696729878354379, 5.462326266862286, 0.901697836471943, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.388051665400384, 0.6666666666666667, 1, 0.06767684128978046],
[0.9177187961896835, 2.000413401855173, 1, 1, 0.314488424069531, 1.089658405332814, 0.4998966708944287, -8.714380328613856, 0.9010970311262629, 0.5300738792653248, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.089549128455773, 0, 0, 0.2410068532263215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.9951164656907542, 2.004883534309246, 0, 1, 0.3317054885635847, 0, 0.4987820902746531, 7.370055705451071, 0.6682945114364154, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.089549128455773, 0, 0, 0.2410068532263215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.692608447453411, 0, 0, 0.3713870841286895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.610276616440213, 2.389723383559788, 1, 1, 0.2034255388134042, 1.638601206503817, 0.4184584738466158, -18.02895509606842, 0.958618050158476, 0.3654691277852847, 0.06767684128978046],
[0.9682271503085831, 2.101027680382781, 0, 0, 0.3154600069784644, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06442260796626022],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 7.388051665400384, 0.6666666666666667, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 1, 0.1967972566955803, 0, 0.4150052226689139, 6.132160052977852, 0.8032027433044198, 1, 0.06767684128978046],
[1.914304589615849, 1.080811003448718, 1, 0, 0.6391421399723524, 0.5223829088769379, 0, -7.718783839809916, 1, 0.6391421399723524, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.088687270718143, 0, 1, 0.2410823252898868, 0, 0.4787696147811419, 7.07434929965383, 0.7589176747101132, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.921670056371827, 0, 0, 0.3422699965107678, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1.303999202922878, 1.286392567163864, 0, 0, 0.5033984503738647, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2, 0, 0, 0.2279160152160966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.364722510792037, 0, 0, 0.3433561812569474, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0, 1.672990231198771, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 2.039446580020251, 0, 0, 0.2592057509600927, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.590391770086741, 2.40960822991326, 0, 0, 0.1967972566955803, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.7136074328361367, 1.979001014617275, 0, 0, 0.2650245836935724, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.6635048844006148, 2.029103563052796, 0, 0, 0.2464171443226875, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[0.921670056371827, 2.078329943628173, 0, 0, 0.3072233521239423, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 1.692608447453411, 0, 0, 0.3713870841286895, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06767684128978046]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node117":{
"Global MG94xREV":0.001616388398168375,
"Nucleotide GTR":0.001855979738146506,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.001614036090212664,
"Nucleotide GTR":0.001853278756186578,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node124":{
"Global MG94xREV":0.001615079167063564,
"Nucleotide GTR":0.001854476444503815,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node127":{
"Global MG94xREV":0.001614190743320835,
"Nucleotide GTR":0.001853456332959294,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.00161466654852203,
"Nucleotide GTR":0.001854002665025108,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "D", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GAC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node142":{
"Global MG94xREV":0.0004595907074123742,
"Nucleotide GTR":0.0005277141569219114,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.0004595931741026324,
"Nucleotide GTR":0.0005277169892406447,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node163":{
"Global MG94xREV":0.0004620510351085245,
"Nucleotide GTR":0.0005305391699932944,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node164":{
"Global MG94xREV":0.001275221668528928,
"Nucleotide GTR":0.001464243112062058,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node177":{
"Global MG94xREV":0.00161441754377881,
"Nucleotide GTR":0.001853716751219589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node185":{
"Global MG94xREV":0.00161453454841599,
"Nucleotide GTR":0.001853851099026171,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node210":{
"Global MG94xREV":0.001613747733779816,
"Nucleotide GTR":0.001852947657734414,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "F", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "TTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.001615183193423625,
"Nucleotide GTR":0.001854595890310729,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node249":{
"Global MG94xREV":0.001902866642871799,
"Nucleotide GTR":0.002184921605207554,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node25":{
"Global MG94xREV":0.0004595966841281232,
"Nucleotide GTR":0.0005277210195443751,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node250":{
"Global MG94xREV":0.001396031526710489,
"Nucleotide GTR":0.001602960173634269,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.001616083898222149,
"Nucleotide GTR":0.001855630103287022,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node255":{
"Global MG94xREV":0.003254233323520249,
"Nucleotide GTR":0.003736596426019133,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node260":{
"Global MG94xREV":0.001614479402832678,
"Nucleotide GTR":0.001853787779414752,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node263":{
"Global MG94xREV":0.001614513996455772,
"Nucleotide GTR":0.001853827500724062,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node271":{
"Global MG94xREV":0.001614356025491396,
"Nucleotide GTR":0.001853646114301451,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.001614880724488773,
"Nucleotide GTR":0.001854248587512009,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node277":{
"Global MG94xREV":0.001614607385543591,
"Nucleotide GTR":0.001853934732534776,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node284":{
"Global MG94xREV":0.0004622083111256983,
"Nucleotide GTR":0.0005307197584592233,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.0004596142842185713,
"Nucleotide GTR":0.0005277412284318553,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node306":{
"Global MG94xREV":0.001614098164950321,
"Nucleotide GTR":0.001853350032035547,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node311":{
"Global MG94xREV":0.0004596142575142353,
"Nucleotide GTR":0.0005277411977692321,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node339":{
"Global MG94xREV":0.001614405889623755,
"Nucleotide GTR":0.001853703369611759,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node378":{
"Global MG94xREV":0.0008751532818251712,
"Nucleotide GTR":0.001004874051731928,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATC", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node389":{
"Global MG94xREV":0.001614336910887988,
"Nucleotide GTR":0.00185362416641029,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node397":{
"Global MG94xREV":0.001614416510077076,
"Nucleotide GTR":0.001853715564296025,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTT", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node40":{
"Global MG94xREV":0.0004621214873647703,
"Nucleotide GTR":0.0005306200651297894,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node404":{
"Global MG94xREV":0.001622182026826205,
"Nucleotide GTR":0.00186263213518886,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node407":{
"Global MG94xREV":0.001614593766094922,
"Nucleotide GTR":0.001853919094325047,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.0004622083269718982,
"Nucleotide GTR":0.0005307197766542468,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node42":{
"Global MG94xREV":0.001686295167969406,
"Nucleotide GTR":0.001936248532736347,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "GTG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node432":{
"Global MG94xREV":0.001614890068723936,
"Nucleotide GTR":0.00185425931680897,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node440":{
"Global MG94xREV":0.0004595932473905693,
"Nucleotide GTR":0.0005277170733917849,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node462":{
"Global MG94xREV":0.0004599754014511811,
"Nucleotide GTR":0.000528155872750991,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node465":{
"Global MG94xREV":0.001613778808752266,
"Nucleotide GTR":0.001852983338836369,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node47":{
"Global MG94xREV":0.001614604956991202,
"Nucleotide GTR":0.001853931944006951,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node472":{
"Global MG94xREV":0.001614897520358161,
"Nucleotide GTR":0.001854267872971681,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTT", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node52":{
"Global MG94xREV":0.001614397986798355,
"Nucleotide GTR":0.001853694295379453,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.001614425965669688,
"Nucleotide GTR":0.001853726421456547,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "V", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GTC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node53":{
"Global MG94xREV":0.001616048525645507,
"Nucleotide GTR":0.001855589487562722,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node57":{
"Global MG94xREV":0.0005390349059331221,
"Nucleotide GTR":0.0006189340784054358,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "-", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "---", "CAT", "GTG", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node61":{
"Global MG94xREV":0.001614233244176727,
"Nucleotide GTR":0.001853505133561606,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node68":{
"Global MG94xREV":0.001613868329277022,
"Nucleotide GTR":0.001853086128661068,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node76":{
"Global MG94xREV":0.001614417543769338,
"Nucleotide GTR":0.001853716751208711,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.001312223986524435,
"Nucleotide GTR":0.001506730148310236,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node86":{
"Global MG94xREV":0.0003045010564753332,
"Nucleotide GTR":0.0003496361342996676,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node87":{
"Global MG94xREV":4.351194290428669e-06,
"Nucleotide GTR":4.996155904685684e-06,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901688937944541,
"Nucleotide GTR":0.001853800816530342,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAA", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902644651667492,
"Nucleotide GTR":0.00185473246357557,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTA", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003814126560480092,
"Nucleotide GTR":0.00371807964546001,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "V", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "GTA", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002147028761612256,
"Nucleotide GTR":0.002092962519776198,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413747_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002102445204127911,
"Nucleotide GTR":0.002049501660526717,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901868815438106,
"Nucleotide GTR":0.001853976164368677,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "G", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GGG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAT", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901868815438106,
"Nucleotide GTR":0.001853976164368677,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAG", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901688937944541,
"Nucleotide GTR":0.001853800816530342,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "R", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "AGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902314695221576,
"Nucleotide GTR":0.001854410816056538,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "V", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GTT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902315805796228,
"Nucleotide GTR":0.001854411898664819,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "F", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "TTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003840449170940128,
"Nucleotide GTR":0.003743739402842186,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "Q", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGA", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "CAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "F", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "TTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901688937944541,
"Nucleotide GTR":0.001853800816530342,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902315805796228,
"Nucleotide GTR":0.001854411898664819,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "F", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTT", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903061243649531,
"Nucleotide GTR":0.001855138564984195,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001753762378424498,
"Nucleotide GTR":0.001709599327341905,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "D", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAT", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190089712600537,
"Nucleotide GTR":0.001853028943912227,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "C", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "TGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902805858806214,
"Nucleotide GTR":0.001854889611213879,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "C", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "TGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902267566946017,
"Nucleotide GTR":0.001854364874560025,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "V", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GTT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902870413831528,
"Nucleotide GTR":0.001854952540621655,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "D", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GAC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901055997285399,
"Nucleotide GTR":0.00185318381451318,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "A", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GCC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008704130330969961,
"Nucleotide GTR":0.0008484943879506967,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATC", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190204432131214,
"Nucleotide GTR":0.001854147250673116,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTC", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901648837450645,
"Nucleotide GTR":0.001853761725842667,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "A", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "GCA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902315805836848,
"Nucleotide GTR":0.001854411898704421,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "I", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "ATT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901068894955269,
"Nucleotide GTR":0.001853196387395344,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001910777294116805,
"Nucleotide GTR":0.001862660310718323,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "I", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "ATT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902901689705263,
"Nucleotide GTR":0.001854983028909782,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCG", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003805016608795606,
"Nucleotide GTR":0.003709199099575623,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003809863795013984,
"Nucleotide GTR":0.003713924224484438,
"amino-acid": [
["L", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "S", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["TTG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TCA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423295_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901534942046025,
"Nucleotide GTR":0.001853650698539584,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTC", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423459_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902315805796228,
"Nucleotide GTR":0.001854411898664819,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "C", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "TGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423762_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001899856736004286,
"Nucleotide GTR":0.001852014752897579,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901779774652767,
"Nucleotide GTR":0.001853889365798586,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "S", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "AGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190213800558251,
"Nucleotide GTR":0.001854238575796506,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAC", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901430261109675,
"Nucleotide GTR":0.001853548653667047,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "D", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GAT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001901701924321675,
"Nucleotide GTR":0.001853813475885958,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGG", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001753728029857095,
"Nucleotide GTR":0.001709565843736347,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "Y", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "TAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425241_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902947926166584,
"Nucleotide GTR":0.001855028101049622,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "Y", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "TAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425518_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901264458873963,
"Nucleotide GTR":0.001853387026644976,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAT", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425559_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901430261109675,
"Nucleotide GTR":0.001853548653667047,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "I", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "ATT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902971210569712,
"Nucleotide GTR":0.001855050799107475,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "F", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTT", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901880100306532,
"Nucleotide GTR":0.00185398716506279,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "C", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "TGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902138005571297,
"Nucleotide GTR":0.001854238575785576,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAC", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902241949576866,
"Nucleotide GTR":0.001854339902284644,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "N", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAT", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903304975355771,
"Nucleotide GTR":0.00185537615906545,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "R", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CGC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00190173698917281,
"Nucleotide GTR":0.001853847657737874,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTT", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901880100300543,
"Nucleotide GTR":0.00185398716505695,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "V", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GTT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901264458677879,
"Nucleotide GTR":0.001853387026453828,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAT", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001901430261109675,
"Nucleotide GTR":0.001853548653667047,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTA", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901963952583284,
"Nucleotide GTR":0.00185406890578074,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "F", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "TTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902785870787161,
"Nucleotide GTR":0.001854870126530921,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "E", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAG", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900835125266756,
"Nucleotide GTR":0.001852968504469384,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "L", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "TTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001753728029857095,
"Nucleotide GTR":0.001709565843736347,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "V", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GTT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005727144544943336,
"Nucleotide GTR":0.00558292422170722,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "P", "N", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CCG", "AAT", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001936675704488846,
"Nucleotide GTR":0.001887906550172404,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "-", "-", "-", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTT", "---", "---", "---", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900988035026765,
"Nucleotide GTR":0.001853117563672656,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGT", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902315805796228,
"Nucleotide GTR":0.001854411898664819,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "L", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CTT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901416850812502,
"Nucleotide GTR":0.001853535581066499,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "G", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GGG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901786605368404,
"Nucleotide GTR":0.001853896024503893,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "K", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "AAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001501706934843953,
"Nucleotide GTR":0.001463891116184317,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "M", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "ATG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00189791644462785,
"Nucleotide GTR":0.001850123321724912,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "S", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TCT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190310100391837,
"Nucleotide GTR":0.001855177324014321,
"amino-acid": [
["M", "E", "R", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGA", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "V", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GTC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001505161605619536,
"Nucleotide GTR":0.001467258791820867,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "M", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "ATG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001500777443850351,
"Nucleotide GTR":0.001462985031530556,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "I", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATA", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901786605375091,
"Nucleotide GTR":0.001853896024510412,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "K", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "AAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901416850812502,
"Nucleotide GTR":0.001853535581066499,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "G", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GGT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901786605375091,
"Nucleotide GTR":0.001853896024510412,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "H", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CAT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901082742808841,
"Nucleotide GTR":0.001853209886533795,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "L", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TTG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901877498818375,
"Nucleotide GTR":0.001853984629085016,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "K", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "AAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901989259516072,
"Nucleotide GTR":0.001854093575437134,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "I", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "ATC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901786605368404,
"Nucleotide GTR":0.001853896024503893,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAA", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001924144560444805,
"Nucleotide GTR":0.001875690964017705,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "T", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "ACC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432510_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901362172479343,
"Nucleotide GTR":0.001853482279637107,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "S", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "TCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432510_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432565_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001910604060318492,
"Nucleotide GTR":0.001862491439274443,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "H", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAC", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432565_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901082742610594,
"Nucleotide GTR":0.00185320988634054,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "F", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "TTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432713_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190081817315949,
"Nucleotide GTR":0.001852951979248217,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "Y", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "TAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001753739479379563,
"Nucleotide GTR":0.001709577004938199,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "S", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "TCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001753750928902028,
"Nucleotide GTR":0.001709588166140051,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTT", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901082742808841,
"Nucleotide GTR":0.001853209886533795,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAT", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001900988035222419,
"Nucleotide GTR":0.001853117563863383,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCT", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTT", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433716_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900988035222419,
"Nucleotide GTR":0.001853117563863383,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGT", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433716_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901336502429367,
"Nucleotide GTR":0.001853457256007503,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAA", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434013_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001501710904298195,
"Nucleotide GTR":0.001463894985680198,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTA", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001900988035026765,
"Nucleotide GTR":0.001853117563672656,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "I", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ATA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001934716803601586,
"Nucleotide GTR":0.001885996978111568,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "-", "-", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "---", "---", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901786605368404,
"Nucleotide GTR":0.001853896024503893,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "T", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "ACT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001909414103534127,
"Nucleotide GTR":0.001861331447850779,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902954599503776,
"Nucleotide GTR":0.001855034606339576,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900988035023088,
"Nucleotide GTR":0.001853117563669074,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGT", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001902742549087731,
"Nucleotide GTR":0.001854827895753752,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "F", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "TTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001901454778334803,
"Nucleotide GTR":0.001853572553502111,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAT", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190294189799364,
"Nucleotide GTR":0.001855022224677468,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "K", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "AAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901786605562956,
"Nucleotide GTR":0.001853896024693546,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "N", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "AAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901416850624243,
"Nucleotide GTR":0.001853535580882982,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACG", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436671_California_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436674_California_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901786605562956,
"Nucleotide GTR":0.001853896024693546,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTA", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436674_California_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001900988035023088,
"Nucleotide GTR":0.001853117563669074,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGT", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902608682814893,
"Nucleotide GTR":0.001854697400486656,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "CTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901983514676272,
"Nucleotide GTR":0.001854087975263257,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "S", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "AGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900988035026765,
"Nucleotide GTR":0.001853117563672656,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "S", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "TCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901416850812502,
"Nucleotide GTR":0.001853535581066499,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "G", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GGA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903362002568652,
"Nucleotide GTR":0.001855431750225334,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "L", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTA", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902138005761552,
"Nucleotide GTR":0.001854238575971039,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTC", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900714622211879,
"Nucleotide GTR":0.001852851035909168,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "I", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "ATT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901899719317869,
"Nucleotide GTR":0.001854006290030341,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCG", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438404_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001900988035026765,
"Nucleotide GTR":0.001853117563672656,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGT", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438404_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902286420441634,
"Nucleotide GTR":0.00185438325328899,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTC", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901839230504226,
"Nucleotide GTR":0.001853947324439339,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901786605562956,
"Nucleotide GTR":0.001853896024693546,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "D", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GAC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001901336502437499,
"Nucleotide GTR":0.001853457256015428,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "N", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "AAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902463966380873,
"Nucleotide GTR":0.001854556328285938,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "L", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTA", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "I", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ATT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901173610915681,
"Nucleotide GTR":0.001853298466409974,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTT", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190047366669233,
"Nucleotide GTR":0.001852616148104975,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "L", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CTT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902210673611703,
"Nucleotide GTR":0.001854309413907389,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAC", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439564_England_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439564_England_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439774_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439774_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439778_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900819745889117,
"Nucleotide GTR":0.001852953512373541,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAT", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439778_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439819_England_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001902315442448731,
"Nucleotide GTR":0.001854411544467102,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "C", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "TGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439819_England_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439825_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901959721782646,
"Nucleotide GTR":0.001854064781519658,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAG", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439825_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440121_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901608193865641,
"Nucleotide GTR":0.001853722105739945,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "E", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "GAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440121_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440132_England_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001901950616012257,
"Nucleotide GTR":0.001854055905049774,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTC", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440132_England_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440400_England_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00150555108203116,
"Nucleotide GTR":0.001467638460480386,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "T", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "ACT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440400_England_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440671_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901868815627087,
"Nucleotide GTR":0.001853976164552901,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGG", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440671_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_440786_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001900806196839483,
"Nucleotide GTR":0.00185294030451458,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "V", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GTC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440786_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440909_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901430261109675,
"Nucleotide GTR":0.001853548653667047,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAA", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440909_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440936_England_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901682435237751,
"Nucleotide GTR":0.001853794477574001,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "R", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CGT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440936_England_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440988_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901701924311954,
"Nucleotide GTR":0.001853813475876483,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAG", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440988_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441119_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901688937944541,
"Nucleotide GTR":0.001853800816530342,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "K", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "AAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441119_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441246_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190323026845877,
"Nucleotide GTR":0.001855303333429302,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "V", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "GTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441246_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001916571953817291,
"Nucleotide GTR":0.001868309049936361,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "G", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "GGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441534_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441558_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901430261118479,
"Nucleotide GTR":0.001853548653675628,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "I", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "ATC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441558_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441658_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901082742614926,
"Nucleotide GTR":0.001853209886344766,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "F", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "TTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441658_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441860_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900988035222419,
"Nucleotide GTR":0.001853117563863383,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "V", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GTT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441860_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441881_England_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901868815438106,
"Nucleotide GTR":0.001853976164368677,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCG", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441881_England_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442091_England_20200405_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001901258549516164,
"Nucleotide GTR":0.001853381266095976,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTG", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442091_England_20200405_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442117_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901264458677879,
"Nucleotide GTR":0.001853387026453828,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "F", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "TTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442117_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442274_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001913134753983663,
"Nucleotide GTR":0.001864958405290423,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442274_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442289_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001505563845735601,
"Nucleotide GTR":0.001467650902770627,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTA", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442289_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442649_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901265602373712,
"Nucleotide GTR":0.001853388141349239,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTC", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442649_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442747_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001900806196839483,
"Nucleotide GTR":0.00185294030451458,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "S", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "TCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442747_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442958_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001752511516999732,
"Nucleotide GTR":0.001708379964971791,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "L", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "TTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442958_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442984_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443037_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900806197040972,
"Nucleotide GTR":0.001852940304710997,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "F", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "TTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443037_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902947863481063,
"Nucleotide GTR":0.001855028039942642,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "I", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "ATA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902947863481063,
"Nucleotide GTR":0.001855028039942642,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "Y", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "TAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901594334794453,
"Nucleotide GTR":0.001853708595666363,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "L", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TTA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443470_England_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001901264458677879,
"Nucleotide GTR":0.001853387026453828,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "C", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "TGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443470_England_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443568_England_20200414_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001934857069333827,
"Nucleotide GTR":0.001886133711687582,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "-", "-", "-", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "---", "---", "---", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443568_England_20200414_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443675_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001900806196839483,
"Nucleotide GTR":0.00185294030451458,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAT", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443675_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190186881563336,
"Nucleotide GTR":0.001853976164559012,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "G", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GGA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443888_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443946_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001900806197038621,
"Nucleotide GTR":0.001852940304708706,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "L", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CTT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443946_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444012_England_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001922205490530182,
"Nucleotide GTR":0.001873800723548135,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "-", "K", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "---", "AAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444012_England_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444015_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901464279367066,
"Nucleotide GTR":0.001853581815280424,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTC", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444015_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444026_California_20200501_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001901688937944541,
"Nucleotide GTR":0.001853800816530342,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "T", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "ACT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444026_California_20200501_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444097_England_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001505546525286642,
"Nucleotide GTR":0.001467634018483307,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "D", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GAT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444097_England_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444168_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901688937944541,
"Nucleotide GTR":0.001853800816530342,
"amino-acid": [
["M", "K", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "AAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444168_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903653989103278,
"Nucleotide GTR":0.001855716383987203,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTA", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900806196839483,
"Nucleotide GTR":0.00185294030451458,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTT", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444282_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901892431358739,
"Nucleotide GTR":0.001853999185595796,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "H", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CAT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11":{
"Global MG94xREV":0.00190186881563336,
"Nucleotide GTR":0.001853976164559012,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "G", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "GGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001907266471747231,
"Nucleotide GTR":0.001859237897491032,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "A", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "GCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901759323163602,
"Nucleotide GTR":0.00185386942931657,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAC", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903346754598778,
"Nucleotide GTR":0.001855416886228161,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "Q", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAA", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001753018130447265,
"Nucleotide GTR":0.001708873820935277,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "L", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "TTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001936014394952843,
"Nucleotide GTR":0.001887261893660312,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "-", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGG", "---", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001902348957955481,
"Nucleotide GTR":0.001854444215990052,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "D", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAT", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901688938141161,
"Nucleotide GTR":0.001853800816722011,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAA", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901880100306532,
"Nucleotide GTR":0.00185398716506279,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "C", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "TGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001846737958368581,
"Nucleotide GTR":0.001800233606470659,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "M", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "ATG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190231505840164,
"Nucleotide GTR":0.001854411170091043,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "L", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CTA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901959721969887,
"Nucleotide GTR":0.001854064781702183,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "G", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GGA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900367651685866,
"Nucleotide GTR":0.001852512802756727,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001901589596813842,
"Nucleotide GTR":0.001853703976997058,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAG", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001901959721969887,
"Nucleotide GTR":0.001854064781702183,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "G", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GGT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901786605368404,
"Nucleotide GTR":0.001853896024503893,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "I", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "ATA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001752481115362086,
"Nucleotide GTR":0.001708350328904833,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "Y", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "TAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "C", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "TGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "-", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "---", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001901964339301053,
"Nucleotide GTR":0.001854069282760224,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAG", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901699630210911,
"Nucleotide GTR":0.001853811239545241,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "N", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAT", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901666039404152,
"Nucleotide GTR":0.001853778494618478,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "D", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GAT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAT", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "Y", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "TAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447700_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901759323163602,
"Nucleotide GTR":0.00185386942931657,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGC", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447700_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001902315805796228,
"Nucleotide GTR":0.001854411898664819,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "C", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "TGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001900806197040972,
"Nucleotide GTR":0.001852940304710997,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "F", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "TTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902464079479234,
"Nucleotide GTR":0.001854556438536272,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTA", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447890_California_20200402_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447890_California_20200402_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003815538648020594,
"Nucleotide GTR":0.003719456173967569,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "D", "I", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GAT", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447934_England_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901786605562956,
"Nucleotide GTR":0.001853896024693546,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAA", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447934_England_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448054_England_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001505546483223579,
"Nucleotide GTR":0.001467633977479471,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "N", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "AAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448054_England_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448097_England_20200506_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001902315805796228,
"Nucleotide GTR":0.001854411898664819,
"amino-acid": [
["M", "D", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448097_England_20200506_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448105_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001753750928902028,
"Nucleotide GTR":0.001709588166140051,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "V", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GTC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448105_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903904732692948,
"Nucleotide GTR":0.001855960813379407,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "D", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GAC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22":{
"Global MG94xREV":0.001901556576936323,
"Nucleotide GTR":0.001853671788622458,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448409_England_20200429_null_76":{
"Global MG94xREV":0.001902088659165373,
"Nucleotide GTR":0.001854190472015412,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448409_England_20200429_null_76",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448432_England_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901779774457224,
"Nucleotide GTR":0.001853889365607971,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "N", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "AAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448432_England_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448529_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903119644693725,
"Nucleotide GTR":0.001855195495379726,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "W", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TGG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448529_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448559_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901688937944541,
"Nucleotide GTR":0.001853800816530342,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "T", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "ACA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448559_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448600_England_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001752500125053254,
"Nucleotide GTR":0.001708368859896054,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTT", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448600_England_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448602_England_20200101_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001900806196839483,
"Nucleotide GTR":0.00185294030451458,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "TTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448602_England_20200101_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448777_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001279353935976706,
"Nucleotide GTR":0.001247137386048198,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "-", "-", "H", "M", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "---", "---", "CAT", "ATG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448777_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448822_England_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001505563867981137,
"Nucleotide GTR":0.001467650924455979,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "D", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GAC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448822_England_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448848_England_20200415_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448848_England_20200415_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448886_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901853069570265,
"Nucleotide GTR":0.001853960815011546,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAC", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448886_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190204432131214,
"Nucleotide GTR":0.001854147250673116,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTC", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449095_England_20200506_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001901416850812502,
"Nucleotide GTR":0.001853535581066499,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "V", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "GTC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449095_England_20200506_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "D", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GAC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449123_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449148_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901868815627087,
"Nucleotide GTR":0.001853976164552901,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTG", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449148_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001901786605375091,
"Nucleotide GTR":0.001853896024510412,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCA", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001752703489971099,
"Nucleotide GTR":0.001708567103700932,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "I", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATT", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449390_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901786605368404,
"Nucleotide GTR":0.001853896024503893,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "S", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "AGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449390_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449566_England_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001901665556092558,
"Nucleotide GTR":0.001853778023477584,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCC", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449566_England_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449662_England_20200414_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001901924116300599,
"Nucleotide GTR":0.001854030072650941,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "T", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "ACC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449662_England_20200414_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449708_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTT", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449708_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449858_Washington_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "L", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CTA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449858_Washington_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449897_Washington_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901759323155076,
"Nucleotide GTR":0.001853869429308256,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCC", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449897_Washington_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449912_Washington_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901779774652767,
"Nucleotide GTR":0.001853889365798586,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "H", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CAC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449912_Washington_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001901779774652767,
"Nucleotide GTR":0.001853889365798586,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "D", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GAC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449988_Washington_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAT", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449988_Washington_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450007_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001935621853757268,
"Nucleotide GTR":0.001886879237393895,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "S", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "-", "-", "-", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "TCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "---", "---", "---", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450007_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450109_New_York_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001901461824558538,
"Nucleotide GTR":0.001853579422288615,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "Y", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "TAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450109_New_York_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450175_Louisiana_20200404_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "-", "-", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "---", "---", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450175_Louisiana_20200404_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450192_California_20200421_null_24":{
"Global MG94xREV":0.001901759323155076,
"Nucleotide GTR":0.001853869429308256,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCC", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450192_California_20200421_null_24",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450442_Henan_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901959721782646,
"Nucleotide GTR":0.001854064781519658,
"amino-acid": [
["M", "G", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GGG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450442_Henan_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450452_California_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901899719317869,
"Nucleotide GTR":0.001854006290030341,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "G", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GGG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450452_California_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450464_California_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450464_California_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450497_Lithuania_20200301_null_204":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450497_Lithuania_20200301_null_204",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450500_Hubei_20200110_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901665556092558,
"Nucleotide GTR":0.001853778023477584,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGC", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450500_Hubei_20200110_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450510_Beirut_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901868815438106,
"Nucleotide GTR":0.001853976164368677,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "R", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CGG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450510_Beirut_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450538_Utah_20200313_null_79":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450538_Utah_20200313_null_79",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450620_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190089712600537,
"Nucleotide GTR":0.001853028943912227,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "F", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TTC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450620_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450722_Illinois_20200414_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001910111737436781,
"Nucleotide GTR":0.001862011514013318,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "A", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GCC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450722_Illinois_20200414_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450787_Gujarat_20200511_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAT", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450787_Gujarat_20200511_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450791_Gujarat_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001901759323163602,
"Nucleotide GTR":0.00185386942931657,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "A", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GCT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450791_Gujarat_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450808_Halland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGT", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450808_Halland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450815_Vastra_Gotaland_20200423_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001900897126205781,
"Nucleotide GTR":0.001853028944107589,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGT", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450815_Vastra_Gotaland_20200423_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450821_Jamtland_20200423_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001901361375497433,
"Nucleotide GTR":0.001853481502724707,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "Y", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "TAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450821_Jamtland_20200423_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450866_Florida_20200411_null_8":{
"Global MG94xREV":0.00190089712600537,
"Nucleotide GTR":0.001853028943912227,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGT", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450866_Florida_20200411_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451128_South_Australia_20200402_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451128_South_Australia_20200402_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451137_South_Australia_20200324_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00190143026092432,
"Nucleotide GTR":0.001853548653486362,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "K", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "AAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451137_South_Australia_20200324_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451146_South_Australia_20200310_null_348":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451146_South_Australia_20200310_null_348",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_237":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_237",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001505576575202466,
"Nucleotide GTR":0.00146766331168546,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAA", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451163_Gujarat_20200502_null_27553":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451163_Gujarat_20200502_null_27553",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":6487.556749946069,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01557713319610898],
[0.01535615448727611],
[0.01087468060791694],
[0.0243252845182298],
[0.006268572114736813],
[0.00617964554816638],
[0.004376204450282624],
[0.009789015622727274],
[0.009955354425188148],
[0.009814126810378944],
[0.006950014380025735],
[0.01554630276468399],
[0.01277666202804854],
[0.01259541107239404],
[0.008919620641430646],
[0.01995206275203306],
[0.02145717430042334],
[0.02115278076328046],
[0.01497964447808622],
[0.03350756928402107],
[0.008634826626139361],
[0.008512332145619889],
[0.006028129854308375],
[0.01348416372910603],
[0.01371329194110708],
[0.01351875386347473],
[0.009573499055648542],
[0.02141470602769852],
[0.01759958399674712],
[0.01734991460645338],
[0.01228659037496313],
[0.02748354801448939],
[0.03518518358608935],
[0.03468604318964953],
[0.02456341798022373],
[0.05494525794846292],
[0.01415927166461857],
[0.0139584068757598],
[0.009884845629484473],
[0.02211114891787603],
[0.02248687025429871],
[0.0221678693513772],
[0.01569849399170892],
[0.03511554468809253],
[0.02885955929211658],
[0.02845015480994584],
[0.02014738436372896],
[0.04506714952060727],
[0.01231319291909581],
[0.0195050083230823],
[0.005026397581502201],
[0.004955092622261145],
[0.003509019767571626],
[0.007849233214640849],
[0.007869368392249205],
[0.005572805868985933],
[0.01246566158727032],
[0.01024485033305715],
[0.01009951590147185],
[0.007152116749938109],
[0.01599838019363836]
],
"Log Likelihood":-2904.409380338868,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.8174475987450152, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6169671140283022, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":337
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6975.365963204988,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2503154019565262],
[0.2144733304378399],
[0.2700047568819673],
[0.2652065107236665]
],
"Log Likelihood":-2942.641797490164,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.06959020423899084,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3523139521703085,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.05119367583365988,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.386126320606143,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.4372715230443846
},
"display order":0,
"estimated parameters":543
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-23/sequences.leader.compressed.fas",
"number of sequences":269,
"number of sites":180,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_449928_Washington_20200413_null_6,epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2,epi_isl_447700_France_20200301_null_1,epi_isl_425559_England_20200323_null_1,epi_isl_448529_England_20200406_null_2,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_440132_England_20200322_null_5,epi_isl_450452_California_20200326_null_1,epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1,(epi_isl_444015_England_20200325_null_3,epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18)Node389,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5,epi_isl_450821_Jamtland_20200423_null_7,epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1,epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2,epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3,epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1,epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1,(epi_isl_413747_China_20200201_null_1,epi_isl_422000_England_20200402_null_1)Node378,epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2,(epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1,epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1)Node397,epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_441119_England_20200403_null_1,(epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2,epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7)Node177,epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3,epi_isl_450791_Gujarat_20200427_null_2,epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2,(epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1,epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2)Node185,epi_isl_448409_England_20200429_null_76,epi_isl_439825_England_20200415_null_3,epi_isl_447934_England_20200427_null_2,epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3,epi_isl_440909_England_20200420_null_1,epi_isl_440786_England_20200401_null_2,epi_isl_450192_California_20200421_null_24,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3,epi_isl_449858_Washington_20200408_null_1,(epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1,epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1)Node210,epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3,epi_isl_448559_England_20200407_null_1,epi_isl_450866_Florida_20200411_null_8,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4,epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4,epi_isl_448602_England_20200101_null_7,epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8,epi_isl_432565_England_20200402_null_1,epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7,epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1,(epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2,epi_isl_448600_England_20200101_null_4)Node284,epi_isl_441658_England_20200404_null_3,epi_isl_432510_England_20200327_null_2,epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7,epi_isl_449662_England_20200414_null_9,epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4,epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1,(((epi_isl_442274_England_20200406_null_3,epi_isl_447890_California_20200402_null_10)Node255,epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1)Node254,((epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1,epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1)Node250,epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1)Node249,epi_isl_450497_Lithuania_20200301_null_204,epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1)Node242,(epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_2)Node260,(epi_isl_442091_England_20200405_null_8,epi_isl_451128_South_Australia_20200402_null_19)Node263,(epi_isl_442984_England_20200407_null_7,epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1)Node277,(epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1,epi_isl_451146_South_Australia_20200310_null_348)Node271,(epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1,epi_isl_450464_California_20200407_null_2)Node274,epi_isl_449148_England_20200418_null_2,epi_isl_449095_England_20200506_null_8,epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2,epi_isl_439819_England_20200413_null_7,(epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5)Node306,epi_isl_442747_England_20200407_null_2,(epi_isl_425241_England_20200401_null_1,epi_isl_448054_England_20200502_null_2)Node301,epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1,epi_isl_444026_California_20200501_null_10,(epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_444097_England_20200406_null_7)Node311,epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1,epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1,epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1,epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_443946_England_20200326_null_2,epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4,epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1,epi_isl_441881_England_20200430_null_3,epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12,epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5,epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2,epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3,(epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1,epi_isl_450160_New_York_20200320_null_27)Node339,epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1,epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2,epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1,epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1,epi_isl_450620_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_423459_England_20200330_null_1,(epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1,epi_isl_450538_Utah_20200313_null_79)Node404,(epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1,epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7)Node407,epi_isl_449566_England_20200323_null_4,(epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2,epi_isl_442958_England_20200410_null_1)Node414,epi_isl_436674_California_20200331_null_3,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1,epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1,epi_isl_441246_England_20200401_null_1,epi_isl_450442_Henan_20200224_null_1,epi_isl_433716_England_20200101_null_1,epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3,(epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1,epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3)Node432,epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8,(epi_isl_448105_England_20200101_null_1,epi_isl_448822_England_20200324_null_4)Node440,epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1,epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1,epi_isl_448886_England_20200417_null_2,epi_isl_423762_England_20200324_null_3,epi_isl_442117_England_20200405_null_1,epi_isl_444282_England_20200416_null_1,epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15,epi_isl_425518_England_20200320_null_1,epi_isl_440988_England_20200331_null_1,epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2,(epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2,epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1)Node462,(epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_439774_England_20200409_null_1)Node465,epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2,epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1,(epi_isl_442649_England_20200407_null_1,epi_isl_449708_England_20200416_null_6)Node472,epi_isl_434013_England_20200414_null_3,epi_isl_443888_England_20200329_null_1,epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1,epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,epi_isl_449912_Washington_20200413_null_2,epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_449390_England_20200330_null_1,epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1,epi_isl_440121_England_20200323_null_1,epi_isl_443037_England_20200408_null_1,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_441860_England_20200420_null_1,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1,epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6,epi_isl_440671_England_20200404_null_1,epi_isl_450815_Vastra_Gotaland_20200423_null_9,epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2,epi_isl_441534_England_20200426_null_1,epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1,epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4,epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1,epi_isl_443470_England_20200415_null_7,(epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1,epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1,epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1)Node529,epi_isl_432713_England_20200325_null_1,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1,epi_isl_450109_New_York_20200312_null_3,epi_isl_440936_England_20200425_null_1,(epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3,(epi_isl_444012_England_20200326_null_4,epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3)Node42,epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1)Node40,(epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27,epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1)Node47,epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2,(((epi_isl_443568_England_20200414_null_4,epi_isl_448777_England_20200408_null_2)Node57,epi_isl_446382_Wales_20200410_null_10,epi_isl_450175_Louisiana_20200404_null_10)Node53,epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1)Node52,(epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1,epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2)Node61,(epi_isl_423295_England_20200326_null_2,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node68,epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,(epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_440400_England_20200316_null_4)Node25,epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2,(epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2,epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1)Node76,epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4,epi_isl_449897_Washington_20200410_null_2,epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,epi_isl_439778_England_20200409_null_1,epi_isl_450510_Beirut_20200304_null_1,epi_isl_436671_California_20200418_null_2,epi_isl_451163_Gujarat_20200502_null_27553,(((epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1,epi_isl_450007_New_York_20200321_null_1)Node87,epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1)Node86,epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1)Node85,epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3,epi_isl_443675_England_20200416_null_4,epi_isl_450808_Halland_20200331_null_1,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_441558_England_20200405_null_1,epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1,epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_444168_England_20200410_null_1,epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1,epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1,epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2,epi_isl_450787_Gujarat_20200511_null_5,(epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1,epi_isl_449123_England_20200408_null_4)Node130,(epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6)Node127,(epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1,epi_isl_439564_England_20200327_null_4)Node124,(epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16)Node121,(epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1,epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_237)Node117,epi_isl_439434_England_20200401_null_2,epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11,epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6,epi_isl_450722_Illinois_20200414_null_10,epi_isl_451137_South_Australia_20200324_null_7,(epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_1)Node142,epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1,epi_isl_450500_Hubei_20200110_null_1,epi_isl_448432_England_20200429_null_2,epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_448097_England_20200506_null_5,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,(epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2,epi_isl_442289_England_20200406_null_4)Node156,epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1,epi_isl_449988_Washington_20200417_null_4,((epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_448848_England_20200415_null_19)Node164,epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14)Node163,epi_isl_438404_England_20200330_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node117":"test",
"Node121":"test",
"Node124":"test",
"Node127":"test",
"Node130":"test",
"Node142":"test",
"Node156":"test",
"Node163":"test",
"Node164":"test",
"Node177":"test",
"Node185":"test",
"Node210":"test",
"Node242":"test",
"Node249":"test",
"Node25":"test",
"Node250":"test",
"Node254":"test",
"Node255":"test",
"Node260":"test",
"Node263":"test",
"Node271":"test",
"Node274":"test",
"Node277":"test",
"Node284":"test",
"Node301":"test",
"Node306":"test",
"Node311":"test",
"Node339":"test",
"Node378":"test",
"Node389":"test",
"Node397":"test",
"Node40":"test",
"Node404":"test",
"Node407":"test",
"Node414":"test",
"Node42":"test",
"Node432":"test",
"Node440":"test",
"Node462":"test",
"Node465":"test",
"Node47":"test",
"Node472":"test",
"Node52":"test",
"Node529":"test",
"Node53":"test",
"Node57":"test",
"Node61":"test",
"Node68":"test",
"Node76":"test",
"Node85":"test",
"Node86":"test",
"Node87":"test",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"background",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"background",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":"background",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":"background",
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":"background",
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":"background",
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5":"background",
"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_432510_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_432565_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8":"background",
"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_433716_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27":"background",
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_436674_California_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3":"background",
"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_438404_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2":"background",
"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6":"background",
"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_439564_England_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_439774_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_439778_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_439819_England_20200413_null_7":"background",
"epi_isl_439825_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_440121_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440132_England_20200322_null_5":"background",
"epi_isl_440400_England_20200316_null_4":"background",
"epi_isl_440671_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_440786_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_440909_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_440936_England_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_440988_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_441119_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441246_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_441558_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441658_England_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_441860_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441881_England_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_442091_England_20200405_null_8":"background",
"epi_isl_442117_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442274_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_442289_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_442649_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442747_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_442958_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_443037_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_443470_England_20200415_null_7":"background",
"epi_isl_443568_England_20200414_null_4":"background",
"epi_isl_443675_England_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_443946_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_444012_England_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_444015_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_444026_California_20200501_null_10":"background",
"epi_isl_444097_England_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_444168_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11":"background",
"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7":"background",
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7":"background",
"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_10":"background",
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8":"background",
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14":"background",
"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12":"background",
"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7":"background",
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6":"background",
"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15":"background",
"epi_isl_447700_France_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7":"background",
"epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447890_California_20200402_null_10":"background",
"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1":"background",
"epi_isl_447934_England_20200427_null_2":"background",
"epi_isl_448054_England_20200502_null_2":"background",
"epi_isl_448097_England_20200506_null_5":"background",
"epi_isl_448105_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5":"background",
"epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18":"background",
"epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22":"background",
"epi_isl_448409_England_20200429_null_76":"background",
"epi_isl_448432_England_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_448529_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_448559_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_448600_England_20200101_null_4":"background",
"epi_isl_448602_England_20200101_null_7":"background",
"epi_isl_448777_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_448822_England_20200324_null_4":"background",
"epi_isl_448848_England_20200415_null_19":"background",
"epi_isl_448886_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_449095_England_20200506_null_8":"background",
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_449148_England_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16":"background",
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":"background",
"epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_449390_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_449566_England_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_449662_England_20200414_null_9":"background",
"epi_isl_449708_England_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_449858_Washington_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_449897_Washington_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_449912_Washington_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_449928_Washington_20200413_null_6":"background",
"epi_isl_449988_Washington_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_450007_New_York_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_450109_New_York_20200312_null_3":"background",
"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_27":"background",
"epi_isl_450175_Louisiana_20200404_null_10":"background",
"epi_isl_450192_California_20200421_null_24":"background",
"epi_isl_450342_Chattogram_20200508_null_2":"background",
"epi_isl_450442_Henan_20200224_null_1":"background",
"epi_isl_450452_California_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_450464_California_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_450497_Lithuania_20200301_null_204":"background",
"epi_isl_450500_Hubei_20200110_null_1":"background",
"epi_isl_450510_Beirut_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_450538_Utah_20200313_null_79":"background",
"epi_isl_450620_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_450722_Illinois_20200414_null_10":"background",
"epi_isl_450787_Gujarat_20200511_null_5":"background",
"epi_isl_450791_Gujarat_20200427_null_2":"background",
"epi_isl_450808_Halland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_450815_Vastra_Gotaland_20200423_null_9":"background",
"epi_isl_450821_Jamtland_20200423_null_7":"background",
"epi_isl_450866_Florida_20200411_null_8":"background",
"epi_isl_451128_South_Australia_20200402_null_19":"background",
"epi_isl_451137_South_Australia_20200324_null_7":"background",
"epi_isl_451146_South_Australia_20200310_null_348":"background",
"epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_237":"background",
"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_451163_Gujarat_20200502_null_27553":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":6
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":9
}
}
}