{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[71.64342773618448, 165.7606725280727, 1, 0, 0.3017783924390411, 0.01395801445573404, 0, -0.02660372292746269, 1, 0.3017783924390411, 0.002878196933008672],
[71.66489000747231, 165.6833044838834, 1, 0, 0.3019398995684476, 0.01395383429592556, 0, -0.02659575561852415, 1, 0.3019398995684476, 0.002883267847269287],
[32.26911013120417, 69.30155802618106, 6, 2, 0.3177010717425105, 0.1859363327840271, 0.02885938003362682, -0.2993858290170424, 0.9981130304213504, 0.01529050878088156, 0.5073723078137503],
[71.01160146466097, 166.3924987995962, 0, 0, 0.2991169966551427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.145977491690584],
[71.32751460042272, 166.0765856638344, 0, 1, 0.3004476945470919, 0, 0.006021318393576322, 0.01147652387871918, 0.699552305452908, 1, 0.002883653832866259],
[71.64342773618448, 165.7606725280727, 1, 0, 0.3017783924390411, 0.01395801445573404, 0, -0.02660372292746269, 1, 0.3017783924390411, 0.002881361124809962],
[71.57905864946224, 165.8250416147949, 1, 0, 0.301507255223422, 0.01397056651579076, 0, -0.0266276469267519, 1, 0.3015072552234219, 0.002882426318759311],
[71.37350951393617, 166.0018481288784, 1, 0, 0.3006778387726914, 0.01401080046098536, 0, -0.02670433209810134, 1, 0.3006778387726914, 0.002882739884871592]
],
"NAMES": [
["Node108"],
["Node14"],
["Node32"],
["Node31"],
["Node30"],
["Node46"],
["Node51"],
["Node94"]
],
"RESOLVED": [
[71.64342773618448, 165.7606725280727, 1, 0, 0.3017783924390411, 0.01395801445573404, 0, -0.02660372292746269, 1, 0.3017783924390411, 0.002878196933008672],
[71.66489000747231, 165.6833044838834, 1, 0, 0.3019398995684476, 0.01395383429592556, 0, -0.02659575561852415, 1, 0.3019398995684476, 0.002883267847269287],
[32.26911013120417, 69.30155802618106, 6, 2, 0.3177010717425105, 0.1859363327840271, 0.02885938003362682, -0.2993858290170424, 0.9981130304213504, 0.01529050878088156, 0.5073723078137503],
[71.01160146466097, 166.3924987995962, 0, 0, 0.2991169966551427, 0, 0, 0, 1, 1, 0.145977491690584],
[71.32751460042272, 166.0765856638344, 0, 1, 0.3004476945470919, 0, 0.006021318393576322, 0.01147652387871918, 0.699552305452908, 1, 0.002883653832866259],
[71.64342773618448, 165.7606725280727, 1, 0, 0.3017783924390411, 0.01395801445573404, 0, -0.02660372292746269, 1, 0.3017783924390411, 0.002881361124809962],
[71.57905864946224, 165.8250416147949, 1, 0, 0.301507255223422, 0.01397056651579076, 0, -0.0266276469267519, 1, 0.3015072552234219, 0.002882426318759311],
[71.37350951393617, 166.0018481288784, 1, 0, 0.3006778387726914, 0.01401080046098536, 0, -0.02670433209810134, 1, 0.3006778387726914, 0.002882739884871592]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[2.595278508543707, 9.268193717338649, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0, 12.32274736987001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 7.576398713820488, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[2.940013594458907, 9.382733775411104, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.383106196678369, 2.616893803321631, 0, 1, 0.1277020655594563, 0, 0.3821324345415535, 0.5698014000424145, 0.8722979344405437, 1, 0.6706414454459195],
[0.6051389629991795, 2.283049491197987, 1, 0, 0.2095219798139491, 1.652512994773658, 0, -2.4640782432927, 1, 0.209521979813949, 0.6706414454459195],
[0.8164694223666418, 2.112634859850886, 1, 2, 0.2787437194788162, 1.224785610588295, 0.9466851267147812, -0.414678343788611, 0.8102215096752103, 0.6247948215507264, 0.6706414454459195],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 7.576398713820488, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.243452203470081, 0, -1.491109752894984, 1, 0.3333333333333333, 0.1632691376321692],
[5.535292103002615, 5.619886404702967, 0, 0, 0.4962082945762851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 7.576398713820488, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[5.358976004960208, 6.727645989719771, 0, 0, 0.4433807897127091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2763936076295503, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3075244113334902, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.5739834925912235, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.9999999999999999, 1.844490961247485, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.6318262715235109, 2.256362182673655, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[1.320891750802193, 1.535844872202789, 1, 0, 0.4623778545649601, 0.7570643085572214, 0, -1.12886597405837, 1, 0.4623778545649602, 0.6706414454459195],
[0, 1.822196542104319, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2227336937976762, 0.6929416512024802, 0, 0, 0.2432452670194349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1832591637889503, 0.4875094289388476, 0, 0, 0.2732077288289466, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[1.347579059326525, 1.368173728476489, 0, 0, 0.496208294576285, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.7957926705231346, 2.204207329476864, 1, 0, 0.2652642235077117, 1.256608708575595, 0, -1.87374150092984, 1, 0.2652642235077116, 0.6706414454459195],
[0.715752787803014, 2.284247212196985, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.7955160112874989, 2.2044839887125, 2, 0, 0.2651720037624998, 2.514091447088676, 0, -3.748786276423789, 1, 0.07031619157941926, 0.6706414454459195],
[0.7732380306882271, 2.226761969311772, 0, 0, 0.2577460102294091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -1.491109752894984, 1, 0.3333333333333334, 0.6706414454459195],
[1.347579059326525, 1.368173728476489, 0, 0, 0.496208294576285, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.6318262715235109, 2.256362182673655, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.2227336937976762, 0.7108303701915899, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2227336937976762, 0.7108303701915899, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.702152883029503, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0, 0.9335640639892659, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.5739834925912235, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[7.576398713820488, 4.746348656049524, 0, 0, 0.6148303204158286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.243452203470081, 0, -1.491109752894984, 1, 0.3333333333333333, 0.1632691376321692],
[5.358976004960208, 6.727645989719771, 0, 0, 0.4433807897127091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0, 0.9335640639892659, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1832591637889503, 0.4875094289388476, 0, 0, 0.2732077288289466, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1145712540701972, 0.8189928099190688, 0, 0, 0.1227245761588296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1832591637889503, 0.7155104865001108, 0, 0, 0.2039000357099405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2227336937976762, 0.6929416512024802, 0, 0, 0.2432452670194349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0, 0.9335640639892659, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.5725004404025615, 0.3609056986889956, 1, 0, 0.6133454842709207, 1.746723547141442, 0, -3.329223467019396, 1, 0.6133454842709207, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.263153949133608, 0.6701028871219255, 1, 0, 0.2819737706818729, 3.800056975364948, 0, -7.242839818069557, 1, 0.2819737706818729, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.4193504610572344, 0.4257592753999526, 0, 0, 0.496208294576285, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355]
],
"RESOLVED": [
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[2.595278508543707, 9.268193717338649, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0, 12.32274736987001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 7.576398713820488, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[2.940013594458907, 9.382733775411104, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.383106196678369, 2.616893803321631, 0, 1, 0.1277020655594563, 0, 0.3821324345415535, 0.5698014000424145, 0.8722979344405437, 1, 0.6706414454459195],
[0.6051389629991795, 2.283049491197987, 1, 0, 0.2095219798139491, 1.652512994773658, 0, -2.4640782432927, 1, 0.209521979813949, 0.6706414454459195],
[0.8164694223666418, 2.112634859850886, 1, 2, 0.2787437194788162, 1.224785610588295, 0.9466851267147812, -0.414678343788611, 0.8102215096752103, 0.6247948215507264, 0.6706414454459195],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 7.576398713820488, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.243452203470081, 0, -1.491109752894984, 1, 0.3333333333333333, 0.1632691376321692],
[5.535292103002615, 5.619886404702967, 0, 0, 0.4962082945762851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 7.576398713820488, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[5.358976004960208, 6.727645989719771, 0, 0, 0.4433807897127091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2763936076295503, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3075244113334902, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.5739834925912235, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.9999999999999999, 1.844490961247485, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.6318262715235109, 2.256362182673655, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[1.320891750802193, 1.535844872202789, 1, 0, 0.4623778545649601, 0.7570643085572214, 0, -1.12886597405837, 1, 0.4623778545649602, 0.6706414454459195],
[0, 1.822196542104319, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2227336937976762, 0.6929416512024802, 0, 0, 0.2432452670194349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1832591637889503, 0.4875094289388476, 0, 0, 0.2732077288289466, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[1.347579059326525, 1.368173728476489, 0, 0, 0.496208294576285, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.7957926705231346, 2.204207329476864, 1, 0, 0.2652642235077117, 1.256608708575595, 0, -1.87374150092984, 1, 0.2652642235077116, 0.6706414454459195],
[0.715752787803014, 2.284247212196985, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.7955160112874989, 2.2044839887125, 2, 0, 0.2651720037624998, 2.514091447088676, 0, -3.748786276423789, 1, 0.07031619157941926, 0.6706414454459195],
[0.7732380306882271, 2.226761969311772, 0, 0, 0.2577460102294091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -1.491109752894984, 1, 0.3333333333333334, 0.6706414454459195],
[1.347579059326525, 1.368173728476489, 0, 0, 0.496208294576285, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.6318262715235109, 2.256362182673655, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6706414454459195],
[0.2227336937976762, 0.7108303701915899, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2227336937976762, 0.7108303701915899, 0, 0, 0.2385842626010047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.702152883029503, 0, 0, 0.2187621346541047, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0, 0.9335640639892659, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.5739834925912235, 0, 0, 0.3515567507943277, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[7.576398713820488, 4.746348656049524, 0, 0, 0.6148303204158286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[4.107582456623337, 8.215164913246674, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.243452203470081, 0, -1.491109752894984, 1, 0.3333333333333333, 0.1632691376321692],
[5.358976004960208, 6.727645989719771, 0, 0, 0.4433807897127091, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1632691376321692],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0, 0.9335640639892659, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1832591637889503, 0.4875094289388476, 0, 0, 0.2732077288289466, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1145712540701972, 0.8189928099190688, 0, 0, 0.1227245761588296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1832591637889503, 0.7155104865001108, 0, 0, 0.2039000357099405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2227336937976762, 0.6929416512024802, 0, 0, 0.2432452670194349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.6090184391889027, 0, 0, 0.2440518558347492, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0, 0.9335640639892659, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.5725004404025615, 0.3609056986889956, 1, 0, 0.6133454842709207, 1.746723547141442, 0, -3.329223467019396, 1, 0.6133454842709207, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.2627954712614682, 0.670768592727798, 0, 0, 0.2814969870824952, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.263153949133608, 0.6701028871219255, 1, 0, 0.2819737706818729, 3.800056975364948, 0, -7.242839818069557, 1, 0.2819737706818729, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.3111880213297553, 0.6223760426595106, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.4193504610572344, 0.4257592753999526, 0, 0, 0.496208294576285, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355],
[0.1966167672595582, 0.4741518254682397, 0, 0, 0.2931216061562776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.5246639537553355]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node108":{
"Global MG94xREV":0.002878196933008672,
"Nucleotide GTR":0.004023189541913133,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTC", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node14":{
"Global MG94xREV":0.002883267847269287,
"Nucleotide GTR":0.004030277746680243,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGA", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node30":{
"Global MG94xREV":0.002883653832866259,
"Nucleotide GTR":0.004030817283499025,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "I", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "ATA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node31":{
"Global MG94xREV":0.145977491690584,
"Nucleotide GTR":0.2040496642842121,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "I", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "S", "S", "K", "L", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "L", "-", "V", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "ATA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CTA", "CTT", "---", "GTT", "TTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node32":{
"Global MG94xREV":0.5073723078137503,
"Nucleotide GTR":0.7092130977010033,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "I", "K", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "S", "S", "K", "L", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "ATA", "AAA", "ATT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TCA", "TCT", "AAA", "TTA", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "TTA", "CAT", "AAT", "GAT", "ATT", "CTT", "TTA", "GCT", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node46":{
"Global MG94xREV":0.002881361124809962,
"Nucleotide GTR":0.004027612499639741,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTT", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node51":{
"Global MG94xREV":0.002882426318759311,
"Nucleotide GTR":0.004029101444717818,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAT", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.002882739884871592,
"Nucleotide GTR":0.004029539752426777,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "TTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94_1":{
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003629712786406458,
"Nucleotide GTR":0.0003398644713773369,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "I", "K", "IM", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "ATA", "AAA", "AT?", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.008729078366261387,
"Nucleotide GTR":0.008173383898779259,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "L", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "I", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TTA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "ATT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418031_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":58.25218126240309,
"Nucleotide GTR":54.54383846972092,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "R", "K", "P", "I", "W", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "K", "N", "P", "L", "V", "V", "H", "R", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CGG", "AAG", "CCA", "ATA", "TGG", "---", "---", "---", "---", "---", "ATC", "AAG", "AAT", "CCT", "TTG", "GTG", "GTG", "CAT", "CGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2.5, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 2, 0, 2, 2, 1, 1, 2, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418031_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419186_ARA_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.004293953287524715,
"Nucleotide GTR":0.004020599562722933,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "H", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAC", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419186_ARA_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419839_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004299604814009688,
"Nucleotide GTR":0.004025891312165161,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "N", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAT", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419839_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004309169295680066,
"Nucleotide GTR":0.0040348469174656,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "L", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTT", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TTA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303287116738989,
"Nucleotide GTR":0.004029339198937998,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "I", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "ATT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421660_Ohio_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004311483022035268,
"Nucleotide GTR":0.004037013351646197,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "I", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "ATC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421660_Ohio_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421751_Luxembourg_20200317_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "I", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "ATA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421751_Luxembourg_20200317_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422283_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004296361804885276,
"Nucleotide GTR":0.004022854753498949,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTG", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422283_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_422544_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00429704242212629,
"Nucleotide GTR":0.00402349204254202,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "T", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ACA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422544_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422654_Netherlands_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00431102337068768,
"Nucleotide GTR":0.004036582961773887,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "N", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "AAT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422654_Netherlands_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423486_England_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.004296934239727659,
"Nucleotide GTR":0.004023390747051483,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "T", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ACG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423486_England_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0043042264697498,
"Nucleotide GTR":0.00403021875259208,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "Y", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TAT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424503_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004296934463198371,
"Nucleotide GTR":0.004023390956296015,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAC", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424503_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424545_Reykjavik_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004297028132736025,
"Nucleotide GTR":0.004023478662816537,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATC", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424545_Reykjavik_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424582_Reykjavik_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004308228561436843,
"Nucleotide GTR":0.004033966070508567,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "V", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "GTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424582_Reykjavik_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004302043036417941,
"Nucleotide GTR":0.004028174316960978,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "G", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GGT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004349506348688733,
"Nucleotide GTR":0.004072616107493665,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTA", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427473_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303529226785968,
"Nucleotide GTR":0.004029565896222258,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "I", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "ATA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427473_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004304238871467696,
"Nucleotide GTR":0.004030230364814713,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTA", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429534_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004296527648008918,
"Nucleotide GTR":0.004023010039023913,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "V", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "GTG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429534_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.004303555615737665,
"Nucleotide GTR":0.004029590605249241,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "N", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "AAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004299902300389349,
"Nucleotide GTR":0.004026169860516272,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "S", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "TCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430362_New_York_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004309373157120529,
"Nucleotide GTR":0.0040350378010555,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "L", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TTA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAT", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430362_New_York_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430415_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303336444288795,
"Nucleotide GTR":0.004029385386288422,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "F", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "TTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430415_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430429_New_York_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004303040339493313,
"Nucleotide GTR":0.004029108131569627,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "I", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ATT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430429_New_York_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430926_Connecticut_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004297056744579529,
"Nucleotide GTR":0.00402350545322569,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "CTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430926_Connecticut_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432537_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004296118012535761,
"Nucleotide GTR":0.004022626481007797,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "CTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432537_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTT", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433621_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004297056739835998,
"Nucleotide GTR":0.004023505448784139,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "T", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ACG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433621_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00430490084362626,
"Nucleotide GTR":0.004030850195724145,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTA", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004295046597637619,
"Nucleotide GTR":0.004021623272546378,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "F", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTC", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004302964373936289,
"Nucleotide GTR":0.004029037001991611,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "L", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TTA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435578_Louisiana_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGA", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435578_Louisiana_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435642_California_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303015100369333,
"Nucleotide GTR":0.004029084499172149,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "F", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TTT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435642_California_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436045_Virginia_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004297085685999554,
"Nucleotide GTR":0.004023532552230485,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAC", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436045_Virginia_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004299908358942049,
"Nucleotide GTR":0.004026175533380575,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "F", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "TTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436215_Comunitat_Valenciana_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004302860938048716,
"Nucleotide GTR":0.004028940150848505,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "V", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GTA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436215_Comunitat_Valenciana_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436484_Pennsylvania_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004310683647991468,
"Nucleotide GTR":0.004036264865876616,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTA", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436484_Pennsylvania_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436632_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00430190672361167,
"Nucleotide GTR":0.004028046681848858,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "A", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "GCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436632_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437476_Makkah_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":1.227431837382979,
"Nucleotide GTR":1.14929333837701,
"amino-acid": [
["G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "L", "-", "M", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-"]
],
"codon": [
["GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "CTT", "TCT", "GTG", "CTT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTG", "CTG", "---", "ATG", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[2, 1, 2.333333333333333, 1, 1, 1.5, 2.5, 2, 1.5, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437476_Makkah_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0.6666666666666666, 0, 0, 0.5, 0.5, 0, 0.5, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437864_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004296555884300386,
"Nucleotide GTR":0.004023036477788731,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "V", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "GTA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437864_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "TTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438741_England_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0.004296556029921239,
"Nucleotide GTR":0.004023036614139341,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438741_England_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004296963178617226,
"Nucleotide GTR":0.004023417843686903,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "P", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "CCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439066_Scotland_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.004296556039024892,
"Nucleotide GTR":0.004023036622663451,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "G", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GGA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439066_Scotland_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439221_Scotland_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00430281886862329,
"Nucleotide GTR":0.004028900759569155,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "TTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439221_Scotland_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439445_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004304264214451856,
"Nucleotide GTR":0.004030254094460619,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "K", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "AAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439445_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440916_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004298750518455421,
"Nucleotide GTR":0.004025091401196891,
"amino-acid": [
["S", "K", "I", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATT", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440916_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440951_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004303253179810806,
"Nucleotide GTR":0.00402930742243987,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAT", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440951_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442121_England_20200405_null_6":{
"Global MG94xREV":0.004296627227579717,
"Nucleotide GTR":0.004023103279343961,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTG", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442121_England_20200405_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442210_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303253761258163,
"Nucleotide GTR":0.004029307966872197,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "V", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GTT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442210_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442460_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.004303253760663822,
"Nucleotide GTR":0.004029307966315689,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAT", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442460_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442690_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004296627136724065,
"Nucleotide GTR":0.004023103194272197,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCG", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442690_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442886_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303253761603406,
"Nucleotide GTR":0.00402930796719546,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "I", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ATA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442886_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443517_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004296627227115229,
"Nucleotide GTR":0.004023103278909044,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "S", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AGC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443517_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443611_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004339368489080888,
"Nucleotide GTR":0.004063123625583194,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "F", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "TTT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443611_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443614_England_20200416_null_5":{
"Global MG94xREV":0.004298730597100172,
"Nucleotide GTR":0.004025072748038174,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "F", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTT", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443614_England_20200416_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444063_California_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004296627045365075,
"Nucleotide GTR":0.004023103108729129,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "G", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "GGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444063_California_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444331_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004296555884300135,
"Nucleotide GTR":0.004023036477788499,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAG", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444331_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444643_New_York_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004303180734232477,
"Nucleotide GTR":0.004029239588758167,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "I", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ATC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444643_New_York_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445032_Florida_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0.004299670558579295,
"Nucleotide GTR":0.004025952871425384,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "N", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAT", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445032_Florida_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_9":{
"Global MG94xREV":0.004303253730354658,
"Nucleotide GTR":0.004029307937936015,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004303193549488359,
"Nucleotide GTR":0.00402925158819289,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "F", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "TTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445380_Bangkok_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.004303253179810806,
"Nucleotide GTR":0.00402930742243987,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "F", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "TTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445380_Bangkok_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445390_Wales_20200402_null_17":{
"Global MG94xREV":0.004303253761301818,
"Nucleotide GTR":0.004029307966913071,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAT", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445390_Wales_20200402_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004297034906838015,
"Nucleotide GTR":0.004023485005678158,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTC", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446420_Wales_20200410_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAT", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446420_Wales_20200410_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447088_Michigan_20200403_null_8":{
"Global MG94xREV":0.004303253761605007,
"Nucleotide GTR":0.004029307967196965,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTT", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447088_Michigan_20200403_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447171_Michigan_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.004303027881680586,
"Nucleotide GTR":0.004029096466823169,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGT", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447171_Michigan_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447447_Tel_Aviv_District_20200330_null_8":{
"Global MG94xREV":0.004298596655153833,
"Nucleotide GTR":0.004024947332856677,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "I", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATT", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447447_Tel_Aviv_District_20200330_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447498_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303027882135568,
"Nucleotide GTR":0.004029096467249182,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "F", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "TTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447498_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447733_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004303269866421985,
"Nucleotide GTR":0.004029323046778819,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "S", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGC", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447733_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448008_England_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTC", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448008_England_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448398_England_20200501_null_7":{
"Global MG94xREV":0.004303193542293096,
"Nucleotide GTR":0.004029251581455679,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAT", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448398_England_20200501_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448479_England_20200407_null_10":{
"Global MG94xREV":0.004303253761301818,
"Nucleotide GTR":0.004029307966913071,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCT", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448479_England_20200407_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449204_Scotland_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.004298596642099689,
"Nucleotide GTR":0.004024947320633565,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "I", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATT", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449204_Scotland_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.004300134398850807,
"Nucleotide GTR":0.004026387183554075,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTT", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449571_England_20200401_null_29":{
"Global MG94xREV":0.004303253730354658,
"Nucleotide GTR":0.004029307937936015,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAT", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449571_England_20200401_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449648_England_20200404_null_22":{
"Global MG94xREV":0.004303193547783169,
"Nucleotide GTR":0.004029251586596254,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTT", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449648_England_20200404_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449836_Utah_20200405_null_35":{
"Global MG94xREV":0.004303193554991496,
"Nucleotide GTR":0.0040292515933457,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "F", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TTT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449836_Utah_20200405_null_35",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450028_New_York_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00430319355502082,
"Nucleotide GTR":0.004029251593373155,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "F", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "TTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450028_New_York_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00430320615780876,
"Nucleotide GTR":0.004029263393865682,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTT", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450396_New_York_20200330_null_368":{
"Global MG94xREV":0.004301324437018133,
"Nucleotide GTR":0.004027501463709164,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "L", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TTA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450396_New_York_20200330_null_368",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450470_California_20200322_null_29263":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "K", "M", "S", "D", "V", "K", "C", "T", "S", "V", "V", "L", "L", "S", "V", "L", "Q", "Q", "L", "R", "V", "E", "S", "S", "S", "K", "L", "W", "A", "Q", "C", "V", "Q", "L", "H", "N", "D", "I", "L", "L", "A", "K", "D", "T", "T", "E", "A", "F", "E", "K", "M", "V", "S", "L", "L", "S", "V", "L", "L", "S", "M", "Q", "G", "A", "V", "D", "I", "N", "K", "L", "C", "E", "E", "M", "L", "D", "N", "R", "A", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "AAA", "ATG", "TCA", "GAT", "GTA", "AAG", "TGC", "ACA", "TCA", "GTA", "GTC", "TTA", "CTC", "TCA", "GTT", "TTG", "CAA", "CAA", "CTC", "AGA", "GTA", "GAA", "TCA", "TCA", "TCT", "AAA", "TTG", "TGG", "GCT", "CAA", "TGT", "GTC", "CAG", "TTA", "CAC", "AAT", "GAC", "ATT", "CTC", "TTA", "GCT", "AAA", "GAT", "ACT", "ACT", "GAA", "GCC", "TTT", "GAA", "AAA", "ATG", "GTT", "TCA", "CTA", "CTT", "TCT", "GTT", "TTG", "CTT", "TCC", "ATG", "CAG", "GGT", "GCT", "GTA", "GAC", "ATA", "AAC", "AAG", "CTT", "TGT", "GAA", "GAA", "ATG", "CTG", "GAC", "AAC", "AGG", "GCA", "ACC", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450470_California_20200322_null_29263",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":2313.564287868584,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03734558926607493],
[0.01485841279432165],
[0.01586316878420941],
[0.02221529919421743],
[0.02198667085590536],
[0.008747673767372812],
[0.009339209198311356],
[0.0130789333077259],
[0.009460769706369625],
[0.003764086319477359],
[0.004018621465882417],
[0.005627808631888788],
[0.03625002261268946],
[0.01442252781032216],
[0.01539780837409018],
[0.02156359329077691],
[0.02651635576689911],
[0.01054986592870777],
[0.01126326924648562],
[0.01577344978291966],
[0.01561111761796478],
[0.006211079656443912],
[0.006631085452141481],
[0.009286388445187766],
[0.006717396626827006],
[0.002672600806308543],
[0.002853327489965063],
[0.003995892923471683],
[0.02573847447707542],
[0.01024037606561223],
[0.010932851051538],
[0.01531072136088576],
[0.04420036722540224],
[0.01758567249311627],
[0.01877485131175937],
[0.02629291441649795],
[0.02602232137699525],
[0.01035330812779899],
[0.01105341980867348],
[0.0154795697826403],
[0.01119729273187201],
[0.004454983864457258],
[0.004756238903244265],
[0.006660792160260297],
[0.0429037094580141],
[0.01706978087808376],
[0.01822407406005004],
[0.02552158798086983],
[0.02060180199777597],
[0.03080242833847814],
[0.03048542572035289],
[0.01212901037218635],
[0.01294919863802334],
[0.01813448031615193],
[0.005219060886910174],
[0.005571984362674418],
[0.007803188720120664],
[0.05026215105337063],
[0.0199974294945707],
[0.02134969621007794],
[0.02989881123150193]
],
"Log Likelihood":-1045.044560328201,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.6077017637739367, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.2668344263501003, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":110
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":2489.00873222113,
"Equilibrium frequencies": [
[0.317080506231654],
[0.1955752851162119],
[0.1847480871950339],
[0.3025961214571002]
],
"Log Likelihood":-1066.02075337747,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3832853845338248,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1080452217290651,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.181061006961639,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.7314910329949074
},
"display order":0,
"estimated parameters":177
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-21/sequences.nsp7.compressed.fas",
"number of sequences":86,
"number of sites":83,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_442121_England_20200405_null_6,epi_isl_424503_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1,epi_isl_450470_California_20200322_null_29263,epi_isl_439445_England_20200331_null_1,epi_isl_419186_ARA_20200322_null_4,epi_isl_435642_California_20200312_null_1,epi_isl_440951_England_20200327_null_2,epi_isl_423486_England_20200331_null_4,epi_isl_422654_Netherlands_20200318_null_1,epi_isl_447171_Michigan_20200321_null_5,epi_isl_448479_England_20200407_null_10,epi_isl_428787_New_York_20200406_null_1,epi_isl_447498_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1,epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6,epi_isl_449571_England_20200401_null_29,epi_isl_429534_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1,epi_isl_430926_Connecticut_20200404_null_1,epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_9,epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_1,epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_2,epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1,epi_isl_442886_England_20200410_null_1,epi_isl_449836_Utah_20200405_null_35,epi_isl_419839_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_433621_Scotland_20200404_null_1,epi_isl_443517_England_20200416_null_2,epi_isl_450028_New_York_20200324_null_2,epi_isl_422283_Wales_20200327_null_2,epi_isl_443611_England_20200414_null_1,epi_isl_447088_Michigan_20200403_null_8,(epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1,epi_isl_448008_England_20200430_null_2)Node108,epi_isl_438741_England_20200424_null_4,epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1,epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4,epi_isl_430342_New_York_20200330_null_1,epi_isl_444063_California_20200430_null_1,epi_isl_444643_New_York_20200329_null_2,epi_isl_422544_New_York_20200320_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_442690_England_20200405_null_2,(epi_isl_435578_Louisiana_20200424_null_4,epi_isl_447733_France_20200301_null_1)Node14,epi_isl_448398_England_20200501_null_7,epi_isl_449648_England_20200404_null_22,epi_isl_427473_New_York_20200401_null_1,epi_isl_436215_Comunitat_Valenciana_20200313_null_2,epi_isl_440916_England_20200420_null_2,epi_isl_443614_England_20200416_null_5,epi_isl_439221_Scotland_20200423_null_2,epi_isl_432537_England_20200320_null_1,(((epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_418031_Washington_20200316_null_1)Node32,epi_isl_437476_Makkah_20200409_null_1)Node31,epi_isl_421751_Luxembourg_20200317_null_3)Node30,epi_isl_445032_Florida_20200428_null_3,epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1,epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_1,(epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1,epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2)Node46,epi_isl_436484_Pennsylvania_20200301_null_1,(epi_isl_430362_New_York_20200408_null_2,epi_isl_446420_Wales_20200410_null_7)Node51,epi_isl_450396_New_York_20200330_null_368,epi_isl_439066_Scotland_20200323_null_3,epi_isl_436045_Virginia_20200321_null_1,epi_isl_447447_Tel_Aviv_District_20200330_null_8,epi_isl_445380_Bangkok_20200330_null_6,epi_isl_437864_Washington_20200405_null_1,epi_isl_430429_New_York_20200413_null_2,epi_isl_449204_Scotland_20200426_null_2,epi_isl_442460_England_20200324_null_3,epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_5,epi_isl_421660_Ohio_20200401_null_1,epi_isl_430415_New_York_20200410_null_1,epi_isl_442210_England_20200403_null_1,(epi_isl_424582_Reykjavik_20200327_null_1,epi_isl_438174_Washington_20200427_null_10)Node94,epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_2,epi_isl_445390_Wales_20200402_null_17,epi_isl_444331_England_20200428_null_2,epi_isl_424545_Reykjavik_20200325_null_2,epi_isl_436632_Wisconsin_20200326_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node108":"test",
"Node14":"test",
"Node30":"test",
"Node31":"test",
"Node32":"test",
"Node46":"test",
"Node51":"test",
"Node94":"test",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"background",
"epi_isl_417445_Lombardy_20200224_null_1":"background",
"epi_isl_418031_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419186_ARA_20200322_null_4":"background",
"epi_isl_419839_Victoria_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_420300_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_421660_Ohio_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_421751_Luxembourg_20200317_null_3":"background",
"epi_isl_422283_Wales_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_422544_New_York_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_422654_Netherlands_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423486_England_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_424355_Beijing_20200124_null_1":"background",
"epi_isl_424503_Reykjavik_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424545_Reykjavik_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_424582_Reykjavik_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_424597_Reykjavik_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_427041_Victoria_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_427473_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_428787_New_York_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429534_Unknown_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_429644_Washington_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430362_New_York_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_430415_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430429_New_York_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_430926_Connecticut_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432537_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_433206_Scotland_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_433621_Scotland_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_435578_Louisiana_20200424_null_4":"background",
"epi_isl_435642_California_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_436045_Virginia_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_436107_New_Taipei_City_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436215_Comunitat_Valenciana_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_436484_Pennsylvania_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_436632_Wisconsin_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_437476_Makkah_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_437864_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_438174_Washington_20200427_null_10":"background",
"epi_isl_438741_England_20200424_null_4":"background",
"epi_isl_438855_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_439066_Scotland_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_439221_Scotland_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_439445_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_440916_England_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_440951_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_442121_England_20200405_null_6":"background",
"epi_isl_442210_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_442460_England_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_442690_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442886_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_443517_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443611_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_443614_England_20200416_null_5":"background",
"epi_isl_444063_California_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_444331_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_444643_New_York_20200329_null_2":"background",
"epi_isl_445032_Florida_20200428_null_3":"background",
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_9":"background",
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_2":"background",
"epi_isl_445380_Bangkok_20200330_null_6":"background",
"epi_isl_445390_Wales_20200402_null_17":"background",
"epi_isl_445775_Wales_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_446420_Wales_20200410_null_7":"background",
"epi_isl_447088_Michigan_20200403_null_8":"background",
"epi_isl_447171_Michigan_20200321_null_5":"background",
"epi_isl_447447_Tel_Aviv_District_20200330_null_8":"background",
"epi_isl_447498_Comunitat_Valenciana_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_447733_France_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_448008_England_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_448398_England_20200501_null_7":"background",
"epi_isl_448479_England_20200407_null_10":"background",
"epi_isl_449204_Scotland_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_449571_England_20200401_null_29":"background",
"epi_isl_449648_England_20200404_null_22":"background",
"epi_isl_449836_Utah_20200405_null_35":"background",
"epi_isl_450028_New_York_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_450309_Quebec_20200327_null_5":"background",
"epi_isl_450396_New_York_20200330_null_368":"background",
"epi_isl_450470_California_20200322_null_29263":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":2
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":5
}
}
}