{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002378598820685533],
[122.4307367814968, 299.1783598377208, 1, 0, 0.2903892201644593, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903892201644593, 0.002358566658969736],
[122.3153925304851, 299.3294004615405, 0, 1, 0.2900910779960667, 0, 0.00334080113232474, 0.02007826966529724, 0.7099089220039333, 1, 0.002357909914059404],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002357909958232555],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002357909958232555],
[122.1765302374697, 299.2677195618179, 1, 0, 0.2898996256222647, 0.008184878045368774, 0, -0.0491912514583376, 1, 0.2898996256222648, 0.002357909998004746],
[122.606436249693, 298.9079075373714, 0, 1, 0.2908713263424075, 0, 0.003345512028232219, 0.02010658222705985, 0.7091286736575925, 1, 0.002357909958232555],
[122.9910919986813, 298.6537009933443, 0, 1, 0.2916936104580505, 0, 0.003348359644209752, 0.02012369644584614, 0.7083063895419495, 1, 0.002356815551045997],
[122.561185986458, 299.0135130177908, 0, 1, 0.29072234713313, 0, 0.00334433046154841, 0.02009948099188739, 0.7092776528668701, 1, 0.002356596643532931],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002314279281880181],
[122.3153925304851, 299.3294004615405, 0, 1, 0.2900910779960667, 0, 0.00334080113232474, 0.02007826966529724, 0.7099089220039333, 1, 0.002321577222677513],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002361504004314715],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002357604413705507],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.001788757868248842],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.00267172493652984],
[122.4664331543047, 299.1783598377208, 1, 0, 0.2904492956862411, 0.008165502776912137, 0, -0.04907480577674769, 1, 0.290449295686241, 0.002366278296517857],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.002671771063570852],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002364087067359179],
[122.561185986458, 299.0135130177908, 0, 1, 0.29072234713313, 0, 0.00334433046154841, 0.02009948099188739, 0.7092776528668701, 1, 0.002358480474965467],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002358480375069654],
[122.561185986458, 299.1629294367575, 0, 1, 0.2906193445055031, 0, 0.003342660141357515, 0.02008944234011142, 0.7093806554944969, 1, 0.002347916374463066],
[122.36064279372, 299.2048277671156, 0, 1, 0.2902530006334148, 0, 0.003342192061079791, 0.02008662916995585, 0.7097469993665853, 1, 0.002355712706927727],
[101.1763897169967, 245.2985164825527, 0, 0, 0.2920165007815169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002622479296087592],
[122.561185986458, 298.8830638128296, 0, 1, 0.2908123341220758, 0, 0.003345790113508181, 0.02010825352413488, 0.7091876658779241, 1, 0.002409252362707237],
[122.43996522491, 299.2048277671156, 0, 1, 0.2903865226369003, 0, 0.003342192061079791, 0.02008662916995585, 0.7096134773630998, 1, 0.0023464513600898],
[100.9154913070743, 245.960501277951, 0, 0, 0.2909267100182442, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001540514190442122],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002517609990997537],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002670030493903104],
[122.561185986458, 299.3302541873567, 0, 1, 0.2905040830787278, 0, 0.003340791603958884, 0.02007821239966199, 0.7094959169212722, 1, 0.002672220602251394],
[122.561185986458, 299.1100749349623, 1, 0, 0.2906557722682876, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906557722682876, 0.002670085384848706],
[101.1763897169967, 245.6996028680286, 0, 0, 0.2916788474261349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007344782086437726],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.001935810242881258],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002671408610977461],
[121.8220843963804, 296.8227085956452, 0, 0, 0.2909915193874176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.002439922435170281],
[122.4910919986813, 299.1537009933443, 0, 1, 0.2905077781928114, 0, 0.003342763257414116, 0.02009006206930488, 0.7094922218071886, 1, 0.002672206963097971],
[122.561185986458, 299.1537009933443, 0, 1, 0.2906257041675837, 0, 0.003342763257414116, 0.02009006206930488, 0.7093742958324163, 1, 0.0026774280160328],
[98.22607716608032, 237.5097274433915, 0, 0, 0.2925695615942333, 0, 0, 0, 1, 1, 9.610742015822456e-05],
[101.1160344998122, 245.7335172748164, 1, 2, 0.2915270727105165, 0.009889628335868501, 0.008138897868634245, -0.01052191885720552, 0.7945885232372056, 0.6443934285654085, 0.008320936088526408],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002671488765891661],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002670780792163178],
[122.3153925304851, 299.3294004615404, 0, 1, 0.2900910779960668, 0, 0.003340801132324741, 0.02007826966529725, 0.7099089220039332, 1, 0.001783648755533063],
[100.4842596123129, 246.3917329727124, 0, 1, 0.2896835231042473, 0, 0.004058577728785847, 0.02439211879679487, 0.7103164768957526, 1, 0.002349279289012749],
[100.6848028050509, 246.1911897799745, 0, 0, 0.2902616639875165, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005020278721884385],
[100.9305962610238, 245.9453963240015, 0, 1, 0.2909702557068257, 0, 0.00406594315220533, 0.02443638511249519, 0.7090297442931743, 1, 0.00125747323616907],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 0, 0.2906740176174213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009087586498631521],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002670623370696778],
[101.4188312400928, 245.5272553327093, 0, 1, 0.2923187064651077, 0, 0.004072867587123552, 0.02447800108006136, 0.7076812935348924, 1, 0.003216991808543465],
[101.2976104785447, 245.5783821064806, 0, 1, 0.2920283116846575, 0, 0.004072019659965058, 0.02447290502391481, 0.7079716883153424, 1, 0.002702900094490401],
[122.682406748006, 298.9623862440196, 0, 1, 0.2909615125979423, 0, 0.003344902389104489, 0.02010291828589117, 0.7090384874020577, 1, 0.002669733722299432],
[100.9272443281469, 246.1492914496164, 0, 2, 0.2907924734870919, 0, 0.008125150343605092, 0.04883228698993623, 0.5029753156625573, 1, 0.00660314046681098],
[122.4818635552681, 299.1629294367575, 1, 1, 0.2904858914208969, 0.008164474077819409, 0.003342660141357515, -0.02897918093819649, 0.9156179468854069, 0.4965897297272007, 0.003486247236881903],
[122.8153925304851, 299.2593064737637, 0, 1, 0.2909802289031516, 0, 0.003341583631210048, 0.02008297249644753, 0.7090197710968484, 1, 0.002347124484112014],
[122.561185986458, 299.0135130177908, 0, 1, 0.29072234713313, 0, 0.00334433046154841, 0.02009948099188739, 0.7092776528668701, 1, 0.002517849449551372],
[101.2668902434666, 245.3482039316363, 0, 0, 0.2921594931821077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000710413230430946],
[101.2216399802316, 245.5239033998324, 0, 1, 0.2919190798922069, 0, 0.004072923190584475, 0.02447833525777459, 0.7080809201077931, 1, 0.001174527684289062],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 0, 0.2906740176174213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007830469725069652],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002386670710459899],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002671246408107446],
[123.2452985427084, 298.8294004615405, 0, 1, 0.2919987832330782, 0, 0.003346390945654963, 0.02011186453520343, 0.7080012167669218, 1, 0.001963356281044956],
[122.1312799742348, 299.5135130177908, 1, 0, 0.2896544247767922, 0.008187910584503523, 0, -0.04920947706833544, 1, 0.2896544247767922, 0.002671915287652247],
[122.5312325222218, 299.1135604698038, 1, 0, 0.2906029780487274, 0.008161184535694959, 0, -0.04904885307612167, 1, 0.2906029780487274, 0.002669589610047774],
[100.7753033315208, 246.1006892535046, 0, 0, 0.2905225656595966, 0, 0, 0, 1, 1, 6.870053410117589e-05],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002604880096562658],
[122.6448028019833, 299.2466373718314, 0, 1, 0.2907022781771894, 0, 0.00334172510268659, 0.02008382274234468, 0.7092977218228107, 1, 0.002499272262633425],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.0026695903102276],
[100.9922771607464, 245.883715424279, 0, 1, 0.2911480740080085, 0, 0.004066963110080198, 0.0244425150760721, 0.7088519259919914, 1, 0.001910089481829294],
[100.3165776925502, 246.5594148924751, 0, 0, 0.2892001171512637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007646393665166786],
[122.1312799742348, 299.5135130177908, 1, 0, 0.2896544247767922, 0.008187910584503523, 0, -0.04920947706833544, 1, 0.2896544247767922, 0.002670989968462688],
[122.8453459947213, 299.0460941790935, 0, 1, 0.2911776212954459, 0, 0.003343966095745486, 0.02009729114742849, 0.7088223787045541, 1, 0.002669051366946213],
[102.0362017414432, 244.8397908435821, 0, 0, 0.294157577701006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002758822872989095],
[122.9910919986813, 298.6537009933443, 0, 1, 0.2916936104580505, 0, 0.003348359644209752, 0.02012369644584614, 0.7083063895419495, 1, 0.002395387480205051],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.002671339957873121],
[100.7753033315208, 246.1006892535046, 0, 0, 0.2905225656595966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001472678748330538],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002524422212101283]
],
"NAMES": [
["Node558"],
["Node555"],
["Node552"],
["Node535"],
["Node532"],
["Node529"],
["Node526"],
["Node523"],
["Node520"],
["Node510"],
["Node504"],
["Node501"],
["Node47"],
["Node38"],
["Node43"],
["Node498"],
["Node515"],
["Node492"],
["Node489"],
["Node486"],
["Node543"],
["Node57"],
["Node61"],
["Node60"],
["Node483"],
["Node78"],
["Node77"],
["Node73"],
["Node163"],
["Node151"],
["Node156"],
["Node155"],
["Node224"],
["Node187"],
["Node185"],
["Node201"],
["Node210"],
["Node209"],
["Node207"],
["Node271"],
["Node266"],
["Node296"],
["Node295"],
["Node294"],
["Node293"],
["Node290"],
["Node283"],
["Node286"],
["Node278"],
["Node332"],
["Node331"],
["Node360"],
["Node366"],
["Node374"],
["Node373"],
["Node372"],
["Node406"],
["Node390"],
["Node403"],
["Node399"],
["Node410"],
["Node420"],
["Node419"],
["Node447"],
["Node436"],
["Node460"],
["Node459"],
["Node458"],
["Node479"],
["Node104"],
["Node103"],
["Node93"],
["Node99"],
["Node98"]
],
"RESOLVED": [
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002378598820685533],
[122.4307367814968, 299.1783598377208, 1, 0, 0.2903892201644593, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903892201644593, 0.002358566658969736],
[122.3153925304851, 299.3294004615405, 0, 1, 0.2900910779960667, 0, 0.00334080113232474, 0.02007826966529724, 0.7099089220039333, 1, 0.002357909914059404],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002357909958232555],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002357909958232555],
[122.1765302374697, 299.2677195618179, 1, 0, 0.2898996256222647, 0.008184878045368774, 0, -0.0491912514583376, 1, 0.2898996256222648, 0.002357909998004746],
[122.606436249693, 298.9079075373714, 0, 1, 0.2908713263424075, 0, 0.003345512028232219, 0.02010658222705985, 0.7091286736575925, 1, 0.002357909958232555],
[122.9910919986813, 298.6537009933443, 0, 1, 0.2916936104580505, 0, 0.003348359644209752, 0.02012369644584614, 0.7083063895419495, 1, 0.002356815551045997],
[122.561185986458, 299.0135130177908, 0, 1, 0.29072234713313, 0, 0.00334433046154841, 0.02009948099188739, 0.7092776528668701, 1, 0.002356596643532931],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002314279281880181],
[122.3153925304851, 299.3294004615405, 0, 1, 0.2900910779960667, 0, 0.00334080113232474, 0.02007826966529724, 0.7099089220039333, 1, 0.002321577222677513],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002361504004314715],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002357604413705507],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.001788757868248842],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.00267172493652984],
[122.4664331543047, 299.1783598377208, 1, 0, 0.2904492956862411, 0.008165502776912137, 0, -0.04907480577674769, 1, 0.290449295686241, 0.002366278296517857],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.002671771063570852],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002364087067359179],
[122.561185986458, 299.0135130177908, 0, 1, 0.29072234713313, 0, 0.00334433046154841, 0.02009948099188739, 0.7092776528668701, 1, 0.002358480474965467],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002358480375069654],
[122.561185986458, 299.1629294367575, 0, 1, 0.2906193445055031, 0, 0.003342660141357515, 0.02008944234011142, 0.7093806554944969, 1, 0.002347916374463066],
[122.36064279372, 299.2048277671156, 0, 1, 0.2902530006334148, 0, 0.003342192061079791, 0.02008662916995585, 0.7097469993665853, 1, 0.002355712706927727],
[101.1763897169967, 245.2985164825527, 0, 0, 0.2920165007815169, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002622479296087592],
[122.561185986458, 298.8830638128296, 0, 1, 0.2908123341220758, 0, 0.003345790113508181, 0.02010825352413488, 0.7091876658779241, 1, 0.002409252362707237],
[122.43996522491, 299.2048277671156, 0, 1, 0.2903865226369003, 0, 0.003342192061079791, 0.02008662916995585, 0.7096134773630998, 1, 0.0023464513600898],
[100.9154913070743, 245.960501277951, 0, 0, 0.2909267100182442, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001540514190442122],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002517609990997537],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002670030493903104],
[122.561185986458, 299.3302541873567, 0, 1, 0.2905040830787278, 0, 0.003340791603958884, 0.02007821239966199, 0.7094959169212722, 1, 0.002672220602251394],
[122.561185986458, 299.1100749349623, 1, 0, 0.2906557722682876, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906557722682876, 0.002670085384848706],
[101.1763897169967, 245.6996028680286, 0, 0, 0.2916788474261349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007344782086437726],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.001935810242881258],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002671408610977461],
[121.8220843963804, 296.8227085956452, 0, 0, 0.2909915193874176, 0, 0, 0, 1, 1, 0.002439922435170281],
[122.4910919986813, 299.1537009933443, 0, 1, 0.2905077781928114, 0, 0.003342763257414116, 0.02009006206930488, 0.7094922218071886, 1, 0.002672206963097971],
[122.561185986458, 299.1537009933443, 0, 1, 0.2906257041675837, 0, 0.003342763257414116, 0.02009006206930488, 0.7093742958324163, 1, 0.0026774280160328],
[98.22607716608032, 237.5097274433915, 0, 0, 0.2925695615942333, 0, 0, 0, 1, 1, 9.610742015822456e-05],
[101.1160344998122, 245.7335172748164, 1, 2, 0.2915270727105165, 0.009889628335868501, 0.008138897868634245, -0.01052191885720552, 0.7945885232372056, 0.6443934285654085, 0.008320936088526408],
[122.4307367814968, 299.2140562105288, 1, 0, 0.2903646358649857, 0.008167883542061081, 0, -0.04908911421438791, 1, 0.2903646358649857, 0.002671488765891661],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002670780792163178],
[122.3153925304851, 299.3294004615404, 0, 1, 0.2900910779960668, 0, 0.003340801132324741, 0.02007826966529725, 0.7099089220039332, 1, 0.001783648755533063],
[100.4842596123129, 246.3917329727124, 0, 1, 0.2896835231042473, 0, 0.004058577728785847, 0.02439211879679487, 0.7103164768957526, 1, 0.002349279289012749],
[100.6848028050509, 246.1911897799745, 0, 0, 0.2902616639875165, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005020278721884385],
[100.9305962610238, 245.9453963240015, 0, 1, 0.2909702557068257, 0, 0.00406594315220533, 0.02443638511249519, 0.7090297442931743, 1, 0.00125747323616907],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 0, 0.2906740176174213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009087586498631521],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002670623370696778],
[101.4188312400928, 245.5272553327093, 0, 1, 0.2923187064651077, 0, 0.004072867587123552, 0.02447800108006136, 0.7076812935348924, 1, 0.003216991808543465],
[101.2976104785447, 245.5783821064806, 0, 1, 0.2920283116846575, 0, 0.004072019659965058, 0.02447290502391481, 0.7079716883153424, 1, 0.002702900094490401],
[122.682406748006, 298.9623862440196, 0, 1, 0.2909615125979423, 0, 0.003344902389104489, 0.02010291828589117, 0.7090384874020577, 1, 0.002669733722299432],
[100.9272443281469, 246.1492914496164, 0, 2, 0.2907924734870919, 0, 0.008125150343605092, 0.04883228698993623, 0.5029753156625573, 1, 0.00660314046681098],
[122.4818635552681, 299.1629294367575, 1, 1, 0.2904858914208969, 0.008164474077819409, 0.003342660141357515, -0.02897918093819649, 0.9156179468854069, 0.4965897297272007, 0.003486247236881903],
[122.8153925304851, 299.2593064737637, 0, 1, 0.2909802289031516, 0, 0.003341583631210048, 0.02008297249644753, 0.7090197710968484, 1, 0.002347124484112014],
[122.561185986458, 299.0135130177908, 0, 1, 0.29072234713313, 0, 0.00334433046154841, 0.02009948099188739, 0.7092776528668701, 1, 0.002517849449551372],
[101.2668902434666, 245.3482039316363, 0, 0, 0.2921594931821077, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000710413230430946],
[101.2216399802316, 245.5239033998324, 0, 1, 0.2919190798922069, 0, 0.004072923190584475, 0.02447833525777459, 0.7080809201077931, 1, 0.001174527684289062],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 0, 0.2906740176174213, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007830469725069652],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 0, 1, 0.2906740176174213, 0, 0.003343546675834308, 0.02009477042687492, 0.7093259823825786, 1, 0.002386670710459899],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002671246408107446],
[123.2452985427084, 298.8294004615405, 0, 1, 0.2919987832330782, 0, 0.003346390945654963, 0.02011186453520343, 0.7080012167669218, 1, 0.001963356281044956],
[122.1312799742348, 299.5135130177908, 1, 0, 0.2896544247767922, 0.008187910584503523, 0, -0.04920947706833544, 1, 0.2896544247767922, 0.002671915287652247],
[122.5312325222218, 299.1135604698038, 1, 0, 0.2906029780487274, 0.008161184535694959, 0, -0.04904885307612167, 1, 0.2906029780487274, 0.002669589610047774],
[100.7753033315208, 246.1006892535046, 0, 0, 0.2905225656595966, 0, 0, 0, 1, 1, 6.870053410117589e-05],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002604880096562658],
[122.6448028019833, 299.2466373718314, 0, 1, 0.2907022781771894, 0, 0.00334172510268659, 0.02008382274234468, 0.7092977218228107, 1, 0.002499272262633425],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.0026695903102276],
[100.9922771607464, 245.883715424279, 0, 1, 0.2911480740080085, 0, 0.004066963110080198, 0.0244425150760721, 0.7088519259919914, 1, 0.001910089481829294],
[100.3165776925502, 246.5594148924751, 0, 0, 0.2892001171512637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007646393665166786],
[122.1312799742348, 299.5135130177908, 1, 0, 0.2896544247767922, 0.008187910584503523, 0, -0.04920947706833544, 1, 0.2896544247767922, 0.002670989968462688],
[122.8453459947213, 299.0460941790935, 0, 1, 0.2911776212954459, 0, 0.003343966095745486, 0.02009729114742849, 0.7088223787045541, 1, 0.002669051366946213],
[102.0362017414432, 244.8397908435821, 0, 0, 0.294157577701006, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002758822872989095],
[122.9910919986813, 298.6537009933443, 0, 1, 0.2916936104580505, 0, 0.003348359644209752, 0.02012369644584614, 0.7083063895419495, 1, 0.002395387480205051],
[122.561185986458, 299.0836070055676, 1, 0, 0.2906740176174213, 0.008159189974797499, 0, -0.04903686573237481, 1, 0.2906740176174214, 0.002671339957873121],
[100.7753033315208, 246.1006892535046, 0, 0, 0.2905225656595966, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001472678748330538],
[122.36064279372, 299.2841501983056, 0, 1, 0.2901983964403758, 0, 0.003341306244708918, 0.02008130539902072, 0.7098016035596242, 1, 0.002524422212101283]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[2.815332712938987, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2525194923013131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.815332712938987, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2525194923013131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.195340020872699, 7.953631835841065, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.83001967326119, 6.729376481490752, 0, 0, 0.3627119976493735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[6.911663973110619, 4.23730788360314, 0, 0, 0.6199373414821663, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.889427736766991, 9.259544119946774, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.225757010977169, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2107844973668814, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.604262662284022, 7.711467535559608, 0, 0, 0.1722100821098673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.225757010977169, 7.432647904475841, 0, 0, 0.2304476805912391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.195340020872699, 7.953631835841065, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.195340020872699, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3006533356376493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.82689621547093, 6.126735620370132, 0, 0, 0.2296933342122371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.604262662284022, 7.711467535559608, 0, 0, 0.1722100821098673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.225757010977169, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2107844973668814, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.350240827436493, 7.432647904475841, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.889427736766991, 9.259544119946774, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[0.7575584769039398, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2525194923013132, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.7575584769039398, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2525194923013132, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[2.203361401061886, 8.833429286086648, 0, 0, 0.1996378715080214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03606967554835129],
[0.9971331512384096, 2.002866848761592, 0, 1, 0.3323777170794697, 0, 0.4992843136918053, 3.000706924144589, 0.6676222829205303, 1, 0.1663888964545034],
[0.8577173871162929, 2.142282612883708, 1, 0, 0.2859057957054308, 1.165885191347317, 0, -7.006989145252919, 1, 0.2859057957054308, 0.1663888964545034],
[1.030593597997507, 1.81076153962262, 0, 0, 0.3627119976493735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.839089255406952, 1.160910744593049, 1, 0, 0.613029751802317, 0.5437473994587181, 0, -3.267930799741784, 1, 0.613029751802317, 0.1663888964545034],
[0.5161698943951116, 2.48383010560489, 0, 1, 0.1720566314650371, 0, 0.4026040258323017, 2.419656806500834, 0.8279433685349629, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.010016421218557, 1, 0.3333333333333333, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.005008210609279, 0.6666666666666667, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.9982905192181306, 2.001709480781871, 0, 1, 0.3327635064060434, 0, 0.4995729947831383, 3.002441902243995, 0.6672364935939565, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2107844973668815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4329359638434379, 2.077474477846113, 0, 1, 0.1724562472549565, 0, 0.4813536872119754, 2.892943564558075, 0.8275437527450434, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2304476805912391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.140187975553502, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.001127909437638, 0, 1, 0.3005348047552961, 0, 0.4997181815734221, 3.003314477237745, 0.699465195244704, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 1.64860106360768, 0, 0, 0.2296933342122371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4316799834734419, 2.075025652948223, 0, 0, 0.1722100821098672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.243560843189058, 0, 1, 0.2107014938688009, 0, 0.4457200271772317, 2.678784682601146, 0.7892985061311991, 1, 0.1663888964545034],
[0.9967804325006862, 2.003219567499315, 0, 1, 0.3322601441668953, 0, 0.499196401744584, 3.000178571898168, 0.6677398558331047, 1, 0.1663888964545034],
[0.6324101067726376, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.9965705134114772, 2.003429486588524, 0, 1, 0.3321901711371589, 0, 0.4991440960084989, 2.999864213565372, 0.6678098288628411, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.090500526469887, 1.508413088054179, 0, 0, 0.4195986047306879, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.015118724475844, 0, 0, 0.1961087511845087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.010016421218557, 0.4444444444444445, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.052935858789516, 0, 0, 0.295189305396134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 1.510666812285611, 0, 1, 0.3983005610727136, 0, 0.6619593360146824, 3.978386479627176, 0.6016994389272864, 1, 0.1663888964545034],
[0.9965168419347751, 2.003483158065226, 0, 1, 0.3321722806449249, 0, 0.4991307243958591, 2.999783849953829, 0.6678277193550751, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3006533356376492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4362382062554167, 2.074423908102791, 0, 1, 0.1737542474395966, 0, 0.4820615478321264, 2.897197818509116, 0.8262457525604034, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.000641244990308, 1.8577469113194, 1, 1, 0.3500718552802065, 0.9993591659413213, 0.5382864554406848, -2.771054561484577, 0.8774496961406741, 0.5775934067010871, 0.1663888964545034],
[1.007614681113306, 1.992385318886695, 0, 1, 0.3358715603711019, 0, 0.5019109459001534, 3.016493026849262, 0.6641284396288981, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.397550432971588, 0, 1, 0.1998734525196847, 0, 0.4170923732188496, 2.506732012210307, 0.8001265474803153, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.854361037898382, 1.142797048913511, 1, 0, 0.61870644930541, 0.5392693114029931, 0, -3.241017416991213, 1, 0.61870644930541, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8575966603215028, 2.142403339678498, 1, 0, 0.2858655534405009, 1.166049316965754, 0, -7.007975542914866, 1, 0.2858655534405008, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 1.998939315589555, 0, 2, 0.3334512288400249, 0, 1.000530623617322, 6.01320547787215, 0.4442872643348729, 1, 0.1663888964545034],
[1.859812024446499, 1.140187975553501, 0, 0, 0.6199373414821664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.052935858789516, 0, 0, 0.295189305396134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8547802440600247, 2.143897478443535, 1, 2, 0.2850523874724287, 1.169891333999733, 0.9328804292694048, -1.424439429437143, 0.8025591949167856, 0.6345544644700813, 0.1663888964545034],
[1.052033496537345, 2.10406699307469, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.158067960365977],
[0.5256632345487784, 1.731226051274539, 0, 1, 0.2329149408660582, 0, 0.5776253189257369, 3.654284635471685, 0.7670850591339418, 1, 0.158067960365977],
[0.630077184011571, 2.526023305600464, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.158067960365977],
[1.052033496537345, 2.10406699307469, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4752700381173187, 3.006744928048159, 0.6666666666666666, 1, 0.158067960365977],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.010016421218557, 1, 0.3333333333333333, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2107844973668815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8579629714363504, 2.14203702856365, 1, 0, 0.28598765714545, 1.165551467012451, 0, -7.004983456520216, 1, 0.28598765714545, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.010016421218557, 1, 0.3333333333333333, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8577176351161153, 2.141288817206687, 1, 1, 0.2860005967815749, 1.165884854244163, 0.4670084632975858, -4.200258585990889, 0.9182036586405831, 0.4902048522037328, 0.1663888964545034],
[0.9968185771996685, 2.003181422800333, 0, 1, 0.332272859066556, 0, 0.4992059074719539, 3.000235701475756, 0.667727140933444, 1, 0.1663888964545034],
[0.6078267704223983, 2.029764412369944, 0, 0, 0.2304476805912391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1639489740193331],
[0.4316799834734419, 1.708507992080061, 0, 0, 0.2017019011434262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.078950461526472, 1.527921706119397, 0, 1, 0.4138869849152658, 0, 0.6544837971703351, 3.933458368415191, 0.5861130150847342, 1, 0.1663888964545034],
[1.038368365700023, 2.084437077251013, 0, 1, 0.3325113858898522, 0, 0.4797458320587999, 3.002431781815099, 0.6674886141101477, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 2.08264992615887, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9603150173628529, 0, -6.010016421218558, 1, 0.3333333333333333, 0.1597857559876924],
[0.6585444310860783, 2.08264992615887, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.0420599501096, 1.933814851689194, 0, 1, 0.350169284500718, 0, 0.5171125866193946, 3.236287136002445, 0.649830715499282, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 2.08264992615887, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 1.93666868769144, 0, 0, 0.3496733321811753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 2.08264992615887, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9603150173628529, 6.010016421218558, 0.4444444444444445, 1, 0.1597857559876924],
[0.5119017229323162, 2.229292634312632, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.929479858879932, 1.194495030358373, 1, 0, 0.6176361613938524, 0.5182743916179061, 0, -3.243558153317662, 1, 0.6176361613938524, 0.1597857559876924],
[0.893418974689961, 2.230555914548344, 1, 0, 0.2859878860638975, 1.119295681342592, 0, -7.004977849394827, 1, 0.2859878860638975, 0.1597857559876924],
[0.9847983306441113, 2.139176558594195, 1, 0, 0.3152388753304693, 1.015436327299566, 0, -6.354986531952076, 1, 0.3152388753304693, 0.1597857559876924],
[0.6585444310860783, 2.08264992615887, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[0.5156358129944706, 1.719310325835375, 0, 1, 0.2307150960087311, 0, 0.5816285663928192, 3.640052661750523, 0.7692849039912689, 1, 0.1597857559876924],
[0.449519142852613, 2.160776011445189, 0, 0, 0.1722100821098672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[0.5114012812226307, 2.098893873075171, 1, 0, 0.1959170327465146, 1.955411604775908, 0, -12.23770912925759, 1, 0.1959170327465145, 0.1597857559876924],
[1.037883193087062, 2.086091696151244, 0, 1, 0.3322316055300049, 0, 0.479365313540608, 3.000050352282536, 0.667768394469995, 1, 0.1597857559876924],
[0.5119017229323162, 1.716729441693984, 0, 0, 0.2296933342122371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[0.5119017229323162, 2.098393431365485, 0, 0, 0.1961087511845087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.037786957915255, 2.086187931323051, 0, 1, 0.3322008001697767, 0, 0.4793432005743627, 2.999911960934017, 0.6677991998302233, 1, 0.1597857559876924],
[0.8953437246120043, 2.084061139462035, 0, 1, 0.3005109293497329, 0, 0.4798323720282664, 3.00297338184028, 0.699489070650267, 1, 0.1597857559876924],
[1.062720890254445, 2.12544178050889, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1565687641791489],
[1.06919222686113, 2.117915423399281, 1, 2, 0.3354741490372214, 0.9352855126301655, 0.9443247723225768, 0.05773348049211451, 0.7378817563334552, 0.7065489682700203, 0.1565687641791489],
[0.7966162836406951, 2.39154638712264, 0, 1, 0.2498668875794732, 0, 0.4181394955935344, 2.67064441484057, 0.7501331124205268, 1, 0.1565687641791489],
[0.6188368670614068, 2.440309193938313, 0, 1, 0.2022907225486228, 0, 0.4097841382083807, 2.511364558117431, 0.7977092774513772, 1, 0.1631719046459599],
[1.014425086649862, 2.044720974349858, 0, 2, 0.3316040053080534, 0, 0.9781285686844984, 5.994466822010688, 0.4467532057202368, 1, 0.1631719046459599],
[0.7832731622125401, 2.27587289878718, 0, 1, 0.2560430743070073, 0, 0.439391848522342, 2.692815589029905, 0.7439569256929928, 1, 0.1631719046459599],
[1.033955217389253, 2.076718340776963, 0, 1, 0.3323894963760786, 0, 0.4815289489983846, 3.000759868513654, 0.6676105036239215, 1, 0.1604690045514695],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.490332913201864, 3.005008210609279, 0.6666666666666667, 1, 0.1631719046459599],
[0.5184366318938813, 2.54070942910584, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[0.6107214082501321, 2.448424652749588, 0, 0, 0.1996378715080214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[0.5184366318938813, 2.54070942910584, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.016432883511397, 2.042713177488324, 0, 1, 0.3322603312308761, 0, 0.4895449889982002, 3.000179412383424, 0.6677396687691239, 1, 0.1631719046459599],
[0.8748779458706242, 2.094779819162259, 1, 0, 0.2946056465401953, 1.143016582735849, 0, -7.00498400883347, 1, 0.2946056465401954, 0.1631719046459599],
[0.8767635225952336, 2.182382538404486, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.017028560294789, 2.042117500704931, 0, 1, 0.3324550511858943, 0, 0.489687787139968, 3.001054551654965, 0.6675449488141056, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9806658264037279, 0, -6.010016421218558, 1, 0.3333333333333333, 0.1631719046459599],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.6324101067726376, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4316799834734419, 2.200730123299197, 0, 0, 0.1639866000980698, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.9897184006183789, 2.010281599381623, 0, 1, 0.3299061335394595, 0, 0.4974427464826855, 2.989639074977001, 0.6700938664605405, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.015118724475844, 0, 0, 0.1961087511845087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034]
],
"RESOLVED": [
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[2.815332712938987, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2525194923013131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.815332712938987, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2525194923013131, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.195340020872699, 7.953631835841065, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.83001967326119, 6.729376481490752, 0, 0, 0.3627119976493735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[6.911663973110619, 4.23730788360314, 0, 0, 0.6199373414821663, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.889427736766991, 9.259544119946774, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.225757010977169, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2107844973668814, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.604262662284022, 7.711467535559608, 0, 0, 0.1722100821098673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.225757010977169, 7.432647904475841, 0, 0, 0.2304476805912391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.195340020872699, 7.953631835841065, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.195340020872699, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3006533356376493, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.82689621547093, 6.126735620370132, 0, 0, 0.2296933342122371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.604262662284022, 7.711467535559608, 0, 0, 0.1722100821098673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.225757010977169, 8.333639143774775, 0, 0, 0.2107844973668814, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[2.350240827436493, 7.432647904475841, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[3.716323952237921, 7.432647904475841, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[1.889427736766991, 9.259544119946774, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03636328369076375],
[0.7575584769039398, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2525194923013132, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.7575584769039398, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2525194923013132, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[2.203361401061886, 8.833429286086648, 0, 0, 0.1996378715080214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.03606967554835129],
[0.9971331512384096, 2.002866848761592, 0, 1, 0.3323777170794697, 0, 0.4992843136918053, 3.000706924144589, 0.6676222829205303, 1, 0.1663888964545034],
[0.8577173871162929, 2.142282612883708, 1, 0, 0.2859057957054308, 1.165885191347317, 0, -7.006989145252919, 1, 0.2859057957054308, 0.1663888964545034],
[1.030593597997507, 1.81076153962262, 0, 0, 0.3627119976493735, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.839089255406952, 1.160910744593049, 1, 0, 0.613029751802317, 0.5437473994587181, 0, -3.267930799741784, 1, 0.613029751802317, 0.1663888964545034],
[0.5161698943951116, 2.48383010560489, 0, 1, 0.1720566314650371, 0, 0.4026040258323017, 2.419656806500834, 0.8279433685349629, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.010016421218557, 1, 0.3333333333333333, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999998, 3.005008210609279, 0.6666666666666667, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.9982905192181306, 2.001709480781871, 0, 1, 0.3327635064060434, 0, 0.4995729947831383, 3.002441902243995, 0.6672364935939565, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2107844973668815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4329359638434379, 2.077474477846113, 0, 1, 0.1724562472549565, 0, 0.4813536872119754, 2.892943564558075, 0.8275437527450434, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2304476805912391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.140187975553502, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.001127909437638, 0, 1, 0.3005348047552961, 0, 0.4997181815734221, 3.003314477237745, 0.699465195244704, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 1.64860106360768, 0, 0, 0.2296933342122371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4316799834734419, 2.075025652948223, 0, 0, 0.1722100821098672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.243560843189058, 0, 1, 0.2107014938688009, 0, 0.4457200271772317, 2.678784682601146, 0.7892985061311991, 1, 0.1663888964545034],
[0.9967804325006862, 2.003219567499315, 0, 1, 0.3322601441668953, 0, 0.499196401744584, 3.000178571898168, 0.6677398558331047, 1, 0.1663888964545034],
[0.6324101067726376, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.9965705134114772, 2.003429486588524, 0, 1, 0.3321901711371589, 0, 0.4991440960084989, 2.999864213565372, 0.6678098288628411, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.090500526469887, 1.508413088054179, 0, 0, 0.4195986047306879, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.015118724475844, 0, 0, 0.1961087511845087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9999999999999996, 6.010016421218557, 0.4444444444444445, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.052935858789516, 0, 0, 0.295189305396134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 1.510666812285611, 0, 1, 0.3983005610727136, 0, 0.6619593360146824, 3.978386479627176, 0.6016994389272864, 1, 0.1663888964545034],
[0.9965168419347751, 2.003483158065226, 0, 1, 0.3321722806449249, 0, 0.4991307243958591, 2.999783849953829, 0.6678277193550751, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3006533356376492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4362382062554167, 2.074423908102791, 0, 1, 0.1737542474395966, 0, 0.4820615478321264, 2.897197818509116, 0.8262457525604034, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.000641244990308, 1.8577469113194, 1, 1, 0.3500718552802065, 0.9993591659413213, 0.5382864554406848, -2.771054561484577, 0.8774496961406741, 0.5775934067010871, 0.1663888964545034],
[1.007614681113306, 1.992385318886695, 0, 1, 0.3358715603711019, 0, 0.5019109459001534, 3.016493026849262, 0.6641284396288981, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.397550432971588, 0, 1, 0.1998734525196847, 0, 0.4170923732188496, 2.506732012210307, 0.8001265474803153, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.854361037898382, 1.142797048913511, 1, 0, 0.61870644930541, 0.5392693114029931, 0, -3.241017416991213, 1, 0.61870644930541, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8575966603215028, 2.142403339678498, 1, 0, 0.2858655534405009, 1.166049316965754, 0, -7.007975542914866, 1, 0.2858655534405008, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 1.998939315589555, 0, 2, 0.3334512288400249, 0, 1.000530623617322, 6.01320547787215, 0.4442872643348729, 1, 0.1663888964545034],
[1.859812024446499, 1.140187975553501, 0, 0, 0.6199373414821664, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8598120244464986, 2.052935858789516, 0, 0, 0.295189305396134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8547802440600247, 2.143897478443535, 1, 2, 0.2850523874724287, 1.169891333999733, 0.9328804292694048, -1.424439429437143, 0.8025591949167856, 0.6345544644700813, 0.1663888964545034],
[1.052033496537345, 2.10406699307469, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.158067960365977],
[0.5256632345487784, 1.731226051274539, 0, 1, 0.2329149408660582, 0, 0.5776253189257369, 3.654284635471685, 0.7670850591339418, 1, 0.158067960365977],
[0.630077184011571, 2.526023305600464, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.158067960365977],
[1.052033496537345, 2.10406699307469, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4752700381173187, 3.006744928048159, 0.6666666666666666, 1, 0.158067960365977],
[0.5989136145240646, 2.401086385475936, 0, 0, 0.1996378715080215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.010016421218557, 1, 0.3333333333333333, 0.1663888964545034],
[0.5989136145240646, 2.242441523096061, 0, 0, 0.2107844973668815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8579629714363504, 2.14203702856365, 1, 0, 0.28598765714545, 1.165551467012451, 0, -7.004983456520216, 1, 0.28598765714545, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -6.010016421218557, 1, 0.3333333333333333, 0.1663888964545034],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.8577176351161153, 2.141288817206687, 1, 1, 0.2860005967815749, 1.165884854244163, 0.4670084632975858, -4.200258585990889, 0.9182036586405831, 0.4902048522037328, 0.1663888964545034],
[0.9968185771996685, 2.003181422800333, 0, 1, 0.332272859066556, 0, 0.4992059074719539, 3.000235701475756, 0.667727140933444, 1, 0.1663888964545034],
[0.6078267704223983, 2.029764412369944, 0, 0, 0.2304476805912391, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1639489740193331],
[0.4316799834734419, 1.708507992080061, 0, 0, 0.2017019011434262, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[1.078950461526472, 1.527921706119397, 0, 1, 0.4138869849152658, 0, 0.6544837971703351, 3.933458368415191, 0.5861130150847342, 1, 0.1663888964545034],
[1.038368365700023, 2.084437077251013, 0, 1, 0.3325113858898522, 0, 0.4797458320587999, 3.002431781815099, 0.6674886141101477, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 2.08264992615887, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9603150173628529, 0, -6.010016421218558, 1, 0.3333333333333333, 0.1597857559876924],
[0.6585444310860783, 2.08264992615887, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.0420599501096, 1.933814851689194, 0, 1, 0.350169284500718, 0, 0.5171125866193946, 3.236287136002445, 0.649830715499282, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 2.08264992615887, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 1.93666868769144, 0, 0, 0.3496733321811753, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.041324963079435, 2.08264992615887, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.9603150173628529, 6.010016421218558, 0.4444444444444445, 1, 0.1597857559876924],
[0.5119017229323162, 2.229292634312632, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.929479858879932, 1.194495030358373, 1, 0, 0.6176361613938524, 0.5182743916179061, 0, -3.243558153317662, 1, 0.6176361613938524, 0.1597857559876924],
[0.893418974689961, 2.230555914548344, 1, 0, 0.2859878860638975, 1.119295681342592, 0, -7.004977849394827, 1, 0.2859878860638975, 0.1597857559876924],
[0.9847983306441113, 2.139176558594195, 1, 0, 0.3152388753304693, 1.015436327299566, 0, -6.354986531952076, 1, 0.3152388753304693, 0.1597857559876924],
[0.6585444310860783, 2.08264992615887, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[0.5156358129944706, 1.719310325835375, 0, 1, 0.2307150960087311, 0, 0.5816285663928192, 3.640052661750523, 0.7692849039912689, 1, 0.1597857559876924],
[0.449519142852613, 2.160776011445189, 0, 0, 0.1722100821098672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[0.5114012812226307, 2.098893873075171, 1, 0, 0.1959170327465146, 1.955411604775908, 0, -12.23770912925759, 1, 0.1959170327465145, 0.1597857559876924],
[1.037883193087062, 2.086091696151244, 0, 1, 0.3322316055300049, 0, 0.479365313540608, 3.000050352282536, 0.667768394469995, 1, 0.1597857559876924],
[0.5119017229323162, 1.716729441693984, 0, 0, 0.2296933342122371, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[0.5119017229323162, 2.098393431365485, 0, 0, 0.1961087511845087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1597857559876924],
[1.037786957915255, 2.086187931323051, 0, 1, 0.3322008001697767, 0, 0.4793432005743627, 2.999911960934017, 0.6677991998302233, 1, 0.1597857559876924],
[0.8953437246120043, 2.084061139462035, 0, 1, 0.3005109293497329, 0, 0.4798323720282664, 3.00297338184028, 0.699489070650267, 1, 0.1597857559876924],
[1.062720890254445, 2.12544178050889, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1565687641791489],
[1.06919222686113, 2.117915423399281, 1, 2, 0.3354741490372214, 0.9352855126301655, 0.9443247723225768, 0.05773348049211451, 0.7378817563334552, 0.7065489682700203, 0.1565687641791489],
[0.7966162836406951, 2.39154638712264, 0, 1, 0.2498668875794732, 0, 0.4181394955935344, 2.67064441484057, 0.7501331124205268, 1, 0.1565687641791489],
[0.6188368670614068, 2.440309193938313, 0, 1, 0.2022907225486228, 0, 0.4097841382083807, 2.511364558117431, 0.7977092774513772, 1, 0.1631719046459599],
[1.014425086649862, 2.044720974349858, 0, 2, 0.3316040053080534, 0, 0.9781285686844984, 5.994466822010688, 0.4467532057202368, 1, 0.1631719046459599],
[0.7832731622125401, 2.27587289878718, 0, 1, 0.2560430743070073, 0, 0.439391848522342, 2.692815589029905, 0.7439569256929928, 1, 0.1631719046459599],
[1.033955217389253, 2.076718340776963, 0, 1, 0.3323894963760786, 0, 0.4815289489983846, 3.000759868513654, 0.6676105036239215, 1, 0.1604690045514695],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.490332913201864, 3.005008210609279, 0.6666666666666667, 1, 0.1631719046459599],
[0.5184366318938813, 2.54070942910584, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[0.6107214082501321, 2.448424652749588, 0, 0, 0.1996378715080214, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[0.5184366318938813, 2.54070942910584, 0, 0, 0.1694710293513928, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.016432883511397, 2.042713177488324, 0, 1, 0.3322603312308761, 0, 0.4895449889982002, 3.000179412383424, 0.6677396687691239, 1, 0.1631719046459599],
[0.8748779458706242, 2.094779819162259, 1, 0, 0.2946056465401953, 1.143016582735849, 0, -7.00498400883347, 1, 0.2946056465401954, 0.1631719046459599],
[0.8767635225952336, 2.182382538404486, 0, 0, 0.2866040081488328, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1631719046459599],
[1.017028560294789, 2.042117500704931, 0, 1, 0.3324550511858943, 0, 0.489687787139968, 3.001054551654965, 0.6675449488141056, 1, 0.1631719046459599],
[1.019715353666574, 2.039430707333147, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9806658264037279, 0, -6.010016421218558, 1, 0.3333333333333333, 0.1631719046459599],
[0.4915869119458218, 2.140823194826817, 0, 0, 0.1867440451930616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.6324101067726376, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2402399630458716, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.4316799834734419, 2.200730123299197, 0, 0, 0.1639866000980698, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034],
[0.9897184006183789, 2.010281599381623, 0, 1, 0.3299061335394595, 0, 0.4974427464826855, 2.989639074977001, 0.6700938664605405, 1, 0.1663888964545034],
[0.4915869119458218, 2.015118724475844, 0, 0, 0.1961087511845087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1663888964545034]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node103":{
"Global MG94xREV":0.002395387480205051,
"Nucleotide GTR":0.002473922538459807,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node104":{
"Global MG94xREV":0.0002758822872989095,
"Nucleotide GTR":0.0002849273506481674,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node151":{
"Global MG94xREV":0.002670085384848706,
"Nucleotide GTR":0.002757626675340176,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node155":{
"Global MG94xREV":0.001935810242881258,
"Nucleotide GTR":0.001999277624025711,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node156":{
"Global MG94xREV":0.0007344782086437726,
"Nucleotide GTR":0.0007585587757250313,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node163":{
"Global MG94xREV":0.002672220602251394,
"Nucleotide GTR":0.002759831897877517,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "V", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GTA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node185":{
"Global MG94xREV":0.002672206963097971,
"Nucleotide GTR":0.002759817811551474,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "I", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "F", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ATA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "TTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node187":{
"Global MG94xREV":0.002439922435170281,
"Nucleotide GTR":0.002519917614307971,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "I", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "F", "-", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ATA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "TTC", "---", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node201":{
"Global MG94xREV":0.0026774280160328,
"Nucleotide GTR":0.002765210041675703,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "N", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "AAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node207":{
"Global MG94xREV":0.002671488765891661,
"Nucleotide GTR":0.002759076067566237,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGT", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node209":{
"Global MG94xREV":0.008320936088526408,
"Nucleotide GTR":0.008593745897313815,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "-", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "TCT", "---", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node210":{
"Global MG94xREV":9.610742015822456e-05,
"Nucleotide GTR":9.925839339458557e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "-", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "TCT", "---", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node224":{
"Global MG94xREV":0.002671408610977461,
"Nucleotide GTR":0.002758993284696888,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAT", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node266":{
"Global MG94xREV":0.001783648755533063,
"Nucleotide GTR":0.00184212737750107,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "I", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node271":{
"Global MG94xREV":0.002670780792163178,
"Nucleotide GTR":0.002758344882245279,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "F", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "TTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node278":{
"Global MG94xREV":0.002669733722299432,
"Nucleotide GTR":0.002757263483199543,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"Global MG94xREV":0.003216991808543465,
"Nucleotide GTR":0.00332246394663254,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "F", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TTC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node286":{
"Global MG94xREV":0.002702900094490401,
"Nucleotide GTR":0.002791517246467588,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "I", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "ATT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node290":{
"Global MG94xREV":0.002670623370696778,
"Nucleotide GTR":0.002758182299566283,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "F", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "TTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node293":{
"Global MG94xREV":0.0009087586498631521,
"Nucleotide GTR":0.0009385531670743737,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.00125747323616907,
"Nucleotide GTR":0.001298700692967784,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.0005020278721884385,
"Nucleotide GTR":0.0005184873337635046,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node296":{
"Global MG94xREV":0.002349279289012749,
"Nucleotide GTR":0.0024263026463376,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node331":{
"Global MG94xREV":0.003486247236881903,
"Nucleotide GTR":0.003600547170442358,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "F", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCT", "TTT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node332":{
"Global MG94xREV":0.00660314046681098,
"Nucleotide GTR":0.006819630711295739,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "ATA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node360":{
"Global MG94xREV":0.002347124484112014,
"Nucleotide GTR":0.002424077194107443,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "P", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CCA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node361":{
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "I", "I", "I", "F", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ATA", "ATT", "ATT", "TTT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node366":{
"Global MG94xREV":0.002517849449551372,
"Nucleotide GTR":0.002600399540019528,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "S", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "TCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node372":{
"Global MG94xREV":0.0007830469725069652,
"Nucleotide GTR":0.0008087199127348976,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node373":{
"Global MG94xREV":0.001174527684289062,
"Nucleotide GTR":0.00121303569222921,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node374":{
"Global MG94xREV":0.000710413230430946,
"Nucleotide GTR":0.0007337048042985969,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node38":{
"Global MG94xREV":0.001788757868248842,
"Nucleotide GTR":0.001847403997339632,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "S", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.002671246408107446,
"Nucleotide GTR":0.002758825763851413,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "F", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "TTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node399":{
"Global MG94xREV":0.002671915287652247,
"Nucleotide GTR":0.002759516573248673,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTT", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node403":{
"Global MG94xREV":0.001963356281044956,
"Nucleotide GTR":0.002027726785266471,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "L", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CTA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.002386670710459899,
"Nucleotide GTR":0.002464919981122716,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "S", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "TCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node410":{
"Global MG94xREV":0.002669589610047774,
"Nucleotide GTR":0.002757114646090561,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node419":{
"Global MG94xREV":0.002604880096562658,
"Nucleotide GTR":0.002690283569621093,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node420":{
"Global MG94xREV":6.870053410117589e-05,
"Nucleotide GTR":7.095294649472595e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node43":{
"Global MG94xREV":0.00267172493652984,
"Nucleotide GTR":0.002759319981283555,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node436":{
"Global MG94xREV":0.0026695903102276,
"Nucleotide GTR":0.002757115369226446,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACG", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node447":{
"Global MG94xREV":0.002499272262633425,
"Nucleotide GTR":0.002581213282348368,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "D", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAT", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.002670989968462688,
"Nucleotide GTR":0.002758560916588844,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node459":{
"Global MG94xREV":0.0007646393665166786,
"Nucleotide GTR":0.0007897087958635019,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node460":{
"Global MG94xREV":0.001910089481829294,
"Nucleotide GTR":0.001972713583343934,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node47":{
"Global MG94xREV":0.002357604413705507,
"Nucleotide GTR":0.002434900718166519,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTT", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node479":{
"Global MG94xREV":0.002669051366946213,
"Nucleotide GTR":0.002756558756176665,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "G", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GGG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node483":{
"Global MG94xREV":0.0023464513600898,
"Nucleotide GTR":0.00242338200107354,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "I", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ATT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node486":{
"Global MG94xREV":0.002358480375069654,
"Nucleotide GTR":0.002435805398757652,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAT", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node489":{
"Global MG94xREV":0.002358480474965467,
"Nucleotide GTR":0.002435805501928645,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node492":{
"Global MG94xREV":0.002364087067359179,
"Nucleotide GTR":0.002441595911789838,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "L", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CTT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node498":{
"Global MG94xREV":0.002366278296517857,
"Nucleotide GTR":0.002443858982481898,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATT", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node501":{
"Global MG94xREV":0.002361504004314715,
"Nucleotide GTR":0.002438928160565132,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "V", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GTA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node504":{
"Global MG94xREV":0.002321577222677513,
"Nucleotide GTR":0.002397692341393204,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "I", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ATA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node510":{
"Global MG94xREV":0.002314279281880181,
"Nucleotide GTR":0.002390155130661299,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "V", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GTA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node515":{
"Global MG94xREV":0.002671771063570852,
"Nucleotide GTR":0.002759367620643504,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node520":{
"Global MG94xREV":0.002356596643532931,
"Nucleotide GTR":0.002433859907289729,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "S", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "TCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node523":{
"Global MG94xREV":0.002356815551045997,
"Nucleotide GTR":0.002434085991893943,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "L", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CTA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node526":{
"Global MG94xREV":0.002357909958232555,
"Nucleotide GTR":0.002435216280261678,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "L", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TTA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.002357909998004746,
"Nucleotide GTR":0.002435216321337837,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "TTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node532":{
"Global MG94xREV":0.002357909958232555,
"Nucleotide GTR":0.002435216280261678,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "S", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "TCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node535":{
"Global MG94xREV":0.002357909958232555,
"Nucleotide GTR":0.002435216280261678,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "L", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CTT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node543":{
"Global MG94xREV":0.002347916374463066,
"Nucleotide GTR":0.002424895047337304,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "F", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TTT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.002357909914059404,
"Nucleotide GTR":0.002435216234640266,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "I", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ATA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node555":{
"Global MG94xREV":0.002358566658969736,
"Nucleotide GTR":0.002435894511557517,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGT", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node558":{
"Global MG94xREV":0.002378598820685533,
"Nucleotide GTR":0.00245658344675999,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "F", "F", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "TTT", "TTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node57":{
"Global MG94xREV":0.002355712706927727,
"Nucleotide GTR":0.002432946989981674,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "C", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "TGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node60":{
"Global MG94xREV":0.002409252362707237,
"Nucleotide GTR":0.002488241994330183,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node61":{
"Global MG94xREV":0.0002622479296087592,
"Nucleotide GTR":0.00027084597756518,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node73":{
"Global MG94xREV":0.002670030493903104,
"Nucleotide GTR":0.002757569984742681,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node77":{
"Global MG94xREV":0.002517609990997537,
"Nucleotide GTR":0.00260015223058911,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node78":{
"Global MG94xREV":0.0001540514190442122,
"Nucleotide GTR":0.0001591021414299821,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node93":{
"Global MG94xREV":0.002671339957873121,
"Nucleotide GTR":0.002758922380735186,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node98":{
"Global MG94xREV":0.002524422212101283,
"Nucleotide GTR":0.00260718779684501,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node99":{
"Global MG94xREV":0.0001472678748330538,
"Nucleotide GTR":0.0001520961922658884,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799160388742288,
"Nucleotide GTR":0.002759326501110459,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Q", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAG", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003277063428184575,
"Nucleotide GTR":0.0003230428666959146,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGT", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "ATA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "SL", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TYA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "YSCWLF", "DAV", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TNN", "GHT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798724412203026,
"Nucleotide GTR":0.002758896728803202,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "S", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TCT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002795442595370784,
"Nucleotide GTR":0.002755661614376244,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "D", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAT", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003449822217258111,
"Nucleotide GTR":0.0003400728985192982,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "P", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CCA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002818777538351959,
"Nucleotide GTR":0.002778664485818987,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTG", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417245_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "SL", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TYA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417245_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "EG", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GRG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798222943172449,
"Nucleotide GTR":0.002758402396005725,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "I", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ATT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00279822336088496,
"Nucleotide GTR":0.002758402807773911,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "V", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GTT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002816897865044767,
"Nucleotide GTR":0.002776811561495381,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "R", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "CGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTY", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418691_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QH", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAW", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797871150041995,
"Nucleotide GTR":0.002758055609122173,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "P", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CCG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "IL", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "WTA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "AV", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GYT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797316611574876,
"Nucleotide GTR":0.002757508962101031,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAC", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "PS", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "YCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797307319749675,
"Nucleotide GTR":0.002757499802504592,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "V", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "GTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420739_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATY", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420739_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799215006343031,
"Nucleotide GTR":0.002759380341466931,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798725069321108,
"Nucleotide GTR":0.002758897376570064,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAC", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13":{
"Global MG94xREV":0.002799824159929958,
"Nucleotide GTR":0.00275998082639892,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "S", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "TCA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799242463121569,
"Nucleotide GTR":0.002759407407517507,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "F", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TTT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421884_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799701028280327,
"Nucleotide GTR":0.002759859446993398,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "C", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "TGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421884_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421901_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "ED", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAK", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421901_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799901637399142,
"Nucleotide GTR":0.002760057201312915,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "S", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "TCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "AS", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "KCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002804972214459221,
"Nucleotide GTR":0.002765055620736854,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "L", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAY", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002799729593962026,
"Nucleotide GTR":0.002759887606166713,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "F", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TTT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801590908096593,
"Nucleotide GTR":0.002761722432580756,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "R", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "AGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "I", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "ATT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002791786280336341,
"Nucleotide GTR":0.002752057331102044,
"amino-acid": [
["M", "R", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AGA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "TP", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "MCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423055_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "TI", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "AYT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGY", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423270_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423333_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "ED", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CT-", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAK", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423333_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "AV", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GYA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003006656142430971,
"Nucleotide GTR":0.0002963869454177298,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "S", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "TCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423492_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTY", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423562_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "KN", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAM", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423575_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "SI", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AKC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423634_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423669_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "HY", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "YAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423669_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423756_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797772657676386,
"Nucleotide GTR":0.002757958518367508,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "A", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GCA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423756_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTY", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423802_England_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423805_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "KAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423805_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "KR", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCY", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ARA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423807_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "ED"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAW"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_423881_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423934_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "TI", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "AYA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423934_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "CF", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TKC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424015_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799039260765079,
"Nucleotide GTR":0.002759207096863783,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "H", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "CAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424015_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "G", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GGG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799979440810342,
"Nucleotide GTR":0.002760133897530566,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "H", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAT", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8":{
"Global MG94xREV":0.002801996392909337,
"Nucleotide GTR":0.002762122147078753,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "T", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "ACT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003637143365880042,
"Nucleotide GTR":0.003585384431050867,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "SL", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TYA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002804944646742601,
"Nucleotide GTR":0.00276502844532692,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "SL", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "R", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TYA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003283779745025575,
"Nucleotide GTR":0.000323704940620787,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "L", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TTA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "PL", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CYT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002804872532713354,
"Nucleotide GTR":0.002764957357527591,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "Q", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CAA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003297214378059027,
"Nucleotide GTR":0.0003250292855604695,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "S", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "TCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACG", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002804868005089451,
"Nucleotide GTR":0.002764952894334741,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGA", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797360758463088,
"Nucleotide GTR":0.002757552480750078,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACG", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0028010591015297,
"Nucleotide GTR":0.002761198193969998,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "K", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AAA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003283777849349753,
"Nucleotide GTR":0.000323704753750876,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "TTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTT", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "TI", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "AYA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002792064982390843,
"Nucleotide GTR":0.002752332067043577,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "P", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CCT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002798718309309979,
"Nucleotide GTR":0.002758890712758331,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "V", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GTA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002800695161013757,
"Nucleotide GTR":0.002760839432566212,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "I", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "ATA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002817883945748256,
"Nucleotide GTR":0.002777783609623931,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "Q", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "CAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGR", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TWA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "YAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "KAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TKA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "PL", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CYA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "KR", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ARA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002818200774702796,
"Nucleotide GTR":0.002778095929894713,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "D", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAC", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797233899508067,
"Nucleotide GTR":0.002757427427081162,
"amino-acid": [
["M", "E", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "GAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800276325932518,
"Nucleotide GTR":0.002760426557782799,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "S", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "AGT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798071216689388,
"Nucleotide GTR":0.002758252828689999,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "P", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CCG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTY", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAY", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432501_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798161787042211,
"Nucleotide GTR":0.002758342110167317,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "A", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GCT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432501_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432607_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002795886261248293,
"Nucleotide GTR":0.002756098966597424,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432607_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_432743_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002798400429836079,
"Nucleotide GTR":0.002758577356917764,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "L", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "CTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432743_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432806_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799118856401103,
"Nucleotide GTR":0.002759285559801719,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "F", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "TTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432806_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798517232979863,
"Nucleotide GTR":0.002758692497876226,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGC", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797369797581925,
"Nucleotide GTR":0.002757561391236328,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "A", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "GCA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433767_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002798725112133475,
"Nucleotide GTR":0.002758897418773182,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "P", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CCT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433767_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433810_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "ILVF", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "-TC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433810_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433872_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799736880285806,
"Nucleotide GTR":0.002759894788801334,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "S", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "TCT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433872_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002799257368834849,
"Nucleotide GTR":0.002759422101112716,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGT", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00288472596511,
"Nucleotide GTR":0.002843674423224452,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "F", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "H", "-", "-", "-", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "TTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAT", "---", "---", "---", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002805129114747253,
"Nucleotide GTR":0.002765210288230914,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "D", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GAT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798859495888233,
"Nucleotide GTR":0.002759029890158998,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCG", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00280030299959166,
"Nucleotide GTR":0.002760452851858279,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "H", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CAT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002803019301607338,
"Nucleotide GTR":0.002763130499115298,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "H", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAC", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002817664732253188,
"Nucleotide GTR":0.002777567515680623,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "L", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "QPRL", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "NTSI", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTA", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CNG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ANC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002812157293596036,
"Nucleotide GTR":0.002772138451486575,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "Q", "L", "F", "I", "R", "QPRL", "E", "E", "V", "Q", "EAGV", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "CAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CNA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GNA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "AV", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GYA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797052768479828,
"Nucleotide GTR":0.002757248873666218,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "A", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "GCA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTK", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QL", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CWA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "TI", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "AYW", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0]
],
"original name":"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0]
]
},
"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "LF", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "YTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798859272007799,
"Nucleotide GTR":0.002759029669464532,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "V", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "GTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002799672480566671,
"Nucleotide GTR":0.002759831305532424,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "L", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "TTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003389200866201637,
"Nucleotide GTR":0.0003340970315709091,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "F", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TTT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437079_California_20200426_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002799246066888283,
"Nucleotide GTR":0.002759410960000259,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "F", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TTT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437079_California_20200426_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGT", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "SC", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "WGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797700983001631,
"Nucleotide GTR":0.002757887863670368,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "V", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GTG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTY", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "ED", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAK", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438355_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438382_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "YAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438382_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438743_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "IMLVF", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "KQE", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "-TN", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "NAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 16.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438743_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002798945076542404,
"Nucleotide GTR":0.00275911425294435,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "F", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTT", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002823541343695766,
"Nucleotide GTR":0.002783360499089308,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797415586057396,
"Nucleotide GTR":0.002757606528111776,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "S", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AGC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797307657143793,
"Nucleotide GTR":0.002757500135097376,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "C", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TGT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002798801570357899,
"Nucleotide GTR":0.00275897278894694,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "L", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "CTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439443_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439443_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439658_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002827824542382382,
"Nucleotide GTR":0.00278758274505029,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "H", "-", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAT", "---", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439658_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439787_England_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002797985453460473,
"Nucleotide GTR":0.002758168285928069,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCC", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439787_England_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439956_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003247569828841417,
"Nucleotide GTR":0.0003201354780872439,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "V", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GTA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439956_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440237_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "LF", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "YTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440237_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440408_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003113889087328662,
"Nucleotide GTR":0.003069576403960648,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "HPRL", "Y", "-", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "C-C", "TAT", "---", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440408_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440445_England_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "F", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "TTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440445_England_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440448_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003160522276397841,
"Nucleotide GTR":0.003115545972173812,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "NTSI", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "A-C", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440448_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440595_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGY", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440595_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440685_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACR", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440685_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440705_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "HY", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "YAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440705_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440854_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003510673494617745,
"Nucleotide GTR":0.003460714308977981,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "SRGC", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-GT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440854_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440924_England_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0027984660817869,
"Nucleotide GTR":0.002758642074598276,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "S", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "TCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440924_England_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441000_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002797897276865537,
"Nucleotide GTR":0.002758081364143887,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "P", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CCC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441000_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441109_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "YAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441109_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441318_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "LF", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "YTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441318_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "PS", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "YCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441452_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003199260754731838,
"Nucleotide GTR":0.0003153733176561811,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATT", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441452_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441559_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "KQ", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "MAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441559_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "PL", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CYA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441798_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441821_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCY", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441821_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799201647969946,
"Nucleotide GTR":0.002759367173192256,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "S", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "TCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441918_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "AS", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "KCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442260_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442331_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797357508647487,
"Nucleotide GTR":0.002757549277181484,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "V", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "GTA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442331_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442342_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "TI", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "AYA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442342_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442504_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003380066875327516,
"Nucleotide GTR":0.0003331966307513908,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442504_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "PS", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "YCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442537_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442776_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002797592050271611,
"Nucleotide GTR":0.002757780481124517,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "I", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ATA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442776_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442851_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002816601312378767,
"Nucleotide GTR":0.002776519228968259,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "N", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAC", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442851_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442912_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00280035929492513,
"Nucleotide GTR":0.002760508346072239,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "R", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CGT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442912_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442937_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAY", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442937_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797614529355251,
"Nucleotide GTR":0.002757802640316061,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "H", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "CAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442948_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443024_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798808099098084,
"Nucleotide GTR":0.002758979224778872,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "V", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "GTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443024_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "PL", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CYT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002803346757089457,
"Nucleotide GTR":0.002763453294691209,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "Q", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "CAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443449_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002810326420614454,
"Nucleotide GTR":0.002770333633027955,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QHPRL", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "C--", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTA", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443449_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443595_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002800164199052223,
"Nucleotide GTR":0.002760316026541525,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "F", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "TTT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443595_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443609_England_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0.002799246168178151,
"Nucleotide GTR":0.002759411059848707,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "F", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TTT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443609_England_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443813_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002799700675784684,
"Nucleotide GTR":0.002759859099513995,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTT", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443813_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443844_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAR", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443844_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444010_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002803752279047561,
"Nucleotide GTR":0.002763853045805967,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACC", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444010_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003739824740341001,
"Nucleotide GTR":0.0003686604582229085,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "V", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GTA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444058_California_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444094_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002808359804647461,
"Nucleotide GTR":0.002768395003295604,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "K", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "AAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444094_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444174_England_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002798752631544553,
"Nucleotide GTR":0.002758924546564996,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAC", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444174_England_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444295_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "F", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "TTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444295_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799700322141843,
"Nucleotide GTR":0.002759858750903727,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "I", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "ATA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444342_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798779495667739,
"Nucleotide GTR":0.002758951028394097,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "P", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "CCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0003664968872332975,
"Nucleotide GTR":0.000361281396230288,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "I", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ATA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799246070515114,
"Nucleotide GTR":0.002759410963575482,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGT", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279810318150403,
"Nucleotide GTR":0.002758284338624369,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "L", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CTT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797535097389549,
"Nucleotide GTR":0.002757724338719313,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "S", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "TCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002799672479881787,
"Nucleotide GTR":0.002759831304857286,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "L", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "TTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "F", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "TTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003287454562598462,
"Nucleotide GTR":0.0003240671928717261,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTT", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007290297672365924,
"Nucleotide GTR":0.007186551956525004,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AC-", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "KTRI", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "A-A", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805485872147606,
"Nucleotide GTR":0.002765561968739548,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "I", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "ATT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "KAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797286662401053,
"Nucleotide GTR":0.002757479439123587,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGG", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799700322131981,
"Nucleotide GTR":0.002759858750894004,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCT", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002798725111913692,
"Nucleotide GTR":0.002758897418556526,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "P", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "CCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002799673156532384,
"Nucleotide GTR":0.002759831971878702,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "I", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "ATA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798227384603553,
"Nucleotide GTR":0.002758406774232351,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCC", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002796326566077244,
"Nucleotide GTR":0.002756533005599967,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "TTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "EV", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GWG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "RC", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "YGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "LF", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "YTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002957936524814061,
"Nucleotide GTR":0.002915843148662629,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "VF", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "KTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0003072944331696573,
"Nucleotide GTR":0.0003029214319047076,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "ILVF", "F", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "NTT", "TTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "KN", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAK", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.5632131819081873,
"Nucleotide GTR":0.5551982890527714,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "K", "KNTRSIM", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AAA", "A??", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 13.5, 0]
],
"original name":"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 9.5, 0]
]
},
"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002793972179431831,
"Nucleotide GTR":0.002754212123420198,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "V", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GTG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798724410890136,
"Nucleotide GTR":0.002758896727508999,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "CTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002804292014031228,
"Nucleotide GTR":0.002764385100006934,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "T", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "ACT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003278797559627023,
"Nucleotide GTR":0.0003232138120574166,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14":{
"Global MG94xREV":0.002799672481286486,
"Nucleotide GTR":0.002759831306241991,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTY", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAT", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002804868277160379,
"Nucleotide GTR":0.002764953162533924,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "N", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "AAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00562567629477272,
"Nucleotide GTR":0.005545619232562107,
"amino-acid": [
["K", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["AAA", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00279978586671435,
"Nucleotide GTR":0.002759943078120877,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "D", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAT", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798223219556745,
"Nucleotide GTR":0.002758402668456891,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "F", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "TTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798724412005765,
"Nucleotide GTR":0.00275889672860875,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "P", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CCT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447762_Antioquia_20200331_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447762_Antioquia_20200331_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002797212761758788,
"Nucleotide GTR":0.002757406590135917,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "A", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "GCT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "F", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "TTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447929_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798809602058401,
"Nucleotide GTR":0.002758980706351081,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTT", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447929_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448043_England_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002796984176130982,
"Nucleotide GTR":0.002757181257431471,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTC", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448043_England_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448055_England_20200501_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0003294975481419154,
"Nucleotide GTR":0.0003248085819931967,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "L", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CTA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448055_England_20200501_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448079_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797388163303174,
"Nucleotide GTR":0.002757579495601321,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "C", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TGC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448079_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0003278798588328272,
"Nucleotide GTR":0.0003232139134636318,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAT", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801781472982889,
"Nucleotide GTR":0.002761910285603774,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "K"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "AAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448258_England_20200412_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "V", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GTA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448258_England_20200412_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448281_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009309768739216348,
"Nucleotide GTR":0.0009177284626005927,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "I", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448281_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448315_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797308258412629,
"Nucleotide GTR":0.002757500727809759,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "L", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "CTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448315_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448317_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "AV", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GYA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448317_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448364_England_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002799326967516752,
"Nucleotide GTR":0.002759490709359746,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "S", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "TCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448364_England_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448375_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "N", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "AAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448375_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448380_England_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002798040435976086,
"Nucleotide GTR":0.002758222486006431,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "L", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TTA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448380_England_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448409_England_20200429_null_7":{
"Global MG94xREV":0.002800784061635824,
"Nucleotide GTR":0.002760927068074139,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "I", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "ATA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448409_England_20200429_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448456_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003221554061977262,
"Nucleotide GTR":0.0003175709235428282,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "L", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CTT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448456_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448469_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797371708689474,
"Nucleotide GTR":0.002757563275147567,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ACT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448469_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448504_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279929932257501,
"Nucleotide GTR":0.002759463457823646,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448504_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448509_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "KE", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "RAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448509_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448548_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002808735469850493,
"Nucleotide GTR":0.002768765322536488,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "H", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CAT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448548_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448612_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002797251780539095,
"Nucleotide GTR":0.002757445053653396,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATC", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448612_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448734_England_20200101_null_8":{
"Global MG94xREV":0.002798239346932083,
"Nucleotide GTR":0.002758418566329106,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "S", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "TCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448734_England_20200101_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448753_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798712021405226,
"Nucleotide GTR":0.002758884514334579,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "F", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "TTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448753_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448764_England_20200101_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0003283778695529054,
"Nucleotide GTR":0.0003237048371646374,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "I", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ATA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448764_England_20200101_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448823_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "PR", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CST", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448823_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448869_England_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0003392966476048945,
"Nucleotide GTR":0.0003344682338459303,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "I", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ATT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448869_England_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448889_England_20200415_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0001826610253264525,
"Nucleotide GTR":0.0001800616391723645,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "D", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAT", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448889_England_20200415_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448891_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001631914419505261,
"Nucleotide GTR":0.000160869120733322,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "S", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "TCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448891_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448902_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002797233516313821,
"Nucleotide GTR":0.002757427049340024,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "G", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GGT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448902_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448917_England_20200417_null_38":{
"Global MG94xREV":0.002797535092334191,
"Nucleotide GTR":0.002757724333735892,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAT", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448917_England_20200417_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.002797535097317296,
"Nucleotide GTR":0.002757724338648085,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "TTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002797280361891586,
"Nucleotide GTR":0.002757473228274506,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "T", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ACA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448990_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003307031410614145,
"Nucleotide GTR":0.0003259970185349909,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "C", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "TGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448990_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449036_England_20200503_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449036_England_20200503_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449043_England_20200504_null_110":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449043_England_20200504_null_110",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449114_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "YTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449114_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "TI", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "AYA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449123_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449147_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTM", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449147_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7":{
"Global MG94xREV":0.000328377824257113,
"Nucleotide GTR":0.0003237047925134335,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "S", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "TCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10":{
"Global MG94xREV":0.002799871999127401,
"Nucleotide GTR":0.002760027984813214,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "L", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "TTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0007409849319967629,
"Nucleotide GTR":0.0007304402305795996,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "L", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CTA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279850334877794,
"Nucleotide GTR":0.002758678811255601,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "F", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "TTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449262_Scotland_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002799857390815551,
"Nucleotide GTR":0.002760013584387222,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "I", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ATA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449262_Scotland_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002796298597610158,
"Nucleotide GTR":0.002756505435142504,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAG", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449670_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002797871147344252,
"Nucleotide GTR":0.00275805560646282,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAC", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449670_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449706_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003283785188827426,
"Nucleotide GTR":0.0003237054772540852,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "L", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CTT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449706_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449720_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002797369512358891,
"Nucleotide GTR":0.002757561110072206,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449720_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449722_England_20200417_null_29":{
"Global MG94xREV":0.002799201437501036,
"Nucleotide GTR":0.002759366965718455,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449722_England_20200417_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "KE", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "RAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002801337583159785,
"Nucleotide GTR":0.002761472712623891,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "T", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "ACA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800350368309185,
"Nucleotide GTR":0.002760499546487898,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "I", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ATA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00279967315658181,
"Nucleotide GTR":0.002759831971927421,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "S", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "TCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12":{
"Global MG94xREV":0.002798223390740668,
"Nucleotide GTR":0.002758402837204753,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAT", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798189255286761,
"Nucleotide GTR":0.002758369187520738,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTC", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009238151719495993,
"Nucleotide GTR":0.0009106686763432668,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "S", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00196276885781863,
"Nucleotide GTR":0.001934837370061071,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "F", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCT", "TTT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "IM", "F", "I", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "AT-", "TTT", "ATT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805129114747253,
"Nucleotide GTR":0.002765210288230914,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCA", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003189355012422004,
"Nucleotide GTR":0.003143968399459851,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAA", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "TCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_94":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_94",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_25354":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_25354",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5098.240758682967,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02975534457889522],
[0.0129685619911858],
[0.008822314882531157],
[0.02791070503638315],
[0.02466225288015914],
[0.0107487901701362],
[0.007312237976087766],
[0.02313335218974533],
[0.01433231671568694],
[0.006246593357770342],
[0.004249462167265202],
[0.01344380547430429],
[0.03358280659988469],
[0.01463672208781992],
[0.00995713874788973],
[0.03150088908626191],
[0.02423187710740891],
[0.01056121530022948],
[0.007184633653612257],
[0.02272965694043684],
[0.02008421308646953],
[0.008753498443463027],
[0.005954871453324168],
[0.01883912135038467],
[0.0116718170209099],
[0.005087041831564222],
[0.003460636953362317],
[0.01094823960937467],
[0.0273488495585253],
[0.01191971579918832],
[0.008108800818640757],
[0.02565339719351886],
[0.02782019029807556],
[0.01212514483005104],
[0.008248551054442997],
[0.02609551784577132],
[0.02305833046181325],
[0.01004973702167679],
[0.006836682783497766],
[0.02162886262145962],
[0.01340020705811313],
[0.005840342916113458],
[0.00397309618930247],
[0.01256948060654392],
[0.03139873133967749],
[0.01368481526885126],
[0.009309571060625882],
[0.02945221241228577],
[0.01463731320110878],
[0.03150216126961267],
[0.02783570914779802],
[0.0121319085616598],
[0.008253152317873276],
[0.02611007462685511],
[0.007050384111961966],
[0.004796268755225023],
[0.01517370942714517],
[0.03790412990344416],
[0.01652012656319325],
[0.01123839008047426],
[0.03555431820292702]
],
"Log Likelihood":-2164.687380167052,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[1.009414796587607, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.9460713953779484, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":381
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5557.15816294609,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2949973945595846],
[0.2169924266400688],
[0.1650850204758845],
[0.322925158324462]
],
"Log Likelihood":-2188.877125201469,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2179400130256883,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3822689618982614,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.2362770152864123,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.961917830271639,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.043903950078216
},
"display order":0,
"estimated parameters":587
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-23/sequences.ORF7a.compressed.fas",
"number of sequences":291,
"number of sites":147,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_441559_England_20200406_null_1,epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_423934_England_20200319_null_1,epi_isl_423634_England_20200321_null_1,epi_isl_448317_England_20200423_null_1,epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_440685_England_20200405_null_1,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1,epi_isl_421901_England_20200326_null_1,epi_isl_448509_England_20200406_null_1,epi_isl_442937_England_20200410_null_1,epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_423575_England_20200331_null_1,(epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1,epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8)Node558,(epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_423270_England_20200326_null_1)Node555,(epi_isl_448764_England_20200101_null_8,epi_isl_449123_England_20200408_null_4)Node552,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,(epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_449706_England_20200414_null_2)Node535,(epi_isl_442537_England_20200408_null_1,epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7)Node532,(epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1,epi_isl_449114_England_20200408_null_1)Node529,(epi_isl_417245_England_20200302_null_1,epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1)Node526,(epi_isl_441798_England_20200403_null_1,epi_isl_448055_England_20200501_null_4)Node523,(epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1,epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4)Node520,(epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1,epi_isl_444058_California_20200428_null_1)Node510,(epi_isl_442342_England_20200405_null_1,epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12)Node504,(epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_439956_England_20200323_null_1)Node501,(epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1,epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4)Node47,(epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2,epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3)Node38,epi_isl_423055_England_20200319_null_1,(epi_isl_423333_England_20200327_null_2,epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1)Node43,epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2,(epi_isl_420739_England_20200327_null_1,epi_isl_441452_England_20200409_null_2)Node498,epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1,epi_isl_442331_England_20200403_null_1,epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1,epi_isl_448823_England_20200324_null_1,epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1,(epi_isl_443595_England_20200415_null_3,epi_isl_447762_Antioquia_20200331_null_13)Node515,epi_isl_449147_England_20200408_null_1,(epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_448456_England_20200407_null_2)Node492,(epi_isl_423669_England_20200320_null_1,epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4)Node489,epi_isl_423562_England_20200401_null_1,epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1,(epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15)Node486,epi_isl_423805_England_20200324_null_1,epi_isl_438382_England_20200331_null_1,(epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1,epi_isl_436958_LA_20200406_null_1)Node543,epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1,(epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2,epi_isl_448990_England_20200419_null_3)Node57,((epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1,epi_isl_424015_England_20200319_null_1,epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4)Node61,epi_isl_440705_England_20200403_null_1)Node60,epi_isl_423881_England_20200318_null_1,epi_isl_432607_England_20200404_null_1,(epi_isl_423187_England_20200329_null_1,epi_isl_448869_England_20200417_null_6)Node483,((epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7,epi_isl_448504_England_20200405_null_1)Node78,epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1)Node77,(epi_isl_439443_England_20200401_null_4,epi_isl_449720_England_20200417_null_2)Node73,epi_isl_449722_England_20200417_null_29,epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1,epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1,epi_isl_440237_England_20200323_null_1,epi_isl_432743_England_20200403_null_3,epi_isl_443024_England_20200411_null_1,epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1,epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4,epi_isl_448902_England_20200415_null_2,epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1,epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1,epi_isl_448469_England_20200407_null_1,(epi_isl_423756_England_20200324_null_1,epi_isl_448258_England_20200412_null_9)Node163,epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_430903_USA_20200405_null_1,(epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1,epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17)Node151,epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1,epi_isl_442851_England_20200409_null_4,epi_isl_449262_Scotland_20200503_null_4,epi_isl_423807_England_20200324_null_1,epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1,epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1,((epi_isl_448380_England_20200502_null_2,epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11)Node156,epi_isl_441821_England_20200403_null_1)Node155,epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1,epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1,epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1,epi_isl_421884_England_20200327_null_1,epi_isl_437079_California_20200426_null_5,epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7,epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2,(epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1,epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1)Node224,epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1,epi_isl_448734_England_20200101_null_8,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_449670_England_20200415_null_3,(epi_isl_440445_England_20200314_null_8,(epi_isl_440408_England_20200314_null_1,epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1)Node187,epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1)Node185,epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_433872_England_20200408_null_1,epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1,(epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1,epi_isl_448375_England_20200501_null_3)Node201,epi_isl_442948_England_20200411_null_1,(epi_isl_440595_England_20200403_null_2,((epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2,epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1)Node210,epi_isl_440854_England_20200417_null_2)Node209,epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1)Node207,epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1,epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3,epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4,epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1,epi_isl_444342_England_20200427_null_1,epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1,epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_443609_England_20200414_null_6,epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1,epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1,epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13,epi_isl_448612_England_20200101_null_1,epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1,epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1,epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10,epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5,epi_isl_440924_England_20200424_null_3,epi_isl_441000_England_20200402_null_2,epi_isl_448364_England_20200503_null_4,epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1,(epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4,epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1)Node271,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1,(epi_isl_440448_England_20200311_null_1,epi_isl_448281_England_20200415_null_1)Node266,epi_isl_444010_England_20200325_null_3,((((epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1,epi_isl_442504_England_20200409_null_4)Node296,epi_isl_449036_England_20200503_null_5)Node295,epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1)Node294,epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1)Node293,(epi_isl_441318_England_20200403_null_2,epi_isl_444295_England_20200324_null_1)Node290,(epi_isl_433051_England_20200404_null_1,epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2,(epi_isl_433810_England_20200406_null_1,epi_isl_438743_England_20200427_null_1)Node283,(epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1)Node286)Node278,epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14,epi_isl_433767_England_20200406_null_2,epi_isl_448409_England_20200429_null_7,epi_isl_448917_England_20200417_null_38,epi_isl_448079_England_20200507_null_1,epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1,epi_isl_448548_England_20200101_null_2,epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2,epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1,epi_isl_421990_England_20200331_null_1,epi_isl_448315_England_20200422_null_1,epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1,epi_isl_439787_England_20200412_null_3,epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3,epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1,epi_isl_442912_England_20200409_null_2,epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12,((epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1)Node332,epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2)Node331,epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1,epi_isl_432501_England_20200330_null_1,epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2,epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1,epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3,epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3,epi_isl_441109_England_20200402_null_1,epi_isl_444094_England_20200406_null_2,epi_isl_444174_England_20200411_null_3,(epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1)Node360,epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_25354,(epi_isl_442260_England_20200405_null_2,epi_isl_448891_England_20200417_null_2)Node366,epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1,epi_isl_441918_England_20200410_null_1,(((epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_94)Node374,epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1)Node373,epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2)Node372,epi_isl_443813_England_20200326_null_5,epi_isl_432806_England_20200320_null_1,(epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1,epi_isl_423492_England_20200331_null_1)Node406,epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3,epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3,epi_isl_418731_England_20200313_null_1,(epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1,epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3)Node390,epi_isl_439658_England_20200324_null_1,(epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6)Node403,(epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1,epi_isl_448043_England_20200504_null_2)Node399,epi_isl_443449_England_20200413_null_1,(epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_443844_England_20200326_null_2,epi_isl_449043_England_20200504_null_110,epi_isl_418691_England_20200317_null_1,epi_isl_423802_England_20200223_null_1)Node410,((epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1,epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12)Node420,epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1)Node419,epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1,(epi_isl_438355_England_20200329_null_1,epi_isl_448889_England_20200415_null_16)Node447,epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2,epi_isl_448753_England_20200101_null_1,epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1,epi_isl_447929_England_20200426_null_1,epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1,epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2,(epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2,epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3)Node436,epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8,epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_442776_England_20200406_null_4,epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2,epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2,epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1,(((epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1,epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1)Node460,epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1)Node459,epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1)Node458,epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1,epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5,epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6,epi_isl_436957_LA_20200406_null_5,epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1,(epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1,epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1)Node479,epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1,((epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3)Node104,epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3)Node103,(epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1,epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1,epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3)Node93,((epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36)Node99,epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1)Node98)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node103":"test",
"Node104":"test",
"Node151":"test",
"Node155":"test",
"Node156":"test",
"Node163":"test",
"Node185":"test",
"Node187":"test",
"Node201":"test",
"Node207":"test",
"Node209":"test",
"Node210":"test",
"Node224":"test",
"Node266":"test",
"Node271":"test",
"Node278":"test",
"Node283":"test",
"Node286":"test",
"Node290":"test",
"Node293":"test",
"Node294":"test",
"Node295":"test",
"Node296":"test",
"Node331":"test",
"Node332":"test",
"Node360":"test",
"Node366":"test",
"Node372":"test",
"Node373":"test",
"Node374":"test",
"Node38":"test",
"Node390":"test",
"Node399":"test",
"Node403":"test",
"Node406":"test",
"Node410":"test",
"Node419":"test",
"Node420":"test",
"Node43":"test",
"Node436":"test",
"Node447":"test",
"Node458":"test",
"Node459":"test",
"Node460":"test",
"Node47":"test",
"Node479":"test",
"Node483":"test",
"Node486":"test",
"Node489":"test",
"Node492":"test",
"Node498":"test",
"Node501":"test",
"Node504":"test",
"Node510":"test",
"Node515":"test",
"Node520":"test",
"Node523":"test",
"Node526":"test",
"Node529":"test",
"Node532":"test",
"Node535":"test",
"Node543":"test",
"Node552":"test",
"Node555":"test",
"Node558":"test",
"Node57":"test",
"Node60":"test",
"Node61":"test",
"Node73":"test",
"Node77":"test",
"Node78":"test",
"Node93":"test",
"Node98":"test",
"Node99":"test",
"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1":"background",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413852_Guangdong_20200130_null_1":"background",
"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1":"background",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"background",
"epi_isl_417245_England_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1":"background",
"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_420739_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13":"background",
"epi_isl_421731_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421884_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421901_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422500_New_York_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423333_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_423669_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_423756_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":"background",
"epi_isl_423805_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423934_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424015_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8":"background",
"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_424854_Florida_20200305_null_2":"background",
"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1":"background",
"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4":"background",
"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3":"background",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_430715_Victoria_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432501_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432607_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432743_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_432806_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433767_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_433810_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_433872_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3":"background",
"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437079_California_20200426_null_5":"background",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437650_Unknown_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17":"background",
"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438382_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438743_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_439443_England_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_439658_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439787_England_20200412_null_3":"background",
"epi_isl_439956_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440237_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440408_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440445_England_20200314_null_8":"background",
"epi_isl_440448_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_440595_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440685_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_440705_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440854_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_440924_England_20200424_null_3":"background",
"epi_isl_441000_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441109_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441318_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_441452_England_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_441559_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441821_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442331_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_442342_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442504_England_20200409_null_4":"background",
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442776_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_442851_England_20200409_null_4":"background",
"epi_isl_442912_England_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_442937_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443024_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443449_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443595_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_443609_England_20200414_null_6":"background",
"epi_isl_443813_England_20200326_null_5":"background",
"epi_isl_443844_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_444010_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444094_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_444174_England_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_444295_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12":"background",
"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4":"background",
"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3":"background",
"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12":"background",
"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8":"background",
"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4":"background",
"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14":"background",
"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7":"background",
"epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447762_Antioquia_20200331_null_13":"background",
"epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_447929_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_448043_England_20200504_null_2":"background",
"epi_isl_448055_England_20200501_null_4":"background",
"epi_isl_448079_England_20200507_null_1":"background",
"epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15":"background",
"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_448258_England_20200412_null_9":"background",
"epi_isl_448281_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_448315_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_448317_England_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_448364_England_20200503_null_4":"background",
"epi_isl_448375_England_20200501_null_3":"background",
"epi_isl_448380_England_20200502_null_2":"background",
"epi_isl_448409_England_20200429_null_7":"background",
"epi_isl_448456_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_448469_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_448504_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_448509_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_448548_England_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_448612_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448734_England_20200101_null_8":"background",
"epi_isl_448753_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448764_England_20200101_null_8":"background",
"epi_isl_448823_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_448869_England_20200417_null_6":"background",
"epi_isl_448889_England_20200415_null_16":"background",
"epi_isl_448891_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_448902_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_448917_England_20200417_null_38":"background",
"epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7":"background",
"epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_448990_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_449036_England_20200503_null_5":"background",
"epi_isl_449043_England_20200504_null_110":"background",
"epi_isl_449114_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_449147_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7":"background",
"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10":"background",
"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11":"background",
"epi_isl_449262_Scotland_20200503_null_4":"background",
"epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_449670_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_449706_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_449720_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_449722_England_20200417_null_29":"background",
"epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5":"background",
"epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6":"background",
"epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12":"background",
"epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36":"background",
"epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_451148_South_Australia_20200323_null_94":"background",
"epi_isl_451162_Gujarat_20200503_null_25354":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":13
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":16
}
}
}