{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.00160645593931674],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001607241406158149],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 0, 0.3040187616747351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008605413655699678],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001606392679477916],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001606145706483789],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.00161204873193017],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605798534175408],
[157.5911573958921, 361.3363811757985, 1, 0, 0.3036862484300796, 0.006345533699507347, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3036862484300795, 0.001606146714975363],
[157.5911573958921, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3037872617181585, 0.006345533699507349, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3037872617181585, 0.001605986873006537],
[157.7262725164427, 361.2012660552479, 0, 1, 0.30394662220196, 0, 0.002768539576068496, 0.04500651857381487, 0.69605337779804, 1, 0.001605269463822526],
[157.5911573958921, 361.3363811757985, 1, 0, 0.3036862484300796, 0.006345533699507347, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3036862484300795, 0.00160578640787686],
[157.7637076754837, 361.1777668395995, 0, 1, 0.3040105973855791, 0, 0.002768719704843028, 0.04500944682129478, 0.6959894026144209, 1, 0.001606528570950319],
[158.7637076754837, 360.1638308962068, 0, 0, 0.3059458129982252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006866167505260382],
[158.7637076754837, 360.1638308962068, 1, 0, 0.3059458129982252, 0.006298668723736413, 0, -0.1023937506097388, 1, 0.3059458129982251, 0.001606704730027788],
[158.2637076754837, 360.6638308962068, 0, 1, 0.3049822873364801, 0, 0.002772665053535084, 0.0450735840331028, 0.6950177126635199, 1, 0.001606432022568177],
[157.6445068222912, 361.2830317493994, 1, 0, 0.3037890555128293, 0.006343386269255013, 0, -0.1031206974304941, 1, 0.3037890555128293, 0.001606389299067334],
[157.7637076754837, 358.1638308962067, 0, 0, 0.3057865608651975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004824913524880217],
[157.7637076754837, 358.1638308962067, 0, 0, 0.3057865608651975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004261811423523742],
[157.646243393708, 355.2812951779825, 1, 0, 0.3073460314349532, 0.006343316392910078, 0, -0.1031195614918775, 1, 0.3073460314349532, 0.001508398913957268],
[157.9736931141164, 357.9538454575741, 0, 1, 0.3061935665451307, 0, 0.00279365625677717, 0.04541482567066799, 0.6938064334548693, 1, 0.001749733856560823],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.0011324553579903],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 0, 0.3040187616747351, 0, 0, 0, 1, 1, 2.088398360583512e-05],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001605784994163897],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001607131090077866],
[157.4600222798961, 361.2575308531617, 1, 0, 0.3035563792449984, 0.006350818357071172, 0, -0.1032415165082605, 1, 0.3035563792449985, 0.001605805082296797],
[157.7262725164427, 361.2012660552479, 0, 1, 0.30394662220196, 0, 0.002768539576068496, 0.04500651857381487, 0.69605337779804, 1, 0.001606449970011719],
[157.7312951652347, 361.3628803772541, 0, 1, 0.3038587265988773, 0, 0.002767301386783347, 0.04498639005929346, 0.6961412734011228, 1, 0.001606617865440009],
[157.7637076754837, 361.1263957371657, 0, 1, 0.3040406950101754, 0, 0.002769113561911487, 0.04501584952386772, 0.6959593049898246, 1, 0.001606422243266857],
[157.8425579981204, 360.9183436027719, 0, 1, 0.3042684163571685, 0, 0.002770709823218639, 0.04504179900452172, 0.6957315836428315, 1, 0.001608341629748306],
[157.5911573958921, 361.3363811757985, 1, 0, 0.3036862484300796, 0.006345533699507347, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3036862484300795, 0.001606146714975363],
[157.7262725164427, 361.2012660552479, 0, 1, 0.30394662220196, 0, 0.002768539576068496, 0.04500651857381487, 0.69605337779804, 1, 0.001606502987332302],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605949546718806],
[158.2813585142585, 360.646180057432, 1, 1, 0.3050163014087018, 0.006317863388251855, 0.002772800754026432, -0.0576299969383772, 0.906965055874956, 0.5169976586923597, 0.003236330896315141],
[158.2813585142585, 360.646180057432, 1, 0, 0.3050163014087018, 0.006317863388251855, 0, -0.1027057869745067, 1, 0.3050163014087018, 0.001607420644143119],
[157.9362579550753, 360.9912806166152, 1, 0, 0.3043512749193907, 0.006331668313202964, 0, -0.102930205515095, 1, 0.3043512749193907, 0.001606521640240564],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605788241882034],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605785713625324],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001606392796169045],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605790239300065],
[158.1325725594877, 360.7949660122027, 0, 1, 0.3047295832376442, 0, 0.002771657296255564, 0.04505720151608528, 0.6952704167623558, 1, 0.001606604792939757],
[157.7637076754837, 361.1072325795967, 0, 1, 0.3040519239676942, 0, 0.00276926051260847, 0.04501823841486657, 0.6959480760323058, 1, 0.001607774025672908]
],
"NAMES": [
["Node65"],
["Node499"],
["Node54"],
["Node19"],
["Node73"],
["Node80"],
["Node83"],
["Node455"],
["Node439"],
["Node392"],
["Node368"],
["Node143"],
["Node120"],
["Node119"],
["Node118"],
["Node125"],
["Node132"],
["Node131"],
["Node137"],
["Node136"],
["Node130"],
["Node129"],
["Node152"],
["Node169"],
["Node211"],
["Node208"],
["Node205"],
["Node202"],
["Node198"],
["Node216"],
["Node233"],
["Node242"],
["Node274"],
["Node273"],
["Node269"],
["Node279"],
["Node282"],
["Node295"],
["Node289"],
["Node292"],
["Node330"]
],
"RESOLVED": [
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.00160645593931674],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001607241406158149],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 0, 0.3040187616747351, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008605413655699678],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001606392679477916],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001606145706483789],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.00161204873193017],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605798534175408],
[157.5911573958921, 361.3363811757985, 1, 0, 0.3036862484300796, 0.006345533699507347, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3036862484300795, 0.001606146714975363],
[157.5911573958921, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3037872617181585, 0.006345533699507349, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3037872617181585, 0.001605986873006537],
[157.7262725164427, 361.2012660552479, 0, 1, 0.30394662220196, 0, 0.002768539576068496, 0.04500651857381487, 0.69605337779804, 1, 0.001605269463822526],
[157.5911573958921, 361.3363811757985, 1, 0, 0.3036862484300796, 0.006345533699507347, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3036862484300795, 0.00160578640787686],
[157.7637076754837, 361.1777668395995, 0, 1, 0.3040105973855791, 0, 0.002768719704843028, 0.04500944682129478, 0.6959894026144209, 1, 0.001606528570950319],
[158.7637076754837, 360.1638308962068, 0, 0, 0.3059458129982252, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006866167505260382],
[158.7637076754837, 360.1638308962068, 1, 0, 0.3059458129982252, 0.006298668723736413, 0, -0.1023937506097388, 1, 0.3059458129982251, 0.001606704730027788],
[158.2637076754837, 360.6638308962068, 0, 1, 0.3049822873364801, 0, 0.002772665053535084, 0.0450735840331028, 0.6950177126635199, 1, 0.001606432022568177],
[157.6445068222912, 361.2830317493994, 1, 0, 0.3037890555128293, 0.006343386269255013, 0, -0.1031206974304941, 1, 0.3037890555128293, 0.001606389299067334],
[157.7637076754837, 358.1638308962067, 0, 0, 0.3057865608651975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004824913524880217],
[157.7637076754837, 358.1638308962067, 0, 0, 0.3057865608651975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004261811423523742],
[157.646243393708, 355.2812951779825, 1, 0, 0.3073460314349532, 0.006343316392910078, 0, -0.1031195614918775, 1, 0.3073460314349532, 0.001508398913957268],
[157.9736931141164, 357.9538454575741, 0, 1, 0.3061935665451307, 0, 0.00279365625677717, 0.04541482567066799, 0.6938064334548693, 1, 0.001749733856560823],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.0011324553579903],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 0, 0.3040187616747351, 0, 0, 0, 1, 1, 2.088398360583512e-05],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001605784994163897],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001607131090077866],
[157.4600222798961, 361.2575308531617, 1, 0, 0.3035563792449984, 0.006350818357071172, 0, -0.1032415165082605, 1, 0.3035563792449985, 0.001605805082296797],
[157.7262725164427, 361.2012660552479, 0, 1, 0.30394662220196, 0, 0.002768539576068496, 0.04500651857381487, 0.69605337779804, 1, 0.001606449970011719],
[157.7312951652347, 361.3628803772541, 0, 1, 0.3038587265988773, 0, 0.002767301386783347, 0.04498639005929346, 0.6961412734011228, 1, 0.001606617865440009],
[157.7637076754837, 361.1263957371657, 0, 1, 0.3040406950101754, 0, 0.002769113561911487, 0.04501584952386772, 0.6959593049898246, 1, 0.001606422243266857],
[157.8425579981204, 360.9183436027719, 0, 1, 0.3042684163571685, 0, 0.002770709823218639, 0.04504179900452172, 0.6957315836428315, 1, 0.001608341629748306],
[157.5911573958921, 361.3363811757985, 1, 0, 0.3036862484300796, 0.006345533699507347, 0, -0.1031556069403213, 1, 0.3036862484300795, 0.001606146714975363],
[157.7262725164427, 361.2012660552479, 0, 1, 0.30394662220196, 0, 0.002768539576068496, 0.04500651857381487, 0.69605337779804, 1, 0.001606502987332302],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605949546718806],
[158.2813585142585, 360.646180057432, 1, 1, 0.3050163014087018, 0.006317863388251855, 0.002772800754026432, -0.0576299969383772, 0.906965055874956, 0.5169976586923597, 0.003236330896315141],
[158.2813585142585, 360.646180057432, 1, 0, 0.3050163014087018, 0.006317863388251855, 0, -0.1027057869745067, 1, 0.3050163014087018, 0.001607420644143119],
[157.9362579550753, 360.9912806166152, 1, 0, 0.3043512749193907, 0.006331668313202964, 0, -0.102930205515095, 1, 0.3043512749193907, 0.001606521640240564],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605788241882034],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605785713625324],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 0, 1, 0.3040187616747351, 0, 0.002768826539242755, 0.04501118356525798, 0.6959812383252648, 1, 0.001606392796169045],
[157.7637076754837, 361.1638308962068, 1, 0, 0.3040187616747351, 0.006338593423887938, 0, -0.1030427829640009, 1, 0.3040187616747352, 0.001605790239300065],
[158.1325725594877, 360.7949660122027, 0, 1, 0.3047295832376442, 0, 0.002771657296255564, 0.04505720151608528, 0.6952704167623558, 1, 0.001606604792939757],
[157.7637076754837, 361.1072325795967, 0, 1, 0.3040519239676942, 0, 0.00276926051260847, 0.04501823841486657, 0.6959480760323058, 1, 0.001607774025672908]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9206243627289081, 2.079375637271093, 1, 0, 0.3068747875763026, 1.086219353391656, 0, -17.65802877670304, 1, 0.3068747875763026, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.920624362728908, 2.079375637271093, 1, 0, 0.3068747875763026, 1.086219353391656, 0, -17.65802877670304, 1, 0.3068747875763026, 0.06151419091720757],
[0.9206253734077394, 2.079374626592262, 1, 0, 0.3068751244692464, 1.086218160920822, 0, -17.65800939140648, 1, 0.3068751244692464, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.073892711593799, 0, 1, 0.3084770837054725, 0, 0.4821850206665195, 7.838598110076682, 0.6915229162945276, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.224883265967309, 1.621419449937781, 0, 0, 0.4303418814600017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 1.430016174849473, 0, 0, 0.3107925047714317, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9990230950487047, 2.000976904951295, 0, 1, 0.3330076983495682, 0, 0.4997558929968462, 8.124237440909717, 0.6669923016504318, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.666726058403385, 0, 0, 0.3749916482230339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.644007598439421, 2.027070657893181, 0, 1, 0.2411039799798473, 0, 0.493322714778646, 8.019657048608716, 0.7588960200201527, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.925129681917892, 0, 0, 0.3418651850485957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9990223443739729, 2.000977655626027, 0, 1, 0.3330074481246576, 0, 0.4997557055114338, 8.124234393069706, 0.6669925518753423, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.266273593170417, 0, 0, 0.2037833570875933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9990223766382651, 2.000977623361735, 0, 1, 0.3330074588794217, 0, 0.4997557135696269, 8.124234524067008, 0.6669925411205784, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.224883265967309, 1.621419449937781, 0, 0, 0.4303418814600017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 1.430016174849473, 0, 0, 0.3107925047714317, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2, 0, 0, 0.2248149517474742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9690152871796932, 2.030984712820307, 1, 0, 0.3230050957265644, 1.031975463370126, 0, -16.77621777971639, 1, 0.3230050957265644, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.953001568703213, 0, 0, 0.3386384926436534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5820907324953606, 2.413552400037249, 0, 1, 0.1943124420174986, 0, 0.4143270309708489, 6.73547070672676, 0.8056875579825014, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.046998431296787, 1.027871886785321, 0, 0, 0.5046090939623509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.011287919334816, 2.022575838669632, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06082757416668153],
[0.6302450457036664, 2.369754954296334, 3, 1, 0.2100816819012221, 4.760053284751347, 0.4219845592840785, -70.52143027136468, 0.9980521624097998, 0.03124373010697734, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.05128268446012278, 2.797958983772864, 0, 1, 0.0179987134934492, 0, 0.3574033807499085, 5.919064389916346, 0.9820012865065508, 1, 0.06038173555921727],
[1.004038101481599, 2.008076202963198, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9959781392004543, 0, -16.6650579321715, 1, 0.3333333333333333, 0.05976445706064674],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.925129681917892, 1.074870318082108, 0, 0, 0.6417098939726307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.128205744800479, 0.6666666666666667, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.7337264068295837, 2.266273593170417, 0, 0, 0.2445754689431945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 1.430016174849473, 0, 0, 0.3107925047714317, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2, 0, 0, 0.3162696299028087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.2719041080415618, 2.728095891958439, 0, 1, 0.09063470268052057, 0, 0.3665560301409062, 5.958885659965143, 0.9093652973194795, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.128205744800479, 0.6666666666666667, 1, 0.06151419091720757],
[0.9206248110933587, 2.00036395652596, 1, 1, 0.3151757450418721, 1.086218824379036, 0.4999090274235415, -9.531293319692903, 0.9006642497373006, 0.5310157398210451, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.135068548390902, 0, 0, 0.2319683727809086, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.135068548390902, 0, 0, 0.2319683727809086, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.666726058403385, 0, 0, 0.3749916482230339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6026941446231189, 2.397305855376882, 1, 1, 0.2008980482077063, 1.659216385162207, 0.4171349257572265, -20.19178730769146, 0.9596399742263342, 0.3614360706417467, 0.06151419091720757],
[0.9765046941715292, 2.111065536557277, 0, 0, 0.3162696299028087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05827786002089243],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.128205744800479, 0.6666666666666667, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 1, 0.1933430409115579, 0, 0.4132281133606219, 6.71760624986174, 0.806656959088442, 1, 0.06151419091720757],
[1.917202087579373, 1.077316320619827, 1, 0, 0.6402372021924927, 0.5215934232903863, 0, -8.479237319278131, 1, 0.6402372021924927, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.133589258783322, 0, 1, 0.2320918766114682, 0, 0.4686937731258778, 7.619278838547945, 0.7679081233885318, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.925129681917892, 0, 0, 0.3418651850485957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2, 0, 0, 0.2248149517474742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0, 1.71029171353473, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.666726058403385, 0, 0, 0.3749916482230339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9206243627289081, 2.079375637271093, 1, 0, 0.3068747875763026, 1.086219353391656, 0, -17.65802877670304, 1, 0.3068747875763026, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.920624362728908, 2.079375637271093, 1, 0, 0.3068747875763026, 1.086219353391656, 0, -17.65802877670304, 1, 0.3068747875763026, 0.06151419091720757],
[0.9206253734077394, 2.079374626592262, 1, 0, 0.3068751244692464, 1.086218160920822, 0, -17.65800939140648, 1, 0.3068751244692464, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.073892711593799, 0, 1, 0.3084770837054725, 0, 0.4821850206665195, 7.838598110076682, 0.6915229162945276, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.224883265967309, 1.621419449937781, 0, 0, 0.4303418814600017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 1.430016174849473, 0, 0, 0.3107925047714317, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9990230950487047, 2.000976904951295, 0, 1, 0.3330076983495682, 0, 0.4997558929968462, 8.124237440909717, 0.6669923016504318, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.666726058403385, 0, 0, 0.3749916482230339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.644007598439421, 2.027070657893181, 0, 1, 0.2411039799798473, 0, 0.493322714778646, 8.019657048608716, 0.7588960200201527, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.925129681917892, 0, 0, 0.3418651850485957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9990223443739729, 2.000977655626027, 0, 1, 0.3330074481246576, 0, 0.4997557055114338, 8.124234393069706, 0.6669925518753423, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.266273593170417, 0, 0, 0.2037833570875933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9990223766382651, 2.000977623361735, 0, 1, 0.3330074588794217, 0, 0.4997557135696269, 8.124234524067008, 0.6669925411205784, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.224883265967309, 1.621419449937781, 0, 0, 0.4303418814600017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 1.430016174849473, 0, 0, 0.3107925047714317, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2, 0, 0, 0.2248149517474742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9690152871796932, 2.030984712820307, 1, 0, 0.3230050957265644, 1.031975463370126, 0, -16.77621777971639, 1, 0.3230050957265644, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.953001568703213, 0, 0, 0.3386384926436534, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5820907324953606, 2.413552400037249, 0, 1, 0.1943124420174986, 0, 0.4143270309708489, 6.73547070672676, 0.8056875579825014, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.046998431296787, 1.027871886785321, 0, 0, 0.5046090939623509, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.011287919334816, 2.022575838669632, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06082757416668153],
[0.6302450457036664, 2.369754954296334, 3, 1, 0.2100816819012221, 4.760053284751347, 0.4219845592840785, -70.52143027136468, 0.9980521624097998, 0.03124373010697734, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.05128268446012278, 2.797958983772864, 0, 1, 0.0179987134934492, 0, 0.3574033807499085, 5.919064389916346, 0.9820012865065508, 1, 0.06038173555921727],
[1.004038101481599, 2.008076202963198, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9959781392004543, 0, -16.6650579321715, 1, 0.3333333333333333, 0.05976445706064674],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.925129681917892, 1.074870318082108, 0, 0, 0.6417098939726307, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.128205744800479, 0.6666666666666667, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[0.7337264068295837, 2.266273593170417, 0, 0, 0.2445754689431945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 1.430016174849473, 0, 0, 0.3107925047714317, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2, 0, 0, 0.3162696299028087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -16.25641148960096, 1, 0.3333333333333333, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.2719041080415618, 2.728095891958439, 0, 1, 0.09063470268052057, 0, 0.3665560301409062, 5.958885659965143, 0.9093652973194795, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.128205744800479, 0.6666666666666667, 1, 0.06151419091720757],
[0.9206248110933587, 2.00036395652596, 1, 1, 0.3151757450418721, 1.086218824379036, 0.4999090274235415, -9.531293319692903, 0.9006642497373006, 0.5310157398210451, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.135068548390902, 0, 0, 0.2319683727809086, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.135068548390902, 0, 0, 0.2319683727809086, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.666726058403385, 0, 0, 0.3749916482230339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6026941446231189, 2.397305855376882, 1, 1, 0.2008980482077063, 1.659216385162207, 0.4171349257572265, -20.19178730769146, 0.9596399742263342, 0.3614360706417467, 0.06151419091720757],
[0.9765046941715292, 2.111065536557277, 0, 0, 0.3162696299028087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05827786002089243],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 8.128205744800479, 0.6666666666666667, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 1, 0.1933430409115579, 0, 0.4132281133606219, 6.71760624986174, 0.806656959088442, 1, 0.06151419091720757],
[1.917202087579373, 1.077316320619827, 1, 0, 0.6402372021924927, 0.5215934232903863, 0, -8.479237319278131, 1, 0.6402372021924927, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.133589258783322, 0, 1, 0.2320918766114682, 0, 0.4686937731258778, 7.619278838547945, 0.7679081233885318, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.925129681917892, 0, 0, 0.3418651850485957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1.317758890742716, 1.262270231991959, 0, 0, 0.5107534946527934, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2, 0, 0, 0.2248149517474742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.337140550074066, 0, 0, 0.3555546395255957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0, 1.71029171353473, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 2.042192923615495, 0, 0, 0.2653777999765855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.5800291227346738, 2.419970877265327, 0, 0, 0.1933430409115579, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.7377297680080422, 1.928996290395343, 0, 0, 0.2766425016485321, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.6448541432326356, 2.021871915170749, 0, 0, 0.2418149180342585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[0.9251296819178925, 2.074870318082108, 0, 0, 0.3083765606392974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 1.666726058403385, 0, 0, 0.3749916482230339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.06151419091720757]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node118":{
"Global MG94xREV":0.001606432022568177,
"Nucleotide GTR":0.00185404449833298,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node119":{
"Global MG94xREV":0.001606704730027788,
"Nucleotide GTR":0.001854359240418576,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.0006866167505260382,
"Nucleotide GTR":0.0007924505929238874,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "-", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "---", "CAT", "GTG", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node125":{
"Global MG94xREV":0.001606389299067334,
"Nucleotide GTR":0.001853995189510343,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node129":{
"Global MG94xREV":2.088398360583512e-05,
"Nucleotide GTR":2.410300240764248e-05,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.0011324553579903,
"Nucleotide GTR":0.001307009942900037,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "GTG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node131":{
"Global MG94xREV":0.0004261811423523742,
"Nucleotide GTR":0.0004918719193660436,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "GTG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node132":{
"Global MG94xREV":0.0004824913524880217,
"Nucleotide GTR":0.0005568616816686309,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "GTG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node136":{
"Global MG94xREV":0.001749733856560823,
"Nucleotide GTR":0.002019434613309861,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTT", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node137":{
"Global MG94xREV":0.001508398913957268,
"Nucleotide GTR":0.001740900746763609,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node143":{
"Global MG94xREV":0.001606528570950319,
"Nucleotide GTR":0.001854155928505077,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node152":{
"Global MG94xREV":0.001605784994163897,
"Nucleotide GTR":0.001853297738161145,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node169":{
"Global MG94xREV":0.001607131090077866,
"Nucleotide GTR":0.001854851318822174,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node19":{
"Global MG94xREV":0.001606392679477916,
"Nucleotide GTR":0.001853999090971187,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node198":{
"Global MG94xREV":0.001608341629748306,
"Nucleotide GTR":0.001856248448849753,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node202":{
"Global MG94xREV":0.001606422243266857,
"Nucleotide GTR":0.001854033211668151,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node205":{
"Global MG94xREV":0.001606617865440009,
"Nucleotide GTR":0.001854258986683086,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node208":{
"Global MG94xREV":0.001606449970011719,
"Nucleotide GTR":0.001854065212162444,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "D", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GAC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node211":{
"Global MG94xREV":0.001605805082296797,
"Nucleotide GTR":0.001853320922641884,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node216":{
"Global MG94xREV":0.001606146714975363,
"Nucleotide GTR":0.001853715213952839,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node233":{
"Global MG94xREV":0.001606502987332302,
"Nucleotide GTR":0.001854126401475258,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node242":{
"Global MG94xREV":0.001605949546718806,
"Nucleotide GTR":0.001853487654544052,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTT", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node269":{
"Global MG94xREV":0.001606521640240564,
"Nucleotide GTR":0.001854147929508472,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node273":{
"Global MG94xREV":0.001607420644143119,
"Nucleotide GTR":0.001855185504218202,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.003236330896315141,
"Nucleotide GTR":0.003735172985101196,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node279":{
"Global MG94xREV":0.001605788241882034,
"Nucleotide GTR":0.001853301486476577,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node282":{
"Global MG94xREV":0.001605785713625324,
"Nucleotide GTR":0.00185329856851903,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node289":{
"Global MG94xREV":0.001605790239300065,
"Nucleotide GTR":0.001853303791772942,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node292":{
"Global MG94xREV":0.001606604792939757,
"Nucleotide GTR":0.001854243899211699,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.001606392796169045,
"Nucleotide GTR":0.001853999225648871,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node297":{
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node330":{
"Global MG94xREV":0.001607774025672908,
"Nucleotide GTR":0.00185559335532669,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node368":{
"Global MG94xREV":0.00160578640787686,
"Nucleotide GTR":0.00185329936978122,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node392":{
"Global MG94xREV":0.001605269463822526,
"Nucleotide GTR":0.001852702744921644,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node439":{
"Global MG94xREV":0.001605986873006537,
"Nucleotide GTR":0.001853530734237086,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node455":{
"Global MG94xREV":0.001606146714975363,
"Nucleotide GTR":0.001853715213952839,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node499":{
"Global MG94xREV":0.001607241406158149,
"Nucleotide GTR":0.001854978638820067,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "V", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GTC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node54":{
"Global MG94xREV":0.0008605413655699678,
"Nucleotide GTR":0.0009931836280705352,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node65":{
"Global MG94xREV":0.00160645593931674,
"Nucleotide GTR":0.001854072101565155,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node73":{
"Global MG94xREV":0.001606145706483789,
"Nucleotide GTR":0.001853714050014234,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTT", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node80":{
"Global MG94xREV":0.00161204873193017,
"Nucleotide GTR":0.001860526956940032,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node83":{
"Global MG94xREV":0.001605798534175408,
"Nucleotide GTR":0.001853313365205111,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903592949984591,
"Nucleotide GTR":0.001854181563223403,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAA", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904518995249136,
"Nucleotide GTR":0.001855083571216362,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTA", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003820484840909224,
"Nucleotide GTR":0.003721316868002539,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "V", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "GTA", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002157282253279627,
"Nucleotide GTR":0.002101285876653672,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTG", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413747_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002104779494621944,
"Nucleotide GTR":0.002050145927263635,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903346071636458,
"Nucleotide GTR":0.001853941093073798,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "G", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GGG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190276878218741,
"Nucleotide GTR":0.001853378788273772,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAT", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903346071665843,
"Nucleotide GTR":0.001853941093102421,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAG", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904257004994921,
"Nucleotide GTR":0.001854828381419029,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "R", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "AGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904557885295589,
"Nucleotide GTR":0.001855121451797463,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "V", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GTT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904557884829143,
"Nucleotide GTR":0.001855121451343123,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "F", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "TTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00385776378708482,
"Nucleotide GTR":0.00375762816800801,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "Q", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGA", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "CAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903033413096811,
"Nucleotide GTR":0.00185363655018305,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "F", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "TTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904256536413544,
"Nucleotide GTR":0.001854827925000575,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904557884829143,
"Nucleotide GTR":0.001855121451343123,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "F", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTT", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001905622930745587,
"Nucleotide GTR":0.001856158851960872,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904557520234881,
"Nucleotide GTR":0.001855121096212601,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "D", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAT", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902312768474542,
"Nucleotide GTR":0.001852934611266821,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "C", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "TGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904935966379249,
"Nucleotide GTR":0.001855489719065279,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "C", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "TGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTT", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190341282273675,
"Nucleotide GTR":0.001854006111521933,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "V", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GTT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190502389946465,
"Nucleotide GTR":0.00185557536967969,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "D", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GAC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903096359194744,
"Nucleotide GTR":0.001853697862394915,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "A", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GCC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903868476812475,
"Nucleotide GTR":0.001854449938226807,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATC", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903955569853748,
"Nucleotide GTR":0.001854534770602033,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTC", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903258988677218,
"Nucleotide GTR":0.001853856270518905,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "A", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "GCA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904557884829143,
"Nucleotide GTR":0.001855121451343123,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "I", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "ATT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901814674992487,
"Nucleotide GTR":0.001852449446751375,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001910618379693972,
"Nucleotide GTR":0.001861024634501304,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "I", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "ATT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904139943108726,
"Nucleotide GTR":0.001854714358097427,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCG", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00380806519523328,
"Nucleotide GTR":0.003709219597924768,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGC", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003815416869815775,
"Nucleotide GTR":0.003716380445767685,
"amino-acid": [
["L", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "S", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["TTG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TCA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423295_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903855022221951,
"Nucleotide GTR":0.001854436832875851,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTC", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423459_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001904557884829143,
"Nucleotide GTR":0.001855121451343123,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "C", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "TGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423762_England_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901354128736196,
"Nucleotide GTR":0.001852000854851814,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "V", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GTT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424146_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903418812751891,
"Nucleotide GTR":0.001854011946054801,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "S", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "AGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424148_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903955631752418,
"Nucleotide GTR":0.001854534830894007,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAC", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904168198014297,
"Nucleotide GTR":0.001854741879593015,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "D", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GAT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903346071665843,
"Nucleotide GTR":0.001853941093102421,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGG", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903645898963089,
"Nucleotide GTR":0.001854233137810145,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "Y", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "TAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425241_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190407520217737,
"Nucleotide GTR":0.001854651297640457,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "Y", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "TAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425518_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902399455085288,
"Nucleotide GTR":0.001853019047761202,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAT", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425559_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001904167841255132,
"Nucleotide GTR":0.001854741532094218,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "I", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "ATT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001905064969926739,
"Nucleotide GTR":0.001855615374079576,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "F", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTT", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904557883987155,
"Nucleotide GTR":0.001855121450522992,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "C", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "TGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903868476102521,
"Nucleotide GTR":0.00185444993753528,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAC", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00190407520217737,
"Nucleotide GTR":0.001854651297640457,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "N", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAT", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904271594841438,
"Nucleotide GTR":0.001854842592558245,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "R", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CGC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001903424937625274,
"Nucleotide GTR":0.00185401791194541,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTT", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904464634191522,
"Nucleotide GTR":0.001855030621203711,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "V", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GTT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902312768474542,
"Nucleotide GTR":0.001852934611266821,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAT", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001904257262601275,
"Nucleotide GTR":0.001854828632338718,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTA", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001904168198014297,
"Nucleotide GTR":0.001854741879593015,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "K", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "AAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902809113496506,
"Nucleotide GTR":0.001853418072706799,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "F", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "TTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904683181654683,
"Nucleotide GTR":0.001855243495850515,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "E", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAG", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902375859859349,
"Nucleotide GTR":0.001852996064994368,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "L", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "TTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190364589891706,
"Nucleotide GTR":0.00185423313776531,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "V", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GTT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00573034786964855,
"Nucleotide GTR":0.005581605758124318,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "P", "N", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CCG", "AAT", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001939209745282954,
"Nucleotide GTR":0.001888873856648769,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "-", "-", "-", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTT", "---", "---", "---", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902312770413473,
"Nucleotide GTR":0.001852934613155425,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGT", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001904464736973148,
"Nucleotide GTR":0.001855030721317443,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "L", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CTT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903346071665843,
"Nucleotide GTR":0.001853941093102421,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "G", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GGG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904257251683934,
"Nucleotide GTR":0.001854828621704757,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "K", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "AAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903898375202156,
"Nucleotide GTR":0.001854479060546743,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "M", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "ATG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903364099041097,
"Nucleotide GTR":0.001853958652542755,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "S", "S", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "TCA", "TCT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001904750529747039,
"Nucleotide GTR":0.001855309095794639,
"amino-acid": [
["M", "E", "R", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGA", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "V", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GTC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902865544749597,
"Nucleotide GTR":0.001853473039179053,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "M", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "ATG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001878633587988975,
"Nucleotide GTR":0.001829870069086765,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "I", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATA", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190425735996834,
"Nucleotide GTR":0.001854828727178437,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "K", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "AAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190334610072999,
"Nucleotide GTR":0.001853941121412149,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "G", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GGT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904257251683934,
"Nucleotide GTR":0.001854828621704757,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "H", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CAT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902399455085288,
"Nucleotide GTR":0.001853019047761202,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "L", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TTG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190341876243469,
"Nucleotide GTR":0.001854011897043679,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "K", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "AAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008832934665066699,
"Nucleotide GTR":0.0008603658994038674,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "I", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "ATC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904257262601275,
"Nucleotide GTR":0.001854828632338718,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAA", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001925677535573347,
"Nucleotide GTR":0.001875692901259419,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "L", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "T", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CTG", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "ACC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432510_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902399454808538,
"Nucleotide GTR":0.001853019047491636,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "S", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "TCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432510_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432565_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001910104855914879,
"Nucleotide GTR":0.001860524440211616,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "H", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAC", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432565_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902399455085288,
"Nucleotide GTR":0.001853019047761202,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "F", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "TTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432713_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902279195694837,
"Nucleotide GTR":0.001852901909932664,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "Y", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "TAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190364563382372,
"Nucleotide GTR":0.001854232879552971,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "S", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "TCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903646560005975,
"Nucleotide GTR":0.0018542337816944,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTT", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAT", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00190248824939811,
"Nucleotide GTR":0.001853105537248232,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAT", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001902576001116115,
"Nucleotide GTR":0.001853191011202979,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCT", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTT", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433716_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902400508456556,
"Nucleotide GTR":0.001853020073790209,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGT", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433716_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001904257251683934,
"Nucleotide GTR":0.001854828621704757,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAA", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434013_England_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903326436554385,
"Nucleotide GTR":0.001853921967657739,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTA", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001902576197876341,
"Nucleotide GTR":0.001853191202855918,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "I", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ATA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001936146728422269,
"Nucleotide GTR":0.001885890346234437,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "-", "-", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "---", "---", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903593026691276,
"Nucleotide GTR":0.001854181637939018,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "T", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "ACT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001909970117693316,
"Nucleotide GTR":0.001860393199377652,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904670517190189,
"Nucleotide GTR":0.001855231160116356,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190240050684585,
"Nucleotide GTR":0.00185302007222131,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGT", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001905150593138554,
"Nucleotide GTR":0.001855698774777576,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "Y", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "TAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATT", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902400508488552,
"Nucleotide GTR":0.001853020073821376,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "F", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "TTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903450057045613,
"Nucleotide GTR":0.00185404237934327,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAT", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904017398846028,
"Nucleotide GTR":0.001854594994704861,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "K", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "AAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001909555744711609,
"Nucleotide GTR":0.001859989582237242,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "A", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GCC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903593026691276,
"Nucleotide GTR":0.001854181637939018,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "N", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "AAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903346071665843,
"Nucleotide GTR":0.001853941093102421,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACG", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436671_California_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436674_California_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001904257251683934,
"Nucleotide GTR":0.001854828621704757,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTA", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436674_California_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902488260466346,
"Nucleotide GTR":0.001853105548029169,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGT", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903546448859129,
"Nucleotide GTR":0.001854136269123368,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "CTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436953_LA_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902662677932578,
"Nucleotide GTR":0.001853275438157307,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAT", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436953_LA_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001904168198014297,
"Nucleotide GTR":0.001854741879593015,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "S", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "AGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902312768474542,
"Nucleotide GTR":0.001852934611266821,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "S", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "TCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903259002658381,
"Nucleotide GTR":0.00185385628413716,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "G", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GGA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437595_California_20200322_null_75":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437595_California_20200322_null_75",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23":{
"Global MG94xREV":0.001903868476812475,
"Nucleotide GTR":0.001854449938226807,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCC", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001905715134429872,
"Nucleotide GTR":0.001856248662322622,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "L", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTA", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001903868476812475,
"Nucleotide GTR":0.001854449938226807,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTC", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902308410937496,
"Nucleotide GTR":0.001852930366837964,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "I", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "ATT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190352026033447,
"Nucleotide GTR":0.001854110760371828,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCG", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001903592950197243,
"Nucleotide GTR":0.001854181563430532,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "D", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GAC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438404_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902768417701898,
"Nucleotide GTR":0.001853378433249178,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGT", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438404_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190437000377114,
"Nucleotide GTR":0.001854938447096431,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTC", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903128778711669,
"Nucleotide GTR":0.001853729440401434,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "T", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ACA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190385434471403,
"Nucleotide GTR":0.001854436172953939,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "D", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GAC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001903593028883188,
"Nucleotide GTR":0.001854181640074032,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "N", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "AAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190550450241099,
"Nucleotide GTR":0.001856043497659644,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "L", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTA", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902400508488552,
"Nucleotide GTR":0.001853020073821376,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "I", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ATT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902662677932578,
"Nucleotide GTR":0.001853275438157307,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTT", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902007053417017,
"Nucleotide GTR":0.001852636831626868,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "L", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CTT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001904822268715621,
"Nucleotide GTR":0.001855378972641426,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAC", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439564_England_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "D", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAT", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439564_England_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439774_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGT", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439774_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439778_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902663742978095,
"Nucleotide GTR":0.001853276475557534,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAT", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439778_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439819_England_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001904463205649594,
"Nucleotide GTR":0.001855029229742315,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "C", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "TGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439819_England_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439825_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001903258978292013,
"Nucleotide GTR":0.001853856260403267,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAG", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439825_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439839_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTT", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439839_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440121_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903607354148771,
"Nucleotide GTR":0.001854195593500019,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "E", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "GAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440121_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440132_England_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001903868476812475,
"Nucleotide GTR":0.001854449938226807,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTC", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440132_England_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440400_England_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903868117465406,
"Nucleotide GTR":0.001854449588207277,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "T", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "ACT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440400_England_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440671_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903258648766673,
"Nucleotide GTR":0.001853855939431386,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGG", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440671_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_440786_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902311717362225,
"Nucleotide GTR":0.001852933587438132,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "V", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GTC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440786_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440909_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903593026691276,
"Nucleotide GTR":0.001854181637939018,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAA", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440909_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440936_England_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902867065597267,
"Nucleotide GTR":0.001853474520550219,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "R", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CGT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440936_England_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440988_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903607354148771,
"Nucleotide GTR":0.001854195593500019,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAG", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440988_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441119_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904168298404876,
"Nucleotide GTR":0.001854741977377766,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "K", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "AAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441119_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441246_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903813748074318,
"Nucleotide GTR":0.001854396630077463,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "V", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "GTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441246_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001923402974305494,
"Nucleotide GTR":0.001873477380568765,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "G", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "GGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441534_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441558_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904168198014297,
"Nucleotide GTR":0.001854741879593015,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "I", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "ATC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441558_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441658_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902399455085288,
"Nucleotide GTR":0.001853019047761202,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "F", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "TTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441658_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441860_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190231205846549,
"Nucleotide GTR":0.001852933919687411,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "V", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GTT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441860_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441881_England_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001903259002658381,
"Nucleotide GTR":0.00185385628413716,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCG", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441881_England_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442091_England_20200405_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001902445444027971,
"Nucleotide GTR":0.00185306384297314,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTG", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442091_England_20200405_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442117_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902311703460983,
"Nucleotide GTR":0.001852933573897724,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "F", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "TTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442117_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442274_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001914442668420271,
"Nucleotide GTR":0.001864749656517592,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442274_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442289_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903894941107332,
"Nucleotide GTR":0.0018544757155904,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTA", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442289_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442649_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902652658730727,
"Nucleotide GTR":0.001853265679022955,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTC", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442649_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442747_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902312770413473,
"Nucleotide GTR":0.001852934613155425,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "S", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "TCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442747_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442958_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903911992026411,
"Nucleotide GTR":0.001854492323920346,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "L", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "TTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442958_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442984_England_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443037_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902312768474542,
"Nucleotide GTR":0.001852934611266821,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "F", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "TTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443037_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904074837255594,
"Nucleotide GTR":0.001854650942190924,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "I", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "ATA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904261572942474,
"Nucleotide GTR":0.001854832830796791,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "Y", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "TAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902715513715599,
"Nucleotide GTR":0.001853326902486775,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "L", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TTA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443470_England_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001902312770413473,
"Nucleotide GTR":0.001852934613155425,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "C", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "TGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443470_England_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443568_England_20200414_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00193593613871685,
"Nucleotide GTR":0.001885685222786595,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "-", "-", "-", "V", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "---", "---", "---", "GTG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443568_England_20200414_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443675_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001902312768474542,
"Nucleotide GTR":0.001852934611266821,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAT", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443675_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903607354155011,
"Nucleotide GTR":0.001854195593506098,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "G", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GGA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443888_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443946_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902312768474542,
"Nucleotide GTR":0.001852934611266821,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "L", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CTT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443946_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444012_England_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001924044950315392,
"Nucleotide GTR":0.001874102692866539,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "-", "K", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "---", "AAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444012_England_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444015_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902442847168653,
"Nucleotide GTR":0.001853061313520257,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTC", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444015_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444026_California_20200501_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001904168198014297,
"Nucleotide GTR":0.001854741879593015,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "T", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "ACT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444026_California_20200501_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444097_England_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001903862144083137,
"Nucleotide GTR":0.001854443769875542,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "D", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GAT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444097_England_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444168_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904168198014297,
"Nucleotide GTR":0.001854741879593015,
"amino-acid": [
["M", "K", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "AAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444168_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444216_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904257251683934,
"Nucleotide GTR":0.001854828621704757,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "H", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CAC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444216_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001905650371987487,
"Nucleotide GTR":0.001856185580912989,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTA", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTA", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902311715423091,
"Nucleotide GTR":0.001852933585549332,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTT", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444282_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAT", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902778436154094,
"Nucleotide GTR":0.001853388191653333,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "H", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CAT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001903258624400303,
"Nucleotide GTR":0.001853855915697494,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "G", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "GGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001908345780300655,
"Nucleotide GTR":0.001858811024760987,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "E", "A", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "GAG", "GCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGT", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903868476345392,
"Nucleotide GTR":0.001854449937771849,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAC", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001906019317708987,
"Nucleotide GTR":0.001856544949944397,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "Q", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAA", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903864035899328,
"Nucleotide GTR":0.001854445612586033,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "L", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "TTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001937589486934442,
"Nucleotide GTR":0.001887295655196882,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "-", "V", "-", "-", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGG", "---", "GTT", "---", "---", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "D", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GAC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001904557885370084,
"Nucleotide GTR":0.001855121451870026,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "D", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAT", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903536795776374,
"Nucleotide GTR":0.001854126866604791,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAA", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001904464634259156,
"Nucleotide GTR":0.00185503062126959,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "C", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "TGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001412848060609151,
"Nucleotide GTR":0.001376174893712772,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "M", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "---", "ATG", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001902663740584373,
"Nucleotide GTR":0.001853276473225943,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGT", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001902818476851223,
"Nucleotide GTR":0.001853427193017779,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "L", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CTA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903258978542114,
"Nucleotide GTR":0.001853856260646877,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "G", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GGA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001901063180650447,
"Nucleotide GTR":0.001851717458878712,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "V", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GTA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001903544762403497,
"Nucleotide GTR":0.001854134626442907,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAG", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903258624400303,
"Nucleotide GTR":0.001853855915697494,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "G", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GGT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903593028883188,
"Nucleotide GTR":0.001854181640074032,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "I", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "ATA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001903851113159924,
"Nucleotide GTR":0.001854433025280988,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "Y", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "TAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001902400508488552,
"Nucleotide GTR":0.001853020073821376,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "C", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "TGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001902311717107939,
"Nucleotide GTR":0.001852933587190446,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGT", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "-", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "C", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "---", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TGC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001903349575874716,
"Nucleotide GTR":0.001853944506352867,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAG", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001902832928462284,
"Nucleotide GTR":0.001853441269509701,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "N", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAT", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00190231205846549,
"Nucleotide GTR":0.001852933919687411,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAT", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190277482829917,
"Nucleotide GTR":0.001853384677447168,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "D", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GAT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.00190231205846549,
"Nucleotide GTR":0.001852933919687411,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAT", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001902311717107939,
"Nucleotide GTR":0.001852933587190446,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "Y", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "TAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447700_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903986060180928,
"Nucleotide GTR":0.001854564469494602,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGC", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447700_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001904464634191522,
"Nucleotide GTR":0.001855030621203711,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "C", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "TGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00190323773827116,
"Nucleotide GTR":0.001853835571707678,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "F", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "TTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGT", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001905503687701298,
"Nucleotide GTR":0.001856042704097295,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTA", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903365160294439,
"Nucleotide GTR":0.001853959686249241,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "Y", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "TAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447890_California_20200402_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "N", "-", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AAC", "---", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447890_California_20200402_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447934_England_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903505848065261,
"Nucleotide GTR":0.001854096722200566,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAA", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447934_England_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448054_England_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903862144421234,
"Nucleotide GTR":0.001854443770204862,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "N", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "AAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448054_England_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448097_England_20200506_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001904464166865692,
"Nucleotide GTR":0.001855030166008213,
"amino-acid": [
["M", "D", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAT", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448097_England_20200506_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448105_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001903646559947808,
"Nucleotide GTR":0.001854233781637745,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "V", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GTC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448105_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001906459733732436,
"Nucleotide GTR":0.001856973934129713,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "D", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "E", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GAC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAA", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448143_Scotland_20200408_null_203":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAC", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448143_Scotland_20200408_null_203",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "F", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "TTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTT", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22":{
"Global MG94xREV":0.001902708813195169,
"Nucleotide GTR":0.001853320375891139,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "C", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "TGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448409_England_20200429_null_76":{
"Global MG94xREV":0.001903319603880471,
"Nucleotide GTR":0.001853915312338915,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "I", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "ATT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448409_England_20200429_null_76",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448432_England_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903592950197243,
"Nucleotide GTR":0.001854181563430532,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "N", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "AAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448432_England_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448448_England_20200429_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001902663740584373,
"Nucleotide GTR":0.001853276473225943,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGT", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448448_England_20200429_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448529_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001904271136855608,
"Nucleotide GTR":0.001854842146460312,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "W", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TGG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448529_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448559_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904257262601275,
"Nucleotide GTR":0.001854828632338718,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "T", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "ACA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448559_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448600_England_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903921758373239,
"Nucleotide GTR":0.001854501836763011,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTT", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448600_England_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448602_England_20200101_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001902400519822531,
"Nucleotide GTR":0.001853020084861161,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "TTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448602_England_20200101_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448725_England_20200101_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001903690136687111,
"Nucleotide GTR":0.001854276227259639,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "Y", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "TAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448725_England_20200101_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448777_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001102147847725041,
"Nucleotide GTR":0.001073539497619312,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "-", "-", "H", "M", "-", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "---", "---", "CAT", "ATG", "---", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448777_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448822_England_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903894863957121,
"Nucleotide GTR":0.001854475640442775,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "D", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GAC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448822_England_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448848_England_20200415_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "N", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "AAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448848_England_20200415_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448886_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903986002835563,
"Nucleotide GTR":0.001854564413637746,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAC", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448886_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00190386847678333,
"Nucleotide GTR":0.00185444993819842,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTC", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449095_England_20200506_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001903259003043376,
"Nucleotide GTR":0.00185385628451216,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "V", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "GTC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449095_England_20200506_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "D", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GAC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449123_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449148_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001903346071665843,
"Nucleotide GTR":0.001853941093102421,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTG", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449148_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "TTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001904168198014297,
"Nucleotide GTR":0.001854741879593015,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCA", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001903679401429998,
"Nucleotide GTR":0.001854265770656607,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "I", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATT", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449390_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001904256536413544,
"Nucleotide GTR":0.001854827925000575,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "S", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "AGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449390_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449566_England_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001903868476812475,
"Nucleotide GTR":0.001854449938226807,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCC", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449566_England_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449608_England_20200428_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449608_England_20200428_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449662_England_20200414_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001904167840364377,
"Nucleotide GTR":0.001854741531226581,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "T", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "ACC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449662_England_20200414_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449700_England_20200416_null_26590":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449700_England_20200416_null_26590",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449708_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTC", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTT", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449708_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449728_England_20200417_null_367":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "E", "S", "L", "V", "P", "G", "F", "N", "E", "K", "T", "H", "V", "Q", "L", "S", "L", "P", "V", "L", "Q", "V", "R", "D", "V", "L", "V", "R", "G", "F", "G", "D", "S", "V", "E", "E", "V", "L", "S", "E", "A", "R", "Q", "H", "L", "K", "D", "G", "T", "C", "G", "L", "V", "E", "V", "E", "K", "G", "V", "L", "P", "Q", "L", "E", "Q", "P", "Y", "V", "F", "I", "K", "R", "S", "D", "A", "R", "T", "A", "P", "H", "G", "H", "V", "M", "V", "E", "L", "V", "A", "E", "L", "E", "G", "I", "Q", "Y", "G", "R", "S", "G", "E", "T", "L", "G", "V", "L", "V", "P", "H", "V", "G", "E", "I", "P", "V", "A", "Y", "R", "K", "V", "L", "L", "R", "K", "N", "G", "N", "K", "G", "A", "G", "G", "H", "S", "Y", "G", "A", "D", "L", "K", "S", "F", "D", "L", "G", "D", "E", "L", "G", "T", "D", "P", "Y", "E", "D", "F", "Q", "E", "N", "W", "N", "T", "K", "H", "S", "S", "G", "V", "T", "R", "E", "L", "M", "R", "E", "L", "N", "G", "G"]
],
"codon": [
["ATG", "GAG", "AGC", "CTT", "GTC", "CCT", "GGT", "TTC", "AAC", "GAG", "AAA", "ACA", "CAC", "GTC", "CAA", "CTT", "AGT", "TTG", "CCT", "GTT", "TTA", "CAG", "GTT", "CGC", "GAC", "GTG", "CTC", "GTA", "CGT", "GGC", "TTT", "GGA", "GAC", "TCC", "GTG", "GAG", "GAG", "GTC", "TTA", "TCA", "GAG", "GCA", "CGT", "CAA", "CAT", "CTT", "AAA", "GAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GGC", "TTA", "GTA", "GAA", "GTT", "GAA", "AAA", "GGC", "GTT", "TTG", "CCT", "CAA", "CTT", "GAA", "CAG", "CCC", "TAT", "GTG", "TTC", "ATC", "AAA", "CGT", "TCG", "GAT", "GCT", "CGA", "ACT", "GCA", "CCT", "CAT", "GGT", "CAT", "GTT", "ATG", "GTT", "GAG", "CTG", "GTA", "GCA", "GAA", "CTC", "GAA", "GGC", "ATT", "CAG", "TAC", "GGT", "CGT", "AGT", "GGT", "GAG", "ACA", "CTT", "GGT", "GTC", "CTT", "GTC", "CCT", "CAT", "GTG", "GGC", "GAA", "ATA", "CCA", "GTG", "GCT", "TAC", "CGC", "AAG", "GTT", "CTT", "CTT", "CGT", "AAG", "AAC", "GGT", "AAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GGT", "GGC", "CAT", "AGT", "TAC", "GGC", "GCC", "GAT", "CTA", "AAG", "TCA", "TTT", "GAC", "TTA", "GGC", "GAC", "GAG", "CTT", "GGC", "ACT", "GAT", "CCT", "TAT", "GAA", "GAT", "TTT", "CAA", "GAA", "AAC", "TGG", "AAC", "ACT", "AAA", "CAT", "AGC", "AGT", "GGT", "GTT", "ACC", "CGT", "GAA", "CTC", "ATG", "CGT", "GAG", "CTT", "AAC", "GGA", "GGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449728_England_20200417_null_367",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":6231.330480881757,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01558096141110793],
[0.01535563813227503],
[0.01087842404598963],
[0.02433547800681055],
[0.006269954067585631],
[0.006179281446598781],
[0.004377600155497974],
[0.009792869983405766],
[0.009960141484418813],
[0.009816103406299388],
[0.006954040881477022],
[0.01555647290583719],
[0.01277061451398974],
[0.01258593292348455],
[0.008916276495750048],
[0.01994607395774006],
[0.02146048302747566],
[0.02115013334663752],
[0.01498342935617623],
[0.03351854221000401],
[0.008635939676645754],
[0.008511051475436437],
[0.006029500449899311],
[0.01348823827516374],
[0.01371863016907548],
[0.01352023889852215],
[0.009578168661846236],
[0.02142675371271358],
[0.01758964346272794],
[0.01733527173084636],
[0.01228085965663897],
[0.0274727836325741],
[0.03518453374946351],
[0.03467571440902253],
[0.02456538257736952],
[0.05495376213623954],
[0.01415865200341741],
[0.01395389737954742],
[0.009885386167696237],
[0.0221140117958066],
[0.02249174007697166],
[0.02216647692490533],
[0.01570343957819217],
[0.03512923442502271],
[0.02883827932777798],
[0.02842123602200343],
[0.0201345105097695],
[0.0450417207140427],
[0.01231679982287079],
[0.01951955422638973],
[0.005029147501641814],
[0.004956418741528436],
[0.003511285194101429],
[0.007854888102858594],
[0.007873523695630174],
[0.005577855427394256],
[0.01247788995029686],
[0.01024334522791702],
[0.01009521161330411],
[0.00715177004156523],
[0.0159988010966017]
],
"Log Likelihood":-2800.517751038265,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.7912814958670428, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5893981078225062, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":313
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6718.429365508346,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2503350211153849],
[0.2144569760450848],
[0.2699582038521995],
[0.2652497989873308]
],
"Log Likelihood":-2840.270142303119,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.07199439117896607,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3036123437346643,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.03959193708861453,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.337471273919287,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.4877602562947924
},
"display order":0,
"estimated parameters":517
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-19/sequences.leader.compressed.fas",
"number of sequences":256,
"number of sites":180,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_434013_England_20200414_null_3,epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2,epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_425518_England_20200320_null_1,epi_isl_439825_England_20200415_null_3,epi_isl_424148_England_20200320_null_1,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2,(epi_isl_444015_England_20200325_null_3,epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18)Node65,epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_448725_England_20200101_null_6,epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3,epi_isl_433716_England_20200101_null_1,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3,epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2,epi_isl_443037_England_20200408_null_1,epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3,epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1,epi_isl_438404_England_20200330_null_2,epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_441119_England_20200403_null_1,epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1,epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1,epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2,epi_isl_443675_England_20200416_null_4,(epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1,epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1,epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1)Node499,epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2,epi_isl_440132_England_20200322_null_5,epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1,epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1,epi_isl_440909_England_20200420_null_1,epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2,epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1,epi_isl_449700_England_20200416_null_26590,epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5,(epi_isl_413747_China_20200201_null_1,epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1)Node54,epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1,epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11,(epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_439774_England_20200409_null_1)Node19,epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2,epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1,epi_isl_422000_England_20200402_null_1,(epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1,epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1)Node73,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6,epi_isl_423459_England_20200330_null_1,(epi_isl_437595_California_20200322_null_75,epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1)Node80,(epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1,epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7)Node83,epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_449566_England_20200323_null_4,epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5,epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2,epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2,epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3,epi_isl_439778_England_20200409_null_1,epi_isl_442747_England_20200407_null_2,(epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2,epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7)Node455,epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2,epi_isl_443470_England_20200415_null_7,epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2,epi_isl_441860_England_20200420_null_1,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1,epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4,epi_isl_444282_England_20200416_null_1,epi_isl_444216_England_20200415_null_1,epi_isl_441534_England_20200426_null_1,epi_isl_447700_France_20200301_null_1,epi_isl_436671_California_20200418_null_2,epi_isl_425241_England_20200401_null_1,epi_isl_448054_England_20200502_null_2,epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1,epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5,epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4,epi_isl_448448_England_20200429_null_4,epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4,(epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1,epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25)Node439,epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_441881_England_20200430_null_3,epi_isl_432713_England_20200325_null_1,epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1,epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5,(epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5)Node392,epi_isl_444168_England_20200410_null_1,epi_isl_436674_California_20200331_null_3,epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2,epi_isl_442958_England_20200410_null_1,epi_isl_448602_England_20200101_null_7,epi_isl_448105_England_20200101_null_1,epi_isl_448822_England_20200324_null_4,epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1,epi_isl_425559_England_20200323_null_1,epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5,epi_isl_440988_England_20200331_null_1,epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3,epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1,epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2,epi_isl_442289_England_20200406_null_4,epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15,epi_isl_449390_England_20200330_null_1,epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1,epi_isl_440121_England_20200323_null_1,epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4,epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2,(epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1,epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2)Node368,epi_isl_448409_England_20200429_null_76,epi_isl_441558_England_20200405_null_1,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1,epi_isl_449662_England_20200414_null_9,epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1,epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1,epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2,epi_isl_440936_England_20200425_null_1,epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2,(epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27,epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1)Node143,(((epi_isl_443568_England_20200414_null_4,epi_isl_448777_England_20200408_null_2)Node120,epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19)Node119,epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1)Node118,(epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1,epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2)Node125,((((epi_isl_444012_England_20200326_null_4,epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3)Node132,epi_isl_413752_China_20200201_null_1)Node131,((epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1,epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1)Node137,epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1)Node136)Node130,epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1)Node129,epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3,(epi_isl_423295_England_20200326_null_2,epi_isl_424146_England_20200321_null_1)Node152,epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22,epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2,epi_isl_448600_England_20200101_null_4,epi_isl_441658_England_20200404_null_3,epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1,epi_isl_441246_England_20200401_null_1,epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1,epi_isl_432510_England_20200327_null_2,(epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1,epi_isl_448848_England_20200415_null_19)Node169,epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14,epi_isl_440786_England_20200401_null_2,epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1,epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7,epi_isl_447934_England_20200427_null_2,epi_isl_444026_California_20200501_null_10,epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1,epi_isl_448529_England_20200406_null_2,epi_isl_448886_England_20200417_null_2,epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2,(epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16)Node211,(epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1,epi_isl_449123_England_20200408_null_4)Node208,(epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1,epi_isl_439564_England_20200327_null_4)Node205,(epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6)Node202,(epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1,epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227)Node198,epi_isl_439434_England_20200401_null_2,(epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2,epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1)Node216,epi_isl_449148_England_20200418_null_2,epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4,epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1,epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3,epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6,epi_isl_443946_England_20200326_null_2,epi_isl_448559_England_20200407_null_1,epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2,(epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1,epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3)Node233,epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8,epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12,(epi_isl_442649_England_20200407_null_1,epi_isl_449708_England_20200416_null_6)Node242,epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8,epi_isl_449095_England_20200506_null_8,epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1,epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2,epi_isl_439819_England_20200413_null_7,epi_isl_443888_England_20200329_null_1,epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2,epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1,epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4,epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1,(((epi_isl_442274_England_20200406_null_3,epi_isl_447890_California_20200402_null_10)Node274,epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1)Node273,epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1,epi_isl_448143_Scotland_20200408_null_203)Node269,(epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_439839_England_20200414_null_1)Node279,(epi_isl_442091_England_20200405_null_8,epi_isl_449608_England_20200428_null_17)Node282,(epi_isl_442984_England_20200407_null_7,epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1)Node295,(epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1,epi_isl_449728_England_20200417_null_367)Node289,(epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1)Node292,epi_isl_440671_England_20200404_null_1,epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1,epi_isl_423762_England_20200324_null_3,epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1,epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1,epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1,epi_isl_436953_LA_20200406_null_1,epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2,epi_isl_444097_England_20200406_null_7,epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8,epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3,(epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1,epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1,epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1)Node330,epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1,epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1,epi_isl_432565_England_20200402_null_1,epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7,epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23,epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_448097_England_20200506_null_5,epi_isl_448432_England_20200429_null_2,epi_isl_442117_England_20200405_null_1,epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1,epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_440400_England_20200316_null_4)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node118":"test",
"Node119":"test",
"Node120":"test",
"Node125":"test",
"Node129":"test",
"Node130":"test",
"Node131":"test",
"Node132":"test",
"Node136":"test",
"Node137":"test",
"Node143":"test",
"Node152":"test",
"Node169":"test",
"Node19":"test",
"Node198":"test",
"Node202":"test",
"Node205":"test",
"Node208":"test",
"Node211":"test",
"Node216":"test",
"Node233":"test",
"Node242":"test",
"Node269":"test",
"Node273":"test",
"Node274":"test",
"Node279":"test",
"Node282":"test",
"Node289":"test",
"Node292":"test",
"Node295":"test",
"Node330":"test",
"Node368":"test",
"Node392":"test",
"Node439":"test",
"Node455":"test",
"Node499":"test",
"Node54":"test",
"Node65":"test",
"Node73":"test",
"Node80":"test",
"Node83":"test",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"background",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"background",
"epi_isl_408483_Shanghai_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_413747_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416726_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417067_Washington_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417094_Washington_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418989_Vorst_20200304_null_2":"background",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419442_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419847_Victoria_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_419868_Victoria_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_420310_Norway_20200316_null_2":"background",
"epi_isl_420942_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_421203_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421248_Jiangxi_20200123_null_2":"background",
"epi_isl_421335_Wisconsin_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_421504_Ile_de_France_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_421584_New_Jersey_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_422000_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422346_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422347_Wales_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_422359_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422885_Noord_Brabant_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_422888_Noord_Brabant_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422904_Zuid_Holland_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423012_Washington_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423295_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_423459_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423762_England_20200324_null_3":"background",
"epi_isl_424146_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424148_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424352_Anhui_20200310_null_2":"background",
"epi_isl_424451_Reykjavik_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424907_Virginia_20200306_null_4":"background",
"epi_isl_425241_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425518_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_425559_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_425772_Scotland_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_425778_Scotland_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_426074_Idaho_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_426467_Virginia_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_426521_Arizona_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_426742_Victoria_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_426749_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426758_Victoria_20200327_null_5":"background",
"epi_isl_426828_Victoria_20200325_null_5":"background",
"epi_isl_426930_Victoria_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_427053_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427098_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_427104_Victoria_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_427243_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_427264_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_427303_Rio_de_Janeiro_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428390_Connecticut_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_428453_Guangdong_20200122_null_1":"background",
"epi_isl_428748_Connecticut_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429215_Switzerland_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_429550_Unknown_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_429725_Luxembourg_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_429986_Virginia_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_430083_St_Petersburg_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430153_Washington_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_430156_Washington_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430386_New_York_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430632_Northern_Territory_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_430937_Washington_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_432031_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_432046_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_432326_Wales_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_432510_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_432565_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_433234_Scotland_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_433235_Scotland_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_433268_Scotland_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_433312_Scotland_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_433328_Scotland_20200326_null_8":"background",
"epi_isl_433560_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433639_Scotland_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_433716_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_434013_England_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_434088_Washington_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_434334_Washington_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_434363_Ghent_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434508_Luxembourg_20200409_null_27":"background",
"epi_isl_434556_Manila_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434588_Maryland_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_434939_Texas_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435011_Texas_20200402_null_6":"background",
"epi_isl_435503_New_York_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_435510_New_York_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_435527_New_York_20200420_null_4":"background",
"epi_isl_436548_Florida_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_436614_Wisconsin_20200421_null_5":"background",
"epi_isl_436639_Wisconsin_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436671_California_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_436674_California_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_3":"background",
"epi_isl_436936_Utah_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_436953_LA_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437120_Michigan_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_437286_Bavaria_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437522_Oregon_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_437595_California_20200322_null_75":"background",
"epi_isl_437642_Unknown_20200308_null_23":"background",
"epi_isl_437761_Makkah_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437843_Washington_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_437865_Connecticut_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_437958_Bad_Gastein_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_438185_Washington_20200417_null_5":"background",
"epi_isl_438404_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_438918_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_438971_Kanto_20200424_null_1":"background",
"epi_isl_439188_Scotland_20200422_null_2":"background",
"epi_isl_439254_Scotland_20200426_null_6":"background",
"epi_isl_439260_Scotland_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_439265_Scotland_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_439279_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_439350_Scotland_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_439564_England_20200327_null_4":"background",
"epi_isl_439774_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_439778_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_439819_England_20200413_null_7":"background",
"epi_isl_439825_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_439839_England_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_440121_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440132_England_20200322_null_5":"background",
"epi_isl_440400_England_20200316_null_4":"background",
"epi_isl_440671_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_440786_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_440909_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_440936_England_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_440988_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_441119_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441246_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_441558_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441658_England_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_441860_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441881_England_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_442091_England_20200405_null_8":"background",
"epi_isl_442117_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442274_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_442289_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_442649_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442747_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_442958_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442984_England_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_443037_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443220_Singapore_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_443281_Bretagne_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_443470_England_20200415_null_7":"background",
"epi_isl_443568_England_20200414_null_4":"background",
"epi_isl_443675_England_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_443888_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_443946_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_444012_England_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_444015_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_444026_California_20200501_null_10":"background",
"epi_isl_444097_England_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_444168_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_444216_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444282_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_444924_Unknown_20200328_null_25":"background",
"epi_isl_445010_Florida_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_445027_Florida_20200430_null_11":"background",
"epi_isl_445062_Luxembourg_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_445075_Luxembourg_20200508_null_7":"background",
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_445234_Vastra_Gotaland_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_445641_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445736_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_445816_Wales_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_445870_Wales_20200408_null_7":"background",
"epi_isl_445941_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_446101_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_446147_Wales_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_446382_Wales_20200410_null_19":"background",
"epi_isl_446451_Wales_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446729_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446758_Wales_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_446803_Wales_20200416_null_8":"background",
"epi_isl_446912_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_446938_Wales_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_446979_Wales_20200416_null_14":"background",
"epi_isl_447010_Bangkok_20200329_null_12":"background",
"epi_isl_447061_Michigan_20200327_null_8":"background",
"epi_isl_447129_Li_ge_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_447162_Li_ge_20200419_null_7":"background",
"epi_isl_447212_Michigan_20200323_null_227":"background",
"epi_isl_447247_Kinshasa_20200425_null_2":"background",
"epi_isl_447251_Israel_20200309_null_4":"background",
"epi_isl_447276_South_Coast_District_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_447483_Comunitat_Valenciana_20200329_null_6":"background",
"epi_isl_447522_Comunitat_Valenciana_20200401_null_15":"background",
"epi_isl_447700_France_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_447750_Choco_20200330_null_4":"background",
"epi_isl_447753_Huila_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_447797_Boyaca_20200404_null_7":"background",
"epi_isl_447853_Telangana_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_447890_California_20200402_null_10":"background",
"epi_isl_447934_England_20200427_null_2":"background",
"epi_isl_448054_England_20200502_null_2":"background",
"epi_isl_448097_England_20200506_null_5":"background",
"epi_isl_448105_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448117_Scotland_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_448143_Scotland_20200408_null_203":"background",
"epi_isl_448145_Scotland_20200410_null_5":"background",
"epi_isl_448163_Scotland_20200412_null_18":"background",
"epi_isl_448196_Scotland_20200421_null_22":"background",
"epi_isl_448409_England_20200429_null_76":"background",
"epi_isl_448432_England_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_448448_England_20200429_null_4":"background",
"epi_isl_448529_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_448559_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_448600_England_20200101_null_4":"background",
"epi_isl_448602_England_20200101_null_7":"background",
"epi_isl_448725_England_20200101_null_6":"background",
"epi_isl_448777_England_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_448822_England_20200324_null_4":"background",
"epi_isl_448848_England_20200415_null_19":"background",
"epi_isl_448886_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_448928_Northern_Ireland_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_449095_England_20200506_null_8":"background",
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_449148_England_20200418_null_2":"background",
"epi_isl_449245_Scotland_20200426_null_16":"background",
"epi_isl_449256_Scotland_20200427_null_4":"background",
"epi_isl_449297_Scotland_20200425_null_3":"background",
"epi_isl_449390_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_449566_England_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_449608_England_20200428_null_17":"background",
"epi_isl_449662_England_20200414_null_9":"background",
"epi_isl_449700_England_20200416_null_26590":"background",
"epi_isl_449708_England_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_449728_England_20200417_null_367":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":5
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":3
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":9
}
}
}