{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[104.4865409260027, 222.8458523754997, 0, 1, 0.3192062352037406, 0, 0.004487406830058386, 0.317732500738566, 0.6807937647962594, 1, 0.002016326124706818],
[103.9865409260027, 223.3458523754997, 1, 0, 0.3176787359087366, 0.009616629143492757, 0, -0.6809089842200852, 1, 0.3176787359087366, 0.002017199571127524],
[104.0466018811302, 223.2857914203722, 1, 0, 0.3178622220419656, 0.009611077939310958, 0, -0.6805159291543, 1, 0.3178622220419656, 0.00201724399607424],
[103.8755602588041, 223.4568330426983, 1, 0, 0.3173396901269268, 0.009626903551793299, 0, -0.6816364675008685, 1, 0.3173396901269268, 0.002018244403011537],
[103.9865409260027, 223.5411703428047, 1, 0, 0.3174892912821634, 0.009616629143492757, 0, -0.6809089842200852, 1, 0.3174892912821634, 0.002016920878552419],
[103.9865409260027, 223.3458523754997, 1, 0, 0.3176787359087366, 0.009616629143492757, 0, -0.6809089842200852, 1, 0.3176787359087366, 0.002017886552489176],
[103.8421321153351, 223.4902611861673, 0, 1, 0.3172375671957624, 0, 0.004474467901610265, 0.3168163551229822, 0.6827624328042377, 1, 0.002019401057901923]
],
"NAMES": [
["Node137"],
["Node168"],
["Node175"],
["Node112"],
["Node55"],
["Node87"],
["Node10"]
],
"RESOLVED": [
[104.4865409260027, 222.8458523754997, 0, 1, 0.3192062352037406, 0, 0.004487406830058386, 0.317732500738566, 0.6807937647962594, 1, 0.002016326124706818],
[103.9865409260027, 223.3458523754997, 1, 0, 0.3176787359087366, 0.009616629143492757, 0, -0.6809089842200852, 1, 0.3176787359087366, 0.002017199571127524],
[104.0466018811302, 223.2857914203722, 1, 0, 0.3178622220419656, 0.009611077939310958, 0, -0.6805159291543, 1, 0.3178622220419656, 0.00201724399607424],
[103.8755602588041, 223.4568330426983, 1, 0, 0.3173396901269268, 0.009626903551793299, 0, -0.6816364675008685, 1, 0.3173396901269268, 0.002018244403011537],
[103.9865409260027, 223.5411703428047, 1, 0, 0.3174892912821634, 0.009616629143492757, 0, -0.6809089842200852, 1, 0.3174892912821634, 0.002016920878552419],
[103.9865409260027, 223.3458523754997, 1, 0, 0.3176787359087366, 0.009616629143492757, 0, -0.6809089842200852, 1, 0.3176787359087366, 0.002017886552489176],
[103.8421321153351, 223.4902611861673, 0, 1, 0.3172375671957624, 0, 0.004474467901610265, 0.3168163551229822, 0.6827624328042377, 1, 0.002019401057901923]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.021097307247067, 0, 0, 0.2254444927580591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.153739150469937, 1.014956560610369, 0, 0, 0.5319967870897009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 1.580428952937343, 0, 0, 0.2712537103003377, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.236917895007626, 0, 0, 0.2412341211782672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -70.80536995448483, 1, 0.3333333333333334, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.50824160688256, 0, 0, 0.3045397751392008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.014956560610369, 0, 0, 0.2920689047375781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7197609874355316, 2.280239012564468, 1, 0, 0.2399203291451773, 1.389350100181095, 0, -98.373447839623, 1, 0.2399203291451772, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2, 0, 0, 0.2936117789151108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2, 0, 0, 0.2936117789151108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.315658831126164, 0, 0, 0.2025763884297806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 1.637257195578598, 1, 0, 0.3791818263597935, 1, 0, -70.80536995448483, 1, 0.3791818263597935, 0.01412322258386364],
[0.9793517872213011, 2.020648212778699, 0, 1, 0.3264505957404337, 0, 0.4948906958054059, 35.04091880353418, 0.6735494042595662, 1, 0.01412322258386364],
[0.8317382432143424, 2.168261756785657, 0, 0, 0.2772460810714475, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 1.580428952937343, 0, 0, 0.2712537103003377, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.299449136807731, 1.648651136864664, 0, 0, 0.4407750809605369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0, 1.823466483714076, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.903925589269126, 2, 0, 0, 0.3112771183288586, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.315658831126164, 0, 0, 0.2025763884297806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 1.609364065390029, 0, 0, 0.3832351388845109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9691840199769515, 2.030815980023048, 1, 0, 0.3230613399923172, 1.03179579872126, 0, -73.05668324594195, 1, 0.3230613399923172, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2, 0, 0, 0.2623144736633394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.948909961192284, 0, 0, 0.2531092203490682, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.948909961192284, 0, 0, 0.2531092203490682, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.236917895007626, 0, 0, 0.2412341211782672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.8317382432143424, 2.168261756785657, 0, 0, 0.2772460810714475, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.315658831126164, 0, 0, 0.2025763884297806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2, 0, 0, 0.2623144736633394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2, 0, 0, 0.2936117789151108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7630821049923732, 2.236917895007626, 0, 0, 0.2543607016641244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 1.609364065390029, 0, 0, 0.3832351388845109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.903925589269126, 2, 0, 0, 0.3112771183288586, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.07138335860437948, 2.928616641395621, 0, 1, 0.02379445286812649, 0, 0.3414581430239548, 24.17707014078251, 0.9762055471318735, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -70.80536995448483, 1, 0.3333333333333334, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.50824160688256, 0, 0, 0.3045397751392008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364]
],
"RESOLVED": [
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.021097307247067, 0, 0, 0.2254444927580591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.153739150469937, 1.014956560610369, 0, 0, 0.5319967870897009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 1.580428952937343, 0, 0, 0.2712537103003377, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0, 2.999999999999999, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.236917895007626, 0, 0, 0.2412341211782672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -70.80536995448483, 1, 0.3333333333333334, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.50824160688256, 0, 0, 0.3045397751392008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.014956560610369, 0, 0, 0.2920689047375781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7197609874355316, 2.280239012564468, 1, 0, 0.2399203291451773, 1.389350100181095, 0, -98.373447839623, 1, 0.2399203291451772, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2, 0, 0, 0.2936117789151108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2, 0, 0, 0.2936117789151108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.315658831126164, 0, 0, 0.2025763884297806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 1.637257195578598, 1, 0, 0.3791818263597935, 1, 0, -70.80536995448483, 1, 0.3791818263597935, 0.01412322258386364],
[0.9793517872213011, 2.020648212778699, 0, 1, 0.3264505957404337, 0, 0.4948906958054059, 35.04091880353418, 0.6735494042595662, 1, 0.01412322258386364],
[0.8317382432143424, 2.168261756785657, 0, 0, 0.2772460810714475, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 1.580428952937343, 0, 0, 0.2712537103003377, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.299449136807731, 1.648651136864664, 0, 0, 0.4407750809605369, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0, 1.823466483714076, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.903925589269126, 2, 0, 0, 0.3112771183288586, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.315658831126164, 0, 0, 0.2025763884297806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 1.609364065390029, 0, 0, 0.3832351388845109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9691840199769515, 2.030815980023048, 1, 0, 0.3230613399923172, 1.03179579872126, 0, -73.05668324594195, 1, 0.3230613399923172, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2, 0, 0, 0.2623144736633394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.948909961192284, 0, 0, 0.2531092203490682, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.948909961192284, 0, 0, 0.2531092203490682, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.236917895007626, 0, 0, 0.2412341211782672, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.8317382432143424, 2.168261756785657, 0, 0, 0.2772460810714475, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.5882667581429618, 2.315658831126164, 0, 0, 0.2025763884297806, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2, 0, 0, 0.2623144736633394, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2, 0, 0, 0.2936117789151108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7630821049923732, 2.236917895007626, 0, 0, 0.2543607016641244, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 2.24347148507138, 0, 0, 0.2274349269273018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 1.609364065390029, 0, 0, 0.3832351388845109, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.831304288919694, 2.168695711080305, 0, 0, 0.2771014296398981, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.903925589269126, 2, 0, 0, 0.3112771183288586, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.07138335860437948, 2.928616641395621, 0, 1, 0.02379445286812649, 0, 0.3414581430239548, 24.17707014078251, 0.9762055471318735, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.7111823786647695, 2.28881762133523, 0, 0, 0.2370607928882566, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.371636482862515, 1.339545895802255, 0, 0, 0.5059181904015001, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -70.80536995448483, 1, 0.3333333333333334, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.9999999999999998, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[1.831304288919694, 1.168695711080306, 0, 0, 0.6104347629732314, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364],
[0.6604541041977453, 1.50824160688256, 0, 0, 0.3045397751392008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01412322258386364]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node10":{
"Global MG94xREV":0.002019401057901923,
"Nucleotide GTR":0.002957284201379392,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "S", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "AGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node112":{
"Global MG94xREV":0.002018244403011537,
"Nucleotide GTR":0.002955590353978253,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATT", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node117":{
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node137":{
"Global MG94xREV":0.002016326124706818,
"Nucleotide GTR":0.002952781157606791,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "V", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "GTG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node168":{
"Global MG94xREV":0.002017199571127524,
"Nucleotide GTR":0.002954060264246158,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCC", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node175":{
"Global MG94xREV":0.00201724399607424,
"Nucleotide GTR":0.002954125321750485,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAC", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node55":{
"Global MG94xREV":0.002016920878552419,
"Nucleotide GTR":0.002953652136724296,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGG", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node87":{
"Global MG94xREV":0.002017886552489176,
"Nucleotide GTR":0.002955066304685476,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCC", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002894258472161,
"Nucleotide GTR":0.002956938447619405,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCT", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001247100260597,
"Nucleotide GTR":0.002955316497252247,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAG", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001247099933988,
"Nucleotide GTR":0.002955316496930632,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAG", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003083917917438229,
"Nucleotide GTR":0.003036722133537624,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "R", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "CGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002788476950961,
"Nucleotide GTR":0.002956834284961602,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "R", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "AGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001247100222264,
"Nucleotide GTR":0.002955316497214498,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGG", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002998935229818871,
"Nucleotide GTR":0.002953040007304002,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACC", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001247099694669,
"Nucleotide GTR":0.002955316496694973,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGG", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002998935229578363,
"Nucleotide GTR":0.002953040007067168,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "S", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TCA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003002894254562025,
"Nucleotide GTR":0.002956938443769111,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "S", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "TCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003697504829988,
"Nucleotide GTR":0.002957729401224138,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "L", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CTA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002999185794026629,
"Nucleotide GTR":0.002953286736917415,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "P", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "CCT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003081785123682,
"Nucleotide GTR":0.002957123104393214,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "TTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423819_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003025162990934194,
"Nucleotide GTR":0.002978866382980756,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTT", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423819_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002869813179432,
"Nucleotide GTR":0.00295691437643351,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "N", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "AAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002999125219521774,
"Nucleotide GTR":0.002953227089435039,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "A", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "GCT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002999146803071011,
"Nucleotide GTR":0.002953248342673111,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "P", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "CCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00300510874079505,
"Nucleotide GTR":0.00295911903986093,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "E", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAA", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429071_California_20200328_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00300745589345186,
"Nucleotide GTR":0.002961430272070913,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "Q", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CAA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429071_California_20200328_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002999146803076245,
"Nucleotide GTR":0.002953248342678259,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "S", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TCA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003002580847714617,
"Nucleotide GTR":0.002956629833249699,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAT", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003002581560082541,
"Nucleotide GTR":0.00295663053471566,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "V", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GTT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGG", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002999161082744638,
"Nucleotide GTR":0.002953262403812907,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAC", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003001790546234078,
"Nucleotide GTR":0.002955851626415934,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "H", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAT", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432723_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002999161082303356,
"Nucleotide GTR":0.002953262403378374,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAC", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432723_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18":{
"Global MG94xREV":0.002999178127608881,
"Nucleotide GTR":0.002953279187825287,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACG", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003003602573272364,
"Nucleotide GTR":0.002957635922483807,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "S", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "TCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433684_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001326674721915,
"Nucleotide GTR":0.002955394853918798,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "G", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "GGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433684_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433838_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002057233860088,
"Nucleotide GTR":0.002956114232697399,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "F", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTT", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433838_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01216193157280916,
"Nucleotide GTR":0.01197580732771221,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "M", "C", "D", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "ATG", "TGT", "GAT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001824195226078,
"Nucleotide GTR":0.002955884760449173,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "F", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "TTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003025163068556366,
"Nucleotide GTR":0.002978866459415006,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "L", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CTA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00904763505933706,
"Nucleotide GTR":0.008909171507289369,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "R", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "R", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "CGT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGG", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002998935229331756,
"Nucleotide GTR":0.002953040006824337,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACC", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002999195073338908,
"Nucleotide GTR":0.002953295874220591,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "A", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GCT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003054539988514,
"Nucleotide GTR":0.002957096276213207,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "F", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "TTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001247099879288,
"Nucleotide GTR":0.002955316496876769,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "R", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AGA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002999100202583639,
"Nucleotide GTR":0.002953202455352104,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "Q", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "CAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436654_California_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003029960510580438,
"Nucleotide GTR":0.002983590482157794,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "L", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTA", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436654_California_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002894254448035,
"Nucleotide GTR":0.002956938443656865,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "F", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "TTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002948034358952,
"Nucleotide GTR":0.002956991400528674,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "I", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ATT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003007455102652847,
"Nucleotide GTR":0.002961429493374158,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "T", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "ACT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46":{
"Global MG94xREV":0.003003257788855607,
"Nucleotide GTR":0.002957296414592322,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAA", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438365_England_20200330_null_14":{
"Global MG94xREV":0.003003054540088332,
"Nucleotide GTR":0.002957096276311501,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438365_England_20200330_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002996643155577569,
"Nucleotide GTR":0.002950783010598308,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "H", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "CAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCC", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438715_England_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002999128741948651,
"Nucleotide GTR":0.002953230557955259,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACC", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439687_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002999120383463245,
"Nucleotide GTR":0.002953222327386772,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAC", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439687_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440298_England_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003001790546219616,
"Nucleotide GTR":0.002955851626401693,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "N", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAT", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440298_England_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440722_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003209628196266,
"Nucleotide GTR":0.002957248990975964,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "K", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AAG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440722_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440922_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003002329928994677,
"Nucleotide GTR":0.002956382754549499,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTT", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440922_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441236_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002999724166315374,
"Nucleotide GTR":0.002953816870043219,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "G", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GGT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441236_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441735_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00300163933802943,
"Nucleotide GTR":0.002955702732277336,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "S", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "TCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441735_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002894254448035,
"Nucleotide GTR":0.002956938443656865,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "L", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CTT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442349_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442638_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003004437261723522,
"Nucleotide GTR":0.002958457836997131,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTT", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATT", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442638_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442646_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002998908748098818,
"Nucleotide GTR":0.00295301393085593,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "T", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ACG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442646_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442717_England_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002999454075106742,
"Nucleotide GTR":0.002953550912267015,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTT", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442717_England_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442893_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003002840426206306,
"Nucleotide GTR":0.002956885439193893,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "I", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ATA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442893_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442931_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003002813500518087,
"Nucleotide GTR":0.002956858925572076,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAT", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442931_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443387_England_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003001178710968251,
"Nucleotide GTR":0.00295524915457863,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTG", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443387_England_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443415_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.003002813498909132,
"Nucleotide GTR":0.002956858923987744,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "S", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "TCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443415_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443456_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003003129322684298,
"Nucleotide GTR":0.002957169914446642,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "N", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "AAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443456_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443742_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003003258062144994,
"Nucleotide GTR":0.002957296683699335,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAA", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443742_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444102_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001178710631867,
"Nucleotide GTR":0.002955249154247392,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "G", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GGC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444102_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001163000478262,
"Nucleotide GTR":0.002955233684519454,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTC", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444125_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444387_England_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003004987983215832,
"Nucleotide GTR":0.002959000130336283,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCC", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCA", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444387_England_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444389_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCC", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444389_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003002813500526525,
"Nucleotide GTR":0.002956858925580383,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "I", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ATA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001163000252199,
"Nucleotide GTR":0.002955233684296851,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAC", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34":{
"Global MG94xREV":0.003002813498894213,
"Nucleotide GTR":0.00295685892397305,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAT", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002813500526525,
"Nucleotide GTR":0.002956858925580383,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "V", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GTA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATT", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003002813500568781,
"Nucleotide GTR":0.002956858925621995,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAT", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6":{
"Global MG94xREV":0.003002813500518087,
"Nucleotide GTR":0.002956858925572076,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "V", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GTT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003001824195226078,
"Nucleotide GTR":0.002955884760449173,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "I", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATT", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001178710539296,
"Nucleotide GTR":0.002955249154156239,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "G", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "GGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10":{
"Global MG94xREV":0.003001824195226078,
"Nucleotide GTR":0.002955884760449173,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCT", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9":{
"Global MG94xREV":0.003002894261491547,
"Nucleotide GTR":0.002956938450592585,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "I", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ATT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8":{
"Global MG94xREV":0.003007455102834403,
"Nucleotide GTR":0.002961429493552936,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "K", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "AAA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00300320931608829,
"Nucleotide GTR":0.002957248683644441,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "I", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "ATA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6":{
"Global MG94xREV":0.003002894258472161,
"Nucleotide GTR":0.002956938447619405,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "I", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ATA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003004035580472042,
"Nucleotide GTR":0.002958062303010934,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "G", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GGG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002867341218714,
"Nucleotide GTR":0.002956911942303278,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "TTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "V", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "GTG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003005028564552788,
"Nucleotide GTR":0.002959040090622985,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "F", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "S", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "TTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "AGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003001233095025058,
"Nucleotide GTR":0.002955302706350575,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACG", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003004215680885571,
"Nucleotide GTR":0.002958239647196694,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCG", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447836_Athens_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00300284042608432,
"Nucleotide GTR":0.002956885439073773,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGT", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447836_Athens_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447838_Norway_20200323_null_13":{
"Global MG94xREV":0.00300284042608432,
"Nucleotide GTR":0.002956885439073773,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "F", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "TTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447838_Norway_20200323_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447938_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003002840428463556,
"Nucleotide GTR":0.002956885441416598,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "I", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ATA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447938_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447941_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003000626151811773,
"Nucleotide GTR":0.002954705051698631,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "V", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTA", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "GTG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447941_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448105_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003001178710539761,
"Nucleotide GTR":0.002955249154156696,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAG", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448105_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448539_England_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.003002840426206306,
"Nucleotide GTR":0.002956885439193893,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAT", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448539_England_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448689_England_20200101_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00300300108216185,
"Nucleotide GTR":0.002957043636496529,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "I", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ATA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448689_England_20200101_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448787_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003002894254448035,
"Nucleotide GTR":0.002956938443656865,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "L", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CTT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448787_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448916_England_20200418_null_11":{
"Global MG94xREV":0.003000244149648683,
"Nucleotide GTR":0.002954328895635213,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGC", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448916_England_20200418_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448954_Northern_Ireland_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003003129246996,
"Nucleotide GTR":0.00295716983991666,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "K", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AAA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448954_Northern_Ireland_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449123_England_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003002057229834188,
"Nucleotide GTR":0.002956114228733112,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "C", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "TGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449123_England_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449128_England_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "S", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "AGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449128_England_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449170_England_20200417_null_36":{
"Global MG94xREV":0.003002813500518087,
"Nucleotide GTR":0.002956858925572076,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "I", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ATA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449170_England_20200417_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449197_Scotland_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAC", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449197_Scotland_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449223_Scotland_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.003002813498910736,
"Nucleotide GTR":0.002956858923989321,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "I", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ATT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449223_Scotland_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_9":{
"Global MG94xREV":0.003003599040144736,
"Nucleotide GTR":0.002957632443426598,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCT", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0.003002813500518087,
"Nucleotide GTR":0.002956858925572076,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "L", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CTT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449573_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003002813500640168,
"Nucleotide GTR":0.002956858925692291,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "TTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449573_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449598_England_20200405_null_93":{
"Global MG94xREV":0.003002813500640168,
"Nucleotide GTR":0.002956858925692291,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "TTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449598_England_20200405_null_93",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449636_England_20200404_null_28660":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449636_England_20200404_null_28660",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449701_England_20200415_null_9":{
"Global MG94xREV":0.003002894261491547,
"Nucleotide GTR":0.002956938450592585,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "I", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ATT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449701_England_20200415_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449705_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003001163000479626,
"Nucleotide GTR":0.002955233684520796,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACC", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCT", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449705_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449723_England_20200417_null_102":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["N", "N", "E", "L", "S", "P", "V", "A", "L", "R", "Q", "M", "S", "C", "A", "A", "G", "T", "T", "Q", "T", "A", "C", "T", "D", "D", "N", "A", "L", "A", "Y", "Y", "N", "T", "T", "K", "G", "G", "R", "F", "V", "L", "A", "L", "L", "S", "D", "L", "Q", "D", "L", "K", "W", "A", "R", "F", "P", "K", "S", "D", "G", "T", "G", "T", "I", "Y", "T", "E", "L", "E", "P", "P", "C", "R", "F", "V", "T", "D", "T", "P", "K", "G", "P", "K", "V", "K", "Y", "L", "Y", "F", "I", "K", "G", "L", "N", "N", "L", "N", "R", "G", "M", "V", "L", "G", "S", "L", "A", "A", "T", "V", "R", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAT", "AAT", "GAG", "CTT", "AGT", "CCT", "GTT", "GCA", "CTA", "CGA", "CAG", "ATG", "TCT", "TGT", "GCT", "GCC", "GGT", "ACT", "ACA", "CAA", "ACT", "GCT", "TGC", "ACT", "GAT", "GAC", "AAT", "GCG", "TTA", "GCT", "TAC", "TAC", "AAC", "ACA", "ACA", "AAG", "GGA", "GGT", "AGG", "TTT", "GTA", "CTT", "GCA", "CTG", "TTA", "TCC", "GAT", "TTA", "CAG", "GAT", "TTG", "AAA", "TGG", "GCT", "AGA", "TTC", "CCT", "AAG", "AGT", "GAT", "GGA", "ACT", "GGT", "ACT", "ATC", "TAT", "ACA", "GAA", "CTG", "GAA", "CCA", "CCT", "TGT", "AGG", "TTT", "GTT", "ACA", "GAC", "ACA", "CCT", "AAA", "GGT", "CCT", "AAA", "GTG", "AAG", "TAT", "TTA", "TAC", "TTT", "ATT", "AAA", "GGA", "TTA", "AAC", "AAC", "CTA", "AAT", "AGA", "GGT", "ATG", "GTA", "CTT", "GGT", "AGT", "TTA", "GCC", "GCC", "ACA", "GTA", "CGT", "CTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449723_England_20200417_null_102",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":2825.159259456152,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03404719850809855],
[0.01171680147301024],
[0.01439325362682164],
[0.03924608367893687],
[0.02812571894949366],
[0.00967901852889639],
[0.01188998284779507],
[0.03242041541713132],
[0.02256422584171611],
[0.00776511919230796],
[0.009538894231061381],
[0.02600970224683182],
[0.02743074164896379],
[0.009439853152143874],
[0.0115961852670916],
[0.03161931757393963],
[0.01834404674994046],
[0.006312811726038091],
[0.007754838253472259],
[0.02114511693487053],
[0.01515365509918461],
[0.005214889217548465],
[0.006406118881236669],
[0.01746756391492491],
[0.01215721797545836],
[0.004183713072565284],
[0.005139392648581813],
[0.01401358158306108],
[0.01477921324641264],
[0.005086031013515269],
[0.006247825782491349],
[0.0170359461334123],
[0.03122129950191477],
[0.01074431330690293],
[0.01319862138387479],
[0.03598868002387453],
[0.0257912995343787],
[0.008875665241690199],
[0.01090312072152838],
[0.02972953852499746],
[0.02069140733753742],
[0.007120618511782891],
[0.008747171184560603],
[0.02385091107013707],
[0.02515400497278021],
[0.008656350461465257],
[0.01063370818064343],
[0.02899493136820961],
[0.008943633443114237],
[0.02995720182771188],
[0.0214688386747665],
[0.00738815913293101],
[0.009075825726035304],
[0.02474705338587746],
[0.00592724728314879],
[0.007281199877950298],
[0.01985364720875862],
[0.02093835070485919],
[0.007205600141308078],
[0.00885156504581994],
[0.02413556180448642]
],
"Log Likelihood":-1278.130215284355,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.6117575256579265, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.2859199041669731, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":133
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":3053.104760210027,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3095199785465272],
[0.1883346741753822],
[0.2122552963260928],
[0.2898900509519979]
],
"Log Likelihood":-1300.180428885501,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.4154643005203496,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1065099820123462,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.05894013433429307,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.398637573853581,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.7090114677817256
},
"display order":0,
"estimated parameters":225
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-19/sequences.nsp9.compressed.fas",
"number of sequences":110,
"number of sites":113,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_449573_England_20200401_null_1,epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_423819_England_20200323_null_2,epi_isl_439687_England_20200407_null_1,epi_isl_448539_England_20200406_null_7,(epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9,epi_isl_447941_England_20200501_null_1)Node137,epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1,epi_isl_443387_England_20200413_null_5,epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9,epi_isl_440298_England_20200314_null_3,epi_isl_443742_England_20200325_null_1,epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6,epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1,epi_isl_432723_England_20200407_null_1,epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_443415_England_20200414_null_5,epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1,epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4,epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1,epi_isl_447838_Norway_20200323_null_13,(epi_isl_438715_England_20200425_null_3,epi_isl_449723_England_20200417_null_102)Node168,epi_isl_440922_England_20200420_null_3,epi_isl_449170_England_20200417_null_36,(epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1,epi_isl_449197_Scotland_20200422_null_1)Node175,epi_isl_448787_England_20200408_null_2,epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34,epi_isl_449701_England_20200415_null_9,epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2,epi_isl_438365_England_20200330_null_14,epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1,epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2,epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2,epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46,epi_isl_447836_Athens_20200316_null_4,epi_isl_433684_England_20200401_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_449636_England_20200404_null_28660,epi_isl_442931_England_20200408_null_2,epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1,epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_433838_England_20200101_null_1,epi_isl_442893_England_20200406_null_3,epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1,(epi_isl_442638_England_20200406_null_1,epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46)Node112,epi_isl_442717_England_20200405_null_3,epi_isl_448105_England_20200101_null_1,epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1,epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1,epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1,epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_3,epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3,epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4,epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4,epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1,epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5,epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2,epi_isl_444102_England_20200406_null_1,epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1,epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1,epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4,epi_isl_448954_Northern_Ireland_20200324_null_3,epi_isl_440722_England_20200405_null_1,epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1,epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1,epi_isl_442646_England_20200406_null_1,epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1,(epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1,epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1)Node55,epi_isl_448916_England_20200418_null_11,epi_isl_449223_Scotland_20200428_null_4,epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1,epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2,epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10,epi_isl_443456_England_20200414_null_2,epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5,epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_449123_England_20200408_null_3,epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1,epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1,epi_isl_449705_England_20200416_null_2,epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6,epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3,epi_isl_441236_England_20200403_null_1,epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18,epi_isl_441735_England_20200405_null_1,epi_isl_449598_England_20200405_null_93,epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1,epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8,epi_isl_448689_England_20200101_null_6,epi_isl_444125_England_20200408_null_1,epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1,epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_429071_California_20200328_null_5,epi_isl_447938_England_20200428_null_2,epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_9,(epi_isl_444387_England_20200428_null_1,epi_isl_444389_England_20200428_null_2)Node87,epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1,(epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1,epi_isl_449128_England_20200408_null_5)Node10,epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4,epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1,epi_isl_442349_England_20200326_null_1,epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1,epi_isl_436654_California_20200407_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node10":"test",
"Node112":"test",
"Node137":"test",
"Node168":"test",
"Node175":"test",
"Node55":"test",
"Node87":"test",
"epi_isl_413221_Scotland_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_413890_Guangdong_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_415654_Hauts_de_France_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_415710_Saint_Petersburg_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_416502_Bretagne_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":"background",
"epi_isl_417176_Hong_Kong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_420329_Riemst_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_420352_Sint_Gillis_Waas_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_5":"background",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422349_Wales_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_422635_Zuid_Holland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423819_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_427168_Idaho_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_427776_New_South_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428353_Hauts_De_France_20200324_null_4":"background",
"epi_isl_428485_Karnataka_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_429071_California_20200328_null_5":"background",
"epi_isl_429766_Luxembourg_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429853_Zhejiang_20200128_null_5":"background",
"epi_isl_430342_New_York_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_430738_Beijing_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_432003_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432392_Wales_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_432723_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_433271_Scotland_20200409_null_18":"background",
"epi_isl_433381_Scotland_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_433684_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433838_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434536_Costa_Rica_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_434675_Stockholm_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_434720_Texas_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_435489_New_York_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_436052_New_York_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_436514_Florida_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_436568_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436654_California_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_437331_Ankara_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_437651_Unknown_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_437976_Ischgl_20200311_null_4":"background",
"epi_isl_438104_Vienna_20200325_null_46":"background",
"epi_isl_438365_England_20200330_null_14":"background",
"epi_isl_438715_England_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_438781_Scotland_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_439687_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_440298_England_20200314_null_3":"background",
"epi_isl_440722_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_440922_England_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_441236_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441735_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_442638_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442646_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442717_England_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_442893_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_442931_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_443387_England_20200413_null_5":"background",
"epi_isl_443415_England_20200414_null_5":"background",
"epi_isl_443456_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443742_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_444102_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_444125_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444387_England_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444389_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_444663_New_York_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_444742_New_Jersey_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_444956_Unknown_20200331_null_34":"background",
"epi_isl_445024_Florida_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_445340_Temuco_20200325_null_46":"background",
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_446062_Wales_20200409_null_6":"background",
"epi_isl_446198_Wales_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_446211_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446704_Wales_20200414_null_10":"background",
"epi_isl_446794_Wales_20200421_null_9":"background",
"epi_isl_446852_Wales_20200418_null_8":"background",
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_447245_Kinshasa_20200424_null_6":"background",
"epi_isl_447254_Taipei_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_447506_Comunitat_Valenciana_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_447520_Comunitat_Valenciana_20200401_null_9":"background",
"epi_isl_447608_Germany_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_447615_Taipei_20200319_null_2":"background",
"epi_isl_447817_Cordoba_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_447836_Athens_20200316_null_4":"background",
"epi_isl_447838_Norway_20200323_null_13":"background",
"epi_isl_447938_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_447941_England_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_448105_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448539_England_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_448689_England_20200101_null_6":"background",
"epi_isl_448787_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_448916_England_20200418_null_11":"background",
"epi_isl_448954_Northern_Ireland_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_449123_England_20200408_null_3":"background",
"epi_isl_449128_England_20200408_null_5":"background",
"epi_isl_449170_England_20200417_null_36":"background",
"epi_isl_449197_Scotland_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_449223_Scotland_20200428_null_4":"background",
"epi_isl_449266_Scotland_20200503_null_9":"background",
"epi_isl_449298_Scotland_20200424_null_3":"background",
"epi_isl_449573_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_449598_England_20200405_null_93":"background",
"epi_isl_449636_England_20200404_null_28660":"background",
"epi_isl_449701_England_20200415_null_9":"background",
"epi_isl_449705_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_449723_England_20200417_null_102":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":2
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":1
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":3
}
}
}