{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2938198044877431, 0.008417559456613049, 0, -0.4589582270199732, 1, 0.2938198044877431, 0.002291349731336074],
[119.2992796670268, 285.0277188964162, 0, 1, 0.2950564273246462, 0, 0.003508430702360624, 0.191293348514793, 0.7049435726753539, 1, 0.002291349731336074],
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 0, 1, 0.2938198044877431, 0, 0.00350228693685176, 0.1909583664169879, 0.7061801955122569, 1, 0.002293838567027831],
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2938198044877431, 0.008417559456613049, 0, -0.4589582270199732, 1, 0.2938198044877431, 0.002291036337338963],
[118.7546432170597, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2937418357710275, 0.008420723374766917, 0, -0.4591307361984138, 1, 0.2937418357710275, 0.002292999896634331],
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2938198044877431, 0.008417559456613049, 0, -0.4589582270199732, 1, 0.2938198044877431, 0.002293840633908565],
[118.7290869370774, 285.5402881782589, 0, 1, 0.2936880561462378, 0, 0.003502132768654046, 0.1909499605645493, 0.7063119438537622, 1, 0.002293939513805513],
[119.1844504871102, 285.6777335923517, 0, 1, 0.2943827681958017, 0, 0.003500447820784491, 0.1908580906240021, 0.7056172318041983, 1, 0.002292224231833554]
],
"NAMES": [
["Node152"],
["Node160"],
["Node177"],
["Node187"],
["Node132"],
["Node37"],
["Node77"],
["Node113"]
],
"RESOLVED": [
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2938198044877431, 0.008417559456613049, 0, -0.4589582270199732, 1, 0.2938198044877431, 0.002291349731336074],
[119.2992796670268, 285.0277188964162, 0, 1, 0.2950564273246462, 0, 0.003508430702360624, 0.191293348514793, 0.7049435726753539, 1, 0.002291349731336074],
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 0, 1, 0.2938198044877431, 0, 0.00350228693685176, 0.1909583664169879, 0.7061801955122569, 1, 0.002293838567027831],
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2938198044877431, 0.008417559456613049, 0, -0.4589582270199732, 1, 0.2938198044877431, 0.002291036337338963],
[118.7546432170597, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2937418357710275, 0.008420723374766917, 0, -0.4591307361984138, 1, 0.2937418357710275, 0.002292999896634331],
[118.7992796670268, 285.5277188964162, 1, 0, 0.2938198044877431, 0.008417559456613049, 0, -0.4589582270199732, 1, 0.2938198044877431, 0.002293840633908565],
[118.7290869370774, 285.5402881782589, 0, 1, 0.2936880561462378, 0, 0.003502132768654046, 0.1909499605645493, 0.7063119438537622, 1, 0.002293939513805513],
[119.1844504871102, 285.6777335923517, 0, 1, 0.2943827681958017, 0, 0.003500447820784491, 0.1908580906240021, 0.7056172318041983, 1, 0.002292224231833554]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.859614540101092, 0, 0, 0.3496974805438809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.355742018045441, 1.414599622121364, 0, 0, 0.4893771939130982, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3006050389122382, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.000000000000001, 0, 0, 0.278067379487687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.859614540101092, 1.14038545989891, 0, 0, 0.6198715133670302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.622366535654061, 0, 0, 0.3813349455172878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.9748614363145215, 2.02513856368548, 0, 0, 0.3249538121048404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 2.264898537700042, 0, 0, 0.2009305809448425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.339863346427697, 1.59146427308829, 0, 0, 0.4570841339969129, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 1.570863753638018, 0, 0, 0.2660837110563212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.4145996221213635, 2.585400377878638, 0, 0, 0.1381998740404544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.06246666956124119, 2.93753333043876, 0, 1, 0.02082222318708039, 0, 0.3404216693094123, 18.56111935897071, 0.9791777768129196, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -54.52390676722855, 1, 0.3333333333333333, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.88475310378657, 0, 0, 0.3466501166728568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.859614540101092, 1.14038545989891, 0, 0, 0.6198715133670302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8540339432643266, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2992374863935632, 1.170913647972533, 0, -63.8427865745299, 1, 0.2992374863935632, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.02513856368548, 0, 0, 0.2979854806197271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.02513856368548, 0, 0, 0.2979854806197271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.4145996221213635, 2.585400377878638, 0, 0, 0.1381998740404544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.622366535654061, 0, 0, 0.3813349455172878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.355742018045441, 1.414599622121364, 0, 0, 0.4893771939130982, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 2.264898537700042, 0, 0, 0.2009305809448425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.000000000000001, 0, 0, 0.278067379487687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.4145996221213635, 2.585400377878638, 0, 0, 0.1381998740404544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -54.52390676722855, 1, 0.3333333333333333, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.02513856368548, 0, 0, 0.2979854806197271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.04813904208615118, 1.879705577237138, 0, 1, 0.02497039522980277, 0, 0.5319982087140678, 29.00662073225844, 0.9750296047701972, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.000000000000001, 0, 0, 0.278067379487687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833196, 0, 1, 0.2567805467222681, 0, 0.448499204189655, 24.45392879441296, 0.7432194532777319, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.9912206762967949, 2.001572097197156, 0, 1, 0.3312025760940305, 0, 0.4996072843942624, 27.24054099454102, 0.6687974239059695, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -54.52390676722855, 1, 0.3333333333333333, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 1.570863753638018, 0, 0, 0.2660837110563212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209]
],
"RESOLVED": [
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.859614540101092, 0, 0, 0.3496974805438809, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.355742018045441, 1.414599622121364, 0, 0, 0.4893771939130982, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3006050389122382, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.000000000000001, 0, 0, 0.278067379487687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.859614540101092, 1.14038545989891, 0, 0, 0.6198715133670302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.622366535654061, 0, 0, 0.3813349455172878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.9748614363145215, 2.02513856368548, 0, 0, 0.3249538121048404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 2.264898537700042, 0, 0, 0.2009305809448425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.339863346427697, 1.59146427308829, 0, 0, 0.4570841339969129, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 1.570863753638018, 0, 0, 0.2660837110563212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.4145996221213635, 2.585400377878638, 0, 0, 0.1381998740404544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.06246666956124119, 2.93753333043876, 0, 1, 0.02082222318708039, 0, 0.3404216693094123, 18.56111935897071, 0.9791777768129196, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -54.52390676722855, 1, 0.3333333333333333, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.88475310378657, 0, 0, 0.3466501166728568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.859614540101092, 1.14038545989891, 0, 0, 0.6198715133670302, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8540339432643266, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2992374863935632, 1.170913647972533, 0, -63.8427865745299, 1, 0.2992374863935632, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.02513856368548, 0, 0, 0.2979854806197271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.02513856368548, 0, 0, 0.2979854806197271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.4145996221213635, 2.585400377878638, 0, 0, 0.1381998740404544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 1.622366535654061, 0, 0, 0.3813349455172878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1.355742018045441, 1.414599622121364, 0, 0, 0.4893771939130982, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 2.264898537700042, 0, 0, 0.2009305809448425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.000000000000001, 0, 0, 0.278067379487687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.4145996221213635, 2.585400377878638, 0, 0, 0.1381998740404544, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -54.52390676722855, 1, 0.3333333333333333, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.14038545989891, 0, 0, 0.2865381800336968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.8596145401010907, 2.02513856368548, 0, 0, 0.2979854806197271, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.04813904208615118, 1.879705577237138, 0, 1, 0.02497039522980277, 0, 0.5319982087140678, 29.00662073225844, 0.9750296047701972, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.249019866082298, 0, 0, 0.2065326689385249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.000000000000001, 0, 0, 0.278067379487687, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833196, 0, 1, 0.2567805467222681, 0, 0.448499204189655, 24.45392879441296, 0.7432194532777319, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.160985979349182, 0, 0, 0.2627961593368404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.7703416401668043, 2.229658359833197, 0, 0, 0.256780546722268, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 1.554985082020274, 0, 0, 0.2735023148149611, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0.9912206762967949, 2.001572097197156, 0, 1, 0.3312025760940305, 0, 0.4996072843942624, 27.24054099454102, 0.6687974239059695, 1, 0.0183405786432209],
[0.585400377878637, 2.036966157775424, 0, 0, 0.2232336212041497, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.0183405786432209],
[1, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999996, 0, -54.52390676722855, 1, 0.3333333333333333, 0.0183405786432209],
[0.5695217062608928, 1.570863753638018, 0, 0, 0.2660837110563212, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0183405786432209]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node113":{
"Global MG94xREV":0.002292224231833554,
"Nucleotide GTR":0.002402044910362178,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "C", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGT", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node124":{
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node132":{
"Global MG94xREV":0.002292999896634331,
"Nucleotide GTR":0.002402857737336509,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node152":{
"Global MG94xREV":0.002291349731336074,
"Nucleotide GTR":0.002401128512463616,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTC", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"Node160":{
"Global MG94xREV":0.002291349731336074,
"Nucleotide GTR":0.002401128512463616,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "T", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ACG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node177":{
"Global MG94xREV":0.002293838567027831,
"Nucleotide GTR":0.002403736588507435,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "N", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AAT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node187":{
"Global MG94xREV":0.002291036337338963,
"Nucleotide GTR":0.002400800103730626,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node37":{
"Global MG94xREV":0.002293840633908565,
"Nucleotide GTR":0.002403738754412619,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCT", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node77":{
"Global MG94xREV":0.002293939513805513,
"Nucleotide GTR":0.002403842371654732,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004874809838968947,
"Nucleotide GTR":0.004816267214645451,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "L", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCG", "CTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433172523168381,
"Nucleotide GTR":0.002403952038750833,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431005115929626,
"Nucleotide GTR":0.002401810660364881,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCC", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002431833537003463,
"Nucleotide GTR":0.002402629132754503,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "F", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "TTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004887760242093913,
"Nucleotide GTR":0.004829062093635114,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "R", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACA", "CGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "C", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGT", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431317604942791,
"Nucleotide GTR":0.002402119396631271,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "A", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "GCT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002434964109925145,
"Nucleotide GTR":0.002405722109962604,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "N", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "AAC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431639989949331,
"Nucleotide GTR":0.002402437910047955,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "G", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "GGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002437307295369136,
"Nucleotide GTR":0.00240803715559608,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "F", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TTT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002436386597687135,
"Nucleotide GTR":0.002407127514767631,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "L", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "TTA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432913055601059,
"Nucleotide GTR":0.002403695687184511,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "L", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CTT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002431639657162572,
"Nucleotide GTR":0.002402437581257698,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "S", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "TCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00242937157036084,
"Nucleotide GTR":0.002400196732390978,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "T", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "ACT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004957626962379906,
"Nucleotide GTR":0.004898089769672507,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "S", "H", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TCT", "CAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002431401746266635,
"Nucleotide GTR":0.002402202527484126,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGC", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00243228284841373,
"Nucleotide GTR":0.002403073048288836,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAA", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432913039135355,
"Nucleotide GTR":0.002403695670916546,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "S", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "TCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430855502119121,
"Nucleotide GTR":0.002401662843298331,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACC", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00243228284841373,
"Nucleotide GTR":0.002403073048288836,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGA", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431639657272797,
"Nucleotide GTR":0.002402437581366606,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "N", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAT", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432913071306714,
"Nucleotide GTR":0.002403695702701548,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGT", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433464991167976,
"Nucleotide GTR":0.002404240994440251,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "K", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "AAG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432913039144056,
"Nucleotide GTR":0.00240369567092514,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "F", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "TTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432913073116277,
"Nucleotide GTR":0.002403695704489384,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "I", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ATT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004857680682299808,
"Nucleotide GTR":0.004799343765648404,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "I", "C", "T", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATT", "TGT", "ACA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430300766750485,
"Nucleotide GTR":0.002401114769864281,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAT", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432913071455407,
"Nucleotide GTR":0.00240369570284846,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "L", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CTA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002438854935993373,
"Nucleotide GTR":0.002409566210276115,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "C", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "TGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002449355794063089,
"Nucleotide GTR":0.002419940961316149,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "-", "G", "W", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "---", "GGC", "TGG", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002439869216303811,
"Nucleotide GTR":0.002410568309879375,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "N", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "AAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002430855519266994,
"Nucleotide GTR":0.002401662860240267,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAC", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002425392181817348,
"Nucleotide GTR":0.002396265133167736,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAC", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430855502119121,
"Nucleotide GTR":0.002401662843298331,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "CTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432559_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430855519415625,
"Nucleotide GTR":0.002401662860387115,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAC", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432559_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432311028466174,
"Nucleotide GTR":0.002403100889921056,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "S", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "TCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430864273236182,
"Nucleotide GTR":0.002401671509081181,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCT", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAT", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431639657398809,
"Nucleotide GTR":0.0024024375814911,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "S", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "TCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00243228284841373,
"Nucleotide GTR":0.002403073048288836,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTA", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431639580191934,
"Nucleotide GTR":0.00240243750521142,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "S", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "TCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002436591705920864,
"Nucleotide GTR":0.00240733015981312,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "L", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "TTA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432512242780894,
"Nucleotide GTR":0.002403299687810433,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTT", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002436604315024214,
"Nucleotide GTR":0.002407342617491078,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "T", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "ACC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432712253698706,
"Nucleotide GTR":0.002403497296754747,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAT", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6":{
"Global MG94xREV":0.002430292333338997,
"Nucleotide GTR":0.002401106437731418,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ATT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430458319249568,
"Nucleotide GTR":0.00240127043028202,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "T", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ACG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431653647160886,
"Nucleotide GTR":0.002402451403247162,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "A", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "GCC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431653631389347,
"Nucleotide GTR":0.002402451387665026,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACG", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438320_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002435533800744792,
"Nucleotide GTR":0.002406284959244475,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGA", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438320_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438363_England_20200329_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCT", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438363_England_20200329_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438450_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002436604315024214,
"Nucleotide GTR":0.002407342617491078,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "N", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "AAT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438450_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00243205616279241,
"Nucleotide GTR":0.002402849084983173,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAG", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430855517772019,
"Nucleotide GTR":0.002401662858763248,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGC", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432110620002709,
"Nucleotide GTR":0.002402902888205294,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "V", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00243291371065299,
"Nucleotide GTR":0.002403696334369785,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "V", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GTA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431317589256115,
"Nucleotide GTR":0.002402119381132977,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAG", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002433379432527629,
"Nucleotide GTR":0.002404156463291744,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATT", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002432779261860273,
"Nucleotide GTR":0.002403563500201106,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "I", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ATA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431647963848465,
"Nucleotide GTR":0.002402445788186845,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "L", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TTG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439493_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439748_England_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00243277929237113,
"Nucleotide GTR":0.002403563530345553,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "I", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ATT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439748_England_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440094_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431654301547194,
"Nucleotide GTR":0.002402452049774806,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "V", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "GTA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440094_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440119_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430374302496475,
"Nucleotide GTR":0.002401187422503917,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCC", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440119_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440540_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433380088003832,
"Nucleotide GTR":0.002404157110896193,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "I", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ATA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440540_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440914_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433059866881223,
"Nucleotide GTR":0.002403840735376901,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "I", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATA", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440914_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441006_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429662903382173,
"Nucleotide GTR":0.002400484566732321,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "I", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "ATC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441006_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441031_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429516958559693,
"Nucleotide GTR":0.002400340374592145,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "G", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GGT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441031_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442445_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "T", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ACG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442445_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442498_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432980283294601,
"Nucleotide GTR":0.002403762107526435,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAT", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442498_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442569_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432980283294601,
"Nucleotide GTR":0.002403762107526435,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTT", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442569_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442749_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002431005099132669,
"Nucleotide GTR":0.002401810643769636,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGC", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442749_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442868_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002433380103757826,
"Nucleotide GTR":0.002404157126460995,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTT", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442868_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442971_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431713924793805,
"Nucleotide GTR":0.002402510956993213,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "GTG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442971_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002429605587817002,
"Nucleotide GTR":0.00240042793948192,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCT", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002430374302496475,
"Nucleotide GTR":0.002401187422503917,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAC", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443481_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00243660396667977,
"Nucleotide GTR":0.002407342273329974,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "E", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAA", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443481_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002431713926305301,
"Nucleotide GTR":0.002402510958486561,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTG", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443510_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443791_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430374302331097,
"Nucleotide GTR":0.002401187422340523,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAC", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443791_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429663572362694,
"Nucleotide GTR":0.002400485227678918,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "I", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "ATA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430374302496475,
"Nucleotide GTR":0.002401187422503917,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGC", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432980267595491,
"Nucleotide GTR":0.002403762092015856,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAT", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002432980276356946,
"Nucleotide GTR":0.002403762100672095,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "I", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ATT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431714585138631,
"Nucleotide GTR":0.002402511609407817,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "S", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AGT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13":{
"Global MG94xREV":0.002432980267612635,
"Nucleotide GTR":0.002403762092032797,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "V", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002432980938934872,
"Nucleotide GTR":0.00240376275529298,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGT", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432779292388327,
"Nucleotide GTR":0.00240356353036254,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "F", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "TTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.002431054303471246,
"Nucleotide GTR":0.002401859257202894,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "CTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432779277557068,
"Nucleotide GTR":0.002403563515709397,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGT", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431054303471246,
"Nucleotide GTR":0.002401859257202894,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAC", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00243277930987708,
"Nucleotide GTR":0.002403563547641269,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "L", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CTC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002430374271641497,
"Nucleotide GTR":0.002401187392019481,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAC", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432980269245715,
"Nucleotide GTR":0.002403762093646262,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "V", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GTT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432980267604127,
"Nucleotide GTR":0.002403762092024388,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "V", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GTT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002429662918405571,
"Nucleotide GTR":0.002400484581575303,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCA", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447929_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432980267612635,
"Nucleotide GTR":0.002403762092032797,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "L", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CTT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447929_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448099_England_20200509_null_25":{
"Global MG94xREV":0.002430292333336554,
"Nucleotide GTR":0.002401106437729011,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "S", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "TCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448099_England_20200509_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432913071306714,
"Nucleotide GTR":0.002403695702701548,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "I", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ATA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448250_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432779277557068,
"Nucleotide GTR":0.002403563515709397,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCT", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448250_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448395_England_20200501_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTT", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448395_England_20200501_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448475_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448475_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448546_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432980284927653,
"Nucleotide GTR":0.002403762109139874,
"amino-acid": [
["V", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GTT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448546_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448553_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.002432980285085903,
"Nucleotide GTR":0.002403762109296221,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACT", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448553_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448683_England_20200101_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002432980284927653,
"Nucleotide GTR":0.002403762109139874,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCT", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448683_England_20200101_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448781_England_20200408_null_9":{
"Global MG94xREV":0.002432980284927653,
"Nucleotide GTR":0.002403762109139874,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "V", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GTT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448781_England_20200408_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448846_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "N", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AAT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448846_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448882_England_20200414_null_9":{
"Global MG94xREV":0.002432980283285967,
"Nucleotide GTR":0.002403762107517904,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTT", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448882_England_20200414_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002431713909142087,
"Nucleotide GTR":0.002402510941529461,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "R", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AGG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449579_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002430374270168914,
"Nucleotide GTR":0.002401187390564586,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCC", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449579_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449604_England_20200428_null_62":{
"Global MG94xREV":0.002433006951437616,
"Nucleotide GTR":0.00240378845540607,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "E", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAG", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449604_England_20200428_null_62",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449629_England_20200404_null_6":{
"Global MG94xREV":0.002432980284927653,
"Nucleotide GTR":0.002403762109139874,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "TTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449629_England_20200404_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002431720265833828,
"Nucleotide GTR":0.002402517221882343,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "K", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAG", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTC", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002432980283294601,
"Nucleotide GTR":0.002403762107526435,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGT", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002429466466427477,
"Nucleotide GTR":0.00240029048883064,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAC", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450192_California_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002431612791448109,
"Nucleotide GTR":0.002402411038179296,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "R", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "AGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450192_California_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450203_Bavaria_20200201_null_27977":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450203_Bavaria_20200201_null_27977",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":3155.96948674944,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02532044495988984],
[0.01254358454756282],
[0.009918865413488019],
[0.03600772591125272],
[0.02132059834087992],
[0.01056208642135246],
[0.008351991673654378],
[0.03031961968039814],
[0.01895959610823609],
[0.009392461196793163],
[0.007427108109260617],
[0.02696208305718451],
[0.01696978819182917],
[0.008406723233957282],
[0.00664763377724165],
[0.02413241485097726],
[0.01597302299372389],
[0.007912932206338775],
[0.00625716750129284],
[0.02271493391380945],
[0.01344977973642641],
[0.006662933828264597],
[0.005268728699594397],
[0.01912667739777627],
[0.01196037688390965],
[0.005925093295228149],
[0.004685279772690423],
[0.01700862576914902],
[0.01070513639930485],
[0.005303255283648727],
[0.004193560079451246],
[0.01522357201539561],
[0.03066030049779555],
[0.01518891441904006],
[0.01201066547829169],
[0.04360143348310538],
[0.02581692197588552],
[0.01278953604785947],
[0.01011335207082568],
[0.03671375648621016],
[0.02295800547408242],
[0.01137324731708884],
[0.008993418828945233],
[0.03264814539749684],
[0.02054856485222244],
[0.0101796260280274],
[0.00804956032693714],
[0.02922172545705714],
[0.01279985801960406],
[0.03674338683055343],
[0.02175619183029246],
[0.01077787661664601],
[0.008522628216705611],
[0.03093906894364526],
[0.00958435519908476],
[0.007578848688292767],
[0.02751293569522661],
[0.0173164918412712],
[0.008578477977865363],
[0.0067834491960713],
[0.02462545555390785]
],
"Log Likelihood":-1436.749681121076,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.5818216763957145, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5208436007989795, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":140
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":3415.001753652514,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2781947114887635],
[0.2009344828299117],
[0.2228700200541669],
[0.2980007856271579]
],
"Log Likelihood":-1469.329023250822,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.471821987312664,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2115380433985505,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1284655307235129,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.285368971256566,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6190014301477159
},
"display order":0,
"estimated parameters":237
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-20/sequences.nsp10.compressed.fas",
"number of sequences":116,
"number of sites":139,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1,epi_isl_448781_England_20200408_null_9,epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2,epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2,epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1,epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5,(epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15)Node152,epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1,epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2,(epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1,epi_isl_442445_England_20200325_null_3)Node160,epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1,epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3,epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11,epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1,epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1,(epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1,epi_isl_448846_England_20200412_null_1)Node177,epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1,epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13,epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1,epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3,(epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_448395_England_20200501_null_7)Node187,epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3,epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1,epi_isl_441006_England_20200403_null_1,epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1,epi_isl_440540_England_20200310_null_1,epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1,epi_isl_442971_England_20200407_null_1,epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1,epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_450203_Bavaria_20200201_null_27977,epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1,epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1,epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2,(epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1,epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6)Node132,epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1,epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6,epi_isl_438450_England_20200331_null_1,epi_isl_443510_England_20200416_null_2,epi_isl_449579_England_20200401_null_4,epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1,epi_isl_443791_England_20200331_null_1,epi_isl_447929_England_20200426_null_2,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_449604_England_20200428_null_62,epi_isl_450192_California_20200421_null_1,(epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_438363_England_20200329_null_5)Node37,epi_isl_448553_England_20200407_null_7,epi_isl_449629_England_20200404_null_6,epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1,epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1,epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4,epi_isl_448546_England_20200405_null_1,epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4,epi_isl_438320_England_20200330_null_1,epi_isl_441031_England_20200406_null_1,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1,epi_isl_440119_England_20200318_null_1,epi_isl_432559_England_20200402_null_1,epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_448099_England_20200509_null_25,epi_isl_442498_England_20200325_null_2,epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1,epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3,epi_isl_442868_England_20200408_null_1,epi_isl_448683_England_20200101_null_3,epi_isl_448250_England_20200101_null_2,(epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_448475_England_20200407_null_2)Node77,epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3,epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2,epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1,epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1,epi_isl_439493_England_20200330_null_1,epi_isl_439748_England_20200409_null_3,epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1,epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1,epi_isl_443481_England_20200414_null_2,epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1,epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2,epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2,(epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1,epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1)Node113,epi_isl_440914_England_20200419_null_1,epi_isl_442569_England_20200411_null_1,epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1,epi_isl_442749_England_20200406_null_2,epi_isl_448882_England_20200414_null_9,epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_440094_England_20200323_null_1,epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2,epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node113":"test",
"Node132":"test",
"Node152":"test",
"Node160":"test",
"Node177":"test",
"Node187":"test",
"Node37":"test",
"Node77":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_415525_Noord_Holland_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":"background",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":"background",
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421692_Minnesota_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_421722_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_422746_Netherlands_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_424870_Missouri_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_424936_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_426017_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426068_Idaho_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426088_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426516_Arizona_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427655_New_South_Wales_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_4":"background",
"epi_isl_430578_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432283_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_432559_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432895_Scotland_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434604_Virginia_20200408_null_6":"background",
"epi_isl_435446_Louisiana_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435476_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435699_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436054_New_York_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_436336_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436631_Wisconsin_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436982_Unknown_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_437217_Bavaria_20200411_null_6":"background",
"epi_isl_437221_Bavaria_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_438320_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438363_England_20200329_null_5":"background",
"epi_isl_438450_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438754_Scotland_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_438853_Scotland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_438996_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_439062_Scotland_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_439184_Scotland_20200422_null_4":"background",
"epi_isl_439195_Scotland_20200422_null_5":"background",
"epi_isl_439493_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439748_England_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_440094_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440119_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_440540_England_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_440914_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_441006_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441031_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442445_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_442498_England_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_442569_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_442749_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_442868_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442971_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_443264_Bourgogne_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_443303_Ile_de_France_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_443481_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443791_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_444565_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444632_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_445159_Louisiana_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445235_Vastra_Gotaland_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_445240_Uppsala_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_445427_Wales_20200402_null_13":"background",
"epi_isl_446190_Wales_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_446291_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_446367_Wales_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_446632_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_446764_Wales_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_447241_Kinshasa_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_447534_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447580_Telangana_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_447794_Valle_del_Cauca_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_447929_England_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_448099_England_20200509_null_25":"background",
"epi_isl_448165_Scotland_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_448250_England_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_448395_England_20200501_null_7":"background",
"epi_isl_448475_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_448546_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_448553_England_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_448683_England_20200101_null_3":"background",
"epi_isl_448781_England_20200408_null_9":"background",
"epi_isl_448846_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_448882_England_20200414_null_9":"background",
"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_2":"background",
"epi_isl_449579_England_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_449604_England_20200428_null_62":"background",
"epi_isl_449629_England_20200404_null_6":"background",
"epi_isl_449794_Norway_20200402_null_3":"background",
"epi_isl_449994_Washington_20200417_null_15":"background",
"epi_isl_450122_New_York_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_450160_New_York_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_450192_California_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_450203_Bavaria_20200201_null_27977":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":2
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":1
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":3
}
}
}