{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[117.5738971637846, 284.642845199844, 0, 1, 0.2923147765377965, 0, 0.003513174551420441, 0.1616110348844408, 0.7076852234622035, 1, 0.002415450561576],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 0, 1, 0.2925021324139396, 0, 0.003514104891886867, 0.1616538318714316, 0.7074978675860604, 1, 0.002415818313452685],
[117.5501648291366, 284.6665775344919, 1, 0, 0.2922557726919883, 0.008507006361526891, 0, -0.391334413286984, 1, 0.2922557726919883, 0.002415450561576],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 0, 1, 0.2925021324139396, 0, 0.003514104891886867, 0.1616538318714316, 0.7074978675860604, 1, 0.002415551756925804],
[117.5501648291366, 284.567487529679, 1, 0, 0.2923277904851709, 0.008507006361526891, 0, -0.391334413286984, 1, 0.2923277904851709, 0.002415431164845204],
[117.6084664965983, 284.5809657257109, 0, 1, 0.2924205786480997, 0, 0.003513938458427451, 0.1616461756951666, 0.7075794213519003, 1, 0.002415996061276641],
[118.0093764917854, 284.7122238375295, 0, 1, 0.2930296671330428, 0, 0.003512318461502545, 0.1615716535284733, 0.7069703328669572, 1, 0.002414903315576277],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 1, 0, 0.2925021324139396, 0.008499841341208686, 0, -0.3910048121437317, 1, 0.2925021324139396, 0.002414447682006251],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 1, 0, 0.2925021324139396, 0.008499841341208686, 0, -0.3910048121437317, 1, 0.2925021324139396, 0.002415407699462154]
],
"NAMES": [
["Node3"],
["Node220"],
["Node121"],
["Node130"],
["Node185"],
["Node20"],
["Node204"],
["Node46"],
["Node66"]
],
"RESOLVED": [
[117.5738971637846, 284.642845199844, 0, 1, 0.2923147765377965, 0, 0.003513174551420441, 0.1616110348844408, 0.7076852234622035, 1, 0.002415450561576],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 0, 1, 0.2925021324139396, 0, 0.003514104891886867, 0.1616538318714316, 0.7074978675860604, 1, 0.002415818313452685],
[117.5501648291366, 284.6665775344919, 1, 0, 0.2922557726919883, 0.008507006361526891, 0, -0.391334413286984, 1, 0.2922557726919883, 0.002415450561576],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 0, 1, 0.2925021324139396, 0, 0.003514104891886867, 0.1616538318714316, 0.7074978675860604, 1, 0.002415551756925804],
[117.5501648291366, 284.567487529679, 1, 0, 0.2923277904851709, 0.008507006361526891, 0, -0.391334413286984, 1, 0.2923277904851709, 0.002415431164845204],
[117.6084664965983, 284.5809657257109, 0, 1, 0.2924205786480997, 0, 0.003513938458427451, 0.1616461756951666, 0.7075794213519003, 1, 0.002415996061276641],
[118.0093764917854, 284.7122238375295, 0, 1, 0.2930296671330428, 0, 0.003512318461502545, 0.1615716535284733, 0.7069703328669572, 1, 0.002414903315576277],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 1, 0, 0.2925021324139396, 0.008499841341208686, 0, -0.3910048121437317, 1, 0.2925021324139396, 0.002414447682006251],
[117.6492548339495, 284.567487529679, 1, 0, 0.2925021324139396, 0.008499841341208686, 0, -0.3910048121437317, 1, 0.2925021324139396, 0.002415407699462154]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.918423325297622, 0, 0, 0.3426507701373376, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9916266952276385, 2.008373304772361, 0, 1, 0.3305422317425462, 0, 0.4979154012970436, 22.90481788215786, 0.6694577682574538, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.289592706123655, 1.43065060954819, 0, 0, 0.474072557662053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2, 0, 0, 0.3146984597253248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2, 0, 0, 0.2647716516836508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.918423325297622, 1.081576674702378, 0, 0, 0.6394744417658741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.622348821653282, 0, 0, 0.38133752143986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9730436079361425, 2.026956392063857, 0, 0, 0.3243478693120476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 2.107295864957933, 0, 0, 0.2127186690511922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.289621953357438, 1.58133670264433, 0, 0, 0.4491955851267555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 1.512198037016785, 0, 0, 0.2735323875432079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.4306506095481897, 2.56934939045181, 0, 0, 0.1435502031827299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -46.00142478519847, 1, 0.3333333333333334, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.94537971736148, 0, 0, 0.3395147980769748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.918423325297622, 1.081576674702378, 0, 0, 0.6394744417658741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9074131103377998, 2, 1, 0, 0.3121032601494913, 1.10203389019554, 0, -50.69512911056977, 1, 0.3121032601494913, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.026956392063857, 0, 0, 0.311818309837606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.026956392063857, 0, 0, 0.311818309837606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.4306506095481897, 2.56934939045181, 0, 0, 0.1435502031827299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.622348821653282, 0, 0, 0.38133752143986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9074130219220425, 2.092586978077957, 1, 0, 0.3024710073073476, 1.102033997574604, 0, -50.6951340501597, 1, 0.3024710073073476, 0.02173845711669702],
[1.289592706123655, 1.43065060954819, 0, 0, 0.474072557662053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 2.107295864957933, 0, 0, 0.2127186690511922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2, 0, 0, 0.2647716516836508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.4306506095481897, 2.56934939045181, 0, 0, 0.1435502031827299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -46.00142478519847, 1, 0.3333333333333334, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.026956392063857, 0, 0, 0.311818309837606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.04000555241111482, 1.877321335352484, 0, 1, 0.02086527480860498, 0, 0.5326738588480595, 24.50375645284043, 0.979134725191395, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2, 0, 0, 0.2647716516836508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 1, 0.2400811052239483, 0, 0.4386433021007681, 20.17821686911957, 0.7599188947760517, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9954668143255296, 2.00149795674787, 0, 1, 0.3321583302992884, 0, 0.4996257910874153, 22.98349824945301, 0.6678416697007117, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 23.00071239259923, 0.6666666666666666, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 1.512198037016785, 0, 0, 0.2735323875432079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702]
],
"RESOLVED": [
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.918423325297622, 0, 0, 0.3426507701373376, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9916266952276385, 2.008373304772361, 0, 1, 0.3305422317425462, 0, 0.4979154012970436, 22.90481788215786, 0.6694577682574538, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.289592706123655, 1.43065060954819, 0, 0, 0.474072557662053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2, 0, 0, 0.3146984597253248, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2, 0, 0, 0.2647716516836508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.918423325297622, 1.081576674702378, 0, 0, 0.6394744417658741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.622348821653282, 0, 0, 0.38133752143986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9730436079361425, 2.026956392063857, 0, 0, 0.3243478693120476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 2.107295864957933, 0, 0, 0.2127186690511922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.289621953357438, 1.58133670264433, 0, 0, 0.4491955851267555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 1.512198037016785, 0, 0, 0.2735323875432079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.4306506095481897, 2.56934939045181, 0, 0, 0.1435502031827299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -46.00142478519847, 1, 0.3333333333333334, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.94537971736148, 0, 0, 0.3395147980769748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[1.918423325297622, 1.081576674702378, 0, 0, 0.6394744417658741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9074131103377998, 2, 1, 0, 0.3121032601494913, 1.10203389019554, 0, -50.69512911056977, 1, 0.3121032601494913, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.026956392063857, 0, 0, 0.311818309837606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.026956392063857, 0, 0, 0.311818309837606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.4306506095481897, 2.56934939045181, 0, 0, 0.1435502031827299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 1.622348821653282, 0, 0, 0.38133752143986, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9074130219220425, 2.092586978077957, 1, 0, 0.3024710073073476, 1.102033997574604, 0, -50.6951340501597, 1, 0.3024710073073476, 0.02173845711669702],
[1.289592706123655, 1.43065060954819, 0, 0, 0.474072557662053, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 2.107295864957933, 0, 0, 0.2127186690511922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2, 0, 0, 0.2647716516836508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.4306506095481897, 2.56934939045181, 0, 0, 0.1435502031827299, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -46.00142478519847, 1, 0.3333333333333334, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.081576674702377, 0, 0, 0.3061411084325408, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9184233252976221, 2.026956392063857, 0, 0, 0.311818309837606, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.04000555241111482, 1.877321335352484, 0, 1, 0.02086527480860498, 0, 0.5326738588480595, 24.50375645284043, 0.979134725191395, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.107325112191716, 0, 0, 0.212707742345777, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2, 0, 0, 0.2647716516836508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 1, 0.2400811052239483, 0, 0.4386433021007681, 20.17821686911957, 0.7599188947760517, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.150715340329922, 0, 0, 0.2508720612072101, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.720243315671845, 2.279756684328154, 0, 0, 0.2400811052239483, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 1.512227284250568, 0, 0, 0.2735183370236482, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9954668143255296, 2.00149795674787, 0, 1, 0.3321583302992884, 0, 0.4996257910874153, 22.98349824945301, 0.6678416697007117, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693493904518099, 2.052999431201471, 0, 0, 0.2171142853881883, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 23.00071239259923, 0.6666666666666666, 1, 0.02173845711669702],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702],
[0.5693786376855926, 1.512198037016785, 0, 0, 0.2735323875432079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.02173845711669702]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.002415450561576,
"Nucleotide GTR":0.00240299430841951,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAT", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node126":{
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.002415551756925804,
"Nucleotide GTR":0.002403094981914339,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "N", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AAT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node185":{
"Global MG94xREV":0.002415431164845204,
"Nucleotide GTR":0.002402975011715845,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node20":{
"Global MG94xREV":0.002415996061276641,
"Nucleotide GTR":0.002403536995029099,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node204":{
"Global MG94xREV":0.002414903315576277,
"Nucleotide GTR":0.002402449884516342,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "C", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGT", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node220":{
"Global MG94xREV":0.002415818313452685,
"Nucleotide GTR":0.002403360163834084,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "S", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "TCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node3":{
"Global MG94xREV":0.002415450561576,
"Nucleotide GTR":0.00240299430841951,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ATT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node46":{
"Global MG94xREV":0.002414447682006251,
"Nucleotide GTR":0.002401996600606122,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node66":{
"Global MG94xREV":0.002415407699462154,
"Nucleotide GTR":0.002402951667341586,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCT", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004858240697584224,
"Nucleotide GTR":0.004820043684270637,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "L", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCG", "CTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242622246208706,
"Nucleotide GTR":0.002407146739525162,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002419762739520772,
"Nucleotide GTR":0.002400737805325321,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCC", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421733776131079,
"Nucleotide GTR":0.002402693345027113,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "F", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "TTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004860041954869836,
"Nucleotide GTR":0.004821830779506078,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "R", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACA", "CGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "C", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGT", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421259656082084,
"Nucleotide GTR":0.002402222952658766,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "A", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "GCT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433246616862601,
"Nucleotide GTR":0.002414115668191048,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "N", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "AAC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242270310051435,
"Nucleotide GTR":0.002403655048277826,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "G", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "GGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002422356443597483,
"Nucleotide GTR":0.002403311116886447,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "F", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TTT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242221031245915,
"Nucleotide GTR":0.002403166134676993,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "L", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "TTA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421732723391044,
"Nucleotide GTR":0.002402692300564051,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "L", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CTT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421277909584654,
"Nucleotide GTR":0.00240224106264657,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "S", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "TCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428145418423061,
"Nucleotide GTR":0.002409054576974853,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "T", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "ACT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004927676014059605,
"Nucleotide GTR":0.0048889330784929,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "S", "H", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TCT", "CAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00242076607928106,
"Nucleotide GTR":0.002401733256513479,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGC", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242174033719028,
"Nucleotide GTR":0.002402699854501208,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAA", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421465465124087,
"Nucleotide GTR":0.002402427143565476,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "S", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "TCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421087381047751,
"Nucleotide GTR":0.002402052032104827,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACC", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421740377593037,
"Nucleotide GTR":0.002402699894586309,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGA", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242127790962981,
"Nucleotide GTR":0.002402241062691368,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "N", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAT", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421465465094699,
"Nucleotide GTR":0.002402427143536322,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGT", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002426220501738644,
"Nucleotide GTR":0.002407144794589615,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "K", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "AAG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421465465124087,
"Nucleotide GTR":0.002402427143565476,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "F", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "TTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421465424815771,
"Nucleotide GTR":0.002402427103574079,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "I", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ATT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004855415903349664,
"Nucleotide GTR":0.00481724109945503,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "I", "C", "T", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATT", "TGT", "ACA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAT", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421739134306917,
"Nucleotide GTR":0.002402698661075293,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "L", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CTA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421707546279923,
"Nucleotide GTR":0.002402667321403281,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "C", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "TGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002443177379157425,
"Nucleotide GTR":0.002423968351715552,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "-", "G", "W", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "---", "GGC", "TGG", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002426505134004944,
"Nucleotide GTR":0.002407427188987695,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "N", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "AAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00242108739759083,
"Nucleotide GTR":0.00240205204851784,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAC", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002416203150974182,
"Nucleotide GTR":0.002397206203381202,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAC", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242108739759083,
"Nucleotide GTR":0.00240205204851784,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "CTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432559_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242108739759083,
"Nucleotide GTR":0.00240205204851784,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAC", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432559_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00242146647787241,
"Nucleotide GTR":0.002402428148351259,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "S", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "TCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002422208364813075,
"Nucleotide GTR":0.002403164202343927,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCT", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421277909584654,
"Nucleotide GTR":0.00240224106264657,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "S", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "TCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421406712201027,
"Nucleotide GTR":0.002402368852576341,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTA", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421104999883079,
"Nucleotide GTR":0.002402069512415343,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "S", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "TCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002421625955841848,
"Nucleotide GTR":0.002402586372454841,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "L", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "TTA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002422333222404443,
"Nucleotide GTR":0.002403288078265716,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTT", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427811873402058,
"Nucleotide GTR":0.002408723654389499,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "T", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "ACC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421739134306917,
"Nucleotide GTR":0.002402698661075293,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ATT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242108739759083,
"Nucleotide GTR":0.00240205204851784,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ACG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421382635587155,
"Nucleotide GTR":0.002402344965260368,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "A", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "GCC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421047502780414,
"Nucleotide GTR":0.002402012467372945,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACG", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438320_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433246316553877,
"Nucleotide GTR":0.002414115370243445,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGA", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438320_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438363_England_20200329_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCT", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438363_England_20200329_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438450_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002427438872193542,
"Nucleotide GTR":0.002408353585833566,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "N", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "AAT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438450_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421047523606558,
"Nucleotide GTR":0.002402012488035347,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAG", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421016917353005,
"Nucleotide GTR":0.002401982122417767,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGC", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002422333222414499,
"Nucleotide GTR":0.002403288078275694,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "V", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421465424904018,
"Nucleotide GTR":0.002402427103661633,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "V", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GTA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421459524612649,
"Nucleotide GTR":0.002402421249760204,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAG", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002421465424904018,
"Nucleotide GTR":0.002402427103661633,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATT", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421104999883079,
"Nucleotide GTR":0.002402069512415343,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "L", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TTG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439493_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439748_England_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002421398881719503,
"Nucleotide GTR":0.002402361083660524,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "I", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ATT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439748_England_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440094_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421459524711779,
"Nucleotide GTR":0.002402421249858557,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "V", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "GTA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440094_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440119_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002420815199108009,
"Nucleotide GTR":0.002401781990144932,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCC", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440119_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440540_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421732704419702,
"Nucleotide GTR":0.002402692281741866,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "I", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ATA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440540_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440914_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421222190127313,
"Nucleotide GTR":0.002402185781273089,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "I", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATA", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440914_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002422093959616306,
"Nucleotide GTR":0.002403050696636724,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "I", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "ATC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441031_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421259656009983,
"Nucleotide GTR":0.002402222952587232,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "G", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GGT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441031_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442445_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002420762132436075,
"Nucleotide GTR":0.00240172934069983,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "T", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ACG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442445_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442498_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002422362842921227,
"Nucleotide GTR":0.002403317465896697,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442498_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442569_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002422362820908164,
"Nucleotide GTR":0.002403317444056712,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTT", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442569_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442749_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002419762716139185,
"Nucleotide GTR":0.002400737782127575,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGC", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442749_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442868_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002422362842988433,
"Nucleotide GTR":0.002403317465963378,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTT", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442868_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442971_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242124739916191,
"Nucleotide GTR":0.002402210792106345,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "GTG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442971_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002421017775567336,
"Nucleotide GTR":0.002401982973884546,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCT", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002420346123844769,
"Nucleotide GTR":0.002401316602898648,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAC", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443481_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002427438856734065,
"Nucleotide GTR":0.002408353570495638,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "E", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAA", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443481_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421259662513131,
"Nucleotide GTR":0.002402222959039251,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTG", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443510_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443791_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002419762755166504,
"Nucleotide GTR":0.002400737820848047,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAC", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443791_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002422007707214366,
"Nucleotide GTR":0.002402965122378243,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "I", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "ATA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002419762755166504,
"Nucleotide GTR":0.002400737820848047,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGC", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421399934364417,
"Nucleotide GTR":0.002402362128029213,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAT", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002422362842890984,
"Nucleotide GTR":0.002403317465866696,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "I", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ATT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421260716352673,
"Nucleotide GTR":0.002402224004593172,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "S", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AGT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13":{
"Global MG94xREV":0.002421732704419702,
"Nucleotide GTR":0.002402692281741866,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "V", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002421732682178896,
"Nucleotide GTR":0.002402692259675928,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGT", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421732704419702,
"Nucleotide GTR":0.002402692281741866,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "F", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "TTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.002420888958037665,
"Nucleotide GTR":0.002401855169158729,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "CTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421398861037534,
"Nucleotide GTR":0.002402361063141164,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGT", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002420888934750476,
"Nucleotide GTR":0.002401855146054631,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAC", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421398881748714,
"Nucleotide GTR":0.002402361083689504,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "L", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CTC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002420888912079626,
"Nucleotide GTR":0.002401855123562026,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAC", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421398842603788,
"Nucleotide GTR":0.002402361044852347,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "V", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GTT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421398840963048,
"Nucleotide GTR":0.002402361043224509,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "V", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GTT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421673828973705,
"Nucleotide GTR":0.002402633869193108,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCA", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447929_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421398859507428,
"Nucleotide GTR":0.002402361061623086,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "L", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CTT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447929_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448099_England_20200509_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "S", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "TCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448099_England_20200509_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421398881719503,
"Nucleotide GTR":0.002402361083660524,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "I", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ATA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448250_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002421398842476082,
"Nucleotide GTR":0.002402361044725645,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCT", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448250_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448395_England_20200501_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448395_England_20200501_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448475_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448475_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448546_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421466477882535,
"Nucleotide GTR":0.002402428148361301,
"amino-acid": [
["V", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GTT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448546_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448553_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.002422333239532861,
"Nucleotide GTR":0.002403288095259467,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACT", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448553_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448683_England_20200101_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002421465465124087,
"Nucleotide GTR":0.002402427143565476,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCT", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448683_England_20200101_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448781_England_20200408_null_9":{
"Global MG94xREV":0.002421465465094699,
"Nucleotide GTR":0.002402427143536322,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "V", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GTT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448781_England_20200408_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448846_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "N", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AAT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448846_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00242145952467453,
"Nucleotide GTR":0.002402421249821601,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "R", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AGG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449579_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002420888958037665,
"Nucleotide GTR":0.002401855169158729,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCC", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449579_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449604_England_20200428_null_62":{
"Global MG94xREV":0.002424834002248628,
"Nucleotide GTR":0.002405769196193798,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "E", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAG", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449604_England_20200428_null_62",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449629_England_20200404_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00242139884250529,
"Nucleotide GTR":0.00240236104475462,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "TTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449629_England_20200404_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002423948296125746,
"Nucleotide GTR":0.002404890453770473,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "K", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAG", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15":{
"Global MG94xREV":0.002420925001088468,
"Nucleotide GTR":0.002401890928827754,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTC", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421398881719503,
"Nucleotide GTR":0.002402361083660524,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGT", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002420881997753667,
"Nucleotide GTR":0.002401848263598669,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAC", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450192_California_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421673810338454,
"Nucleotide GTR":0.002402633850704375,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "R", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "AGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450192_California_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450277_Saint_Petersburg_20200422_null_8":{
"Global MG94xREV":0.002421794661269191,
"Nucleotide GTR":0.002402753751467162,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "I", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ATA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450277_Saint_Petersburg_20200422_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450472_California_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002421625995010647,
"Nucleotide GTR":0.002402586411315683,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "L", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CTA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450472_California_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_12":{
"Global MG94xREV":0.002421794661180863,
"Nucleotide GTR":0.002402753751379525,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTT", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450545_Utah_20200402_null_28346":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450545_Utah_20200402_null_28346",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":3180.306748750111,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02531475039149057],
[0.01254131666390827],
[0.009917044483316529],
[0.03600063137419551],
[0.02132103037664147],
[0.01056276634843499],
[0.00835250608460953],
[0.03032107934058515],
[0.01895961360297647],
[0.009392884162120708],
[0.007427421901438697],
[0.02696285958827299],
[0.01697353352733852],
[0.008408949548377601],
[0.006649375736537503],
[0.02413841393595833],
[0.01596952669586124],
[0.00791154912326749],
[0.006256056416562663],
[0.02271059500516857],
[0.01345013316416098],
[0.006663402821470407],
[0.005269084894487139],
[0.01912771322997391],
[0.01196045984627695],
[0.005925395749844748],
[0.004685505900793741],
[0.01700921791970038],
[0.01070756347963216],
[0.005304691621297057],
[0.004194684193731653],
[0.01522744802080342],
[0.03065330836435878],
[0.01518612038628185],
[0.01200842267488245],
[0.04359270534999126],
[0.0258173637374968],
[0.01279031904529812],
[0.01011394308326985],
[0.03671540823406942],
[0.02295795428567561],
[0.01137372362750896],
[0.008993770445136377],
[0.03264898276943169],
[0.02055303525414908],
[0.01018228975362125],
[0.008051644267884397],
[0.02922889755429654],
[0.01279678514693861],
[0.03673396958195861],
[0.02175534293192838],
[0.0107779314676927],
[0.008522647874034044],
[0.0309387242299191],
[0.009584218607496944],
[0.007578719588662193],
[0.02751209704250289],
[0.01731928692613217],
[0.00858024109954183],
[0.006784824507829638],
[0.02463011701277513]
],
"Log Likelihood":-1446.893696955701,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.6048997538960584, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.6019067396371917, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":142
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":3437.736385974737,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2781740663305047],
[0.2009387939162875],
[0.2228713155413438],
[0.2980158242118641]
],
"Log Likelihood":-1478.686706242019,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2090801853864528,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.4246938243261305,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1287903015747869,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.28155095581772,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6191088170783176
},
"display order":0,
"estimated parameters":239
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-22/sequences.nsp10.compressed.fas",
"number of sequences":117,
"number of sites":139,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1,(epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6,epi_isl_438450_England_20200331_null_1)Node3,epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4,epi_isl_449629_England_20200404_null_6,epi_isl_448683_England_20200101_null_3,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_450545_Utah_20200402_null_28346,epi_isl_447929_England_20200426_null_2,(epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_448099_England_20200509_null_25)Node220,epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1,epi_isl_443791_England_20200331_null_1,epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1,epi_isl_448553_England_20200407_null_7,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_440119_England_20200318_null_1,epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1,epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15,epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2,(epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1,epi_isl_443481_England_20200414_null_2)Node121,epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1,epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2,epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2,(epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1,epi_isl_448846_England_20200412_null_1)Node130,epi_isl_448781_England_20200408_null_9,epi_isl_442749_England_20200406_null_2,epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2,epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1,epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1,epi_isl_442569_England_20200411_null_1,epi_isl_449579_England_20200401_null_4,epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1,epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1,epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3,epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13,epi_isl_448250_England_20200101_null_2,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3,epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1,epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1,epi_isl_440094_England_20200323_null_1,epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1,epi_isl_438320_England_20200330_null_1,epi_isl_442498_England_20200325_null_2,epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1,epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,(epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1,epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6)Node185,epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3,(epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_448475_England_20200407_null_2)Node20,epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1,epi_isl_448546_England_20200405_null_1,epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_441006_England_20200403_null_1,epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,(epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1,epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1)Node204,epi_isl_440914_England_20200419_null_1,epi_isl_439748_England_20200409_null_3,epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_450472_California_20200404_null_1,epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_12,epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1,epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1,epi_isl_449604_England_20200428_null_62,epi_isl_450277_Saint_Petersburg_20200422_null_8,epi_isl_450192_California_20200421_null_1,epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1,epi_isl_441031_England_20200406_null_1,epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2,epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3,(epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_448395_England_20200501_null_7)Node46,epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2,epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3,epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4,epi_isl_439493_England_20200330_null_1,epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2,(epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_438363_England_20200329_null_5)Node66,epi_isl_440540_England_20200310_null_1,epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1,epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2,epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1,epi_isl_442868_England_20200408_null_1,epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1,epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2,epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1,epi_isl_442445_England_20200325_null_3,epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1,epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11,epi_isl_432559_England_20200402_null_1,epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3,epi_isl_442971_England_20200407_null_1,epi_isl_443510_England_20200416_null_2,epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node121":"test",
"Node130":"test",
"Node185":"test",
"Node20":"test",
"Node204":"test",
"Node220":"test",
"Node3":"test",
"Node46":"test",
"Node66":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":"background",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":"background",
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4":"background",
"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_432559_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6":"background",
"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6":"background",
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_438320_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438363_England_20200329_null_5":"background",
"epi_isl_438450_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439748_England_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_440094_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440119_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440540_England_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_440914_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_441006_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441031_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442445_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_442498_England_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_442569_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442749_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442868_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442971_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_443481_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443791_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13":"background",
"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_447929_England_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_448099_England_20200509_null_25":"background",
"epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_448250_England_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_448395_England_20200501_null_7":"background",
"epi_isl_448475_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_448546_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_448553_England_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_448683_England_20200101_null_3":"background",
"epi_isl_448781_England_20200408_null_9":"background",
"epi_isl_448846_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2":"background",
"epi_isl_449579_England_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_449604_England_20200428_null_62":"background",
"epi_isl_449629_England_20200404_null_6":"background",
"epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15":"background",
"epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_450192_California_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_450277_Saint_Petersburg_20200422_null_8":"background",
"epi_isl_450472_California_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_12":"background",
"epi_isl_450545_Utah_20200402_null_28346":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":4
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":7
}
}
}